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Eine optimierte Rhizobox-Protokoll zum Wurzelwachstum und Reaktionsfähigkeit auf lokalisierte Nährstoffe zu visualisieren

Published: October 22, 2018 doi: 10.3791/58674
Automatic Translation
1, 2, 1
1Department of Plant Sciences, University of California at Davis, 2Department of Natural Resources and the Environment, University of New Hampshire

Summary

Visualisieren und Wurzel Wachstum in Situ Messung ist extrem schwierig. Wir präsentieren Ihnen eine anpassbare Rhizobox Methode um WURZELENTWICKLUNG und Verbreitung im Laufe der Zeit als Reaktion auf Nährstoffanreicherung zu verfolgen. Diese Methode wird verwendet, um Mais genotypischen Unterschiede in der Wurzel Plastizität als Reaktion auf eine organische Stickstoff-Quelle zu analysieren.

Abstract

Wurzeln sind notorisch schwierig zu studieren. Boden ist eine visuelle und mechanische Barriere, so dass es schwierig zu verfolgen Wurzeln in Situ ohne zerstörerische Ernte oder teure Ausrüstung. Wir präsentieren Ihnen eine anpassbare und erschwingliche Rhizobox Methode, die ermöglicht die zerstörungsfreie Visualisierung des Wurzelwachstums im Laufe der Zeit und ist besonders gut geeignet zum Studium Wurzel Plastizität als Reaktion auf lokalisierte Ressource Patches. Die Methode wurde durch die Bewertung Mais genotypischen Variation in Plastizität Antworten zu Patches, enthält 15N beschriftet Hülsenfrucht Rückstände überprüft. Methoden werden beschrieben erhalten repräsentative Entwicklungsstörungen Messungen im Laufe der Zeit, Wurzel Länge Dichte in Ressource-haltigen und Kontrolle-Patches zu messen, berechnen Wurzel Wachstumsraten und 15N Einziehung durch Pflanzenwurzeln und Triebe zu bestimmen. Vorteile, Einschränkungen und mögliche zukünftige Anwendungen der Methode werden ebenfalls behandelt. Obwohl darauf geachtet werden muss, um sicherzustellen, dass die Versuchsbedingungen Stamm Wachstum Daten nicht beeinflussen, ergibt das Rhizobox Protokoll hier vorgestellten zuverlässige Ergebnisse wenn genügend Aufmerksamkeit zum Detail durchgeführt.

Introduction

Obwohl oft übersehen im Vergleich zu ihren oberirdischen Pendants, Wurzeln spielen eine wichtige Rolle im Werk Nährstoff Erwerb. Angesichts der erheblichen CO2-Kosten von Wurzel-Bau und Unterhalt, haben Pflanzen Mechanismen entwickelt, um die Wurzeln nur wo Nahrungssuche die Investition Wert ist. Wurzel-Systeme können so effizient und dynamisch Ressource Patches abbauen von proliferierenden in Hotspots, heraufregulierende Raten von Aufnahme und schnell translocating Nährstoffe, das Phloem für weiteren Transport1. Plastizität Antworten können variieren zwischen Werk Arten oder Genotypen2,3 und abhängig von der chemischen Form der Nährstoff mit4,5. Variation in Wurzel Plastizität sollte darüber hinaus als Verständnis für komplexe Wurzel Antworten auf heterogenen Bodenressourcen Zucht und Managementstrategien zur Effizienzsteigerung der Nährstoff Verwendung in der Landwirtschaft informieren könnte untersucht werden.

Trotz seiner Notwendigkeit und Relevanz für Verständnis Anlagensysteme bietet Visualisierung und Quantifizierung von Wurzel Plastizität bei relevanten Skalen technische Herausforderungen. Ausgraben der Wurzel-Krone aus dem Boden ("Shovelomics"6) ist eine gängige Methode, aber feine Wurzeln nutzen kleine Poren zwischen Bodenaggregate und Ausgrabung führt unweigerlich zu einem gewissen Grad der Verlust dieser fragilen Wurzeln. Des weiteren macht zerstörerischen Ernte es unmöglich, Veränderungen in einem Root-System im Laufe der Zeit zu folgen. In Situ bildgebende Verfahren wie berechnet Röntgentomographie ermöglichen direkten Visualisierung der Wurzeln und Bodenressourcen bei hoher räumlicher Auflösung7, aber sind teuer und erfordern speziellen Ausrüstung. Hydroponische Experimente vermeiden Sie Abhängigkeiten verbunden mit Wurzeln aus dem Boden zu extrahieren, aber Wurzel Morphologie und Architektur unterscheiden sich in wässrigen Medien im Vergleich zu mechanischen Einschränkungen und biophysikalischen Komplexität der Böden8,9. Schließlich können nicht mit Entwicklungsstörungen Plastizität in diesen künstlichen Medien Rhizosphäre Prozesse und Funktionen integriert werden.

Wir präsentieren Ihnen ein Protokoll für den Bau und die Verwendung von Rhizoboxes (schmal, Clear-seitig rechteckigen Behälter) als eine kostengünstige, anpassbare Methode Wurzelwachstum im Boden im Laufe der Zeit zu charakterisieren. Speziell gestaltete Rahmen fördern Wurzeln wachsen bevorzugt gegen die Rückwand durch Gravitropismus, Steigerung der Genauigkeit der Wurzel Längenmessungen. Rhizoboxes sind häufig verwendet, um das Wurzelwachstum und Rhizosphäre Interaktionen10,11,12zu studieren, aber die hier vorgestellte Methode bietet einen Vorteil in der Einfachheit mit seinem Einkammer-Design und preiswerte Materialien, und dient zur Wurzel Antworten auf lokalisierte Nährstoffe zu studieren. Die Methode könnte jedoch auch an eine Reihe von anderen Wurzel und Rhizosphäre Prozesse wie Intra/speziesübergreifenden Wettbewerb, räumliche Verteilung von chemischen Verbindungen, Mikroben oder Enzym-Aktivität zu studieren. Hier untersuchen wir genotypischen Unterschiede zwischen Maishybride als Reaktion auf Flecken von 15N beschriftet Hülsenfrucht Rückstände und Highlight repräsentative Ergebnisse, die Rhizobox-Methode zu validieren.

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Protocol

1. Vorbereitung der Vorder- und Rückwände und Abstandhalter

  1. Bereiten Sie die vorderen und hinteren Paneele.
    1. Schnitt zwei Stücke von klaren 0,635 cm dickem Acryl bis 40,5 cm breit und 61 cm lang pro Box oder vorgeschnittene Stücke (siehe Tabelle der Materialien) zu erwerben.
    2. Mit einem Bohrer für Acryl, Bohren Sie Löcher 0,635 cm Durchmesser 1,3 cm aus den seitlichen Rändern bei 2,5, 19, 38 und 53,3 cm von der Spitze. Bohren Sie Löcher 1,3 cm vom unteren Rand bei 2,5, 20,3 und 38 cm von der linken Seite (Abbildung 1).
      Hinweis: Es ist am effizientesten, eine Bohrmaschine für einen Stapel von sechs bis zehn Blätter gleichzeitig verwenden, sondern eine Handbohrmaschine kann auch verwendet werden.
    3. Entfernen Sie alle Abdeckungen aus Acryl und reinigen Sie sanft beide Platten vor der Montage der Boxen.

