Waiting
Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Biochemistry

Kwantitatieve fractioneringstechniek voor microtubuli om stabiele microtubuli, labiele microtubuli en vrije tubuline in muizenweefsels te scheiden

Published: November 17, 2023 doi: 10.3791/63358

Summary

Microtubuli, die tubulinepolymeren zijn, spelen een cruciale rol als onderdeel van het cytoskelet in eukaryote cellen en staan bekend om hun dynamische instabiliteit. Deze studie ontwikkelde een methode voor het fractioneren van microtubuli om ze te scheiden in stabiele microtubuli, labiele microtubuli en vrije tubuline om de stabiliteit van microtubuli in verschillende muizenweefsels te evalueren.

Abstract

Microtubuli, samengesteld uit α/β-tubulinedimeren, zijn een cruciaal onderdeel van het cytoskelet in eukaryote cellen. Deze buisachtige polymeren vertonen dynamische instabiliteit als tubuline-heterodimeersubeenheden repetitieve polymerisatie en depolymerisatie ondergaan. Nauwkeurige controle van de stabiliteit en dynamiek van microtubuli, bereikt door posttranslationele modificaties van tubuline en microtubuli-geassocieerde eiwitten, is essentieel voor verschillende cellulaire functies. Disfuncties in microtubuli zijn sterk betrokken bij de pathogenese, waaronder neurodegeneratieve aandoeningen. Lopend onderzoek richt zich op microtubuli-gerichte therapeutische middelen die de stabiliteit moduleren en mogelijke behandelingsopties bieden voor deze ziekten en kankers. Daarom is het begrijpen van de dynamische toestand van microtubuli cruciaal voor het beoordelen van ziekteprogressie en therapeutische effecten.

Traditioneel wordt de dynamiek van microtubuli in vitro of in gekweekte cellen beoordeeld door middel van ruwe fractionering of immunoassay, met behulp van antilichamen die gericht zijn op posttranslationele modificaties van tubuline. Het nauwkeurig analyseren van de tubulinestatus in weefsels met behulp van dergelijke procedures brengt echter uitdagingen met zich mee. In deze studie ontwikkelden we een eenvoudige en innovatieve fractioneringsmethode voor microtubuli om stabiele microtubuli, labiele microtubuli en vrije tubuline in muizenweefsels te scheiden.

De procedure omvatte het homogeniseren van ontlede muizenweefsels in een microtubuli-stabiliserende buffer met een volumeverhouding van 19:1. De homogenaten werden vervolgens gefractioneerd door middel van een ultracentrifugatieproces in twee stappen na de eerste langzame centrifugatie (2.400 × g) om vuil te verwijderen. De eerste ultracentrifugatiestap (100.000 × g) precipiteerde stabiele microtubuli, terwijl het resulterende supernatans werd onderworpen aan een tweede ultracentrifugatiestap (500.000 × g) om labiele microtubuli en oplosbare tubulinedimeren te fractioneren. Deze methode bepaalde de verhoudingen van tubuline die stabiele of labiele microtubuli in de muizenhersenen vormen. Bovendien werden duidelijke weefselvariaties in de stabiliteit van microtubuli waargenomen die correleerden met de proliferatieve capaciteit van samenstellende cellen. Deze bevindingen benadrukken het aanzienlijke potentieel van deze nieuwe methode voor het analyseren van de stabiliteit van microtubuli in fysiologische en pathologische omstandigheden.

Introduction

Microtubuli (MT's) zijn langwerpige buisvormige structuren die bestaan uit protofilamenten die bestaan uit α/β-tubuline heterodimeersubeenheden. Ze spelen een essentiële rol in verschillende cellulaire processen, zoals celdeling, beweeglijkheid, vormbehoud en intracellulair transport, waardoor ze integrale componenten zijn van het eukaryote cytoskelet1. Het min-uiteinde van MT's, waar de α-tubuline-subeenheid wordt blootgesteld, is relatief stabiel, terwijl het plus-uiteinde, waar de β-tubuline-subeenheid wordt blootgesteld, dynamische depolymerisatie en polymerisatie ondergaat2. Deze continue cyclus van tubulinedimeeradditie en dissociatie aan het plus-uiteinde, aangeduid als dynamische instabiliteit, resulteert in een repetitief proces van redding en catastrofe3. MT's vertonen focale domeinen met gelokaliseerde variaties in dynamische instabiliteit, waaronder stabiele en labiele domeinen4.

Nauwkeurige controle van de dynamische instabiliteit van MT's is cruciaal voor tal van cellulaire functies, met name in neuronen die worden gekenmerkt door ingewikkelde morfologieën. Het aanpassingsvermogen en de duurzaamheid van MT's spelen een cruciale rol bij de ontwikkeling en het goed functioneren van zenuwcellen 5,6,7. De dynamische instabiliteit van MT's blijkt geassocieerd te zijn met verschillende posttranslationele modificaties (PTM's) van tubuline, zoals acetylering, fosforylering, palmitoylering, detyrosinatie, delta 2, polyglutamine-oxidatie en polyglycylering. Bovendien dient de binding van microtubuli-geassocieerde eiwitten (MAP's) als een regulerend mechanisme8. PTM's, met uitzondering van acetylering, komen voornamelijk voor in het tubuline-carboxy-terminale gebied dat zich aan de buitenkant van MT's bevindt. Deze modificaties creëren verschillende oppervlaktecondities op MT's, beïnvloeden hun interactie met MAP's en bepalen uiteindelijk de stabiliteit van MT's9. De aanwezigheid van een carboxy-terminaal tyrosineresidu in α-tubuline is een indicatie van dynamische MT's, die snel worden vervangen door de vrije tubulinepool. Omgekeerd duiden detyrosinatie van het carboxy-eindpunt en acetylering van Lys40 op stabiele MT's met verminderde dynamische instabiliteit 9,10.

De PTM's van tubuline zijn uitgebreid gebruikt in experimenten om de dynamiek en stabiliteit van MT's 5,7,11,12,13,14,15 te beoordelen. In celkweekstudies kunnen tubulines bijvoorbeeld worden gescheiden in twee pools: de vrije tubulinepool en de MT-pool. Dit wordt bereikt door vrije tubuline vrij te geven door celpermeabilisatie voordat de resterende MT's 15,16,17,18,19 worden gefixeerd. Biochemische methoden omvatten het gebruik van chemische MT-stabilisatoren die MT's beschermen tegen catastrofe, waardoor de scheiding van MT's en vrije tubuline mogelijk wordt door middel van centrifugatie20,21,22. Deze procedures maken echter geen onderscheid tussen stabiele en minder stabiele (labiele) MT's, waardoor het onmogelijk wordt om MT's of oplosbare tubuline in weefsels zoals de hersenen te kwantificeren. Bijgevolg is het evalueren van MT-stabiliteit in organismen onder fysiologische en pathologische omstandigheden een uitdaging gebleken. Om deze experimentele beperking aan te pakken, hebben we een nieuwe techniek ontwikkeld voor het nauwkeurig scheiden van MT's en vrije tubuline in muizenweefsel23.

