Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Immunology and Infection

HER2 Gene amplifikasyon meme kanserleri heterojen değerlendirmek için bir yüksek-den geçerek tarama Platform kurma

Published: December 5, 2017 doi: 10.3791/56686

Summary

Türdeş olmayan dağıtım HER2-pozitif hücrelerinin meme kanserlerinin bir alt kümede görülebilir ve klinik ikilemler oluşturur. Burada, tanımlamak, ölçmek ve HER2 içi tümör genetik heterojenite heterogeneously işlenmiş meme kanserlerinin büyük bir dizi karşılaştırmak için güvenilir ve düşük maliyetli bir iletişim kuralı tanıtmak.

Abstract

İnsan epidermal büyüme faktörü reseptörü 2 (HER2) karşı hedefli tedaviler HER2-pozitif meme kanseri olan hastalarda, sonucunu kökten değişti. Ancak, bir azınlık olguların önemli klinik sorunlar oluşturan heterojen bir dağıtım HER2-pozitif hücrelerinin görüntüler. Bugüne kadar hiçbir güvenilir ve standart protokolleri karakterizasyonu ve miktar ile HER2 heterojen gene amplifikasyon içinde büyük tabur için önerilmiştir. Burada, aynı anda birden fazla meme kanserlerinin farklı topografik alanları arasında HER2 durumu değerlendirmek için bir yüksek-den geçerek metodoloji mevcut. Özellikle, tümörler hedef eşlemesi ekleme gelişmiş doku microarrays (ayarlayınca) oluşturmak için laboratuvar yordamı göstermektedir. Tüm TMA parametreleri özellikle gümüş in situ hibridizasyon (FFPE) meme dokuları parafin gömülü formalin sabit için (SISH) optimize edilmiştir. Prognostik ve akıllı biyolojik (Yani, ER, halkla ilişkiler, Ki67 ve HER2) analizini immunohistokimyasal otomatik yordamları kullanarak yapılmalıdır. Özelleştirilmiş bir SISH protokol farklı fiksasyon, işleme ve depolama yordamlar yapılan birden fazla doku arasında bir yüksek kaliteli moleküler analiz izin vermek için uygulamaya konmuştur. Bu çalışmada, biz bir kanıt-in-belirli DNA dizileri verimli ve düşük maliyetli bir yöntem kullanarak aynı anda birden çok farklı topografik alanlarında yerelleştirilmiş ve heterogeneously işlenmiş meme kanserlerinin olabilir ilke sağlar.

Introduction

HER2 overexpressed ve tüm invaziv meme kanserleri1,%215-30'güçlendirilmiş bir proto-oncogene var. HER2 overexpression varlığı ile değişkenden > % 10 hücrelerle gene amplifikasyon zaman HER2/şeması oranı ≥2 ya Gen kopya sayısı ≥6, tespit edilebilir iken boyama (3 +), sayma güçlü membran immunohistokimyasal (IHC) En azından 20 hücreleri tarafından in situ hibridizasyon (ISH)3.

İçi tümör genetik heterojenite, meme kanserleri, biyolojik değerlendirme ve tedavi yanıt4potansiyel olumsuz bir katılımcı olmak yaygın olarak tanımlanmıştır. HER2 içinde güçlendirilmiş College of Amerikan patologlar (kap göre), HER2 heterojenite var demektir > % 5 ve < %50-in tümör infiltre hücreleri5. Ne yazık ki, meme kanserleri HER2 kayma heterojenite gerçek insidansı bir konu tartışma patologlar arasında kalır, bazı yazarlar bu bakımı ile son derece nadir bir olaydır ve diğerleri olguların % 40 ilâ ima HER2-heterojen1,5,6,7,8,9,10. Bu durum temelini oluşturan biyolojik mekanizmaları rağmen değil henüz tam olarak, içi tümör HER2 heterojenite prognostik ve klinik etkileri meme kanseri hastaların11için önemlidir açıkladı.

Son zamanlarda, chromogenic ISH (CISH) ve gümüş ISH (SISH), gibi parlak alan moleküler teknikleri floresan ISH (balık)12' ye göre bazı avantajları ile FFPE dokularda HER2 heterojenite algılamak için güvenilir yöntemi olarak ortaya çıkmıştır. Ne yazık ki, toplu analiz tek olguların büyük kohort araştırma çalışmaları içinde pratik kalır. Çeşitli gruplar histochemistry, IHC ve ISH TMA teknolojileri kombinasyonu çalışmada kanser Biyoloji13,14,15,16, değerli bir strateji doğurabilecek tavsiye ettiler. Bu yaygın olarak kabul edilen yöntemle doku örnekleri farklı hastalarda aynı anda, doku ve istihdam ve böylece durumlarda14büyük bir dizi tek tip analizi teşvik reaktifler minimize analiz edilebilir. Ancak, iletişim kuralı yok eşzamanlı yüksek üretilen iş moleküler karakterizasyonu farklı olarak arşivleme işleme reaktifler, fiksasyon kez ve koruma yöntemleri istihdam, böyle açısından uygulanan birden fazla doku örnekleri için kullanılabilir. blok.

HER2 kayma heterojenite prognostik ve klinik etkileri meme kanserlerinin göz önüne alındığında, biz heterogeneously işlenmiş durumda büyük dizi değerlendirmek için entegre bir moleküler platform geliştirilmiştir. Burada, biz üretmek ve yüksek verimli ayarlayınca içinde HER2 amplifikasyon meme kanseri içi tümör heterojen SISH aracılığıyla analiz laboratuvar stratejileri tasvir. Aşağıdaki iletişim kuralı ölçme tümörler için geliştirilen > 5 mm (> pT1b göre TNM 2017)17. Daha küçük lezyonlar için tam yüz seri bölümlerde çözümlemesini öneririz. Prosedürü her servis talebi için 6 farklı alanlara (aralığı 4-8) ortalaması kapsayan 30 meme kanserlerinin eşzamanlı IHC ve SISH analizi için izin verir. Özet olarak, 1 mm çapında, çekirdek ve kılavuz ve kenarları arasında 2 mm arasında 500 µm ile 180 doku çekirdek her TMA bloğu için oluşturulur.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

Bu çalışmada IRCCS CA'dan kurumsal inceleme kurulları tarafından kabul edildi ' Granda Vakfı, Policlinico hastane, Milan, İtalya.