Figure 1
Abbildung 1: Anordnung der Bohrungen. Löcher sind gebohrte 1,3 cm aus den seitlichen Rändern bei 2,5, 19, 38, und 53,3 cm von oben und 1,3 cm vom unteren Rand bei 2,5, 20,3 und 38 cm vom linken Rand. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

  1. Bereiten Sie die seitlichen und unteren Abstandhalter.
    1. Schneiden Sie drei Abstandshalter pro Box aus High-Density-Polyethylen (HDPE) oder Kauf zwei vorgeschnittene Seite Abstandshalter (0,635 cm dick, 2,5 cm breit, 57 cm lang) und eine vorgeschnittenen unteren Abstandhalter (0,635 cm dick, 40,5 cm lang, 2,5 cm breit). Siehe Tabelle der Materialien.
    2. Richten Sie die Abstandshalter zwischen den vorderen und hinteren Platten entlang der Seiten und der Boden der Box. Mit einer Handbohrmaschine oder Bohrmaschine, Bohren Sie durch die vorhandenen Löcher in der Front und wieder zurück, so dass die Löcher sauber durch alle drei Ebenen passieren.
    3. Halten Sie die Schichten erfolgt über Klemmen oder durch die Installation eine Kombination aus Schrauben, Muttern und Scheiben in jedem neu Loch gebohrt (siehe Punkt 3.1).

2. Installation des Streifens des Polyester Watte an der Unterseite der Box

Hinweis: Dies wird Boden und Wasser verhindert durch Fugen zwischen Abstandhalter undicht.

  1. Polyester Volumenvlies in 2,5 cm Breite durch Schneiden Streifen 40,5 cm lang (siehe die Tabelle der Materialien).
  2. Legen Sie mit der Rückseite liegen flach und die Abstandshalter oben drauf die Watte direkt oberhalb der unteren Abstandhalter und halten Sie es mit der Oberseite (Abbildung 2).

Figure 2
Abbildung 2: Rhizobox mit Watte montiert. Ein schmaler Streifen des Schlagens am unteren Rand der Rhizobox verhindert, dass Erde und Sand austreten. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

3. Montage der Rhizoboxes

  1. Montieren Sie die Rhizoboxes mit 20-Gewinde Schrauben (3,2 cm Länge von 0,635 cm Durchmesser), Unterlegscheiben (0,635 cm Innendurchmesser) und Sechskantmuttern (Größe passen die Schrauben, siehe Tabelle der Materialien.
  2. Ziehen Sie jede Schraube durch eine Unterlegscheibe, Frontplatte, Abstandhalter, Rückwand, Scheibe und Sechskantmutter. Stellen Sie sicher, dass die Schrauben sehr eng sind; Wenn das Feld locker montiert ist, wird Boden durch Lücken zwischen den Platten und Seite Abstandhalter ergießen.
    Hinweis: Acryl ist leicht zerkratzt, und die Kratzer können mit Wurzel Messungen beeinträchtigen, also die montierten Boxen mit Sorgfalt zu behandeln. Vermeiden Sie stapelnde Kisten, wenn Schutzmaterial dazwischen platziert ist.
  3. Bereiten Sie zwei Patch-Abstandhalter (Abstandshalter, die verwendet werden, um die Behandlung und Kontrolle Patches erstellen) pro Box. Geschnitten Sie Abstandhalter aus High-Density-Polyethylen (HDPE) Blätter oder erwerben Sie diese Pre-Cut (0,635 cm dick, 3,8 cm breit, 28 cm lang; siehe Tabelle of Materials). Bohren Sie ein Loch 0,635 cm Durchmesser in jeder Abstandhalter, 2 cm von der Spitze entlang der Mittellinie (Abbildung 3).

Figure 3
Abbildung 3: Patch Abstandshalter. Schrauben durch die Mitte der HDPE-Streifen halten sie vor dem Absturz in die Box. Die Rhizobox ist gefüllt mit Boden rund um die Abstandshalter, der Boden ist benetzt und die Abstandhalter werden entfernt, um leere Behandlung und Kontrolle Flecken hinterlassen. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

  1. Eine Schraube durch jedes Loch mit Mutter sichern, so dass das Distanzstück teilweise in die Rhizobox eingefügt werden kann, bis die Schraube es geht verhindert weiter (Abbildung 3).
    Hinweis: Die Erde ist rund um die Abstandshalter benetzt und die Abstandhalter entfernt, zwei Leerstellen bleiben kann, die mit der entsprechenden Substrate für die Stickstoff-haltigen Behandlung Patch und Kontrolle Patch gefüllt werden.

4. Gebäude PVC-Rahmen, die Rhizoboxes in einem Winkel zu unterstützen

Hinweis: Wenn das Feld schräg platziert wird, wird Gravitropismus fördern die Wurzeln, gegen die Rückwand zu wachsen, so dass alle Wurzeln sichtbar für die Ablaufverfolgung verwendet werden. Polyvinylchlorid (PVC) Maße in Abbildung 4 Ergebnis in einem Rahmen, der die Rhizobox bei verwaltet eine etwa 55 ° Winkel auf die Bank.

  1. 13 Stücke von 1,3 cm Durchmesser PVC pro Karton: 2 × 44 cm Länge, 3 × 42 cm Länge, 2 × 36,3 cm Länge, 2 × 25,4 cm Länge und 4 × 3,8 cm Länge (siehe Tabelle der Materialien).
    Hinweis: Eine hiebsäge wird für Effizienz und sogar Schnitten empfohlen.
  2. Verwenden Sie 4 × 2-Wege-Ellbogen, 2 × 3-Wege Ellbogen und 4 T-Verbindern (siehe Tabelle der Materialien), Feld, wie in Abbildung 4gezeigt zu montieren.
    Hinweis: Frames sollte stabil ohne zusätzlichen Leim, aber PVC Kleber kann bei Bedarf verwendet werden.

Figure 4
Abbildung 4: Rahmen, um Rhizoboxes zu unterstützen. Der leichte Rahmen ist aus PVC auf die angegebenen Längen geschnitten und verbunden mit der Verbindungstypen angegeben gebaut. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

5. Nähen Schutzhüllen, Licht und Wärme zu reflektieren

Hinweis: Wurzeln vermeiden, Licht, so diesen Fällen Licht ausschließen, um sicherzustellen, die beobachtet, dass Wurzel Plastizität Antworten durch die Nährstoffquelle in den Patches und nicht durch leichte Vermeidung angetrieben werden. Leichten Entzug Gewebe reduziert auch die Temperatur im Inneren der Rhizoboxes helfen, um Hitze-Stress zu vermeiden.