Deze unieke MT-fractioneringsmethode omvat weefselhomogenisatie onder omstandigheden die de tubulinestatus in weefsels behouden en centrifugatie in twee stappen om stabiele MT's, labiele MT's en vrije tubuline te scheiden. Deze eenvoudige procedure kan worden toegepast op brede studies, waaronder fundamenteel onderzoek naar MT's en MAP's in levende organismen, fysiologische en pathologische analyses van gezondheid en ziekten die verband houden met MT-stabiliteit, en het ontwikkelen van geneesmiddelen en andere therapieën die gericht zijn op MT's.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

1. MT-fractioneringsmethode

OPMERKING: Alle experimenten die in deze studie zijn uitgevoerd, zijn goedgekeurd door de Animal Ethics Committee van de Doshisha University. C57BL/6J muizen van beide geslachten, 3-4 maanden oud, werden hier gebruikt. In dit protocol werden ontlede weefsels, bijvoorbeeld hersenen, lever of thymus, onmiddellijk gehomogeniseerd in ijskoude microtubuli-stabiliserende buffer (MSB), die Taxol (MT-stabilisator) bevatte in een concentratie die niet alleen depolymerisatie maar ook repolymerisatie van MT verhinderde. Het homogenaat werd in drie fracties gescheiden door middel van een ultracentrifugatieproces in twee stappen (figuur 1). Alle stappen in dit protocol werden zonder onderbreking voltooid in een omgeving met koele temperaturen, en de weefsels en fracties werden niet ingevroren totdat ze waren opgelost in natriumdodecylsulfaat (SDS)-monsterbuffer.

