Summary
Этот протокол анализирует навигационных поведение дрозофилы личинка в ответ на одновременное optogenetic стимуляции обонятельных нейронов. Свет 630 Нм длины волны используется для активации отдельных обонятельных нейронов, выражая родопсин смещается красный канал. Личинок движение одновременно отслеживается, цифровой записали и анализируются с помощью пользовательской программы.
Abstract
Насекомых способность перемещаться к запах источников основывается на деятельности их первого порядка обонятельных рецепторов нейронов (ORNs). Хотя значительный объем информации был создан относительно Орн ответы для отдушки, роль конкретных ORNs в автошколах поведенческих реакций по-прежнему осознаются. Осложнения при анализе поведения возникают из-за различных неустойчивого характера отдушки, активировать отдельные ORNs, несколько ORNs, активированную одного отдушки и трудности в репликации естественно наблюдаемых временной вариации в обонятельные стимулы с помощью методы в обычных запах доставки в лаборатории. Здесь мы описываем протокол, который анализирует дрозофилы личиночной поведение в ответ на стимуляцию одновременное optogenetic его ORNs. Optogenetic технология, используемая здесь позволяет специфики Орн активации и точный контроль временных моделей активации Орн. Соответствующее движение личинок отслеживается, цифровой записали и анализируются с помощью пользовательских письменного программного обеспечения. Заменив запах раздражителей с легкими раздражители, этот метод позволяет для более точного управления отдельных Орн активации с целью изучения ее влияния на личиночной поведение. Наш метод может быть продлен для изучения воздействия второго порядка проекции нейронов (ПНС) а также местные нейронов (LNs) на личиночной поведение. Таким образом, этот метод позволит всеобъемлющий рассечение обонятельных цепи функции и дополнять исследования как обонятельных нейронов деятельности перевести в поведение ответов.
Introduction
Обонятельной информации в среде larva дрозофилы воспринимается только 21 функционально различных ORNs, деятельность которого в конечном итоге определяют поведение личинок1,2,3,4. Тем не менее относительно мало известно о логике, в которой сенсорная информация кодируется в деятельности этих 21 ORNs. Таким образом, существует необходимость экспериментально определить функциональный вклад каждой личиночной Орн поведение.
Хотя сенсорные ответ профиль весь репертуар дрозофилы личинок ORNs изучалось в деталях1,4,5, вклад отдельных ORNs контуре обонятельных и тем самым навигационных поведение по-прежнему во многом неизвестным. До настоящего времени, возникают трудности в личиночной поведение исследования, из-за неспособности пространственно и временно активировать одного ORNs. Группа отдушки, который специально активировать 19 21 дрозофилы личинок ORNs был недавно описан1. Каждый одоранта в панели, при низких концентрациях, вызывает физиологический ответ только от его родственных Орн. Однако при более высоких концентрациях, которые обычно используются для обычных поведение анализов, каждый одоранта вызывает физиологические реакции от нескольких ORNs1,5,6. Кроме того отдушки в этой панели менялись нестабильности, которые усложняют интерпретации поведения исследований, которые зависят от формирования стабильных запах градиенты7,8. Наконец естественно происходя запах стимулы имеют временной компонент, который трудно воспроизвести в лабораторных условиях. Поэтому важно разработать метод, который можно измерить личиночной поведение при одновременно активации отдельных ORNs образом пространственных и временных.
Здесь мы демонстрируем, что метод, который имеет преимущества по сравнению с ранее описанных личиночной отслеживания assays1,8. Assay отслеживания, описанных в Gershow et al. использует электронно управляемые клапаны для поддержания стабильной градиент запаха в поведение Арена8. Однако из-за уровня комплексный инжиниринг участвует построить установки стимул запах, этот метод является трудно воспроизвести в других лабораториях. Кроме того остаются нерешенными вопросы, связанные с использованием отдушки специально активировать одного ORNs. Assay отслеживания, описанные в Мэтью et al. использует простую систему доставки запах, но результирующий градиент запаха зависит от волатильности тест одоранта и неустойчива для длительного времени пробирного1. Таким образом заменив запах раздражителей с легкими раздражители, наш метод имеет преимущества специфичности и точный временной контроль Орн активации и не зависит от формирования запах градиентов различные сильные.