  1. Schneiden Sie den leichten Entzug Stoff (spezielle Material, das auf der einen Seite weiß und schwarz auf der anderen) in Stücke ca. 95 cm Breite und 69 cm lang (siehe Tabelle der Materialien). Ein Stück pro Feld ist erforderlich.
  2. Falten Sie jedes Stück in der Mitte entlang der langen Kante eine 47,5 cm × 69 cm Ärmel bilden. Nähen Sie mit Hilfe einer nähmaschinennadel für Denim, Heavy-Duty Quilten Thread und eine schmale Naht entwickelt an, entlang der Unterseite und ¾ des Weges an der Seite von jedem Ärmel. Fixieren Sie die oberen Ecken zusammen mit einer Sicherheitsnadel.

6. Vorbereitung des Bodens 1:1 (V/V): Sand-Substrat, die Rhizoboxes zu füllen

  1. Sammeln Sie 1.000 cm3 Feld Erde (von der Website von Interesse) pro Box. Trocknen des Bodens zur Gewichtskonstanz in flachen Schalen bei 60 ° C.
    Hinweis: Boden für dieses Experiment wurden unmittelbar nach der Ernte in einem biologisch bewirtschafteten Kornfeld aus 0\u201210 cm Tiefe.
  2. Schleifen Sie den Boden mit einem Mörser und Stößel ein 2 mm Sieb passieren. Messen Sie die Rohdichte des Bodens, indem Sie mit einem Gewicht von einem bekannten Volumen des Bodens.
  3. Sand (z. B. spielen Sand, der aus dem Baumarkt kostengünstig erworben werden kann; siehe Tabelle der Materialien) zu erhalten und die Schüttdichte messen.
  4. Messen Sie gleiche Mengen Sand und Erde in einen Eimer und mischen Sie gründlich. Verwenden Sie einen Trichter, um das Feld langsam und gleichmäßig bis 2,5 cm von der Spitze zu füllen ohne schütteln das Kontrollkästchen, um das Substrat zu begleichen zu verursachen. Messen Sie das Volumen des Substrats; Es sollte ca. 1.272 cm3.
  5. Multiplizieren Sie die Rohdichte des Sandes mit Hälfte dieses Volumens, die Masse des Sandes benötigt für jede Box zu erhalten. Machen Sie dasselbe mit dem Schüttgewicht des Bodens, die Masse des Bodens benötigt für jede Box zu erhalten.
    Hinweis: Für den Bereich Boden und Sand in diesem Experiment verwendet, dies war 976 g Sand und 774 g des Bodens, sondern diese Beträge ist abhängig von der Schüttdichte des Bodens verwendet.
  6. Beschriften Sie einen großen Zip-Top-Plastikbeutel pro Rhizobox, wiegen Sie die entsprechenden Massen von Sand und Boden in den Beutel und homogenisieren Sie gründlich zu.
  7. Analysieren Sie diese 1:1-Boden- und Substrat für Nährstoffgehalt und die natürliche Fülle von 15N (δ15N).

(7) Substrataufbereitung zur Behandlung und Kontrolle Patches

  1. Beschriften Sie zwei kleine Zip-Top Plastiktüten pro Rhizobox, eine für die Behandlung-Patch und eine für den Steuerelement-Patch. Gewicht 30 g des Bodens: sand Substrat aus jeder große Tasche (Schritt 6.6) in die beiden entsprechenden kleinen Beutel.
  2. Mischen Sie das Substrat mit 15N beschriftet Stickstoffquelle für die Behandlung-Patch. Dafür wiegen 1 g 15N beschriftet Pflanzenresten oder andere N-Quelle (die Höhe ist einstellbar wie gewünscht) in jeder Behandlung Beutel (kleine Zip-Top), und gründlich mischen.
    Hinweis: Für dieses Experiment war eine Mischung aus 15N etikettiert Klee und Wicken Rückstände verwendet. Klee und Wicken Samen wurden in einem 1:1 Mischung aus Vermiculit und Sand gepflanzt und unter Gewächshausbedingungen angebaut. Pflanzen waren täglich mit entionisiertem Wasser bewässert und zweimal wöchentlich mit 1/100 Stärke des Long-Ashton Lösung13 enthält 15Stickstoff N beschriftet. Alle oberirdischen Biomasse wurde vier Wochen nach der Pflanzung, geerntet, getrocknet und gemahlen, um ein 2 mm Sieb passieren. Wenn eine andere Nährstoff gewählt wird, besonders, wenn dieses Element Mobil im Erdreich kann, Pilotprojekte, um Auswaschung zu testen sollen. Slow-Release-Formen der Nährstoffe genutzt werden oder eine anderes Rhizobox Design könnte beschränkt Auswaschung (z. B. durch separate Fächer10) bei Bedarf gewählt werden.

8. Laden Rhizobox mit Substrat und Aufbau Behandlung und Kontrollfelder

  1. Wiegen Sie jede leere Rhizobox und notieren Sie die Gewichte für die spätere Verwendung.
  2. Legen Sie zwei Patch-Abstandshalter (siehe Punkt 3.2) in einer Rhizobox, bis die Schraube sie daran hindert, weiter zu gehen. Markieren Sie die Tiefe der Unterkante mit einer leichten Markierung auf der Seite der Rhizobox (Abbildung 3) und entfernen Sie die Abstandshalter.
  3. Mit einem Trichter mit einer Stamm-Öffnung, die als ist schmal wie die Rhizobox-Öffnung, die Rhizobox aus dem entsprechenden großen Beutel des Substrats auf die markierten Tiefe zu füllen. Der Trichter verschoben, hin und her langsam und gleichmäßig damit das Substrat gleichmäßig ausfüllt und keine bevorzugte Strömungskanäle schafft.
  4. Wenn das Substrat die markierten Tiefe erreicht hat, setzen Sie die Abstandhalter wieder 5 cm von jeder Seite des Feldes. Fahren Sie fort, das Feld füllen, bis das Substrat ca. 5 cm von der Spitze des Feldes ist (es sollte sein Substrat bleibt in der Tasche).
  5. Um jede Abstandhalter gründlich nass.
    Hinweis: In diesem Experiment wurde dies durch die Bereitstellung von 50 mL Wasser durch Tropf-Strahler zwischen der Außenkante der einzelnen Abstandhalter und die Seite von der Rhizobox und Gießen 50 mL Wasser gleichmäßig zwischen die zwei Abstandshalter eingefügt. Langsame Bewässerung ist notwendig für gleichmäßige Benetzung.
  6. Entfernen Sie die Abstandshalter, während der Boden nass ist, verlassen eines leeren Hohlraums für die Patches.
  7. Kleben Sie eine Transparentfolie an der Außenseite der einzelnen Rhizobox (siehe Tabelle der Materialien). Markieren Sie einer Seite als Behandlung und als Kontrolle, und füllen Sie die Patches aus dem entsprechenden Beutel mit dem Trichter. Die Grenzen jedes Pflaster auf die Transparenz mit permanent-Marker zu verfolgen.
  8. Füllen Sie die Rhizobox gleichmäßig mit dem restlichen Substrat. Verfolgen Sie oben auf das Substrat auf die Transparenz.
  9. Wiederholen Sie für die restlichen Rhizoboxes. Alle Taschen für die Ernte zu retten.