  1. Bereiding van MSB en microbuisjes
    1. Meng voor de bereiding van MSB de volgende reagentia: 0,1 M 2-(N-morfolino)ethaansulfonzuur (MES), pH 6,8 (geneutraliseerd door KOH), 10% glycerol, 0,1 mM DTT, 1 mM MgSO 4, 1 mM EGTA, 0,5% Triton X-100, fosfataseremmers (1 mM NaF, 1 mM β-glycerofosfaat, 1 mM Na3VO 4, 0,5 μM okadaïnezuur), 1x proteaseremmercocktail, en proteaseremmers (0,1 mM PMSF, 0,1 mM DIFP, 1 μg/ml pepstatine, 1 μg/ml antipijn, 10 μg/ml aprotinine, 10 μg/ml leupeptine, 50 μg/ml TLCK) (zie materiaaltabel) en duiden aan als MSB(-).
    2. Voeg vlak voor weefseldissectie 10 μM Taxol en 2 mM GTP (zie Materiaaltabel) toe aan MSB(-). Deze buffer wordt aangeduid als MSB(+). Bereid de buffer voor op de dag van gebruik en bewaar deze op ijs.
    3. Bereid de microbuisjes voor op bemonstering. Lege microbuis van 2,0 ml voor homogene opslag; lege microbuis van 1.5 ml voor supernatant1 (S1)-lysaat, precipitate2 (P2)-monster en precipitate3 (P3)-monsteropslag; 1,5 ml microbuisje met 1 ml ijskoude fosfaatgebufferde zoutoplossing (PBS) voor de opslag van ontleed weefsel; Microbuisje van 1,5 ml met 200 μl 2x SDS-monsterbuffer (0,16 M Tris pH 6,8; 20% glycerol; 2% 2-mercaptoethanol; 4% SDS) voor opslag van S1-monsters en supernatant3 (S3)-monsters; en centrifugatiemicrobuis voor TLA55- en TLA120.2-centrifugerotoren (zie materiaaltabel). Label alle buisjes en leg ze op ijs.
  2. Homogenisatie van muizenweefsel
    1. Bereid een gekoelde tafel voor weefseldissectie voor. Vul eerst een doos met gemalen ijs en plaats twee petrischaaltjes op ijs, één met de binnenkant naar boven en de andere met de buitenkant. Vul ijskoude PBS in één schaal voor voorbijgaande wassing en opslag van ontlede weefsels. Leg filtreerpapier bevochtigd met PBS op een andere schaal die is omgedraaid.
    2. Om een muis op te offeren, voert u cervicale dislocatie uit onder diepe anesthesie met een gemengd anestheticum van butorfanol, midazolam en medetomidine. Ontleed vervolgens onmiddellijk de weefsels, bijvoorbeeld hersenen, lever of thymus, en was ze met ijskoude PBS in een petrischaal.
      OPMERKING: Elk type zacht weefsel kan met deze methode worden geanalyseerd. De grootte van het weefsel wordt echter beperkt door het aanbevolen volumebereik van de gebruikte homogenisator. Als bijvoorbeeld een volume van 2 ml homogenisator wordt gebruikt, wordt 50-100 mg weefsel aanbevolen.
    3. Na het wegen van de 1,5 ml microbuisjes gevuld met PBS voor ontlede weefselopslag, knipt u weefsels uit en bewaart u ze in de microbuisjes, en weegt u elke microbuis opnieuw. Het natte gewicht van elk weefsel kan worden berekend door het gewicht van de buis voor en na het toevoegen van het weefsel af te trekken.
    4. Homogeniseer het weefsel onmiddellijk in ijskoude MSB(+) met een gekoelde homogenisator (zie Materiaaltabel). Het volume van MSB(+) was 19 keer (μL) het natte gewicht van het weefsel (mg). Voer homogenisatie uit met 20 slagen totdat de weefselstukjes verdwijnen.
      OPMERKING: Bijvoorbeeld, 1.900 μL MSB(+) wordt gebruikt voor 100 mg weefsel. Aangezien het volume MSB(+) dat moet worden toegevoegd, moet worden aangepast voor elk nat gewicht van de geanalyseerde weefselstukken, is het noodzakelijk om elk weefselstuk nauwkeurig te wegen.
  3. Centrifugeren van de muizenweefselhomogenaten
    1. Verplaats het hele homogenaat naar een microbuisje van 2 ml met een pasteurpipet en centrifugeer bij 2.400 × g gedurende 3 minuten bij 2 °C om het vuil via neerslag te verwijderen.
    2. Breng het hele supernatans (S1-fractie) over in een nieuwe microbuis van 1,5 ml en vortex. Vervolgens aliquot 200 μL S1-fractie in een centrifugatiemicrobuis en centrifugeer bij 100.000 × g met behulp van een TLA-55-rotor gedurende 20 minuten bij 2 °C om de relatief grote molecuulgewichteiwitten als neerslag (P2-fractie) te verkrijgen.
      OPMERKING: Het volume van het monster dat aan de ultracentrifugatiestappen wordt onderworpen, is van invloed op de centrifugatiestraal en de precipitatie-efficiëntie van de moleculen. Houd het monstervolume na deze stap op 200 μl of minder om onnauwkeurige fractionering te voorkomen.
    3. Centrifugeer verder alle resulterende supernatans (S2-fractie) bij 500.000 × g met behulp van een TLA-120.2-rotor gedurende 60 minuten bij 2 °C om de onoplosbare eiwitcomplexen in het neerslag (P3-fractie) te scheiden van oplosbare eiwitten in het supernatans (S3-fractie).
    4. Voeg 400 μL 1x SDS-monsterbuffer (0,08 M Tris pH 6,8; 10% glycerol; 1% 2-mercaptoethanol; 2% SDS) toe aan de P2- en P3-fractiebuisjes en laat het kort soniceren om het neerslag op te lossen. Breng deze fractiemonsters over in een lege microbuis van 1,5 ml.
    5. Los de totale S3-fractie op in 200 μL 2x SDS-monsterbuffer.
    6. Meng de resterende S1-fracties met een gelijk volume van 2x SDS-monsterbuffer voor gebruik als standaardcurve voor Western blotting.
    7. Kook al deze monsters op 100 °C gedurende 3 min. Nadat de monsters zijn afgekoeld tot kamertemperatuur, bewaart u de monsters bij -20 °C.
  4. Kwantificering van eiwitten in elke fractie
    1. Kwantificeer eiwitten in de P2-, P3- en S3-fracties door middel van Western blotting. Gebruik eerst 10% SDS-polyacrylamidegelelektroforese (SDS-PAGE) om eiwitten te scheiden van correct verdunde P2-, P3- en S3-fracties, en serieel verdund S1-monster van elk individu als een standaardcurve. Elektroblot de monsters vervolgens op polyvinylideenfluoridemembranen (zie Materiaaltabel).
      OPMERKING: De verdunningsverhouding van elke fractie hangt af van de concentratie van een objectief eiwit en de reactiviteit van het antilichaam. (bijv. α-tubuline, TUBB3, β-tub en getyrosineerde tubuline in hersenweefsel: S3 = 1/400, P3 = 1/2.000, P2 = 1/2.000, S1 = 1/50,000, 1/20.000, 1/10.000, 1/5.000, 1/2.000; geacetyleerde tubuline in hersenweefsel: S3 = 1/200, P3 = 1/400, P2 = 1/8.000, S1 = 1/100.000, 1/40.000, 1/20.000, 1/10.000, 1/4.000; α-tubuline in lever: S3 = 1/20, P3 = 1/100, P2 = 1/20, S1 = 1/50.000, 1/20.000, 1/10.000, 1/5.000, 1/2.000; α-tubuline in thymus: S3 = 1/100, P3 = 1/400, P2 = 1/20, S1 = 1/50.000, 1/20.000, 1/10.000, 1/5.000, 1/2.000 verdunning van weefselconcentratie).
    2. Blokkeer het membraan met 5% magere melk in Tris-gebufferde zoutoplossing (50 mM Tris-HCl pH 7,6; 152 mM NaCl) met 0,1% Tween 20 (TBS-T) gedurende meer dan 30 minuten.
    3. Dompel het membraan gedurende meer dan 2 uur onder in TBS-T-bevattend primair antilichaam (zie Materiaaltabel). Was daarna het membraan met TBS-T gedurende 3 minuten (3 keer).
    4. Label het primaire antilichaam met behulp van HRP-geconjugeerde secundaire antilichamen (zie materiaaltabel) in TBS-T gedurende meer dan 1 uur. Was daarna het membraan met TBS-T gedurende 3 minuten (3 keer).
    5. Ontwikkel de membranen met Enhanced Chemiluminescence reagens. Analyseer vervolgens de banden van belang met een lichtgevende beeldanalysator (zie Tabel met materialen).
    6. Kwantificeer de intensiteiten van de eiwitband met behulp van beeldanalysesoftware (zie Tabel met materialen) en creëer een standaardcurve door de verdunningseenheden van de verdunde S1-monsters die worden gebruikt voor de standaardcurve langs de X-as en de bandintensiteiten langs de Y-as uit te zetten.
    7. Lees de eiwitconcentratie (eenheid) af die overeenkomt met de verdunde fractiemonsters. Vermenigvuldig de afgelezen concentratie met de monsterverdunningsfactor om een eiwiteenheid in elke fractie te verkrijgen. Deel de gemeten eenheid van elke fractie door de totale eiwiteenheid (P2 + P3 + S3) om een percentage te verkrijgen.

2. Evaluatie van de eigenschappen van tubuline in elke fractie

OPMERKING: Deze biochemische methode levert drie groepen tubulinecomplexen op die worden gedefinieerd door sedimentatie-eigenschappen. Hier werd de status van tubulinecomplexen verkregen in deze fracties geïdentificeerd op basis van de grootte van het complex en tubuline-PTM's. Voltooi alle stappen in dit protocol zonder onderbreking in een omgeving met koele temperaturen, maar vries de fractiemonsters niet in totdat ze zijn opgelost in de SDS-monsterbuffer.

