Name: Polimer Microspheres ve Fiber-optik Paketler kullanma İnsan Tükürük Protein Analiz için çoklu Floresan Microarray (Video) | JoVE Journal
Uploaded: 2013-10-10T21:00:00.000+00:00
Duration: 8 min 50 s
Description: Öğrenin, insan tükürüğündeki çoklu proteinleri aynı anda analiz etmek için floresan mikroküre tabanlı mikrodizi yöntemini. Fiber optik paketler ve antikorlar kullanarak hassas biyobelirteç tespiti sağlar.

ai_agent_IP

ai_agent

maintenance

instantTrialDurationMinutes

isBiopharma

enableNewMyJoveSectionDesign

educationFeatures

seoMetaApi

ai_copilot_institution_blacklist

ai_chat_institution_blacklist

freeAccessWindow

ssoRoleCapture

scheduledMaintenanceBanner

joveLabsFeatures

disable_autoplay_for_bots

extended_trial_duration

5 minutes

Bu çalışma Ulusal Sağlık Enstitüleri (hibe 08UDE017788-05) tarafından desteklenmiştir. EBP ayrıca Bilim ve Teknoloji İspanyol Vakfı (FECYT) destek kabul eder. Yazarlar yazının eleştirel okuma için Shonda T. Gaylord ve Pratyusha Mogalisetti teşekkür ederim.