9. auch Bewässerung zu 60 % Wasser-Fassungsvermögen

Hinweis: Dieser Betrag der Bodenfeuchtigkeit erwies sich verhindern, dass Pflanzen erleben Trockenstress während der Entwicklung der anoxischen Bedingungen oder Algenwachstum zu verhindern.

  1. Messen Sie das Wasser-Fassungsvermögen (WHC) der Substrat-14.
  2. Das ideale Gewicht für jedes Feld zu berechnen; hier definiert als die Summe des Gewichts der leeren Rhizobox, kombiniert mit dem Gewicht des Substrats bei 60 % Wasser-Fassungsvermögen.
  3. Multiplizieren Sie die WHC (Gramm Wasser / Gramm trockene Substrat) von 0,6 bis die Masse des Wassers zu erhalten statt in das Substrat bei 60 % WHC. Diese Masse zu der Masse der trockenen Substrat und die Masse der 15N Quelle hinzufügen.
  4. Die Zahl oben erhalten fügen Sie das Leergewicht des jedes Feld hinzu.
  5. Wiegen Sie die Felder sie ausgefüllt haben. Subtrahieren Sie das Gewicht des jedes Feld (in g) an dieser Stelle von seinem ideal Gewicht (in g) in Schritt 9.2 berechnet. Wasser mit diesem Volumen (in mL) der de-ionisiertes (DI) Wasser, langsam und gleichmäßig.
    Hinweis: Dieser Schritt kann erfolgen mit Tropfbewässerung oder Bewässerung von hand. Wenn per hand Gießen, damit das Wasser versickern vollständig vor dem Hinzufügen von mehr um heterogene Bodenbedingungen Feuchtigkeit und bevorzugte Strömungskanäle zu vermeiden.

10. Samen Sie Keimen und Transplantation

  1. Wenn Sie unbepflanzte Steuerelemente verwenden, die Rhizoboxes beiseite.
  2. Sterilisieren Sie Oberfläche-Maissaatgut durch Rühren für 1 min in 5 % NaOCl, dann spülen Sie gründlich mit VE-Wasser.
    Hinweis: In diesem Experiment wurden Samen von sechs verschiedenen Mais Genotypen verwendet, um genotypischen Unterschiede in der Wurzel Plastizität zu untersuchen.
  3. Keimen Sie sterilisiert Saatgut durch auf einem nassen Labor Gewebe (z. B. windex) in Petrischalen gelegt und mit einem anderen feuchten Tuch abdecken. Es sollte alle stehenden Gewässer. Ort Petrischalen an einem dunklen Ort für 48\u201272 h bis Keimwurzel gerade beginnt zu entstehen.
  4. Mit einem Spatel schmal bis 2,5 cm Tiefe in der Mitte jedes Rhizobox ein Loch zu graben. Transplantation eines gekeimten Samen in das Loch, um sicherzustellen, dass die Keimwurzel direkt ausgerichtet ist nach unten.
    Hinweis: Wenn die Keimwurzel in Richtung entweder Patch abgewinkelt ist, wird der Vergleich der Wurzel Wachstumsraten voreingenommen sein.
  5. Verfolgen Sie die Position des Samens auf die Transparenz.
  6. Bedecken Sie die Samen und das Wasser mit bis zu 50 mL VE-Wasser.

11 Pflanzen Wachstum

  1. Pflanzen wachsen, für 25 Tage (oder so lange wie gewünscht), 60 % Erhaltung WHC während der Vegetationsperiode. Monitor Wurzelwachstum durch die Wurzeln.
  2. Wiegen Sie jedes Feld alle 3\u20124 Tage und Wasser, bis es innerhalb von 5 g das Idealgewicht ist. Stoppen Sie, Bewässerung der Rhizoboxes vier Tage vor der Ernte bis zur Trennung der Platten zu erleichtern. Entfernen Sie Unkraut von hand häufig so, dass nur die Pflanzenwurzeln von Interesse vorhanden sind.
  3. Spur sichtbar Wurzeln alle 3\u20124 Tage mit einem permanent-Marker mit klar unterscheidbaren Farben für jeden Tag der Ablaufverfolgung.
    Hinweis: Verschiedene Durchmesser-Marker können für Primär- und seitlichen Wurzeln verwendet werden, falls gewünscht. Es kann nützlich sein, legen Sie Kriterien für die Wurzel Rückverfolgung zu Beginn, da ein Maß an Subjektivität beteiligt ist, insbesondere dann, wenn mehrere Forscher Ablaufverfolgung Wurzeln sein werden, oder wenn Wurzeln von verschiedenen Aufträgen oder Durchmesser sind mit verschiedenen Markern unterschieden werden. In diesem Experiment die Genauigkeit der sichtbaren Wurzeln nur auf einer Seite des Feldes wurde von sichtbaren Wurzeln auf beiden Seiten getestet und insgesamt Wurzellänge Vergleich auf den gescannten Folien zu total Wurzellänge gemessen durch Waschen und Scannen Wurzeln gemessen. Die Korrelation zwischen zurückverfolgen und gescannte Wurzellänge war signifikant, unabhängig davon, ob nur die hinteren Transparenz oder beide Folien verwendet wurden. Es ist daher möglich, nur sichtbare Wurzeln auf der Rückseite zu verfolgen.