1. hasta ve doku örnekleri seçkisi

  1. Tüm kullanılabilir Hematoksilen ve Eozin (H & E) ve özgün tanıdan IHC slaytlar dahil olmak üzere analiz edilecek, tüm servis talepleri arşivleme slaytlar almak ve varsa, bir H & açısı neoplastik olmayan meme dokusu (örneğin, cerrahi kenar boşluğu) bahisler .
  2. Büyük değerlendirmeleri gerçekleştirin.
    Not: Bu görev için meme patoloji deneyimi ile en az iki patolog tanı slaytlar tartışmak ve anlaşmazlıklar collegially çözebilirsiniz. Geleneksel mikroskop veya (çok merkezli çalışmalar ikinci lehine) telepathology araçları kullanın. Varsa, tüm uyumsuz durumlarda hariç.
    1. Histolojik yeniden sınıflandırma18meme tümörleri Dünya Sağlık Örgütü (WHO) sınıflandırılması son sürümü göre tüm vakaların gerçekleştirin.
    2. Her durumda için normal doku arşivleme klinik örneklerinde varsa en az bir neoplastik olmayan terminal lobular duktal birim oluşur emin olun.
    3. Türdeş olmayan göstermek tüm neoplastik alanları belirlemek saytolojik, mimari, veya (ortaklaşa bir patolog ve ayarlayınca inşa technician(s) tarafından gerçekleştirilecek) alan parlak mikroskop kullanarak IHC özellikleri.
  3. Ayrık topografik alanları cam slayt üzerinde bir marker ile veya bir dijital slayt yazılımı (şekil 1A) uygun aracı ile vurgulayın.
  4. Seçili slaytlar üzerinde bağlı olarak, karşılık gelen FFPE blok arşivlerinden almak.
    Not: TMA en iyi duruma getirmek için inşaat, doku tükenmesi önlemek için ve TMA korumak için yumruk yapısal bütünlük, servis talepleriyle < 1 mm kalınlığında kalan doku hariç.

2. tasarım ve Kononen tekniğine göre ayarlayınca oluşturmak

  1. Oluşturma ve her örneğinin farklı bölgelerin kayıtlarını içeren yeni bir elektronik tablo dosyasını açın. Tablo 1'olarak ayrı sütunlarda aşağıdaki verileri içerir: durum kimliği, blok kimliği, alan kimliği, doku türü (örneğin, normal doku, invaziv bileşeni histotype, situ bileşen histotype), topografya (örneğin, tümör çekirdek, invaziv açık), Morfoloji (örneğin, nükleer grade, mimari, mitoses, saytolojik özellikleri), biyolojik durumu (Yani, östrojen reseptör (ER), progesteron reseptör (PR), Ki67 ve HER2) ve tüm diğer IHC özellikleri kullanılabilir.
    1. Belgeyi kaydedin.
  2. TMA projesi oluşturun.
    1. Yükleyin ve TMA tasarımcı yazılımını açın.
    2. TMA alıcının block(s) tanımlamak: erişim menüsünden Dosya > Yeni > blok veya CTRL + b kullanarak
    3. Doldurun veya SEKME tuşuna basın ve parafin blok boyutları yazın ilk alanını tıklatın: Genişlik 35 (mm), yükseklik (mm) 20. Tip "2" "marj" değeri (Yani, mm parafin kenara uzaklığı) olarak (şekil 1B). Uygun düğmesini tıklatarak verileri kaydetmek. Yeni şablon alıcı blok / şimdi kaydedilir ve yeni doku dizi şablonlarında kullanılmak üzere hazır.
    4. Bir doku dizi projesi oluşturun: Dosya menüsüne erişim > New > doku dizi veya CTRL + t kullanarak
    5. Doku dizi, yorum ve yazar adına doldurmak, o zaman tıkırtı "En yakın." "Alma" simgesini tıklatın, alıcı blok önceden oluşturduğunuz şablon dosyası seçin ve "next" tıklayın
    6. 1 mm yuvarlak düğmesini tıklatarak nokta boyutunu seçin. 500 µm olarak komşu noktalar iki merkez arasında boşluk olan nokta aralığı seçin. 231 olması gereken noktaların oluşturulan, toplam sayısını hesaplamak için hesap makinesi simgesini tıklatın. "İleri" düğmesini tıklatın
    7. Spot numaralandırma modu bir kez tıklayarak tanımlayın. Düğmesini tıklatın "tanımlamak" Izgaralar ve alt Izgaralar oluşturmak için. Ana damar (satır 6) silmek ve 8 ve 15 sütun. 3 sıraya oryantasyon 1 satırının korumak. Son harita Toplam 183 noktalar, Şekil 2' de temsil edilen kapsayacak.
    8. Doku türlerinin listesini tanımlayın: erişim menüsünden Dosya > Yeni > listesi doku türleri veya CTRL + l kullanarak
    9. Önceden tanımlanmış doku açıklamaları ekleyin. Aşağı ok tuşuna basın veya tıklatın bir satır eklemek için + düğmesine.
    10. Proje tanımlayın: erişim menüsünden Dosya > Yeni > Booster proje veya CTRL + s. kullanarak
    11. Doku dizi, yorum ve yazar adına doldurmak, o zaman tıkırtı "En yakın." Elektronik tablo dosyası, doku türlerinin listesi ve daha önce uygun simgelerini tıklatarak oluşturulan doku dizi modelini alın.
    12. "Tümünü Seç" seçeneğini tıklatın ve her doku türü için noktaların sayısını tanımlayın; ayarları uygulamak için "match" butonuna tıklayın. Örneklenmiş ve bu projede alıcı blok transfer çekirdek toplam sayısı listeleyen bir tablo görüntülenir. Projeyi kaydedin ve programı kapat.
  3. Alıcısı block(s) (şekil 1B) hazırlayın.
    1. Temizlenmiş metal kalıplar 65 ° C'de elastomerli parafin ile doldurmak
    2. Parafin blok gecede metal kalıplar içinde oda sıcaklığında soğumaya bırakın.
    3. Parafin blok metal kalıplar ayıklayın. Çatlak oluşursa, blok atmak ve adımları 2.3.1-2.3.3 tekrarlayın.
  4. Bir otomatik veya yarı otomatik arrayer19kullanarak TMA oluşturmak.
    1. Tüm seçili FFPE bloklar ve ek açıklamaları karşılık gelen H & E bölümlerle almak.
    2. Arrayer üzerinde açmak ve alıcısı block(s) arrayer atlıkarınca ekleyin.
    3. Arrayer kontrol istasyonu yazılımı açın, "Yeni doku dizisinin"'ı tıklatın ve önceden oluşturulmuş proje (şekil 1 c) yükleyin.
    4. "Devam" ı tıklatın ve donör block(s) konumunu seçin.
    5. Alıcı blokların üzerine başlangıç yerini tanımlar: alıcı blok parafin sol üst kenarında ile hizalayın ve lazer ışığı taşımak için ok tuşlarını kullanın.
    6. "Next" butonuna tıklayın ve dikey hizalama için yineleyin.
    7. "Sonraki" otomatik olarak alıcı (alıcısı) blok önceden tanımlanmış koordinatıyla bir delik oluşturmak için tıklatın.
    8. Yumruk boş.
    9. Örnekleme için donör bloğu getirin ve ilgi alanı daha önce Açıklama eklenmiş bir doku göbeğini çıkarın.
    10. Donör doku çekirdek alıcı (alıcısı) blok deliğe yerleştirin.
    11. Donör blok arrayer kaldırın.
    12. TMA tamamlanıncaya kadar adımları 2.4.5-2.4.11 tekrarlayın.
  5. Yeni oluşturulan TMA blok doku tarafında steril bir boş slayt üzerinde koymak ve 5 min için 45 ° C'de laboratuvar fırında yerleştirin.
  6. Yavaşça 5 için slayt üzerinde blok basın s doku çekirdek düzleştirmek için. Bir kez (Toplam 2 kez) için işlemi yineleyin.
  7. TMA blok slayt ile birlikte Kaldır fırın, onları çevirmek ve yavaşça slayt bloğundan bağlantısını kesin.
  8. Kapak ince bir tabaka halinde 65 ° C'de elastomerli parafin ile TMA doku yüzey
  9. TMA blok 2 h için oda sıcaklığında bırakın.
  10. TMA blok 24 h için 4 ° C'de aktarın.
    Not: TMA blok 4 ° C'de tükenme kadar saklanır.