<img alt="Şekil 1" width="600px" fo:content-width="5.5in" src="/files/ftp_upload/50726/50726fig1.jpg" /> Şekil 1. . Tükürük profil için fiber optik mikrosfer antikor dizisi tatbik edilmesi için iş akışı (1) Mikro dahili olarak iki floresan boyalar ile kodlanır, (2) harici olarak şifrelenmiş mikro proteinine özel monoklonal antikorlar ile modifiye edilir, (3) birden fazla mesaj göndermiş mikro karıştırılır, (5) tükürük proteinleri sandviç bağışıklık tahlili ile mikro tarafından yakalanır, ve (6) floresan mikroskobu kullanılarak belirlenmiştir, ve (4) rasgele bir fiber optik demetin yakın ucunda kabartma mikro oyuk yatırılır. 1.. Mikroküreler Kodlama <ol><li> Bir amber cam şişe içinde sodyum öropyum (III) thenoyltrifluoroacetonate trihidrat (Eu-TTA, MW = 869,54 g / mol) tartılır ve tetrahidrofuran (THF) içinde bir 200 mM stok solüsyonu hazırlanır. Pipetleme tarafından yavaşça karıştırın; görsel doğrulamakboya tamamen çözülür. </li><li> Bir amber cam şişe içinde kumarin 30 (C30, MW = 347,41 g / mol) tartılır ve THF içinde bir 12 mM stok solüsyonu hazırlanır. Pipetleme tarafından yavaşça karıştırın, görsel boya tamamen eriyene doğrulayın. </li><li> Tablo 1&#39;de listelenen nihai konsantrasyon elde etmek üzere stok çözelti ve THF kullanılarak her bir mikroküre tipi için çalışma çözeltisinin 700 ul hazırlayın. </li><li> Mikro küreler (10% w / v) &#39;de vorteks yoluyla süspansiyon haline getirildi ve daha sonra bir 1.5 ml mikrosantrifüj tüpüne 60 ul süspansiyon transferi olduğundan emin olun. </li><li> Kürecik süspansiyon 600 ul PBS ekleyin ve 20x pipetleme karıştırın. 3 dakika 10.000 rpm&#39;de santrifüj tüpü ve dikkatlice supernatant çıkarın. Mikroküreler yıkamak için bu işlemi başka 2x tekrarlayın. </li><li> THF aşama 1.5 edilene benzer bir prosedür kullanılarak topak ile mikrosfer 3 kez yıkayın. </li><li> 3 dakika boyunca 10.000 rpm&#39;de mikrosfer / THF süspansiyon santrifüj, süpernatant kaldırmak ve 600 ul pelet yeniden askıyaçalışma çözeltisi, Tablo 1 &#39;de listelenmiştir. yeni bir 1.5 ml mikrosantrifüj tüpüne karışımın aktarın. </li><li> Parafilm ile mikrosantrifüj tüpü kapatın ve bir çalkalayıcı üzerine yerleştirin. 3000 rpm&#39;de çalkalanır ve 24 saat boyunca inkübe, alüminyum folyo ile kaplı bir kutu kullanılarak setup kaplayarak ışıktan korur. </li><li> Topak elde etmek için 3 dakika boyunca 10.000 rpm&#39;de mikrosfer süspansiyon santrifüjleyin. </li><li> Adım 1.5 &#39;de tarif edildiği gibi yüzer boya çözeltisini çıkarın,% 0.01 Tween-20 ihtiva eden bir 6x 600 ul PBS ile daha sonra mikro 600 ul 6X metanol ile yıkayın. </li><li> Kullanıma kadar ışıktan korumak 4 ° C&#39;de% 0.01 Tween-20 ihtiva eden 600 ul PBS içinde kodlanmış mikro saklayın. </li></ol><table border="1"><tbody><tr><td> Kürecik türü adı: </td><td> 1 </td><td> 2 </td><td> 3 </td><td> 4 </td><td> 5 </td><td> 6 </strong&gt; </td><td> 7 </td></tr><tr><td> Eu-TTA (mM) </td><td> 100 </td><td> 100 </td><td> 10 </td><td> 100 </td><td> 10 </td><td></td><td></td></tr><tr><td> C30 (mM) </td><td></td><td> 1 </td><td> 1 </td><td> 6 </td><td> 6 </td><td> 1 </td><td> 6 </td></tr></tbody></table> Tablo 1. Eu-TTA ve C30 Konsantrasyonları çözümlerini çalışma. 2. Protein-yakalama Mikrokürelerin hazırlanması <ol><li> [- (N-morfolino) etansülfonik asit (MES) 0.1 M,% 0.9 NaCl,% 0.01 SDS, pH 5.7 2] ve PBS / SDS tampon maddesi (0.01 M sodyum fosfat, 0.154 M NaCl,% 0.01 SDS, pH MES tampon hazırlanması 7.4), oda sıcaklığında önceden. </li><li> Güvenli-Lock 1.5 ml mikrosantrifüj tüpe (~ 2 mg küreleri içeren) 200 ul kodlanmış mikrosferdir süspansiyonu ekleyin. Bu, aşama 2.6 &#39;de inkübasyon sırasında dökülmesini önlemek için bir mikrosantrifüj tüpüne bu tür kullanım için önemlidir. </li> &lt;li&gt; aşama 1.5 &#39;de tarif edildiği gibi 3 kez 600 ul tampon MES ile mikro yıkayın. Kürecik pelet 700 ul MES ekle ve pipetleme iyice karıştırın. </li><li> Hazırlama 0.105 g / ml &#39;1-etil-3-[3-dimetilaminopropil] karbodiimid hidroklorür (EDC, MW = 191.7 g / mol) ve 0.163 g / ml sülfo-N-hidroksi-(sülfo-NHS, MW = 217,13 g / mol) ayrı tüplerde MES tamponu içinde çözeltiler. </li><li> Taze kürecik süspansiyonu içine damla EDC çözüm damla hazırlanan 150 ul ekleyin. EDC böylece immobilizasyon verimliliği sağlamak için taze yapılmış çözümü kullanmak esastır, çok hızlı bir şekilde hidrolize. Hemen EDC ilave edilmesinden sonra, mikro 150 ul sülfo-NHS çözeltisi eklemek pipetleme ile iyice karıştırın ve süspansiyon, homojen bir kontrol edin. </li><li> , Tüp Cap Parafilm ile mühür ve bir çalkalayıcı üzerine yerleştirin. , 4 saat boyunca 1500 rpm&#39;de çalkalanır alüminyum folyo ile kaplı bir kutu kullanılarak ışıktan korur. </li><li> Mikroküre esas asma santrifüjbir pelet formu ve süpernatant kaldırmak için 3 dakika boyunca 10.000 rpm&#39;de iyon. Adım 1.5 &#39;de tarif edildiği gibi 500 ul PBS / SDS tamponu 3x mikro yıkayın. </li><li> , Topağa 200 ul PBS / SDS tampon ekleme de mikro karıştırın ve 60 ug yakalama antikorları ihtiva eden 300 ul PBS / SDS tampon çözeltisi aktarın. İlk olarak mikrosfer pelet askıya alma ve daha sonra antikor çözeltisi içine mikrosfer süspansiyon eklemek için önemlidir. </li><li> , Bir çalkalayıcı üzerinde 4 saat süre ile 1500 rpm&#39;de sallayarak antikor mikro-karışımı inkübe alüminyum folyo ile kaplı bir kutu kullanılarak ışıktan korur. </li><li> Bir pelet formu ve süpernatant kaldırmak için 3 dakika boyunca 10.000 rpm&#39;de mikrosfer süspansiyon santrifüjleyin. 