12. Ernte Triebe und Erlangung von Root und Bodenproben zur Analyse

  1. Legen Sie die erste Rhizobox flach und entfernen Sie die Schrauben.
  2. Ernten Sie die Shooting-Proben. Clip-Triebe an der Basis, jedem Boden mit VE-Wasser abspülen und Trocknen bei 60 ° C. Grind schießt mit einem Mörser und Stößel wiegen Teilproben in Zinn Kapseln für Isotopen-Analyse (siehe Abschnitt 14) und durch ein 2 mm Sieb passieren.
  3. Nutzen Sie die Transparenz als Leitfaden, um die Behandlung und Kontrolle Patches mit einem Rasiermesser geschnitten. Verwenden Sie einen Löffel oder Spatel zu den Wurzeln und der anhaftenden Rhizosphäre Boden in den jeweiligen Behandlung oder Kontrolle Beutel schöpfen.
    Hinweis: Zwar gibt es viele Methoden zur separaten Rhizosphäre Boden, der Boden unter dem Einfluss der Pflanze15 Wurzeln, und die Rhizosphäre werden, einen Farbverlauf, anstatt eine streng abgegrenzte Zone16 betrachtet kann, folgt diese Methode die verbreitete Definition des Bodens, die sich um die Pflanzenwurzeln nach dem schütteln17hält.
  4. Schöpfen Sie die verbleibenden Wurzeln und Boden in die dritte Tasche.
  5. Übergeben Sie die Behandlung, Kontrolle, und bulk-Proben durch ein 2 mm Sieb Substrat, entfernen alle sichtbaren Wurzeln oder Fragmente Wurzeln getrennt > 1 cm in der Länge mit einer feinen Pinzette. Bewahren Sie diese getrennt voneinander für eine Gesamtmenge von drei grundlegenden und drei Substrat Proben.

13. Validierung von Kurven und Abschätzung der relativen Wurzel Wachstumsraten

  1. Behandlung, Kontrolle, zu scannen und bulk-Proben und Berechnen der Wurzellänge.
    1. Spülen Sie mit einer Probe gleichzeitig arbeiten, Wurzeln vorsichtig mit VE-Wasser, alle restlichen Substrat zu entfernen. Ordnen Sie Proben in einem klaren Tablett so an, dass die Wurzeln nicht überlappen.
    2. Scannen Sie Proben mit einem Scanner kompatibel mit Wurzel-Analyse-Software (z. B. WinRhizo). Stellen Sie sicher, dass die Software kalibriert ist, um zuverlässig Wurzeln aus dem Bildhintergrund zu unterscheiden.
    3. Verwenden Sie die Software zur Messung insgesamt Wurzellänge und Wurzellänge in den Durchmesser-Klassen von Interesse (z. B. < 0,2 mm, 0.2\u20120.4 mm, 0.4\u20120.8 mm, 0.8\u20121.6 mm, > 1,6 mm).
  2. Wurzel Länge Dichte (RLD) für Behandlung und Kontrolle Patches und für jedes Rhizobox als Ganzes zu berechnen.
    1. Berechnen Sie das Volumen der Behandlung und Kontrolle Patches multipliziert Bereich auf jede Transparenz verfolgt (siehe Punkt 8.1) 0,635 cm, die Tiefe des Feldes. Diese Volumes verwenden, um Wurzel Länge Dichte in Behandlung und Kontrolle Patches mit der gesamten Wurzellänge in jedem Patch zu berechnen (siehe Schritt 13.1.3).
      Equation 1
    2. Berechnen Sie das Volumen des Substrats in jeder Rhizobox durch Multiplikation der Gegend zurückgeführt auf die Transparenz (siehe Punkt 8.1) x 0,635 cm. berechnen RLD für die Behandlung und Kontrolle Patches.
      Equation 2
  3. Überprüfen Sie die Wurzel tracing Methode durch den Vergleich der gescannten Wurzelsysteme und Bilder verfolgt.
    1. Scannen Sie jede Transparenz und berechnen Sie total Wurzellänge, die Verwendung der Software zu. Speichern Sie das gescannte Bild für Wachstum Rate Berechnungen.
    2. Summe der gesamten Wurzel Längenmessungen der Behandlung, Kontrolle, und bulk-Proben für jede Box (siehe Schritt 13.1.3).
    3. Die gescannten und vektorisierte Testmessungen der gesamte Wurzellänge zu sehen, ob die Korrelation statistisch signifikant ist.
      Hinweis: Wenn ja, die Ablaufverfolgung Methode validiert und relativen Wachstumsraten können zu jeden Zeitpunkt berechnet werden. Ist dies nicht der Fall, nur die gescannten Wurzelsystem Daten liefert eine genaue Angabe des Wurzelwachstums. Dies könnte der Fall sein, wenn die Ablaufverfolgung Methodik unvereinbar war oder Wurzeln zum Beispiel nicht gleichermaßen für alle Genotypen sichtbar waren.
  4. Wenn die Ablaufverfolgung Methode validiert wurde, berechnen Sie relative Wurzel Wachstumsraten für jedes Rhizobox.
    1. Wurzel-Analyse-Software kalibriert werden, um zu unterscheiden zwischen den ausgewählten Ablaufverfolgung Farben total Wurzellänge in Behandlung, Kontrolle, Messen und bulk-Proben zu jedem Zeitpunkt zu verwenden. Kumulative Summe Wurzellänge zu jedem Zeitpunkt zu berechnen.
    2. Relative Wurzel Wachstumsraten (RGRWurzel) für jede Rhizobox als auch für die Behandlung und Kontrolle Patches für jede Zeit Intervall t1-t2 wie folgt zu berechnen.
      Equation 3
      Hinweis: Hier L1 ist total Wurzellänge im Patch (kumulative Summe von 11,3) t1 Tage nach Transplantation (DAT) und L2ist total Wurzellänge in den Patch t2 DAT.

14. die Analyse von 15N Partitionierung unter Root, schießen und Behandlung Bodenproben