Наш метод прост в настройке и подходит для исследователей, заинтересованных в измерении аспекты дрозофилы личиночной навигации. Эта техника могут быть адаптированы к другим системам модель, условии, что исследователь имеет возможность управлять выражение CsChrimson в neuron(s) свои любимые системы выбора. CsChrimson версия перешел красного канала родопсина. Он активируется на длинах волн, которые являются невидимыми для личинок Фототаксис системы. Поэтому мы можем манипулировать активность нейронов с9специфика, надежность и воспроизводимость. Путем изменения пользовательских письменного программного обеспечения для учета изменения размера субъектов, этот метод может быть легко адаптирована для обхода личинки других видов насекомых.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Protocol
1. Создание поведение Арена и подготовку оборудования для стимуляции Optogenetic на арене поведение
- Чтобы построить лишен света поведение Арена, построить коробку с измерением 89 x 61 x 66 см3 (35" L х 24" W x 26" H) из черного плексигласа Цветные акриловые листы (толщиной 3 мм) (см. Таблицу материалы). Материалы для строительства такой коробки должны быть доступны в местных магазинах. Поместите это поле на вершине таблицы в зале поведение (рис. 1А).
- Гора, монохромный USB 3.0 ПЗС-камеры оснащены фильтром ИК Лонг перевал 830 нм и 8 мм F1.4 C-креплением (см. Таблицу материалы) в центре потолка черный ящик. Место два инфра красный светодиод полосы (см. Таблицу материалы) на столе-чтобы осветить личинок в Темный Арена (рис. 1A).
- Для создания платформы LED, получите 22 × 22 см квадратных алюминиевых пластины (предпочтительно спрей окрашены в матовый черный, чтобы устранить любые размышления). В центре пластины, с помощью металлической фрезы вырежьте отверстие, достаточно большой, чтобы соответствовать вокруг камеры на ПЗС.
- Металлическая крышка с красный светодиод газа (см. Таблицу материалы). Припой провода светодиодные полосы в серии и подачи газа провода в Оптрон реле, контролируется микропроцессором 2B Raspberry Pi (см. Таблицу материалы) (рис. 1B и 2).
- Установка и настройка Ubuntu мат/Raspian Джесси/Linux на основе операционной системы на процессоре Raspberry Pi перед подключением Оптрон реле для Светодиодных лент. Прикрепить источник питания для Светодиодных лент и Оптрон (рис. 2) (см. Таблицу материалы). Смонтируйте Светодиодные платформы вокруг CCD камеры (рис. 1Б).
Примечание: Ubuntu Мате v16.04 операционная система свободно доступна. Набор простых команд Python основе может быть легко адаптирована к программе моделей Светодиодные света раздражителей (см. файл синтаксиса). - Обеспечения однородной освещенности в различных точках в области поведения. Измерить абсолютное излучения на поверхности арены с помощью спектрометра и определить его ~1.3 Вт/м2 по всей поверхности арены.
Примечание: В интенсивности, никаких существенных изменений были замечены температуры в течение экспериментов. Другое исследование10 используется выше излучения ~1.9 Вт/м2 и отмечено никаких изменений температуры в течение экспериментов.
2. Подготовка дрозофилы личинок для анализа поведения
- Поддерживать мух на стандартных покупать продовольствие (см. Таблицу материалов) при 25 ° C, 50-60% RH и 12 h/12 h свет/темно цикла.