  1. Filterval test
    1. Filtreer de S2- en S3-fracties (elk 500 μL) met behulp van een 300 kDa ultrafiltratie-spinkolom (zie Materiaaltabel). Voer een centrifugatie van 14.000 × g uit bij 2 °C totdat het hele supernatans is gefilterd, geëlueerde eiwitten in ontvangerbuizen zijn verzameld en ingesloten eiwitten op het filter van reservoirbuizen achterblijven.
    2. Vertaal de hele filtraten (ongeveer 500 μL) in ontvangerbuisjes in nieuwe 1,5 ml microbuisjes en los ze op in 500 μL 2x SDS-monsterbuffer.
    3. Los de residuen op het filter van reservoirbuisjes op in 1.000 μL 1x SDS-monsterbuffer door te pipetteren en de monsters over te brengen naar een nieuw microbuisje van 1,5 ml.
    4. Kook de monsters gedurende 3 minuten op 100 °C. Nadat de monsters zijn afgekoeld tot kamertemperatuur, bewaart u de monsters bij -20 °C.
    5. Analyseer de hoeveelheden tubuline door Western blotting met DM1A (anti-α-tubuline-antilichaam, zie Tabel met materialen).
  2. Grootte-uitsluitingschromatografie
    1. Bereid de dragerbuffer (0,1 M MES, pH 6,8; 10% glycerol; 1 mM MgSO4; 1 mM EGTA; 0,1 mM DTT) aangevuld met een concentratie van 1/10 protease en fosfataseremmers zoals beschreven in stap 1.1.1. Filter vervolgens de oplossing en bewaar deze in een koude omgeving.
    2. Bereid een gelfiltratiechromatografiekolom voor die is uitgerust met een preparatief vloeistofchromatografiesysteem in een chromatografiekamer (zie materiaaltabel) bij 4 °C.
    3. Voordat u monsters op de kolom injecteert, moet u 180 ml van de dragerbuffer laten stromen om de kolom te wassen. Het debiet is 1 ml/min gedurende 3 uur.
    4. Injecteer in de handel verkrijgbare gezuiverde varkenstubuline (zie materiaaltabel) als controle of de S3-fractie uit muizenhersenen (elk 500 μl) in de kolom.
    5. Elute met een debiet van 1,0 ml/min met dragerbuffer. Verzamel de fracties van 1,5 ml gedurende 120 minuten. Bewaak geëlueerde eiwitten door absorptie bij 280 nm. Houd de maximale druk onder 0.3 MPa.
    6. Na het vortexen van de verzamelde fracties, meng 50 μL ervan met 50 μL 2x SDS-monsterbuffer in een microbuisje van 1,5 ml. Kook alle monsters gedurende 3 minuten op 100 °C. Nadat de monsters zijn afgekoeld tot kamertemperatuur, bewaart u de monsters bij -20 °C.
    7. Analyseer de hoeveelheden tubuline door Western blotting met DM1A, anti-α-tubuline-antilichaam en KMX-1, anti-β-tubuline-antilichaam (zie Materiaaltabel).

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

Kwantificering van tubuline in de P2-, P3- en S3-fracties uit muizenhersenen door de MT-fractioneringsmethode
Tubuline in muizenweefsel werd gescheiden in de P2-, P3- en S3-fracties door de MT-fractioneringsmethode en gekwantificeerd door Western blotting (Figuur 1A). Het neerslag van MT's dat gedurende 20 minuten in de P2-fractie bleef door ultracentrifugatie bij 100.000 × g was goed voor 34,86% ± 1,68% van de totale tubuline in een muizenbrein. Het supernatans (S2) werd verder gecentrifugeerd bij 500.000 × g gedurende 60 minuten. Er werden een precipitaat (P3-fractie) en een supernatans (S3-fractie) verkregen, die respectievelijk 56,13% ± 2,12% of 9,01% ± 0,68% van de totale tubuline in de muizenhersenen uitmaakten (Figuur 1B).

De hersenschors die in dit onderzoek wordt gebruikt, bevat neuronale en niet-neuronale cellen, zoals glia. Om de MT-stabiliteit in de neuronen van muizenhersenen selectief te beoordelen, hebben we TUBB3 gekwantificeerd, een tubuline-subtype dat uitsluitend tot expressie komt in neuronen in het centrale en perifere zenuwstelsel, door Western blotting met Tuj1 (anti-TUBB3-antilichaam). Het percentage TUBB3 in de P2-, P3- of S3-fractie was respectievelijk 32,65% ± 2,20%, 59,31% ± 2,61% of 8,04% ± 0,74%. Ze verschilden niet significant van die van α-tubuline (Figuur 1B). Deze resultaten suggereerden dat neuronen en gliacellen een vergelijkbare MT-stabiliteit vertonen of dat neuronen veel grotere hoeveelheden tubuline bevatten dan die van gliacellen in vivo.

Kenmerken van tubuline teruggevonden in elke fractie
Hier werd het homogenaat van het muizenweefsel in drie fracties gescheiden door middel van tweestaps ultracentrifugatie met verschillende zwaartekrachtversnellingen; Daarom verschilden de sedimentatiecoëfficiënten tussen eiwitten of hun complexen in elke fractie. Hoewel tubuline neergeslagen bij 100.000 × g ultracentrifugatie als conventioneel MT werd beschouwd, moet worden verduidelijkt hoe de nieuw verkregen tubuline van de P3-fractie hier verschilt van die van tubuline in de P2- en S3-fracties.

Om S3-tubuline te karakteriseren, werd de S2 (P3 + S3) of S3-fractie onderworpen aan ultrafiltratie en grootte-uitsluitingschromatografie. De tubulinecomplexen in de S3-fractie konden volledig door een 300 kDa ultrafiltratie-spinkolom gaan, terwijl bijna alle tubuline in de S2-fractie op het filter werd opgesloten (Figuur 2A). Bovendien werd het molecuulgewicht van tubulinecomplexen in de S3-fractie gemeten door middel van grootte-uitsluitingschromatografie. S3-tubuline geëlueerd met een piek die overeenkomt met 100 kDa, wat vergelijkbaar is met die van in de handel verkrijgbare gezuiverde tubulinedimeren (figuur 2B,C). Bovendien waren de verhoudingen van α- en β-tubuline die in elke fractie werden teruggewonnen met behulp van de MT-fractioneringsmethode gelijk (figuur 2D). In feite is aangetoond dat α- en β-tubuline enigszins als monomeren in levende cellen kunnen bestaan24. Echter, te oordelen naar de geschatte kD-waarde (nM-volgorde) gerapporteerd en de concentratie van tubuline die wordt teruggevonden in de S3-fractie (~11 μM), wordt aangenomen dat de meeste (> 98%) tubuline bestaat als α/β-dimeren. Daarom is tubuline in de S3-fractie in de eerste plaats een oplosbaar α/β-tubulinedimeer.

De tubulinepolymeren werden gescheiden in twee fracties, P2 en P3, op basis van hun posttranslationele modificaties (PTM's). Om onderscheid te maken tussen deze fracties, werd Western blotting uitgevoerd met behulp van specifieke antilichamen. Het anti-geacetyleerde α-tubuline-antilichaam, dat dient als marker voor stabiele MT's, toonde aan dat de P2-fractie significant verrijkt was met 97,40% ± 0,52% geacetyleerde α-tubuline (Figuur 2E), terwijl het totale α-tubuline werd teruggevonden in de P3- en S3-fracties (Figuur 1B). Omgekeerd onthulde het anti-tyrosinated α-tubuline-antilichaam, indicatief voor labiele MT's, dat 75,43% ± 2,69% tyrosinated α-tubuline aanwezig was in de P3-fractie (Figuur 2F). Deze bevindingen bevestigen dat de P2-fractie voornamelijk tubuline bevat in stabiele MT's, terwijl de P3-fractie bestaat uit tubuline in labiele MT's.