  1. Wurzeln bei 60 ° C trocknen, wiegen Biomasse und Schleifen durch ein 2 mm Sieb passieren.
  2. Trockenen Teilproben der Behandlung Boden bei 60 ° C.
  3. Wurzeln und Behandlung in Zinn Kapseln wie bei der Triebe zu verpacken.
    Hinweis: Ideal Probengewicht pro Kapsel sollte separat für Triebe, Wurzeln und Boden basierend auf dem geschätzten C/N Verhältnis des Materials zu den Zielbetrag von insgesamt N für die Analyse berechnet werden. Kontaktieren Sie die stabilen Isotop Anlage wo die Proben müssen weitere Informationen eingereicht werden. Für dieses Experiment waren die Anweisungen zur Vorbereitung der Probe und Probe Weight Calculator zur Verfügung gestellt von der UC Davis stabiles Isotop Anlage folgten18.
    Achtung: Besondere Vorsicht zu mischen Proben gleichmäßig vor dem Verpacken in Kapseln und bereiten Sie mehrere Kapseln pro Probe. Wenn Proben nicht gleichmäßig gemischt werden, kann scheinbare Erholung von 15N ursprünglich vorhandenen übersteigen.
  4. Insgesamt N, δ15 und 15N Inhalt jedes Shooting, Wurzel und Behandlung Bodenprobe analysieren.
    Hinweis: In diesem Experiment wurden Pflanzenproben über Verbrennung mit einem elementaren PDZ Europa ANCA-GSL-Analyzer eine Schnittstelle zu einem PDZ Europa 20-20-Isotop Verhältnis Massenspektrometer an der UC Davis stabiles Isotop Anlage (UCD SIF) analysiert. Bodenproben wurden mit einem Elementar Elementar Vario EL Cube-Analysator eine Schnittstelle zu einem PDZ Europa 20-20 Isotop Verhältnis Massenspektrometer an der UCD SIF analysiert.
  5. Berechnen Sie die Menge schießen 15N aus dem Etikett im Werk gewonnen und Wurzel Proben.
    1. Berechnen Sie zunächst, den Betrag von 15N über atmosphärische 15N in jedem Pool 15P *:
      Equation 4
      wo 15P 15N Inhalt in Atom-% des Pools von Interesse ist.
    2. Zweitens: Berechnen Sie die Menge von 15N über atmosphärische 15N in der Bezeichnung, 15L *:
      Equation 5
      wo ist 15L 15N Inhalt in Atom-% der beschrifteten N Quelle.
    3. Drittens: Berechnen Sie die Menge von insgesamt N in jedem Pool Np:
      Equation 6
      Wo befindet sich die Masse des Pool (z. B. total trocken schießen oder Wurzel Biomasse) und %p mp ist der Prozentsatz von N dieses Pools.
    4. Schließlich verwenden Sie die Ergebnisse der 14.5.1\u201214.5.3 im Ndff Gleichung19 um das erhalten von dem Label, NlN berechnen:
      Equation 7
      Hinweis: Die Ndff Gleichung wird verwendet, um die Menge an N aus einer beschrifteten Quelle bestimmen, die von Pflanzen gewonnen wird. Es wird davon ausgegangen, dass keine isotopischen Diskriminierung während der N-Aufnahme durch die Pflanze tritt und in der Regel gültig für N Quellen angereicherte ~1\u201210%19 ist.

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Representative Results

Wurzeln wuchs bevorzugt gegen die Rückseite der Box, wie erwartet. Insgesamt verfolgt Wurzellänge auf der Rückseite der Box lag zwischen 400 und 1.956 cm, verglichen mit 93-758 cm auf der Vorderseite der Box. Paarweise Pearson Korrelationskoeffizienten zwischen gescannten Wurzellänge und vektorisierte Wurzellänge auf der Vorderseite der Box, Kabelverschraubungen, berechnet wurden und die Summe der Vorder- und Rückseite wurde verwendet, um festzustellen, ob genau nachzeichnen total Wurzellänge reflektiert (n = 23, als Das Werk in einer Box starb während des Experiments). Gescannte total Wurzellänge war signifikant korreliert mit nachgezeichneten Wurzellänge auf der Rückseite der Box (Abbildung 5A, p = 0.0059), front der Box (Abbildung 5 b, p = 0,022), und die Summe der hinten und vorne (Abbildung 5, p = 0.0036). tracing nur die Rückseite der Box ist somit als eine repräsentative Maßnahme des Wurzelwachstums und Halbierung der Zeitaufwand für die Ablaufverfolgung Wurzeln geben validiert. Es sollte jedoch darauf hingewiesen, dass die Ablaufverfolgung nur 21,6-54,6 % der gesamten Wurzellänge erfasst. Während Wurzeln bevorzugt gegen die Oberfläche der Rhizobox wachsen, können feine Seitenwurzeln insbesondere nicht für die Ablaufverfolgung sichtbar. Tracing eignet sich gut für relative Vergleiche der Wurzellänge im Laufe der Zeit besonders früh in der Entwicklung, aber Ernte und Scansysteme Wurzel ist wünschenswert, wenn das Ziel ist, die gesamte Wurzellänge genau zu quantifizieren.

Figure 5
Abbildung 5: Korrelationen zwischen zurückverfolgt und Wurzel Längendaten gescannt. A) Traced Wurzellänge war signifikant korreliert mit gescannten Wurzellänge, wenn nur die Vorderseite des Gehäuses zurückzuführen war. B) Wurzeln auf der Rückseite der Box, wo die Mehrheit der Wurzeln sichtbar waren, verbessert den R-2 -Wert der Regression gegen gescannten Wurzellänge über Verfolgung der Vorderseite der Box; die Korrelation war wieder signifikant. ( C) die genaueste Methode ist Spur Wurzeln auf beiden Seiten der Box, dargestellt durch die höchsten R-2 -Wert der drei Methoden und die signifikante Korrelation mit gescannt Wurzellänge. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Root-Wachstumsraten im Laufe der Zeit glichen sich unter Boxen, dargestellt durch konsequente Pisten beim Plotten der natürlichen Logarithmus der gesamte Wurzellänge gegen die Zeit (Abbildung 6). Während leichte Variabilität ist zu erwarten, zufolge konsequente Wachstumsraten Versuchsbedingungen einheitlich für alle Boxen wurden. Dramatisch unterschiedliche Steigungen würden zeigen, dass Pflanzen mit unterschiedlicher Geschwindigkeit wuchsen, was auf die Notwendigkeit für Unterschiede in der Variablen wie Temperatur oder Feuchtigkeit zu überprüfen.

Figure 6
Abbildung 6: Root-Wachstumsraten im Laufe der Zeit. Ähnliche hängen der Wurzel Länge vs. Zeit unter Rhizoboxes zeigen, dass Wurzeln zu gleichen Preisen wuchsen. Non-Uniform hängen könnte bedeuten, dass die experimentelle Bedingungen variieren zwischen den Rhizoboxes. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Wurzeln von allen Mais Genotypen vermehrt in Flecken mit 15N beschriftet Zwischenfrucht Rückstände. Zwei-Wege-ANOVA mit Patch-Typ und Genotyp als feste Faktoren (n = 23) ergab, dass Wurzel Länge Dichte höher in Behandlung als Kontrolle Patches mit gescannten Wurzel Daten (Abbildung 7a, p = 0.013) sowie vektorisierte Wurzel Daten (Abbildung 7 b, p = 0,005). RLD war nicht signifikant unterschiedlich zwischen Genotypen in jedem Fall.