3. histochemical ve immunohistokimyasal analizleri

  1. TMA bölümleri kestim.
    1. TMA alıcısı block(s) parafin tarafı parafin chill için 10 dakika için bir-10 ° C yüzeye yerleştirin.
    2. Flotasyon banyo ultrasaf su ile doldurun ve ısı 38 ° C'ye ayarla
    3. Yeni bir bıçak üzerinde döner bir microtome ve mum blok bıçak yüzleri ve dikey düzlemde hizalanmış blok microtome chuck yerleştirin.
    4. Blok dikkatle bıçakla yaklaşım ve konumlandırma doğru olduğundan emin olmak için birkaç ince kesitler kesti; gerekirse ayarlayın.
    5. 3 µm kalınlığında bölümleri kestim.
    6. Cımbız kullanarak bölümleri seç ve onları su banyosu yüzeyinde float.
    7. Su banyosu düzenli ve IHC/ISH cam slaytlara bölümleri seç.
    8. Slaytları bir rafa yerleştirin ve 45 ° C fırında gecede depolayabilirsiniz.
      Not: bir kez hazırlanan, TMA bölümleri içinde 24 h lekeli.
  2. Histochemical (H & E) Boyama gerçekleştirmek bir autostainer kullanarak.
    1. Slaytları autostainer rafa takın ve 10 dk 60 ° C'de yer onları.
    2. Autostainer ve TMA ile raf bir yük istasyonları dışa doğru bakan bir standart H & E klibi ile slaytlar ekleme yük çekmece açın.
    3. Bir kez çekmeceyi kapalı, klibi otomatik olarak sistem tarafından tanınması ve aşağıdaki protokol başlayacak: fırın istasyonunda 37 ° C (6 dk), Ksilen (2 dk), Ksilen (2 dk), etanol %100 (2 dk), etanol %100 (2 dk), etanol %95 (2 dk), etanol %95 (2 dk) , distile su (4 min), Carazzi'nın Hematoksilen (9 dk.), alçak basınç akan su (2 dk), Eozin %1 (1 dakika), alçak basınç akan su (2 dk), etanol %95 (20 s), etanol %95 (20 s), etanol %95 (20 s), etanol %95 (20 s), etanol %100 (15 s), etanol %100 (15 s) , Ksilen (30 s), Ksilen (30 s).
    4. Raflar çekmeceyi gelen numarayı boşaltıp bir kapak notu ile slayt monte.
      1. Bir pipet ile monte bir damla toplamak ve kapak slayt dış kenarındaki koydu.
      2. Islak yan kapak slip slayt üzerinde yerleştirin ve 30 dk için Kuru Dağı izin.
  3. ER, halkla ilişkiler, Ki67 ve HER2 için IHC boyama gerçekleştirmek otomatik bir immunostainer kullanarak.
    Not: Boyama koşuya başlamadan önce sistemi, başlatmak ve sarf malzemeleri reaktif şişe (Tablo reçetesi) kontrol ve kapsayıcılar atık.
    1. 10 dk 60 ° C'de çözümlenecek TMA slaytlar yerleştirin.
    2. İmmunostainer enstrüman ve yazılım başlatın.
    3. Giriş Görünümü, iletişim kuralları düğmesini tıklatın ve Oluştur/Düzenle iletişim kuralları'ı tıklatın.
    4. Standart DAB seçin (3, 3'-diaminobenzidine) IHC yordamı temel şablonunu değiştirmek için.
    5. "Deparaffinization" kutu listesinde bayrak ve 72 ° C'de orta sıcaklık ayarla
    6. Cc1 maskesinin çözüm bayrak, orta sıcaklığı 95 ° C ve kuluçka saat 36 dk olarak belirlenmiştir.
    7. Birincil antikor kutusu bayrak (araç yazılım dağıtıcısı reaktif atlıkarınca üstünde-ecek tanımak) ER satır içi Dağıtıcı kimliği eklemek ve kuluçka saat 16 dk az ayarla.
    8. Counterstaining kutusu bayrak, Hematoksilen seçin ben ve set 12 dk kuluçka anda.
    9. "Farklı Kaydet" düğmesini tıklatın ve protokolün adı.
    10. Adımları 3.3.3-3.3.9 kullanarak aşağıdaki birincil antikorlar kuluçka kez kalan antikorlar için yineleyin: PR 16 dk, Ki67 16 dk ve HER2 12 dk. önceden seyreltilmiş için kullanıma hazır (RTU) antikorları kullanın.
    11. Giriş Görünümü etiket Oluştur düğmesini tıklatın.
    12. İletişim kuralları düğmesini tıklatın ve ER, halkla ilişkiler, Ki67 ve HER2 iletişim kuralları her TMA analiz etmek için ekleyin.
    13. Yakın /Print düğmesini tıklatın.
    14. Etiket şablon açılır gibi TMA kimlikleri etiketini girin.
    15. Etiketleri yazdırmak ve ardından onları TMA slayta uygulamak için Yazdır düğmesini tıklatın.
    16. Araç simgesini tıklatın ve araç başlangıç modunu "Hazır" olarak ayarlayın.
    17. Reaktifler atlıkarınca kapsar başlık açmak, algılama sistemi yerleştirin ve birincil antikorlar, başlık kapatın.
    18. Bir slayt çekmece açmak, TMA slaytlar yük ve aynı düğmesini tıklatarak çekmeceyi kapatmak için açık düğmesini tıklatın.
    19. Olarak "çalışan" enstrüman başlangıç modunu ayarlayın ve yönergeleri izleyin.
    20. TMA tamamlanan slaytlar düğmesini slayt denetim cihazda ve durulama açık tüm Çekmeceli basarak slayt çalışma, unload sonunda onları içinde kalan herhangi bir reaktifler kaldırmak için sabunlu su sıcak.
    21. Slaytları düşük basınçlı soğuk akan suyun altında yıkayın, TMA slaytlar kurutmak ve cam coverslip her slayta uygulamak.
  4. ER, halkla ilişkiler ve HER2 IHC analizini gerçekleştirmek Amerikan Derneği, klinik Onkoloji (ASCO) takip / kep yönergeleri ve Ki67 meme kanseri çalışma grubu (Tablo 2) Uluslararası Ki67 önerilerine göre.
    Not: Bu analiz ayrı ayrı ayrı doku sıralarda meme patoloji bir deneyimi olan bir patolog tarafından gerçekleştirilmelidir.
    1. ER ifade ≥ % 1'tümör hücre çekirdeği immunoreactive20,21,22,23ise pozitif olarak değerlendirmek.
    2. PR ifade ≥ % 1'tümör hücre çekirdeği immunoreactive20,21,22,23ise pozitif olarak değerlendirmek.
    3. HER2 ifade olarak değerlendirmek: a) puanı 3 + Eğer çevresel membran tam ve yoğun, boyama b) puanı 2 + çevresel membran boyama eksik ve/veya zayıf/orta ise ve > %10 invaziv tümör hücreleri veya tam içinde ve çevresel membran boyama yoğun ve ≤ % 10 içinde invazif tümör hücrelerinin c) 1 + eksik membran boyama zayıf/ancak algılanabilir ise ve invaziv tümör hücrelerinin d > %10 içinde puan) hiçbir boyama varsa negatif veya membran Boyama eksik ve zayıf/ancak algılanabilir ve ≤ içinde invazif tümör yüzde 10'u3,24hücreleri.
    4. Nükleer en az 1.000 neoplastik hücrelerde rasgele boyama ile hücre yüzdesi üzerinde 10 yüksek güç alan (büyütme, 400 X) seçilen olarak Ki67 dizin değerlendirmek25.