Beoordeling van MT-stabiliteit bij bevriezing en behandeling met nocodazol
Het effect van bevriezing en behandeling met nocodazol op de stabiliteit van intracerebrale MT's van muizen werd geanalyseerd om te bepalen of voorbijgaande veranderingen in de stabiliteit van MT's konden worden onderscheiden door de MT-fractioneringsmethode. MT's worden over het algemeen gedemonteerd bij lage temperaturen, maar sommige MT's blijven stabiel in de kou. Na het wegen van de hersenen werden ze ingevroren in vloeibare stikstof en gedurende 30 minuten bij -80 °C geplaatst. De voorbijgaande bevroren hersenen en de ruwe hersenen als controle werden gehomogeniseerd en gefractioneerd in de P2-, P3- en S3-fracties. Vervolgens werd het aandeel tubuline in de drie fracties gekwantificeerd door Western blotting. Toen de hersenen eenmaal bevroren waren vóór homogenisatie, nam α-tubuline in de P2-fractie af, en die in de P3-fractie nam toe in vergelijking met die in de ruwe hersenen (Figuur 3A). Vlekken met 6-11B1 (geacetyleerd α-tubuline) of 1A2 (getyrosineerd α-tubuline) toonden ook aan dat bevriezing van de hersenen het acetyleringsniveau verlaagde (Figuur 3B) en het tyrosinatieniveau (Figuur 3C) van α-tubuline in de P2-fractie verhoogde.

Nocodazol is een microtubuli-targeting-middel (MTA) dat MT-polymerisatie voorkomt door zich te binden aan β-tubuline en MT-depolymerisatie bevordert. Muizenhersenen werden gehomogeniseerd in Taxol-vrij MSB(+) met of zonder 10 μM nocodazol en gedurende 20 minuten op 4 °C geplaatst. Het onbehandelde of met nocodazol behandelde homogenaat werd toegevoegd aan 10 μM Taxol, opnieuw gehomogeniseerd en gefractioneerd in de P2-, P3- en S3-fracties. Vervolgens werd het aandeel tubuline in de drie fracties gekwantificeerd door Western blotting. Blots met DM1A (α-tubuline) toonden aan dat α-tubuline in de P2-fractie afnam en dat in de P3-fractie de neiging had toe te nemen bij behandeling met nocodazol (Figuur 3D). Deze resultaten geven aan dat P2-tubuline werd gedestabiliseerd als reactie op lage temperatuur of nocodazol en dat de P2-fractie robuuste MT's bevatte die bestand waren tegen de experimentele omstandigheden. In tegenstelling tot bevriezing had nocodazol geen invloed op tubuline-PTM's (Figuur 3E,F). Op basis van de resultaten en de bovenstaande gegevens kan de depolymerisatie van MT's die niet kunnen worden gedetecteerd door PTM-analyse met deze methode worden geëvalueerd.

Vergelijking van de verhouding tussen stabiele MT's, labiele MT's en vrije tubuline in weefsels
De stabiliteit van MT's varieert tussen verschillende weefsels, afhankelijk van de proliferatieve capaciteit van de cellen in die weefsels. Met name stabiele MT's zijn overvloediger aanwezig in het zenuwstelsel, dat voornamelijk bestaat uit niet-proliferatieve neuronen, in vergelijking met andere weefsels. Om het vermogen van de ontwikkelde MT-fractioneringsmethode te beoordelen om verschillen in MT-stabiliteit tussen verschillende weefsels te onderscheiden, werden de levers en thym van muizen gefractioneerd en werd de teruggewonnen tubuline in elke fractie gekwantificeerd. De resultaten toonden aan dat, in vergelijking met andere weefsels, de hersenen een significant hoger niveau van P2-tubulines vertoonden, terwijl P3-tubulines met name verrijkt waren in weefsels die proliferatieve cellen bevatten (Figuur 4). Bovendien bevestigde Western blotting met behulp van 6-11B1- en 1A2-antilichamen de aanwezigheid van een hogere MT-stabiliteit in het zenuwstelsel. De verschillende distributiepatronen van tubuline-PTM's gaven duidelijk aan dat de P2-tubuline die specifiek in het zenuwstelsel wordt aangetroffen, afkomstig is van stabiele MT's (Figuur 4). Deze bevindingen ondersteunen verder het idee dat de P2- en P3-fracties overeenkomen met respectievelijk stabiele en labiele MT's.