Figure 7
Abbildung 7: Root-Länge Dichte von Genotyp und Wurzel Daten Typ. ein) Gescannte Wurzel Daten zeigten, dass alle Genotypen (A-F) verbreitete sich in der Behandlung (T)-Patch und genotypischen Unterschiede nicht signifikant waren. b) geerntet und gescannte Wurzel Daten bestätigt die Auswirkung der Hülsenfrucht Rückstand aber nicht Genotyp (A-F), auf root-Länge Dichte in Flecken. Buchstaben A-F sechs verschiedene Genotypen und Fehlerbalken darstellen Standardfehler. C: Kontrolle; T: Behandlung. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Fußkreisdurchmesser kann verwendet werden, um Rückschlüsse auf die Wurzelfunktion und Umsatz zu machen. FEINWURZELN sind eher Seitenwurzeln, die schnell zu entwickeln und vermehren sich in Reaktion auf Ressource Hotspots, während größere grobe Wurzeln eher langlebig, langsam reagieren axiale Wurzeln sind. Gescannte Wurzel-Systeme wurden für den Anteil der Wurzeln in jede Durchmesserklasse analysiert: < 0,2 mm, 0,2-0,4 mm, 0,4-0,8 mm, 0,8-1,6 mm, und > 1,6 mm und jeder Größenklasse genotypischen Unterschiede getestet wurde. Genotypen mit mehr FEINWURZELN in Behandlung Flecken könnte darauf hindeuten, dass eine effizientere Verbreitung Antwort. Einfache ANOVA mit Genotyp als festen Faktor (n = 23) ergab, dass Genotypen nicht unterscheiden sich in der Wurzellänge in jeder Größenklasse für das Wurzelsystem insgesamt (Abb. 8a), Behandlung Patches (Abbildung 8 b), oder Patches (Abbildung 8 c) zu kontrollieren. Ein Großteil der Wurzeln waren FEINWURZELN (< 0,2 mm).

Figure 8
Abbildung 8: Anteil der Wurzeln in verschiedenen Durchmesser Klassen von Genotyp und Standort. ein) In jedes Rhizobox (mit Ausnahme von Behandlung und Kontrolle-Patches), die Mehrheit der Wurzeln waren in Ordnung (< 0,2 mm im Durchmesser). Genotypen unterschieden sich nicht in den Proportionen der Wurzeln in jeder Durchmesserklasse. ( b) Behandlung Patches Wurzellänge pro Größenklasse sank ebenfalls mit zunehmendem Durchmesser über Genotypen. c) Kontrolle Patches zeichneten sich durch die gleichen Muster. Buchstaben A-F sechs verschiedene Genotypen und Fehlerbalken darstellen Standardfehler. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

Label N lag in Shooting über Wurzelproben Genotypen nach zwei-Wege-ANOVA mit Probentyp und Genotyp als feste Faktoren (n = 23, Abbildung 9), zeigt, dass 77-81 % N entnommen der Behandlung-Patch aus Wurzeln, Triebe während umgesiedelt wurde Das Experiment. Einfache ANOVA (n = 23) zeigte, dass δ15N der Wurzel und schießen Proben nicht variieren je nach Genotyp.

Figure 9
Abbildung 9: Stickstoff von Leguminosen Rückstände in Wurzeln und Triebe bei der Ernte erhalten. Alle Genotypen wurden ebenso effektiv bei der Aufnahme N aus dem Pflaster, 15N beschriftet Hülsenfrucht Rückstände enthält. Die Mehrheit der N aus dem Pflaster aufgegriffen wurde von Wurzeln, Triebe umgesiedelt. Buchstaben A-F sechs verschiedene Genotypen und Fehlerbalken darstellen Standardfehler. Bitte klicken Sie hier für eine größere Version dieser Figur.

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Discussion

Die in diesem Protokoll beschriebenen Rhizoboxes kann verwendet werden, für vielfältige Fragen in der Wurzel und Rhizosphäre Wissenschaft, und haben festgestellt, dass diverse anderswo verwendet10,20,21,22,23 , 24 , 25. andere Forscher haben erfasst Zeitraffer Bilder von Rhizoboxes21,25,26, einige mit automatisierten Systemen22,27. Diese Ansätze können für Quantitative Analysen der Wurzellänge und Architektur nicht möglich mit Tracing-Methoden verwendet werden. Rhizoboxes haben auch verwendet worden, mikrobielle Gemeinschaften mit Techniken wie Fluoreszenz in Situ Hybridisierung (FISH) und Mikro-Autoradiographie (MAR)21,22zu visualisieren oder räumlich explizite zu erfassen Muster von Wasser und Nährstoffen Ressourcen mit RGB bildgebenden24 oder extrazellulären Enzymaktivität mit Zymography11,30. Die hier vorgestellten Rhizoboxes sind insofern einzigartig aus früheren Entwürfen, sie relativ groß sind, die es ermöglichen, Arten mit umfangreichen Wurzelsysteme studieren; haben Sie ein einfaches Einkammer-Design; Verwenden Sie schnell verfügbare, preiswerte Materialien; und sind speziell für lokalisierte Patches zu studieren. Die Vielseitigkeit dieses Rhizobox-Protokolls können es für eine Reihe anderer Anwendungen in Wurzel Plastizität und Interaktionen der Rhizosphäre angepasst werden. Andere Nährstoffe können Stickstoff in den Patches ersetzen. Immobile Nährstoffe wie Phosphor würde weniger Auswaschung ausgesetzt werden wahrscheinlich macht sie eine gute Passform für diesen Ansatz. Die Rhizoboxes sind auch gut geeignet für Vergleiche von Massen- und Rhizosphäre Boden, wie die Zone der Wurzel Einfluss (eine langjährige Definition für die Rhizosphäre15) kann klarer als in Topf Studien abgegrenzt und von Bulk-Boden mit einem Rasiermesser getrennt bei der Ernte. Anpassung dieser Methode auf, um die Rhizosphäre Prozesse zu studieren eröffnet vielfältige neue Möglichkeiten zur Erweiterung des Protokolls, einschließlich Untersuchung der beiden abiotische und biotische Interaktionen23.

Die hier vorgestellte Rhizobox-Methode eignet sich gut für Messung relativen Unterschiede zwischen Genotypen oder Spezies in Wurzelwachstum bereits während der Entwicklung, Charakterisierung von Beziehungen zwischen den Eigenschaften der Wurzel und Erforschung der Auswirkungen von Bodeneigenschaften auf Wurzelwachstum . Bestimmte Schritte des Protokolls sind besonders kritisch, weil sie mit unverhältnismäßig hohen Einfluss auf das Wurzelwachstum Faktoren: Feuchtigkeit, Schüttdichte und Neigung des Bodens. Bewässerung gleichmäßig über Boxen ist wichtig angesichts des Einflusses der Bodenfeuchtigkeit auf Stamm Wachstum Muster1,31. Pilot Experimente zeigten, dass Wasser durch Tropf-Strahler geliefert nach 24-48 h durch Kapillarwirkung verteilt wurde; Variabilität unter Strahler in das Volumen des Wassers in einem gegebenen Bewässerung Zeitraum geliefert war jedoch zu hoch, um diese Methode mit unserem Arrangement wird empfohlen. Bewässerung von Hand langsam und gleichmäßig war das beste der Techniken getestet, aber andere Bewässerungsmethoden sind durchaus möglich. Bewässerung zu einem zuvor berechneten Gewicht sorgt dafür, dass alle Felder die gleiche Bodenfeuchte, verhindern Variabilität im Wurzelwachstum durch Wasser Stress32pflegen. Das Gewicht des leeren Rhizoboxes kann stark variieren, also Berechnung ideal Gewichte für die einzelnen Boxen wichtig.