4. HER2 SISH analizi

  1. TMA bölümler (adımı yineleyin 3.1) kesti.
  2. Otomatik bir immunostainer kullanarak SISH HER2 için gerçekleştirin.
    1. 10 dk 60 ° C'de çözümlenecek TMA slaytlar yerleştirin.
    2. İmmunostainer enstrüman ve yazılım başlatın.
    3. Giriş Görünümü, iletişim kuralları düğmesini tıklatın ve Oluştur/Düzenle iletişim kuralları'ı tıklatın.
    4. Temel şablonunu değiştirmek için "U çift ISH CKT" yordamı seçin.
    5. Kutu listesinde "Kurutma" bayrak ve 20 dk 63 ° c sıcaklık ayarla.
    6. "Hücre Merkezi Klima" kutusu listesi, o zaman "hücre Merkezi Klima CC2", bayrak ve 4 dk. 86 ° C ve kuluçka zaman sıcaklığı ayarlamak.
    7. CC2 hafif (döngüsü 1), standart (döngüsü 2) ve genişletilmiş (döngüsü 3) 8 dk, 12 dk ve 8 dk için sırasıyla bayrak.
    8. Kutu listesinde "Ish-proteaz 3" bayrak ve kuluçka saat 16 dk az ayarla.
    9. HER2DNP ve CHR17DIG sondalar seçin ve kuluçka süresi 6 h olarak ayarlayın.
    10. 8 dk. 76 ° C'de yıkama ayarlayın.
    11. SISH multimer (SIL ISH DNP HRP) kuluçka saat 32 dk az ayarla.
    12. Gümüş Kromojen (SIL ISH DNP CHRC) kuluçka süresi 4 dk ayarlayın.
    13. Kırmızı multimer (kırmızı ISH KAZMAK AP) kuluçka süresi 24 dk az ayarla.
    14. Kırmızı Kromojen (kırmızı ISH KAZMAK FR) kuluçka süresi 8 dk ayarlayın.
    15. Bayrak "Counterstaining" kutu listesindeki "HEMATOKSİLEN II" seçin ve kuluçka süresi 8 dk ayarlayın.
    16. Bayrak "Counterstaining" kutu listesinde sonrası "MAVİLEŞTİRME reaktif" seçin ve kuluçka süresi 4 dk ayarlayın.
    17. 3.3.11-3.3.15 gelen adımları tekrarlayın (select değiştirilmiş U çift ISH CKT Protokolü).
    18. Açık reaktifler atlıkarınca kapsar hood çamaşır ve ISH tespit sistemleri yer, o zaman başlık kapatın.
    19. 3.3.18-3.3.21 gelen adımları yineleyin.
  3. HER2için SISH çözümlemesi: HER2/CEP17 oranı ≥2.0 ile bir ortalama HER2 kopya numarası ≥4.0 sinyaller hücre başına ise HER2 gene amplifikasyon olumlu olarak değerlendirmek ve HER2/CEP17 oranı ise negatif < 2.0 ortalama HER2 numarasını kopyalayın < 4.0 sinyalleri/hücre3,24.
    Not: IHC benzer, bu analiz ayrı ayrı ayrı doku sıralarda meme patoloji deneyimi olan bir patolog tarafından gerçekleştirilmelidir.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

Genel olarak, 444 invaziv meme kanserleri özellikle ISH analizleri için en iyi duruma getirilmiş 15 ayarlayınca dahil. Örnek 2,664 noktalar arasında 2,651 (%99,5) daha önce seçilen alanların temsilcisi idi ve bu nedenle daha sonraki analizler için mükellef kabul. İçi tümör heterojenite IHC ve SIH, ile tümör topografik farklı alanlarında HER2-pozitif klonların heterojen dağılımları özel bir odaklanma ile tespit edilmiştir. Tablo 3 ER, halkla ilişkiler, Ki67 ve HER2 durum farklı histotypes içinde odaklanan analiz, olguların biyolojik özellikleri gösteriyor. Özellikle, olguların % 18 HER2-pozitif hücreler görüntüler bulundu > tümör hücrelerinin % 10 ve bu nedenle HER2 pozitif değerlendirmesi için özellikleri eşleştirdi. İlginçtir, bu değer daha düşük bildirilen görülme oranı aralığı HER2-pozitif meme kanserlerinin sonuna kadar yakındır. Öte yandan, değişken HER2-negatif ve HER2-pozitif meme kanseri (şekil 3, Tablo 4), meme kanseri, son derece heterojen bir hastalıktır kavramına sağlayan daha fazla itimat alanlarında bulunsalar HER2 durumu oldu genomik düzeyi. SISH analiz başarısızlık oranı % 0.8, dinitrophenol öğesini sonda hedef sıraları bağlı 2,629/2,651 noktalar toplam sayısı ile yapıldı.