-
Для того чтобы выразить CsChrimson в одной паре ORNs, крест девственной женщины от UAS-ИВС-CsChrimson линия для мужчин от линии OrX-Gal4 («X» соответствует одному из 21 личиночной запах рецепторов (или) генов, которые однозначно выражена в каждом из 21 пар ORNs)9,11.
- Попеременно чтобы выразить CsChrimson в всех 21 личинок ORNs, крест девственной женщины от UAS-ИВС-CsChrimson линия мужчины от линии Орко-Gal4 («Орко» является ко-рецептор, который выражается в всех 21 ORNs).
- Используйте линии UAS-ИВС-CsChrimson сама по себе как элемент управления в этих экспериментах.
Примечание: Летать запасов, перечисленные здесь все доступны в центре фондовой дрозофилы Блумингтон (см. Таблицу материалы).
-
После того, как мужские и женские мух в крест разрешено спариваются и откладывают яйца в течение 48 часов, передать свежие флакон взрослых.
- К поверхности флакона пищи, содержащие яйца 400 мкл смеси, содержащие 400 мкм все транс ретиналь (ATR) растворяют в диметилсульфоксида (ДМСО) и 89 мм сахарозы, растворяют в дистиллированной воде.
Примечание: Небольшое количество сахарозы способствует личинок кормления ATR решения. АТР является кофактора для upregulating CsChrimson выражение9,10. АТР является светочувствительный. - После того, как ATR добавляется к продовольственной флаконы, содержащие яйца, Инкубируйте флаконов в темноте еще 72 ч.
Примечание: Хотя это исследование и выше двух исследований не наблюдалось воздействие на личиночной поведения из-за кормления ATR, рекомендуется контролировать последствия ATR кормления, подвергая тестирования линии то же количество выше смеси, которая не содержит ATR.
- К поверхности флакона пищи, содержащие яйца 400 мкл смеси, содержащие 400 мкм все транс ретиналь (ATR) растворяют в диметилсульфоксида (ДМСО) и 89 мм сахарозы, растворяют в дистиллированной воде.
- Извлечь третьего возраста личинок (~ 120 h после откладки) от поверхности покупать продукты питания, плавающие их с помощью раствора сахарозы высокой плотности (15%). С помощью P1000 микропипеткой отдельные личинки, плавающей на поверхности раствора сахарозы в стеклянный стакан 1000 мл.
- Вымойте личинки 3 – 4 раза путем обмена свежими 800 мл дистиллированной воды в стеклянный стакан каждый раз. Разрешить личинок на отдых за 10 мин до подвергая их поведение assay.
3. поведение Assay
- Поддержание постоянной температуры (между 22-25 ° C) и влажности (между 50 и 60% RH) в зале поведение.
-
Подготовьте личиночной обхода среднего лить 150 мл растопленного агарозы (1,5%) в 22 x 22 см квадрат Петри. Одна чашка Петри заливается для каждого разбирательства assay, 8 – 10 испытаний на эксперимент. Разрешить агарозы затвердеть и охладить в течение 1-2 ч в чашках Петри перед их использованием в assay поведение.
- Передача не более чем 20 prepped личинок третьего instar центр Петри (рис. 1C). Обложка Петри блюдо с крышкой. Место на Петри блюдо в арену поведение под камеры на ПЗС.
Примечание: В зависимости от эксперимента, поведение анализов обычно осуществляется за 3-5 мин. Если одоранта используется в assay для предоставления руководства подсказок, было отмечено, что результирующий градиент запах остается стабильным для около 5 мин1. Не рекомендуются пробирного раза дольше. Пагубное влияние на личинок из-за обезвоживания или от длительного 630 нм красный свет воздействия не наблюдались в эти моменты времени.
- Передача не более чем 20 prepped личинок третьего instar центр Петри (рис. 1C). Обложка Петри блюдо с крышкой. Место на Петри блюдо в арену поведение под камеры на ПЗС.
- Поверните на 850 нм инфра красный светодиодный источник света для визуализации личинок в видео. Запустите CCD камера для записи личиночной движения.