Wie bei Feuchtigkeit, ist die Einrichtung auch Schüttdichte des Substrates während der Rhizobox entscheidend für Wurzel Verbreitung Antworten zu messen. Wurzeln wachsen mehr ausgiebig in weniger dichten Boden33 und Verdichtung kann Kanäle für bevorzugte Wasserfluss, Auswirkungen auf Weitere Ressourcen Verteilung und Wurzel Wachstum Muster34zu schaffen. Trocknen und Siebung Bereich Boden, gründlich mischen, Sand und Erde und bewegt den Trichter hin und her langsam und gleichmäßig schaffen eine homogene Matrix für Wurzelwachstum.

Eine Reihe von Komponenten innerhalb dieses Experiments hängt die Forschungsfragen der Zinsen sowie den Boden-Typ und Pflanzenarten innerhalb der Studie genutzt. Das Verhältnis von Sand zu Boden müssen möglicherweise angepasst werden, für die Böden von verschiedenen Texturen, um sicherzustellen, dass das Substrat gleichmäßig ohne verklumpen benetzt. Pilot Experimente zeigten, dass einen 1:1 (V/V) Boden: Sand-Gemisch 1:2 oder 1:3 Mischungen für den Boden verwendet in diesem Experiment, ein sehr feiner sandiger Lehm überlegen war. Die Abmessungen der Rhizoboxes und Dauer des Experiments können je nach Fragestellung, Stamm-Merkmale und Pflanzenarten des Interesses eingestellt werden. Mais ist eine relativ schnell wachsende Pflanzenarten; Wir haben daher Rhizobox größer im Vergleich zu anderen Rhizobox Studien20,35 , ein ausreichendes Volumen des Bodens bieten, das Experiment erlaubt weiterhin für die optimale Dauer wie Pflanzen zunehmend überständig im Laufe der Zeit. Schließlich muss der Einbau von statistischen Modellen, sichtbar und vektorisierte Wurzelwachstum für jede Studie und Arten von Interesse, vielleicht mit Pilotversuchen ermittelt werden. Sichtbare Wurzelwachstum kann folgen einer Sättigung Kurve eher als ein lineares Modell25,36, und die Neigung der Regression der geernteten Wurzeln sichtbar variiert je nach Pflanze Arten21.

Wurzeln haben eine inhärente Tendenz zur Schwerkraft zu verfolgen und zu vermeiden, leichte37, aber muss darauf geachtet werden, um sicherzustellen, dass Gravitropismus und leichte Vermeidung nicht-Stamm Wachstum Daten bias zu tun. Wenn Gewächshaus Bänke leicht geneigt sind, wächst z. B. Wurzeln hinunter die Steigung eher als Reaktion auf Nährstoff-Patches. In ähnlicher Weise könnte leichte Steigungen im Gewächshaus Verschiebungen in Sprosswachstum und Wurzeln, bevorzugt auf der einen Seite zu wachsen, wenn die Rhizoboxes nicht ganz dunkel gehalten werden. Die leichten Entzug Fälle präsentiert im Protokoll sind ein wirksames Mittel zur Verringerung der einfallender Licht, aber auch andere Methoden wie die Rhizoboxes in Alufolie wickeln auch arbeiten kann.

Die hier vorgestellte Methode der zerstörungsfreien Rhizobox erleichtert die Nachverfolgung von Wurzeln in Situ über Zeit38 und von einer Studentin mit grundlegenden Kenntnisse von Elektrowerkzeugen umgesetzt werden kann. Als solches bietet es Vorteile gegenüber destruktiven Erntemethoden wie Shovelomics6, die sind besser geeignet, ältere Wurzel Architekturstudium erlauben jedoch nicht wiederholte Messungen von der gleichen Wurzel-System über die Zeit, und MRT oder Röntgen berechnet Tomographie39,40, die es ermöglichen, dass qualitativ hochwertige Bildgebung von Wurzel-Substrat Interaktionen aber teure Ausrüstung erfordert. Es ist jedoch nicht ohne Einschränkungen. Bau der Rhizoboxes kann sehr zeitaufwendig sein und gewährleisten, dass Faktoren wie Feuchtigkeit, Schüttdichte, Neigung und Licht möglichst einheitlich sein, wie oben beschrieben, ist nicht trivial. Dennoch, da genügend Zeit und Liebe zum Detail, die Rhizoboxes zuverlässige Ergebnisse liefern und für viele Experimente wiederverwendet werden.

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Disclosures

Die Autoren haben nichts preisgeben.

Acknowledgments

Die Autoren möchten anonyme Gutachter für ihr Feedback, sowie j.c. Cahill und Tan Bao für erste Orientierung auf die Entwicklung des Rhizobox-Protokolls zu bestätigen. Finanzierung wurde von der Stiftung für Nahrung und Landwirtschaft Forschung, das US Department of Agriculture (USDA) National Institute of Food and Agriculture, landwirtschaftliche Experiment-Station Projekt CA-D-PLS-2332-H, um A.G. und von der UC Davis Abteilung der Pflanze zur Verfügung gestellt Wissenschaften durch ein Stipendium um j.s.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
1.27 cm diameter PVC pipe JM Eagle 530048 305 cm per box, cut into lengths as specified in the protocol
PVC side elbows Lasco 315498 2 per box
PVC 90-degree elbows Charlotte PVC 02300 0600 4 per box
PVC T joints Charlotte PVC 02402 0600 4 per box
Extruded acrylic panes TAP Plastics N/A 2 per box, 0.64 cm thick x 40.5 cm wide x 61 cm long
HDPE spacers (sides) TAP Plastics N/A 2 per box, 0.64 cm thick x 2.5 cm wide x 57 cm long
HDPE spacers (bottom) TAP Plastics N/A 1 per box, 0.64 cm thick x 2.5 cm wide x 40.5 cm long
HDPE spacers (patch) TAP Plastics N/A 2 per box, 0.64 cm thick x 3.8 cm wide x 28 cm long
Polyester batting Fairfield #A-X90 2.5 cm x 40.5 cm strip per box
20-thread screws N/A N/A 3.2 cm long, 0.64 cm diameter
Washers N/A N/A 0.64 cm internal diameter
Hex nuts N/A N/A sized to fit the screws
Light deprivation fabric Americover, Inc. Bold 8WB26.5 1 piece 95 cm wide and 69 cm long per box
Sand Quikrete No. 1113
Field soil N/A N/A
Transparencies for tracing FXN FXNT1319100S One per side of the box to be traced

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Schmidt, J. E., Lowry, C., Gaudin,… More

Schmidt, J. E., Lowry, C., Gaudin, A. C. M. An Optimized Rhizobox Protocol to Visualize Root Growth and Responsiveness to Localized Nutrients. J. Vis. Exp. (140), e58674, doi:10.3791/58674 (2018).

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