Figure 1
Resim 1 : Temel taşı gösterimi aşama gerçekleştirilmesi konusunda yüksek üretilen iş platformu HER2 heterojenite meme kanserlerinin büyük birlik içinde çözümlenmesi için. Örnek alanlar yelpazesi(a)kimlik ve ile tüm alanlarda vurgulamak içermelidir saytolojik, mimari, veya IHC heterojenite. Verilen bu bile bir mikroskopik çatlak sonraki in situ hibridizasyon analizleri tutarlılığını sonucuna (B) bu en önemli adımlardan bir yordam, bir yüksek-nitelik alıcısı blok oluşturulmasıdır. (C) bir dijital olarak destekli arrayer yüksek verimli TMA Kononen tekniğine dayalı oluşturmak için 1 mm çaplı iğne ile istihdam önemlidir. (D) TMA projenin oluşturulması boyutları tanımını ve TMA sınırları başlayacaktır. (E) tüm IHC ve ISH analizleri TMA arasında hızlı bir şekilde gezinmek için dijital patoloji araçları kullanılarak gerçekleştirilmelidir. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 2
Resim 2 : Planimetric bu iletişim kuralı için fark TMA gösterimini. Toplam 180 noktalar 1 mm çapında, 500 µm ayrı, bir en iyi in situ hibridizasyon için izin. Daha yoğun ayarlayınca tek-nokta olarak daha yüksek bir başarısızlık oranı ile tüm noktalar arasında genel kalite ve düzgünlüğü tepkileri açısından verimsiz sonuçlar sağlar. "Yönlendirme" noktalar içinde ve orta-sol üst kılavuz unutmayın. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Figure 3
Şekil 3 : Gümüş gösterilen temsilcisi Filmler situ hibridizasyon analizi HER2-heterojen bir meme kanseri. Paradigmatik Örneğin, yüksek kaliteli invaziv meme kanseri yok özel türü (BR_121) iki farklı noktalar (kırmızı) centromeric numaralandırma sonda 17 karşılaştırıldığında HER2 gen (siyah) güçlendirme açısından farklı sonuçlar gösterdi. Özellikle, tümör çekirdeğe ait ve cytokeratin 7 düzensiz desen boyama HER2 güçlendirilmiş olduğunu gösteren bir alan(a)(Yani, tümör kenar) invaziv önden tek bir nokta ise vahşi tipi HER2 görüntülenen desen (B). Ölçek çubukları 50 µm (insets içinde 20 µm) =. Bu rakam daha büyük bir versiyonunu görüntülemek için buraya tıklayınız.

Servis talebi numarası Blok numarası Alan kimliği Doku Topografya Morfoloji ACİL SERVİS PR Ki67 HER2 Diğer IHC özellikleri
BR_121 A5 bir Normal Cerrahi kenar boşluğu
BR_121 A1 bir NST Tümör çekirdek G2 CK7 +
BR_121 A1 b NST Tümör çekirdek G3 + /-CK7
BR_121 A3 bir NST Tümör çekirdek Müsinöz stroma 90 100 12 2 +
BR_121 A3 b NST İnvaziv açık Borulu 100 100 35 2 +
BR_121 A4 bir NST İnvaziv açık G3
BR_121 A3 c DCIS (EIC +) Bitişik invaziv açık Yüksek dereceli 100 100 45 2 +

Tablo 1: bir olgu çalışmaya dahil temsilcisi rekor. Bu durum (BR_121) türünden bir alt borulu bileşen lezyon çevre ve düzensiz odak kaybetme-in CK7 immunoexpression gösterilen hiçbir özel odak myxoid stroma, yüksek kaliteli bir invaziv Karsinomu oldu. Tanı anında yapılan analizler raporlama, biyolojik dahil olmak üzere immunohistokimyasal özellikleri belirtir. NST, invaziv Karsinomu hiçbir özel türü; DCIS, içinde in situduktal Karsinom; EIC +, geniş Intradüktal bileşen; CK7, cytokeratin 7.

Marker Klon Şirket Seyreltme Mum eritme Antijen alma Antikor kuluçka Puanlama sistemi
ACİL SERVİS SP1 Ventana RTU EZ hazırlık 72 ° c cc1 95 ° c için 36 dk 16 dk ASCO/kapak yönergeleri23
PR 1E2 Ventana RTU EZ hazırlık 72 ° c cc1 95 ° c için 36 dk 17 dk ASCO/kapak yönergeleri23
HER2 4B5 Ventana RTU EZ hazırlık 72 ° c cc1 95 ° c için 36 dk 18 dk ASCO/CAP kuralları3
Ki67 30-9 Ventana RTU EZ hazırlık 72 ° c cc1 95 ° c için 36 dk 12 dk Uluslararası Ki67 çalışma grubu önerileri25 Meme Kanserinde

Tablo 2: antikorlar, klonlar, dilutions, antijen alma yöntemleri ve immunohistokimyasal analizleri için kabul edilen skorlama sistemleri listesi. ER, östrojen reseptör; PR, progesteron reseptör; RTU, kullanıma hazır.