Figure 1
Figuur 1: Kwantificering van tubuline in muizenweefsel met behulp van de MT-fractioneringsmethode. (A) Samenvatting van de MT-fractioneringsmethode voor weefsels. Stabiele MT's (P2-fractie), labiele MT's (P3-fractie) en vrije tubuline (S3-fractie) in weefsels kunnen worden gescheiden door 2-staps ultracentrifugatie onder omstandigheden die MT-polymerisatie en depolymerisatie tijdens de bereiding onderdrukken. (B) MT's in de muizencortex werden neergeslagen door conventionele ultracentrifugatie van 100.000 × g, gevolgd door ultracentrifugatie van 500.000 × g . Vervolgens werden tubulines gescheiden in de P2-, P3- en S3-fracties gekwantificeerd door Western blotting met DM1A (α-tubuline) en anti-Tuj1 (TUBB3). De verhouding tussen eiwitten in elke fractie (P2, P3 of S3) en de totale fractie (P2 + P3 + S3) werd berekend zoals beschreven in de sectie Protocol (gemiddelden ± SD's, n = 4). Dit cijfer is aangepast ten opzichte van Hagita et al.23. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figure 2
Figuur 2: De MT-fractioneringsmethode maakt het mogelijk om stabiele MT's, labiele MT's en vrije tubuline te scheiden in de hersenschors van de muis. (A) De S2- of S3-fracties (input) werden geanalyseerd door de filtervaltest met behulp van een 300 kDa ultrafiltratie-spinkolom. Tubulinen verkregen door filtratie (ontvanger) en insluiting (reservoir) werden gekwantificeerd door Western blotting met DM1A (α-tubuline). (B) Gezuiverde varkenstubulines werden onderworpen aan de MT-fractioneringsmethode en bleken meestal te worden verzameld in de S3-fractie. (C) Molecuulgrootte van tubuline in de S3-fractie. De S3-fractie werd gescheiden door middel van grootte-uitsluitingschromatografie met behulp van een gelfiltratiechromatografiekolom. Eiwitten in elke fractie werden gekwantificeerd door Western blotting met DM1A (α-tubuline) en KMX-1 (β-tubuline). Het theoretisch molecuulgewicht wordt bovenaan de panelen weergegeven. (D) De verhoudingen van α-tubuline en β-tubuline in elke fractie waren gelijk. Tubulinen, gescheiden in de P2-, P3- en S3-fracties, werden gekwantificeerd door Western blotting met KMX-1 (β-tubuline). Kwantificering van het aandeel α-tubuline en β-tubuline in elke fractie ten opzichte van de som van de totale breuk (gemiddelden ± SD's, n = 4). Statistische analyses werden uitgevoerd door middel van de t-toets van Student. (E,F) De modificaties van α-tubuline in de P2-, P3- en S3-fracties werden geverifieerd door Western blotting met 6-11B1 (geacetyleerd α-tubuline: E) en 1A2 (getyrosineerd α-tubuline: F). Kwantificering van het aandeel getyrosineerde of geacetyleerde α-tubuline in elke fractie ten opzichte van de totale fractie (gemiddelden ± SD's, n = 4). (A-C) zijn gewijzigd van Hagita et al.23. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figure 3
Figuur 3: Beoordeling van MT-depolymerisatie geïnduceerd door bevriezing of MTA. (A-C) De stabiliteit van MT na 30 minuten invriezen bij -80 °C werd geëvalueerd. De verhoudingen tubuline in de drie fracties van de rauwe en bevroren hersenen werden gekwantificeerd door Western blotting met DM1A (α-tubuline: A), 1A2 (tyrosinated α-tubuline: B) en 6-11B1 (geacetyleerd α-tubuline: C). (D-F) Het effect van nocodazol op de MT-stabiliteit werd geëvalueerd. De verhoudingen tubuline in de drie fracties van onbehandelde of behandelde hersenen met nocodazol werden gekwantificeerd door Western blotting met DM1A (α-tubuline: D), 1A2 (tyrosinated α-tubuline: E) en 6-11B1 (geacetyleerd α-tubuline: F). Representatieve relatieve niveaus van tyrosinatie (B,E) of acetylering (C,F) werden genormaliseerd naar de hoeveelheid totaal α-tubuline (A,D) (betekent ± SD's, n = 4). Statistische analyses werden uitgevoerd door middel van de t-toets van Student. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Figure 4
Figuur 4: Verhoudingen van stabiele MT's, labiele MT's en vrije tubuline in de hersenen, lever en thymus bij muizen. De hersenen, levers en thym van muizen werden ontleed en onderworpen aan de MT-fractioneringsmethode. Eiwitten gescheiden in elke fractie werden gekwantificeerd door Western blotting met DM1A (α-tubuline), 6-11B1 (geacetyleerd α-tubuline) en 1A2 (tyrosinated α-tubuline). De verhouding tussen eiwitten in elke fractie (P2, P3 of S3) en de totale fractie (P2 + P3 + S3) werd berekend zoals beschreven in de sectie Protocol (gemiddelden ± SD's, n = 4). Statistische analyses werden uitgevoerd door eenrichtings-ANOVA, gevolgd door Tukey's post hoc test. Klik hier om een grotere versie van deze figuur te bekijken.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

De belangrijkste taak bij het onderzoeken van de status van tubuline in weefsel van levende organismen is het voorkomen van accidentele MT-polymerisatie of depolymerisatie tijdens de bereiding. De stabiliteit van MT's in monsters wordt beïnvloed door factoren zoals de concentratie van Taxol in MSB, de verhouding tussen de hoeveelheid weefsel en de buffer en de temperatuur tijdens het proces van weefselverwijdering tot homogenisatie en centrifugatie. Daarom werden de omstandigheden in elke stap van het protocol geoptimaliseerd voor het analyseren van muizenweefsel met een 20-voudig volume homogenaat. Een hogere concentratie Taxol kan MT-polymerisatie in vitro induceren, zelfs onder gekoelde omstandigheden25. Bij het analyseren van weefsels met significant verschillende tubulineconcentraties of het aanbrengen van substantiële protocolwijzigingen, moet elke operator de stappen optimaliseren volgens de specifieke doelstellingen van hun experimenten.

In de uitgevoerde studie werd een nieuwe populatie MT's, aangeduid als P3, verkregen uit de conventionele "oplosbare fractie" met behulp van ultracentrifugatie bij 500.000 × g20. Theoretische berekeningen op basis van factoren zoals de K-factor van de rotor, middelpuntvliedende kracht en duur van de centrifugatie suggereren dat de tubulines die aanwezig zijn in de S3-fractie hoogstwaarschijnlijk 6S-tubulinedimeren vertegenwoordigen. Omgekeerd kan tubuline in de P3-fractie overeenkomen met MT's die korter zijn in vergelijking met die in de P2-fractie. Deze waarneming komt overeen met het resultaat dat aantoont dat het bevriezen van weefsels voorafgaand aan homogenisatie, wat leidt tot de gedeeltelijke ineenstorting van MT's26, resulteerde in een significante toename van tubuline binnen de P3-fractie en een gelijktijdige afname van de P2-fractie (Figuur 3A). Bovendien geven de analyse van tubuline-PTM's en de bindingseigenschappen van verschillende MAP's aan dat de P2- of P3-fractie respectievelijk stabiele of labiele MT's bevat. Bepaalde MAP's die specifiek zijn voor stabiele MT's, voornamelijk gevonden in neuronen, waren bijvoorbeeld uitsluitend aanwezig in de P2-fractie23. Bijgevolg is het aannemelijk om te suggereren dat de P3-fractie MT's omvat die dynamischer en labiel zijn in vergelijking met die in de P2-fractie.

Volgens de theorie die aan de methode ten grondslag ligt, kunnen ongeschikte experimentele omstandigheden die betrokken zijn bij MT-stabilisatie of centrifugatie leiden tot een slechte fractionering. Een lage concentratie Taxol leidt bijvoorbeeld tot een lichte afname van P2-tubuline, terwijl een teveel aan Taxol de P2-tubuline verhoogt als gevolg van MT-vorming tijdens de bereiding23. Evenzo kan het ongepast verwarmen van weefsels en monsters ervoor zorgen dat MT's hyperpolymeriseren en tau afbreekt of fragmenteert23. Bovendien zijn centrifugale omstandigheden van cruciaal belang voor het scheiden van de P3- en S3-fracties, en een lichte afname van de zwaartekrachtversnelling vermindert het herstel van de P3-fractie aanzienlijk. Daarom wordt aanbevolen om de protocolstappen strikt te volgen als er abnormale fractioneringen worden waargenomen.