- Использование программного обеспечения, связанное с процессором Raspberry Pi, программа процедура администрирования соответствующие шаблоны стимуляции красный свет.
Примечание: Набор простых команд Python основе может быть легко адаптирована к программе моделей Светодиодные света раздражителей (см. файл синтаксиса).
4. обработка и анализ данных
- Импортируйте видеозаписи каждого судебного разбирательства в любых доступных программирования как Matlab.
- Получите координаты XY каждый личинка в фильме как функцию от времени. Основываясь на пределы отслеживания программного обеспечения, 15 – 20 третьего возраста личинки могут быть отслежены в одном фильме1,8.
Примечание: Предоставляется набор простых кодов Matlab («Tracklarva»), которые могут быть легко адаптированы для соответствующих условий (см. файл синтаксиса). Эта программа сочетает в себе все испытания в эксперименте и выводит XY координаты каждого личинка на весь срок анализа (см. ниже синтаксис кода). Кроме того можно было бы использовать несколько открытым исходным кодом на основе программ, которые свободно доступны для исследователей. Например JAABA (http://jaaba.sourceforge.net/)12. -
Используйте созданный XY координаты участок личиночной траекторий и далее анализировать личиночной локомоции.
- Для анализа поведения используйте навигационные статистические данные, такие как скорость, кривизны путь, заголовок угол, сегмент индивидуальных траекторий личинок в чередующихся последовательностей бежит и поворотов.
- Бежит определяются как непрерывные периоды движение вперед. Повороты отдельных последовательных запусков. Повороты помечаются при изменения траектории ориентации углы были > 45° (см. файл синтаксиса).
- Вычислять средние значения для запуска скорость, запустите длину, выполнения направление и другие параметры при необходимости.
Примечание: Предоставляется набор простой синтаксис для извлечения из личиночной траекторий «работает» и «останавливается» (см. файл синтаксиса). Простые Matlab или Excel на основе функций могут быть применены к извлеченных данных для вычисления значений для «запуска скорость», «запуск длина» и т.д. - Представления данных для каждой поведенческой метрики, как означает ± SEM.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Representative Results
Чтобы продемонстрировать специфика Орн активации, наш метод успешно применяется для определения влияния двух различных Орн (ORN::7a & ORN::42a) (ORNs, Or7a или Or42a) активации на личиночной поведение (рис. 3). В соответствии с недавними исследованиями, что отдельные личинок ORNs являются функционально различных1,10,13, наших репрезентативных данных показывает, что там было простимулировано ORN::7a, выражая CsChrimson был свет, значительное уменьшение выполнения длина, по сравнению с контрольных животных. И наоборот когда ORN::42a, выражая CsChrimson стимулировался света, было значительное увеличение выполнения длиной, по сравнению с контролем животных (рис. 3). Коллективные данные анализируются с ~ 100-120 личиночной треков были получены от (n = 8) испытания выполняются для каждого генотипа. Планки погрешностей представляют SEM. В то время как мы здесь описать только один поведение параметра (запуска длина), мы отмечаем, что каждой личиночной дорожки могут быть далее проанализированы для расчета параметров для скорости, путь кривизны, и тела поворотах,1,8,13 14,15. Больше параметров связанных с направленности, таких как заголовок угол, запустите длину и запустить скорость к и от запахов могут быть получены при условии источник запахов на одной стороне арены1,8,13.
Чтобы продемонстрировать способность нашего метода изменить временной модели активации Орн, мы разнообразны наш стимул поочередно света и выключения. Мы подвергнуты личинки, выражая бла -CsChrimson в ORN::42a на три различных временных моделей света раздражителей в период на огни (0,04 Гц, 1 Гц и константа). Затем мы измерили изменений в поведенческих параметров, которые происходят на этапе фары OFF → и во время огни на этапе → OFF. Мы обнаружили, что для ORN::42a, различные временные шаблоны света стимуляции вызвало различные поведенческие реакции (рис. 4). Такие изменения не были замечены в управления личинки, которые не выражают Бла-CsChrimson в любом ORNs. Эти результаты выделить важность понимания как временной модели активации Орн вклад поведение животных.