Histotype n (%) ER + (%) PR + (%) Ki67-düşük (%) Ki-67-yüksek (%) HER2 + (%)
Özel tür invaziv Karsinomu 344 (77.5) 301 (87,5) 257 (74,7) 85 (24,7) 259 (75.3) 71 (20,6)
İnvaziv lobular Karsinomu 53 (11,9) 53 (100.0) 44 (83.0) 36 (67.9) 17 (32.0) 4 (7,5)
İnvaziv Karsinomu, karışık-türü 9 (2.0) 8 (88.9) 6 (66,7) 0 (0.0) 9 (100.0) 1 (11,1)
Tübüler Karsinom 8 (1,8) 8 (100.0) 8 (100.0) 8 (100.0) 0 (0.0) 0 (0.0)
Müsinöz Karsinomu 11 (2,4) 11 (100.0) 9 (81.8) 7 (63.6) 4 (36.4) 0 (0.0)
Micropapullary Karsinom 7 (1.6) 7 (100.0) 7 (100.0) 5 (71.4) 2 (28,6) 2 (28,6)
Apokrin featueres olan invaziv karsinoma 5 (1.1) 3 (60.0) 1 (20,0) 1 (20,0) 4 (80.0) 3 (60.0)
Papiller Karsinomu 1 (0,2) 0 (0.0) 0 (0.0) 0 (0.0) 1 (100.0) 0 (0.0)
Medüller Karsinomu 4 (0,9) 0 (0.0) 1 (25.0) 0 (0.0) 4 (100.0) 0 (0.0)
Metaplastic Karsinom 2 (0,5) 0 (0.0) 0 (0.0) 0 (0.0) 2 (100.0) 0 (0.0)
Toplam 444 391 (88.0) 333 (75.0) 142 (32.0) 302 (68.0) 81 (18,2)

Tablo 3: meme kanseri histotypes, reseptör durumu ve HER2 heterojenite durum. ER, östrojen reseptör; PR, progesteron reseptör; Ki67-düşük, Ki67 dizini < %18; Ki67-yüksek, Ki67 > % 18.

Yorumlanabilir neoplastik noktalar HER2-olumlu noktalar (%) Hormon reseptörleri durumu HER2 türdeş olmayan durumlarda
6 5 (83) pozitif 10
6 5 (83) negatif 1
6 4 (67) pozitif 7
6 4 (67) negatif 1
6 2 (33) negatif 1
6 1 (17) pozitif 1
5 3 (60) pozitif 10
5 1 (20) pozitif 2
4 3 (75) pozitif 9
4 2 (50) pozitif 8
4 1 (25) negatif 1
3 2 (67) pozitif 5
3 1 (33) pozitif 2
46 25 (54) 53 (93) 57

Tablo 4: HER2 ifade, hormon reseptör durumu ve HER2 türdeş olmayan durumlarda. 57 HER2 türdeş olmayan olgular arasında 4 (% 7) durumlarda ER negatif ve PR-olumsuz, HER2 heterojenite değerlendirmek klinik önemini teyit edildi.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

Burada, SISH çözümlemesi HER2 gen ve onun karşılık gelen şeması içinde heterogeneously işlenmiş meme kanserlerinin yüksek verimli ayarlayınca yapma laboratuvar stratejileri ayrıntılı olması. Bu yöntem düşük maliyetli ve HER2 gene amplifikasyon heterojenite büyük tabur meme kanserleri alındı formu patoloji arşivlerin incelenmesi için çoğu laboratuarlarında yürütülen olabilir.

Meme kanseri ve türdeş olmayan ifade tarafından oluşturulan zorluklar test klinik önemi HER2 nedeniyle, içi - ve arası - tumor HER2 genetik heterojenite değerlendirmek için bir yüksek üretilen iş test protokol geliştirdik. Analiz alanlar belirli saytolojik, mimari ve IHC özellikleri temelinde önceden invaziv ve invaziv bileşenleri içerir.

Bu protokol için dikkatli bir şekilde yönetilmelidir birkaç kritik aşama vardır. Bir temel adım faiz bölgelerinde seçimidir. Çok disiplinli bir yaklaşımla topografik farklı alanların ek açıklama son moleküler analiz kalitesini garanti etmek için çok önemli olduğunu belirledik. Özellikle, ortak gözden geçirme tanılama slaytların bir patolog tarafından gerçekleştirilen ve bir teknisyen son derece yeterli noktalar (Yani, slayt üzerinde tanımlanan alan yansıtan noktalar) sayısını artırmak ve daha sonra başarısızlık oranını azaltmak Tek-noktalar analizi. Ancak, birden çok IHC ve ISH analizleri seri bölümler sonra birkaç tümör lekeler kaybolmuş olabilir. Hiç uygun doku kullanılabilirliğine göre bu rahatsızlık üstesinden gelmek için biz yinelenen ya da nüsha, ayarlayınca oluşturmak öneririz. Ayrıca, biz alıcısı FFPE blok oluşturmak için ayarlayınca için sıkı laboratuvar Yordamlarý tanımlama önemini vurgulayın. Nitekim, TMA blok içinde en az bir çatlak kalite, tekrarlanabilirlik ve reaksiyon netlik açısından tüm ISH analiz sonucuna gözlemledim. Çatlak oluşursa, donör blok TMA inşaat için göz ardı. Bu, ancak, IHC bile suboptimal ayarlayınca gerçekleştirilebilir ve teknik sorunlar böyle analizi sırasında izine rastlanmadı Deneyimlerimize göre gözlenen kabul.

Rağmen bu protokolü özellikle yüksek verimli meme ayarlayınca HER2 SISH analizleri için optimize edilmiştir, Balık ve IHC, gibi diğer analizleri yukarıda açıklanan14olarakgüvenilir birkaç doku türlerinde yapılabilir notu ise, 19,26. Ancak, burada noktalar ideal sayıda ve yüksek kaliteli ve tekrarlanabilir SISH analizleri HER2 gen meme kanseri örnekler içinde emin olmak için TMA topografik karakteristik tanımladınız. Başka bir önemli nokta'nın standart automatized SISH iletişim kuralları yeniden şekillendirilmesi tarafından çözümlenmesi için birden fazla örnekleri özelliği eşleşecek şekilde temsil edilir. Nitekim, üreticilerin yönergeleri genellikle geleneksel tam yüz bölümleri moleküler analiz için yapılır ve bu nedenle heterogeneously işlenmiş doku örnekleri, yüksek standartları gibi ayarlayınca içinde arşivleme FFPE blok ulaşmak mümkün değildir. Bu amaçla, biz bu sorunlu örneklerdeki SISH analizleri için güvenilir bir özelleştirilmiş protokolü, adım adım açıklamasını sağladı.

Heterojenite gen amplifikasyon Meme Kanserinde klinik olarak dava diğer moleküler biyolojik türdeş olmayan dağılımı açısından ve HER2 ifade keşfetmek son derece faydalı olacaktır. Bu amaçla, bizim yöntem diğer klinik moleküler analizleri, matris yardımlı lazer desorpsiyon/iyonlaşma kütle spektrometresi görüntüleme (maldı-MSI)27için geçerliliğini keşfetmek için daha fazla translasyonel araştırma çalışmaları ihtiyaç vardır. Son zamanlarda, zorlu da olsa yönetimi maldı-MSI analiz için FFPE dokuların mümkün olmuştur. Bu situ proteomik teknik proteinler ve peptidler meme kanseri dahil patolojik doku bölümlerde kayma dağılımını görselleştirme sağlar.