Deze eenvoudige fractioneringsmethode kan breed worden toegepast om de verhoudingen van tubulines tussen stabiele MT's, labiele MT's en vrije dimeren in weefsels te analyseren. Deze methode biedt verschillende voordelen, omdat het subtiele veranderingen in de tubulinestatus kan detecteren die mogelijk niet duidelijk zijn door de kwantificering van tubuline-PTM's. Het analyseren van MT-stabiliteit is belangrijk voor het begrijpen van de fysiologische betekenis van MT's, met name in grote en complexe neuronale cellen, en voor het onderzoeken van aandoeningen die verband houden met MT-ontregeling. Mutaties of disfuncties in tubuline- of MAP-genen zijn bijvoorbeeld gekoppeld aan neurologische ontwikkelingsstoornissen en neurodegeneratieve ziekten27,28. Bij de ziekte van Alzheimer is bekend dat MT's verminderd zijn, mogelijk als gevolg van het functionele verlies van tau-eiwit in aangetaste neuronen 15,29,30,31,32,33. MTA's die de MT-stabiliteit moduleren en de celdeling remmen, zijn voorgesteld als mogelijke therapieën voor neurologische aandoeningen13,34. Het gebruik van deze unieke MT-fractioneringsmethode om de stabiliteit en het gedrag van MT's en MAP's in ziektemodeldieren te analyseren, kan aanzienlijk bijdragen aan het ophelderen van de pathogenese van tau-gerelateerde dementie en het identificeren van nieuwe therapeutische doelen.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

De auteurs hebben geen belangenconflicten te melden.

Acknowledgments

Dit werk werd gedeeltelijk ondersteund door JST: de oprichting van universitaire beurzen voor de oprichting van innovatie op het gebied van wetenschapstechnologie (A.HT.; JPMJFS2145), JST SPRING (A.HT.; JPMJSP2129), Grant-in-Aid voor JSPS Fellows (A.HT.; 23KJ2078), een Grant-in-Aid for Scientific Research (B) JSPS KAKENHI (22H02946 voor TM), een Grant-in-Aid voor wetenschappelijk onderzoek op innovatieve gebieden getiteld "Brain Protein Aging and Dementia Control" van MEXT (TM; 26117004), en door Uehara Research Fellowship van de Uehara Memorial Foundation (TM; 202020027). De auteurs verklaren dat er geen tegenstrijdige financiële belangen zijn.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
1.5 ML TUBE CASE OF 500 Beckman Coulter 357448
1A2 Sigma-Aldrich T9028 1:5,000 dilution
2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES) Nacalai Tesque 02442-44
300 kDa ultrafiltration spin column Aproscience PT-1013
6-11B1 Sigma-Aldrich T7451 1:5,000 dilution
ÄKTAprime plus Cytiva 11001313
anti-mouse IgG Jackson ImmunoResearch 115-035-146 1:5,000 dilution
antipain Peptide Institute Inc. 4062
aprotinin Nacalai Tesque 03346-84
Chemi-Lumi One L Nacalai Tesque 07880-54
Corning bottle-top vacuum filter system Corning 430758 0.22µm 33.2cm² Nitrocellulose membrane
DIFP Sigma-Aldrich 55-91-4 
DIGITAL HOMOGENIZER HK-1 AS ONE 1-2050-11
DM1A Sigma-Aldrich T9026 1:5,000 dilution
DTT Nacalai Tesque 14128-46
EGTA Nacalai Tesque 37346-05
FluoroTrans W 3.3 Meter Roll Pall Corporation BSP0161
glycerol Nacalai Tesque 17018-25
GTP Nacalai Tesque 17450-61
HIGH SPEED REFRIGERATIOED MICRO CENTRIFUGE Kitman TOMY KITMAN-24
HiLoad 16/600 Superdex 200 pg column Cytiva 28-9893-35
Image Gauge Software  FUJIFILUM Wako Pure Chemical Corporation
ImmunoStar LD  FUJIFILUM Wako Pure Chemical Corporation 292-69903
KMX-1 Millipore MAB3408 1:5,000 dilution
LAS-4000 luminescent image analyzer FUJIFILUM Wako Pure Chemical Corporation
leupeptin Peptide Institute Inc. 43449-62
MgSO4 Nacalai Tesque 21003-75
Na3VO4 Nacalai Tesque 32013-92
NaF Nacalai Tesque 31420-82
okadaic acid LC Laboratories O-2220 
OPTIMA MAX-XP Beckman Coulter 393315
pepstatin Nacalai Tesque 26436-52
PMSF Nacalai Tesque 27327-81
Polycarbonate Centrifuge Tubes for TLA120.2 Beckman Coulter 343778
Protease inhibitor cocktail (cOmplete™, EDTA-free) Roche 11873580001
Purified tubulin  Cytoskeleton T240
QSONICA Q55 QSonica Q55
Taxol LC Laboratories P-9600
TLA-120.2 rotor Beckman Coulter 357656
TLA-55 rotor Beckman Coulter 366725
TLCK Nacalai Tesque 34219-94
Triton X-100 Nacalai Tesque 12967-45
β-glycerophosphate Sigma-Aldrich G9422