Рисунок 1 : Поведение Арена и личинок обхода среднего. (A) передний вид поведения BlackBox-Арена. В открытую дверь арены показывает CCD камеры, подвешивали к потолку коробки. (B) вид снизу металлические платформы, содержащие красный светодиодные полосы света, используется для стимуляции optogenetic монтируется вокруг камеры на ПЗС. (C) вид сверху личиночной сканирования среды, используемый в assay. Перед началом записи личиночной движения ~ 20 промывают личинки проложены вдоль центра 22 x 22 см Петри слоистых с 1,5% агарозы. Петри, содержащие личинки помещается в центре арены под камеры на ПЗС и между двумя инфра красный светодиодные полосы света, используемых в качестве источника света для камеры. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 2 : Установки Оптогенетика. Инфографики показаны электронного механизма для Оптогенетика установки. Вкратце, светодиодные (630 Нм) полос связаны в серии и провода от полосы вводятся в Оптрон, подключенных к Малина PI 2B микропроцессора. Светодиодные полосы света и оптрона рассчитаны на питание от блока питания. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 3 : Влияние света активации отдельных ORNs на личиночной поведение. Запуск длина личинок, выражая CsChrimson в ORN::7a и ORN::42a по-разному пострадали по сравнению с контролировать личинок после активации света. Каждый бар представляет собой среднее ± SEM ри (n = 8). Выполнения длина личинок, когда был активирован ORN::7a был значительно ниже, чем элемент управления. Выполнения длина личинок, когда был активирован ORN::42a был значительно выше, чем элемент управления. Столбики показывают среднее ± SEM (n = 8, студент t теста; «*» — p < 0,05, «**» является p < 0,001). Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Рисунок 4 : Влияние разных временных форм Орн активации на личиночной поведение. (A) три временные структуры стимулов, используемых для активации ORNs. A: стимул 1 мин Константа света во время, стимул b: легкой стимуляции 0,04 Гц, стимул c: 1 Гц легкой стимуляции период светодиод ON в минуту 2. (B) личинки были подвергнуты три различных модели света раздражителей, описанные в а. Каждая точка представляет собой изменение в личиночной поведение, под каждый шаблон света раздражителей, когда свет активации переключен из ON в OFF. Изменения в «запуск длина» (Av. запуска Длина (OFF) - Av. запуска Длина (на)) строится на оси x. Изменения в «запуск скорость» (Av. Запуск скорость (OFF) - Av. Запуск скорость (на)) строится на оси y. Левый график (серые точки) представляет измерения от управления личинки и правый граф (красные точки) представляет измерения от личинок, выражая CsChrimson в ORN::42a. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы посмотреть большую версию этой фигуры.
Дополнительный файл синтаксиса: набор простых кодов Matlab («Tracklarva»), которые могут быть легко адаптированы к соответствующим условиям. Пожалуйста, нажмите здесь, чтобы загрузить этот файл.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Discussion
Здесь мы описал метод, который позволяет для измерения дрозофилы личиночной поведения в ответ на одновременное optogenetic активации обонятельных нейронов. Ранее описанный личиночной отслеживания методы1,8 использовать технологии доставки различных запахов для активации ORNs. Однако эти методы не может контролировать для специфики или временной модели активации Орн. Наш метод преодолевает эти недостатки с помощью света стимулы вместо запах стимулы для более точного управления Орн активации.