Bu iletişim kuralının potansiyel ile son tahlilde etkileyebilir birkaç önemli adımlar vardır. HER2 amplifikasyon temel farklı mekanizmaları doğru ilk, belirli dikkat edilmeli. Örneğin, Kromozom 17 polysomy meme kanseri11artan HER2 kopya sayısı için iyi bilinen bir alternatif mekanizma temsil eden, ortaya çıkabilir bir genetik sapma olur. Bu durum, gerçi değil sık, sadece kanser biyolojik özellikleri ve hasta yönetimi aynı zamanda ISH analizleri etkileyebilir. İkinci olarak, bu içi tümör genetik heterojenite da bir tek hücre düzeyinde ve sadece farklı neoplastik alanlarda ortaya tanımlanmıştır. Bu iletişim kuralı tam yüz bölümlerine göre belirli bir koşula algılama gücünü artırmak mümkün değil. Ayrıca, kayma heterojenite TMA tabanlı çalışma tüm bölümü kapsamlı bir analiz eksikliği de dahil olmak üzere bazı içsel sınırlamaları olduğunu vurgulamak önemlidir. Bu çalışma, ancak, bir kanıt-- HER2 gene amplifikasyon heterojen standart laboratuvar donanımları kullanarak bir yüksek işlem hacmi ve düşük maliyetli platform aracılığıyla, değerlendirilebilir prensibi düşünülmelidir. Daha fazla çalışmaları seri tam yüz bölümleri üstün moleküler çalışmalar ve hastaların klinik veri ile birleştiğinde HER2 türdeş olmayan olguların analiz bu protokolü doğrulamak için gereklidir.

Sonuç olarak, türdeş olmayan HER2 meme kanseri numuneler statüsünde HER2 kapsamlı haritalama ve potansiyel sürücü Genetik mutasyonlar HER2-negatif bileşenlerindeki soruşturma birden fazla neoplastik bölgesi analizine yararlanmalıdır. Bu analiz dayanılmaz maliyeti ve standart tanı olanakları yardımıyla çabalar gerektirir. Bu yöntem birden çok büyük kümeleri ve heterogeneously işlenmiş meme kanserleri genetik heterojenite HER2 eşzamanlı karakterizasyonu için güvenilir bir araç temsil eder.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Yazarlar çıkarlarının çakışma var.

Acknowledgments

Hiçbiri.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Surgipath Paraplast Leica Biosystems, Wetzlar, Germany, EU 39601006 Tissue embedding medium, 56 °C melting point
Eosin Y  1% water solution Bio Optica, Milan, Italy, EU 510002 Eosin yellowish, water-soluble
Carazzi’s hematoxylin Bio Optica, Milan, Italy, EU 506012 Alum hematoxylin ripened using potassium iodate
Diamond quality Laboindustria, Arzergrande, Italy, EU 33533 26x76 mm microscope slides
Leica CV Mount Leica Biosystems, Wetzlar, Germany, EU 14046430011 Mounting medium, with no monomers, based on polymers of butylmethacrylate in xylene
FLEX IHC microscope slides Agilent Technologies (Dako),  Santa Clara, CA, USA K8020 Coated microscope slides for adhesion of FFPE for use in IHC
BenchMark ULTRA Ventana medical system, Tucson, AZ, USA N750-BMKU-FS Slide staining system
CONFIRM anti-Estrogen Receptor (ER) (SP1) Rabbit Monoclonal Primary Antibody Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 790-4324 Primary antibody, ready-to-use
CONFIRM anti-Progesterone Receptor (PR) (1E2) Rabbit Monoclonal Primary Antibody Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 790-2223 Primary antibody, ready-to-use
CONFIRM anti-Ki-67 (30-9) Rabbit Monoclonal Primary Antibody Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 790-4286 Primary antibody, ready-to-use
PATHWAY HER2 (4B5) Rabbit Monoclonal Primary Antibody Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 790-4493 Primary antibody, ready-to-use
ultraView Universal DAB Detection Kit Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 760-500 Indirect, biotin-free system for detecting mouse IgG, mouse IgM and rabbit primary antibodies
INFORM HER2 Dual ISH DNA Probe Cocktail Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 780-4422 INFORM HER2 Dual ISH assay - Dual color in situ hybridization FDA approved automated assay for determining HER2 gene status in breast cancer patients 
ultraView Silver ISH DNP Detection Kit Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 800-098
ultraView Red ISH DIG Detection Kit Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 800-505
ISH Protease 3 Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 780-4149 Used in the ISH process to remove protein that surrounds the target DNA sequences of interest
Hematoxylin Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 760-2021 Modified Gill's hematoxylin counterstain reagent
Hematoxylin II Counterstaining Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 790-2208 Modified Meyer's hematoxylin counterstain reagent
Bluing reagent Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 760-2037 Aqueous solution of buffered lithium carbonate for bluing hematoxylin stained sections on glass slides
HybReady Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 780-4409 Formamide-based buffer for ISH assays
EZ Prep (10x) Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 950-102 Concentrate solution for paraffin removal from tissue samples during IHC and ISH reactions, and to dilute 1:10.
SSC Buffer (10X) Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 950-110 Sodium Chloride Sodium Citrate buffer solution is used for stringency washes and to rinse slides between staining steps and provide a stable aqueous environment for the in situ hybridization reactions. Dilute 1:5.
ULTRA LCS Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 650-210 Prediluted (ready-to-use) coverslip solution used as a barrier between the aqueous reagents and the air to prevent evaporation in the IHC and ISH reactions
Reaction Buffer (10x) Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 950-300 Tris based buffer solution (pH 7.6 ± 0.2) to rinse slides between staining steps during IHC and ISH. Dilute 1:10.
ULTRA Cell Conditioning (ULTRA CC2) Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 950-223 Pretreatment steps in the processing of tissue samples during IHC and ISH. Ready to use.
ULTRA Cell Conditioning (ULTRA CC1) Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 950-224
ultraView Silver Wash II Ventana medical system, Tucson, AZ, USA 780-003 Ready-to-use solution to rinse slides between IHC and ISH staining steps
Microtome Leica Biosystems, Wetzlar, Germany, EU RM 2255 Automated rotary microtome
Multistainer Leica Biosystems, Wetzlar, Germany, EU ST 5020 Workstation for automated staining and coverslipping
Minicore 1 Alphelys, Plaisir, France, EU 00-MICO-1 Semi-automatic arrayer for TMA contruction with TMA Designer 2 embedded software
Aperio ScanScope CS2 Leica Biosystems, Wetzlar, Germany, EU K080254 Image capture device - digital pathology scanner
Tissue-Tek III Uni-Cassette Sakura Finetek Europe B.V 4135 Cassette
Tissue-Tek Paraform Standard Base Mold Sakura Finetek Europe B.V 7055 Stainless-Steel base metal mold

