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Article de méthode

Stabilité et structure du complexe histocompatibilité majeur de chauve-souris classe I avec β2-Microglobuline

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DOI :

10.3791/61462

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10 mars 2021

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* These authors contributed equally

Dans cet article

Résumé

Le protocole décrit les méthodes expérimentales pour obtenir stable majeur complexe d’histocompatibilité (MHC) classe I grâce à des substitutions potentielles de β2-microglobuline (β2m) de différentes espèces. La comparaison structurale du MHC I stabilisée par des dommages homologues et β2m ont été étudiées.

Résumé

Le principal complexe d’histocompatibilité (MHC) joue un rôle central dans la présentation du peptide antigène et les réponses immunitaires des cellules T contre les maladies infectieuses et le développement tumoral. Le MHC hybride I complexé d’une substitution β2microglobulines (β2m) de différentes espèces peut être stabilisé in vitro. Il s’agit d’un moyen réalisable d’étudier le MHC I des mammifères, lorsque le β2m n’est pas disponible. Pendant ce temps, il est indiqué que la substitution β2m n’affecte pas significativement la présentation du peptide. Cependant, il y a peu de résumé s’agissant de la méthodologie et de la technologie du MHC hybride I complexés avec des β heterologous2-microglobuline (β2m). Ci-après, des méthodes d’évaluation de la faisabilité d’une substitution β2m dans l’étude MHC I sont présentées. Ces méthodes comprennent la préparation de constructions d’expression; la purification des organismes d’inclusion et le refolding du complexe du CSM; détermination de la thermostabilité des protéines; le criblage en cristal et la détermination de la structure. Cette étude fournit une recommandation pour comprendre la fonction et la structure du MHC I, et est également significative pour l’évaluation de réponse de cellule T pendant la maladie infectieuse et l’immunothérapie de tumeur.

Introduction

Le principal complexe d’histocompatibilité (MHC) existe chez tous les vertébrés et est un ensemble de gènes qui détermine l’immunité à médiatté cellulaire contre les pathogènes infectieux. La classe I du MHC présente des peptides endogènes, tels que des composants viraux produits lors de l’infection virale, aux récepteurs des lymphocytes T (TCR) à la surface des lymphocytes CD8+ T pour jouer le rôle de médiateur de l’immunité cellulaire et participer à la régulationimmunitaire 1. Une étude structurale du MHC I liant aux peptides fournit des informations concernant les motifs de liaison peptidique et les caractéristiques de présentati....

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Protocole

1. La préparation de l’expression construit

  1. Récupérer les séquences des gènes de classe I du MHC (y compris les gènes prévus) à partir des chauves-souris de la base de données NCBI.
  2. Récupérez des séquences de chaînes lourdes MHC I plus élevées à partir de la Base de données sur l’immunomorphisme (DPI) (www.ebi.ac.uk/ipd/mhc) et de la base de données UniProt (www.uniprot.org).
  3. Pour obtenir des complexes solubles de MHC, mutagenize les séquences pour enlever les régions cytosolic et transmembrane.
  4. Cloner les gènes codant les ectodomains de la chauve-souris Ptal-N*01:01 (GenBank no. KT98792919) (résidus 1-27....

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Résultats

Des travaux antérieurs ont rapporté que le peptide HeV1 (DFANTFLP) dérivé de HeV a été présenté par Ptal-N*01:0110,19. Dans ce cas, la capacité de liaison de ce peptide à Ptal-N*01:01 avec une chauve-souris homologue β2m (bβ2m) e.......

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Discussion

La construction d’un complexe protéique hybride par substitution héterologique de différents taxons est une stratégie commune pour les investigations fonctionnelles et structurelles lorsque le complexe homologue n’est pas disponible, comme dans le MHC I et ses ligands. Toutefois, il y a peu de résumé s’agissant de la méthodologie et de la technologie. Dans ce cas, la structure de la chauve-souris MHC I, Ptal-N*01:01, stabilisée par bβ2m ou hβ2m a été analysée. Les acides aminés clés de βliaison.......

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Déclarations de divulgation

Les auteurs n’ont rien à déclarer.

Remerciements

Cette étude a été soutenue par le fonds ouvert du laboratoire clé d’État de la biotechnologie pharmaceutique, Université de Nan-jing, Chine (Subvention no. KF-GN-201905), la National Natural Science Foundation of China (subventions 81971501). William J. Liu est soutenu par l’Excellent Young Scientist Program de la NSFC (81822040) et beijing New-star Plan of Science and Technology (Z181100006218080).

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Matériaux

Liste des matériaux utilisés dans cet article
NomEntrepriseNuméro de catalogueCommentaires
10 kDa MMCO membraneMerck milliporePLGC07610
30 % AcrylamideLABLEADA3291-500ml*5
5&fois ; Protein SDS LoadingNovoproteinPM099-01A
AMICON ULTRA-15 15ML-10 KDa cutoffMerck milliporeUFC901096
AmpicillineInalco1758-9314
APSSigmaA3678-100G
soucheTIANGENCB105-02
DMSOMP219605580Portez des gants appropriés et une protection oculaire/faciale. En cas de contact avec les yeux, rincer immédiatement et abondamment à l’eau et consulter un médecin.
DTTSolarbioD1070doivent être portés et utilisés dans une cuisine ventilée. En cas de contact avec les yeux, rincer immédiatement et abondamment à l’eau et consulter un médecin.
EDTA-2NaKeyGEN BioTECHKGT515500
GlycérineHUSHI10010618
GSHAmresco0399-250G
GSSGAmresco0524-100G
Chlorhydrate de guanidineAmrescoE424-5KG
h&beta ; 2mnotre laboratoireZhang, S. et al. Base structurelle de la présentation inter-allèle par HLA-A*0301 et HLA-A*1101 révélée par deux complexes peptidiques dérivés du VIH. Mol Immunol. 49 (1) et 2), 395 et 401 (2011).
IPTGInalco1758-1400
Chlorhydrate de L-arginineAmresco0877-5KG
NaClSolarbioS8210
Marqueur protéiqueFermentas26614
SDSBoao Rui JingA112130
Superdex Increase 200 10/300 GLGE Healthcare28990944
TEMEDThermo17919Les gants et les lunettes de protection doivent être portés et utilisés dans une cuisine ventilée.
Tris-HClAmresco0497-5KG
Triton X-100BiorulerRH30056-100mL
TryptoneOxoidLP0042
Extrait de levureOxoid LP0021
Les gants et les lunettes de protection

Références

  1. Vyas, J. M., Van der Veen, A. G., Ploegh, H. L. The known unknowns of antigen processing and presentation. Nature Reviews Immunology. 8 (8), 607-618 (2008).
  2. Bjorkman, P. J., et al. Structure of the human class I histocompatibility antigen, HLA-A2. Nature. ....

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Réimpressions et autorisations

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