Материалы, необходимые для построения Арена поведение можно легко получить в местном магазине оборудования и требует минимальных усилий на Ассамблее. Электроники, необходимых для подготовки Оптогенетика модуль также легко доступны и построены. Метод, описанный здесь использует красный свет для того чтобы активировать смещается красный канал родопсина (CsChrimson) в определенных нейронов. Результате личиночной поведение в ответ на соответствующие активации Орн записывается с помощью CCD камеры и измеряется с помощью пользовательских письменном программного обеспечения, которое предоставляется здесь. Наш метод позволяет исследователям спросить ответы на ряд вопросов, которые не были раньше: 1) что такое влияние различных обонятельные стимулы узоры на животного способность перемещаться к запах? 2) аналогичный центр ON и OFF-центр ганглия клеток в сетчатке млекопитающих16, есть ORNs, которые конкретно реагировать на снижение обонятельные стимулы в дополнение к ORNs, которые реагируют на увеличение обонятельные стимулы? Наконец наш метод позволяет целый ряд будущих приложений, включая измерения воздействия течению нейронов в контуре обоняния (ПНС и LNs) личинок навигации.
Хотя есть несколько преимуществ для нашего метода, мы признаем определенные ограничения. Неясно ли концентрация эффектов наблюдается с отдушки могут быть легко воспроизведены с помощью этой системы. Хотя нашей нынешней установки не позволяют этого, модуль Оптогенетика может быть легко изменены для размещения увеличивается или уменьшается в интенсивности света стимул. В будущем мы будем проверять, чтобы увидеть ли изменения интенсивности света стимул имитирует последствия концентрации одорантов. Просто покупать генетических методов может использоваться для выражения CsChrimson либо все 21 пары ORNs (с помощью Орко-Gal4) или в одной пары ORNs (с использованием индивидуальных или-Gal4s). Однако, сложная генетика потребуется выразить CsChrimson в ' 1 < n < 21' нейронов. Благодаря этому было бы сложно воспроизвести эффект с запахом смеси, где отдельные компоненты смеси получить ответы от более чем одного Орн. Даже несмотря на то, что личиночной навигационных поведение считается низкой размерной поведение, мы признаем, что наша программа личиночной отслеживания можно добиться дальнейшего улучшения в будущем с учетом дополнительных поведенческих дескрипторы, основанные на животных осанки (например превращает вероятность головы, тела поворотах и т.д.)8,17. Наше исследование ограничивается первого порядка сенсорных нейронов в личинка. Прежде чем наш метод может быть применен для второго порядка проекции нейронов и местные нейронов, которые внедряются в регионе доли мозга мозга18необходимо дальнейшее расследование.
В целом наш метод предоставляет возможность анализировать функции каждого Орн в простой, шансов справиться с возникающими обонятельных цепи дрозофилы личинка. Поступая таким образом, наш метод позволит разработка более точных вычислительных моделей, которые описывают, как запах сигналы преобразуются в различные поведенческие выходы.
Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.
Disclosures
Авторы не имеют ничего сообщать.
Acknowledgments
Эта работа была поддерживается путем запуска средства от Университет Невады в Рено, NIGMS национального института здравоохранения под номер гранта P20 GM103650.