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Allison, K. H., Dintzis, S. M., Schmidt, R. A. Frequency of HER2 heterogeneity by fluorescence in situ hybridization according to CAP expert panel recommendations: time for a new look at how to report heterogeneity. Am J Clin Pathol. 136 (6), 864-871 (2011).
  2. Montemurro, F., Scaltriti, M. Biomarkers of drugs targeting HER-family signalling in cancer. J Pathol. 232 (2), 219-229 (2014).
  3. Wolff, A. C., et al. Recommendations for human epidermal growth factor receptor 2 testing in breast cancer: American Society of Clinical Oncology/College of American Pathologists clinical practice guideline update. J Clin Oncol. 31 (31), 3997-4013 (2013).
  4. Ng, C. K., Pemberton, H. N., Reis-Filho, J. S. Breast cancer intratumor genetic heterogeneity: causes and implications. Expert Rev Anticancer Ther. 12 (8), 1021-1032 (2012).
  5. Vance, G. H., et al. Genetic heterogeneity in HER2 testing in breast cancer: panel summary and guidelines. Arch Pathol Lab Med. 133 (4), 611-612 (2009).
  6. Murthy, S. S., et al. Assessment of HER2/Neu status by fluorescence in situ hybridization in immunohistochemistry-equivocal cases of invasive ductal carcinoma and aberrant signal patterns: a study at a tertiary cancer center. Indian J Pathol Microbiol. 54 (3), 532-538 (2011).
  7. Ohlschlegel, C., Zahel, K., Kradolfer, D., Hell, M., Jochum, W. HER2 genetic heterogeneity in breast carcinoma. J Clin Pathol. 64 (12), 1112-1116 (2011).
  8. Chang, M. C., Malowany, J. I., Mazurkiewicz, J., Wood, M. 'Genetic heterogeneity' in HER2/neu testing by fluorescence in situ hybridization: a study of 2,522 cases. Mod Pathol. 25 (5), 683-688 (2012).
  9. Bartlett, A. I., et al. Heterogeneous HER2 gene amplification: impact on patient outcome and a clinically relevant definition. Am J Clin Pathol. 136 (2), 266-274 (2011).
  10. Seol, H., et al. Intratumoral heterogeneity of HER2 gene amplification in breast cancer: its clinicopathological significance. Mod Pathol. 25 (7), 938-948 (2012).
  11. Hanna, W. M., et al. HER2 in situ hybridization in breast cancer: clinical implications of polysomy 17 and genetic heterogeneity. Mod Pathol. 27 (1), 4-18 (2014).
  12. Sanguedolce, F., Bufo, P. HER2 assessment by silver in situ hybridization: where are we now? Expert Rev Mol Diagn. 15 (3), 385-398 (2015).
  13. Fusco, N., et al. The Contrasting Role of p16Ink4A Patterns of Expression in Neuroendocrine and Non-Neuroendocrine Lung Tumors: A Comprehensive Analysis with Clinicopathologic and Molecular Correlations. PLoS One. 10 (12), e0144923 (2015).
  14. Albanghali, M., et al. Construction of tissue microarrays from core needle biopsies - a systematic literature review. Histopathology. 68 (3), 323-332 (2016).
  15. Navani, S. Manual evaluation of tissue microarrays in a high-throughput research project: The contribution of Indian surgical pathology to the Human Protein Atlas (HPA) project. Proteomics. 16 (8), 1266-1270 (2016).
  16. Fusco, N., et al. HER2 in gastric cancer: a digital image analysis in pre-neoplastic, primary and metastatic lesions. Mod Pathol. 26 (6), 816-824 (2013).
  17. Amin, M. B., et al. AJCC Cancer Staging Manual. , Eight, Springer International Publishing. (2017).
  18. Lakhani, S. R., Ellis, I. O., Schnitt, S. J., Tan, P. H., van de Vijver, M. J. WHO Classification of Tumours of the Breast. , 4th, IARC press. (2012).
  19. Kononen, J., et al. Tissue microarrays for high-throughput molecular profiling of tumor specimens. Nat Med. 4 (7), 844-847 (1998).
  20. Fusco, N., et al. Resolving quandaries: basaloid adenoid cystic carcinoma or breast cylindroma? The role of massively parallel sequencing. Histopathology. 68 (2), 262-271 (2016).
  21. Fusco, N., et al. Genetic events in the progression of adenoid cystic carcinoma of the breast to high-grade triple-negative breast cancer. Mod Pathol. 29 (11), 1292-1305 (2016).
  22. Fusco, N., et al. Recurrent NAB2-STAT6 gene fusions and oestrogen receptor-α expression in pulmonary adenofibromas. Histopathology. 70 (6), 906-917 (2017).
  23. Hammond, M. E., et al. American Society of Clinical Oncology/College Of American Pathologists guideline recommendations for immunohistochemical testing of estrogen and progesterone receptors in breast cancer. J Clin Oncol. 28 (16), 2784-2795 (2010).
  24. Fusco, N., Bosari, S. HER2 aberrations and heterogeneity in cancers of the digestive system: Implications for pathologists and gastroenterologists. World J Gastroenterol. 22 (35), 7926-7937 (2016).
  25. Dowsett, M., et al. Assessment of Ki67 in breast cancer: recommendations from the International Ki67 in Breast Cancer working group. J Natl Cancer Inst. 103 (22), 1656-1664 (2011).
  26. Dekker, T. J., et al. Determining sensitivity and specificity of HER2 testing in breast cancer using a tissue micro-array approach. Breast Cancer Res. 14 (3), R93 (2012).
  27. De Sio, G., et al. A MALDI-Mass Spectrometry Imaging method applicable to different formalin-fixed paraffin-embedded human tissues. Mol Biosyst. 11 (6), 1507-1514 (2015).

Tags

İmmünoloji sayı: 130 meme kanseri insan epidermal büyüme faktörü reseptörü 2 (HER2) heterojenlik doku Mikroarray in situ hibridizasyon yüksek üretilen iş moleküler analizi
HER2 Gene amplifikasyon meme kanserleri heterojen değerlendirmek için bir yüksek-den geçerek tarama Platform kurma
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Ercoli, G., Lopez, G., Ciapponi, C., More

Ercoli, G., Lopez, G., Ciapponi, C., Corti, C., Despini, L., Gambini, D., Runza, L., Blundo, C., Sciarra, A., Fusco, N. Building Up a High-throughput Screening Platform to Assess the Heterogeneity of HER2 Gene Amplification in Breast Cancers. J. Vis. Exp. (130), e56686, doi:10.3791/56686 (2017).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter