$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
İki protein ortağı arasındaki fiziksel etkileşim, aşağı akış biyolojik mekanizmalarını modüle eder.
Enzime bağlı immünosorbent testi olan ELISA'yı kullanarak protein-protein etkileşimlerini tespit etmek için çok kuyulu bir immünoassay plakası alın. Etkileşen proteinlerden birini (yem proteini) içeren bir kaplama tamponu ekleyin ve inkübe edin. Yem proteinleri, spesifik olmayan hidrofobik etkileşimler yoluyla kuyu yüzeyine adsorbe edilir.
Harcanan çözeltiyi atın ve bağlanmamış proteinleri çıkarmak için plakayı bir tamponla yıkayın. Bir bloke edici çözelti ekleyin ve inkübe edin, çözeltinin bloke edici ajan moleküllerinin kuyu yüzeyindeki spesifik olmayan bağlanma bölgelerini bloke etmesine izin verin.
Kolay miktar tayini için histidin kalıntıları ile etiketlenmiş etkileşen protein ortağını - av proteini - ekleyin. Kuluçkaya yatırın, av proteininin etkileşimli ortağına - yeme özel olarak bağlanmasına izin verin. Avına bağlanan ve bir yem-av-antikor kompleksi oluşturan yaban turpu peroksidaz enzimleri ile konjuge edilmiş bir anti-histidin antikor çözeltisi ekleyin.
Enzimin substratını ve hidrojen peroksiti içeren bir çözeltiyi pipetleyin ve inkübe edin.
Yaban turpu peroksidaz enzimi, substratının katalitik oksidasyonu için hidrojen peroksit kullanır ve mavi renkli bir ürün oluşturur. Reaksiyonu durdurmak için enzimi denatüre eden ve sarı bir reaksiyon ürünü oluşturan asidik bir çözelti ekleyin.
Bir mikroplaka okuyucu kullanarak, bağlı av proteininin miktarıyla orantılı olan ve başarılı protein-protein etkileşimini gösteren ürünün renk yoğunluğunu ölçün.
ELISA'ya hazırlanmak için, bir Polisorp mikrotitre plakasının her bir oyuğuna 100 mikrolitre protein çözeltisi dağıtın. Plakaları kapakla kapatın ve proteinin mikrotitre plaka kuyucuklarına immobilizasyonunu kolaylaştırmak için gece boyunca 4 santigrat derecede saklayın. Lavabonun üzerine baş aşağı eğerek çözeltiyi mikrotitre plakasından atın. Ardından, kuyucukları kuyu başına 300 mikrolitre PBS ile üç kez yıkayın.
Kaplanmış kuyucukları oda sıcaklığında 1 saat boyunca PBS ile bloke edin, 2.5 ağırlık hacmi yüzde BSA içerir. Blokaj çözeltisini çıkardıktan sonra, kuyucukları kuyu başına 300 mikrolitre PBST ile üç kez yıkayın. Şimdi, her numuneye 100 mikrolitre 50 nanomolar rekombinant His etiketli PH ekleyin. Kontrol kuyularına sadece 100 mikrolitre PBS-BSA ekleyin. Plakayı oda sıcaklığında 1 saat inkübe edin.
İnkübasyonun ardından, protein çözeltisini atın ve kuyucukları kuyu başına 300 mikrolitre PBST ile üç kez yıkayarak bağlanmamış proteinleri çıkarın. Ardından, yaban turpu peroksidaz konjuge anti-His poliklonal antikorları içeren 100 mikrolitre PBS-BSA ekleyin.
Oda sıcaklığında 1 saat inkübe ettikten sonra, kuyucukları kuyu başına 300 mikrolitre PBST ile üç kez yıkayın. Her oyuğa 100 mikrolitre ELISA tespit reaktifi ekleyerek antijen-antikor komplekslerini tespit edin. Ardından, reaksiyonu durdurmak için oyuk başına 50 mikrolitre 1 molar sülfürik asit ekleyin. Bir mikroplaka okuyucu kullanarak kuyuların optik yoğunluğunu 450 nanometrede ölçün.