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| Video camera to capture larval movement | |||
| CCD Camera | Edmund Optics | 106215 | |
| M52 to M55 Filter Thread Adapter | Edmund Optics | 59-446 | |
| 2" Square Threaded Filter Holder for Imaging Lenses | Edmund Optics | 59-445 | |
| RG-715, 2" Sq. Longpass Filter | Edmund Optics | 46-066 | |
| Electronics for optogenetic setup | |||
| Raspberry Pi 2B | RASPBERRY-PI.org | RPI2-MODB-V1.2 | |
| 3 Channel programmable power supply | newegg.com | 9SIA3C62037092 | |
| 8 Channel optocoupler relay | amazon.com | 6454319 | |
| 630nm Quad-row LED strip lights | environmentallights.com | red3528-450-reel | |
| 850nm LED strips | environmentallights.com | wp-4000K-CC5050-60x2-kit | |
| Software | |||
| Matlab | Mathworks Inc. | ||
| Ubuntu MATE v16.04 | Nubuntu | https://github.com/yslo/nubuntu | |
| Other items | |||
| Plexiglass black acrylic | Home Depot | MC1184848bl | |
| Fly food and other reagents | |||
| Nutrifly fly food | Genesee Scientific | 66-112 | |
| Agarose powder | Genesee Scientific | 20-102 | |
| 22cm X 22cm square petri-dish | VWR Inc. | 25382-327 | |
| DMSO | Sigma-Aldrich | D2650 | |
| Sucrose | Sigma-Aldrich | 84097 | |
| All trans-retinal | Sigma-Aldrich | R2500 | |
| Flies | |||
| UAS-IVS-CsChrimson | Bloomington Drosophila Stock Center | 55134 | |
| Orco-Gal4 | Bloomington Drosophila Stock Center | 26818 | |
| Or42a-Gal4 | Bloomington Drosophila Stock Center | 9970 | |
| Or7a-Gal4 | Bloomington Drosophila Stock Center | 23907 |
References
- Mathew, D., et al. Functional diversity among sensory receptors in a Drosophila olfactory circuit. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 110, 2134-2143 (2013).
- Ramaekers, A., et al. Glomerular maps without cellular redundancy at successive levels of the Drosophila larval olfactory circuit. Current biology : CB. 15, 982-992 (2005).
- Couto, A., Alenius, M., Dickson, B. Molecular, anatomical, and functional organization of the Drosophila olfactory system. Current biology : CB. 15, 1535-1547 (2005).
- Kreher, S. A., Kwon, J. Y., Carlson, J. R. The molecular basis of odor coding in the Drosophila larva. Neuron. 46, 445-456 (2005).
- Kreher, S. A., Mathew, D., Kim, J., Carlson, J. R. Translation of sensory input into behavioral output via an olfactory system. Neuron. 59, 110-124 (2008).
- Hallem, E. A., Carlson, J. R. Coding of odors by a receptor repertoire. Cell. 125, 143-160 (2006).
- Monte, P., et al. Characterization of the larval olfactory response in Drosophila and its genetic basis. Behav Genet. 19, 267-283 (1989).
- Gershow, M., et al. Controlling airborne cues to study small animal navigation. Nature methods. 9, 290-296 (2012).
- Klapoetke, N. C., et al. Independent optical excitation of distinct neural populations. Nature methods. 11, 338-346 (2014).
- Hernandez-Nunez, L., et al. Reverse-correlation analysis of navigation dynamics in Drosophila larva using optogenetics. eLife. 4, (2015).
- Brand, A. H., Perrimon, N. Targeted gene expression as a means of altering cell fates and generating dominant phenotypes. Development. 118, 401-415 (1993).
- Kabra, M., Robie, A. A., Rivera-Alba, M., Branson, S., Branson, K. JAABA: interactive machine learning for automatic annotation of animal behavior. Nature methods. 10, 64-67 (2013).
- Newquist, G., Novenschi, A., Kohler, D., Mathew, D. Differential contributions of Olfactory Receptor Neurons in a Drosophila olfactory circuit. eNeuro. 3, (2016).
- Schulze, A., et al. Dynamical feature extraction at the sensory periphery guides chemotaxis. eLife. 4, (2015).
- Tastekin, I., et al. Role of the Subesophageal Zone in Sensorimotor Control of Orientation in Drosophila Larva. Current Biology. 25, 1448-1460 (2015).
- Famiglietti, E. V., Kolb, H. Structural basis for ON-and OFF-center responses in retinal ganglion cells. Science. 194, 193-195 (1976).
- Luo, L., et al. Bidirectional thermotaxis in Caenorhabditis elegans is mediated by distinct sensorimotor strategies driven by the AFD thermosensory neurons. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 111, 2776-2781 (2014).
- Berck, M. E., et al. The wiring diagram of a glomerular olfactory system. eLife. 5, (2016).