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. Janke, C., Magiera, M. M. The tubulin code and its role in controlling microtubule properties and functions. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 21 (6), 307-326 (2020).
  2. Conde, C., Caceres, A. Microtubule assembly, organization and dynamics in axons and dendrites. Nature Reviews Neuroscience. 10 (5), 319-332 (2009).
  3. Mitchison, T., Kirschner, M. Dynamic instability of microtubule growth. Nature. 312 (5991), 237-242 (1984).
  4. Baas, P. W., Rao, A. N., Matamoros, A. J., Leo, L. Stability properties of neuronal microtubules. Cytoskeleton (Hoboken). 73 (9), 442-460 (2016).
  5. Challacombe, J. F., Snow, D. M., Letourneau, P. C. Dynamic microtubule ends are required for growth cone turning to avoid an inhibitory guidance cue. Journal of Neuroscience. 17 (9), 3085-3095 (1997).
  6. Kapitein, L. C., Hoogenraad, C. C. Building the neuronal microtubule cytoskeleton. Neuron. 87 (3), 492-506 (2015).
  7. Leo, L., et al. Vertebrate fidgetin restrains axonal growth by severing labile domains of microtubules. Cell Reports. 12 (11), 1723-1730 (2015).
  8. Janke, C. The tubulin code: molecular components, readout mechanisms, and functions. Journal of Cell Biology. 206 (4), 461-472 (2014).
  9. Wloga, D., Joachimiak, E., Fabczak, H. Tubulin post-translational modifications and microtubule dynamics. International Journal of Molecular Sciences. 18 (10), 2207 (2017).
  10. Baas, P. W., Black, M. M. Individual microtubules in the axon consist of domains that differ in both composition and stability. Journal of Cell Biology. 111 (2), 495-509 (1990).
  11. Cartelli, D., et al. Microtubule alterations occur early in experimental parkinsonism and the microtubule stabilizer epothilone D is neuroprotective. Scientific Reports. 3, 1837 (2013).
  12. Zhang, B., et al. Microtubule-binding drugs offset tau sequestration by stabilizing microtubules and reversing fast axonal transport deficits in a tauopathy model. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 102 (1), 227-231 (2005).
  13. Zhang, F., et al. Post-translational modifications of alpha-tubulin in Alzheimer disease. Translational Neurodegeneration. 4, 9 (2015).
  14. Miyasaka, T., et al. Curcumin improves tau-induced neuronal dysfunction of nematodes. Neurobiology of Aging. 39, 69-81 (2016).
  15. Fujiwara, H., et al. Inhibition of microtubule assembly competent tubulin synthesis leads to accumulation of phosphorylated tau in neuronal cell bodies. Biochemical and Biophysical Research Communications. 521 (3), 779-785 (2020).
  16. Vielkind, U., Swierenga, S. H. A simple fixation procedure for immunofluorescent detection of different cytoskeletal components within the same cell. Histochemistry. 91 (1), 81-88 (1989).
  17. Kanai, Y., et al. Expression of multiple tau isoforms and microtubule bundle formation in fibroblasts transfected with a single tau cDNA. Journal of Cell Biology. 109 (3), 1173-1184 (1989).
  18. Brown, A., Li, Y., Slaughter, T., Black, M. M. Composite microtubules of the axon: quantitative analysis of tyrosinated and acetylated tubulin along individual axonal microtubules. Journal of Cell Science. 104 (2), 339-352 (1993).
  19. Black, M. M., Slaughter, T., Moshiach, S., Obrocka, M., Fischer, I. Tau is enriched on dynamic microtubules in the distal region of growing axons. Journal of Neuroscience. 16 (11), 3601-3619 (1996).
  20. Caron, J. M., Jones, A. L., Kirschner, M. W. Autoregulation of tubulin synthesis in hepatocytes and fibroblasts. Journal of Cell Biology. 101 (5), 1763-1772 (1985).
  21. Merrick, S. E., Trojanowski, J. Q., Lee, V. M. Selective destruction of stable microtubules and axons by inhibitors of protein serine/threonine phosphatases in cultured human neurons. Journal of Neuroscience. 17 (15), 5726-5737 (1997).
  22. Miyasaka, T., Sato, S., Tatebayashi, Y., Takashima, A. Microtubule destruction induces tau liberation and its subsequent phosphorylation. FEBS Letters. 584 (14), 3227-3232 (2010).
  23. Hagita, A., et al. Quantitative fractionation of tissue microtubules with distinct biochemical properties reflecting their stability and lability. Biochemical and Biophysical Research Communications. 560, 186-191 (2021).
  24. Montecinos-Franjola, F., Chaturvedi, S. K., Schuck, P., Sackett, D. L. All tubulins are not alike: Heterodimer dissociation differs among different biological sources. Journal of Biological Chemistry. 294 (26), 10315-10324 (2019).
  25. Vallee, R. B. A taxol-dependent procedure for the isolation of microtubules and microtubule-associated proteins (MAPs). Journal of Cell Biology. 92 (2), 435-442 (1982).
  26. Bartolo, M. E., Carter, J. V. Effect of microtubule stabilization on the freezing tolerance of mesophyll cells of spinach. Plant Physiology. 97 (1), 182-187 (1991).
  27. Strang, K. H., Golde, T. E., Giasson, B. I. MAPT mutations, tauopathy, and mechanisms of neurodegeneration. Laboratory Investigation. 99 (7), 912-928 (2019).
  28. Fourel, G., Boscheron, C. Tubulin mutations in neurodevelopmental disorders as a tool to decipher microtubule function. FEBS Letters. 594 (21), 3409-3438 (2020).
  29. Terry, R. D., Gonatas, N. K., Weiss, M. Ultrastructural studies in Alzheimer's presenile dementia. The American Journal of Pathology. 44 (2), 269-297 (1964).
  30. Yoshida, H., Ihara, Y. Tau in paired helical filaments is functionally distinct from fetal tau: assembly incompetence of paired helical filament-tau. Journal of Neurochemistry. 61 (3), 1183-1186 (1993).
  31. Cash, A. D., et al. Microtubule reduction in Alzheimer's disease and aging is independent of tau filament formation. The American Journal of Pathology. 162 (5), 1623-1627 (2003).
  32. Hempen, B., Brion, J. P. Reduction of acetylated alpha-tubulin immunoreactivity in neurofibrillary tangle-bearing neurons in Alzheimer's disease. Journal of Neuropathology and Experimental Neurology. 55 (9), 964-972 (1996).
  33. Miyasaka, T., et al. Imbalanced expression of tau and tubulin induces neuronal dysfunction in C. elegans models of tauopathy. Frontiers in Neuroscience. 12, 415 (2018).
  34. Boiarska, Z., Passarella, D. Microtubule-targeting agents and neurodegeneration. Drug Discovery Today. 26 (2), 604-615 (2021).

Tags

Deze maand in JoVE nummer 201 tubuline labiele microtubuli stabiele microtubuli posttranslationele modificatie microtubuli-geassocieerd eiwit fractionering microtubuli-targeting-agentia
Kwantitatieve fractioneringstechniek voor microtubuli om stabiele microtubuli, labiele microtubuli en vrije tubuline in muizenweefsels te scheiden
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

Hagita-Tatsumoto, A., Miyasaka, T.More

Hagita-Tatsumoto, A., Miyasaka, T. Quantitative Microtubule Fractionation Technique to Separate Stable Microtubules, Labile Microtubules, and Free Tubulin in Mouse Tissues. J. Vis. Exp. (201), e63358, doi:10.3791/63358 (2023).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
Simple Hit Counter