500 ul StartingBlock (TBS) aşama 1.5 &#39;de tarif edildiği gibi, 3 kez tampon engelleme ile mikro yıkayın. </li><li> Bloke edici tampon TBS 1 ml mikro karıştırın ve bir kutu koy kullanılarak ışıktan korumak, bir çalkalayıcı üzerinde 1 saat süre ile 1500 rpm&#39;de inkübe mikroAlüminyum folyo ile kırmızı. </li><li> Bir pelet formu ve süpernatant kaldırmak için 3 dakika boyunca 7,000 rpm&#39;de mikrosfer süspansiyon santrifüjleyin. Adım 1.5 &#39;de tarif edildiği gibi 500 ul TBS, bloke edici tampon ile topak 3 kez yıkayın. </li><li> Bir pelet formu ve süpernatant kaldırmak için 3 dakika boyunca 7,000 rpm&#39;de mikrosfer çözeltisi santrifüjleyin. Bloklama tamponu 500 ul TBS ekle ve pipetleme karıştırın. </li><li> Işıktan korumak, kullanılana kadar 4 ° C &#39;de modifiye mikrosfer süspansiyon saklayın. </li><li> Gelen antikorları kullanarak mikroküreler diğer türlerini yapmak için bu işlemi tekrarlayın. </li></ol> 3. Fiber-optik Microarray Meclisi <ol><li> Yeni bir mikro santrifüj tüpüne otoklav içine protein-yakalama mikro her tip 50 ul karıştırın. Santrifüj stok mikroküreler 3 dakika boyunca 7,000 rpm&#39;de havuzu, ve kalan hacim yaklaşık 100 ul böylece süpernatant kaldırmak. </li><li> Elle kesme fiber optik uzunluk olarak yaklaşık 5 cm ve demetlerisıralı filmler alıştırma 30, 15, 9, 6, 3, 1, 0.5, ve 0.05 mikron boyutlu elmas kullanarak parlatma makinesi üzerinde iki ucunu lehçe. Her taneciği ayırmak için 2 dakika boyunca iyonu giderilmiş suda cilalı paket sonikasyon. </li><li> Bir 0.5 ml mikrosantrifüj tüpü içine bir küçük manyetik karıştırma çubuğu bir ifadeyle, protein içermeyen PBS içinde 400 ul tampon ve hava kabarcıklarını çıkarmak için 30 dakika için bir manyetik karıştırıcı plaka üzerinde karıştırın ekleyin. </li><li> 150 saniye 10,16 için bir 0.025 N HCI çözeltisi içinde cilalı elyaf demetinin bir ucu Etch. Hemen daldırın ve 1 dakika boyunca iyonu giderilmiş suda kazınmış ucunu sonikasyon. Basınçlı hava ile, elyaf demetleri kurutun. </li><li> Bir fiber tutucuya monte elyaf demetini ve 1 saat boyunca kabarcık içermeyen, protein içermeyen PBS tamponu içinde kazınmış ucunu bloke eder. </li><li> Fiber optik demetin aşındırılmış ucunda saklı mikroküre süspansiyonu Deposit 1 ul alikosu. Alüminyum folyo ile bir kutu ile ışıktan korumak kurulum ve 15 dakika boyunca bekleyin. Süspansiyonun hacmi olacakbuharlaştırma yoluyla azaltmak ve kazınmış mikro oyuk içine mikroküreler zorlamak. Bu yükleme adımı bir kez daha tekrarlayın. </li><li> Mikro oyuk içinde sıkışıp değil mikroküreler kaldırmak için numune çözeltisinin doymuş bir bez kullanın. Protein mikroarray artık kullanıma hazırdır. Tükürük analiz için 4.1 adıma hemen gidin. </li></ol> 4. Mikroküreler Mikroarray kullanarak Tükürük Numune Analizi <ol><li> 200 ul örnek çözeltisi (blokaj tamponu. Tükürük yüzer için toplama protokolü daha önce yayınlanmış olan 10 StartingBlock T20 (PBS) eşit hacmi ile seyreltilmiş 100 ul süpernatan tükürük) eklenir. bir 0.5 ml mikrosantrifüj tüpü içine otoklavlanmıştır. Çözelti içine elyaf yüklenen protein mikrodizisini Dip ve 2 saat boyunca 600 rpm&#39;de çalkalayıcı üzerinde inkübe, alüminyum folyo ile kaplı bir kutu kullanılarak ışıktan korur. </li><li> % 10 Tween-20 19.6 ml PBS, mi içine 200 ul% 10 BSA çözeltisi ve 200 ul eklenmesi ile 20 ml yıkama tamponu hazırlayınx iyi hafifçe sallayarak. </li><li> 200 ul yıkama tamponu ihtiva eden yeni bir mikrosantrifüj tüpü içine otoklav protein mikrodizisini Dip ve 2 dakika boyunca 600 rpm&#39;de çalkalanır. Bu yıkama 3x tekrarlayın. </li><li> Anti-VEGF, IP-10, IL-8, EGF, MMP-9 ve 5 ug / ml ihtiva eden bir saptama antikor kokteylinin 100 ul çözelti içinde inkübe mikrodizi, StartingBlock T20 IL-1β biyotinile algılama antikoru (PBS) blokaj tamponunda 600 rpm karıştırma cihazı üzerinde, oda sıcaklığında 30 dakika boyunca, alüminyum folyo ile kaplı bir kutu kullanılarak ışıktan korur. </li><li> Adım 4.3 &#39;de tarif edildiği gibi yıkama tamponu ile 3 kez mikrodizi yıkayın. </li><li> , 10 dakika boyunca bir karıştırıcı üzerinde 600 rpm&#39;de, PBS içinde 20 ug / ml streptavidin R-fikoeritrin bağı (SAPE) çözeltisi 200 ul mikrodizisini inkübe alüminyum folyo ile kaplı bir kutu kullanılarak ışıktan korur. </li><li> Adım 4.3 &#39;de tarif edildiği gibi yıkama tamponu ile mikrodizi 5x yıkayın. </li><li> Lifin uzakta (yani, uç distal ucunu temizlemekküreciklerden) mutlak etanol ile doymuş bir bez ile paket. </li><li> Basınçlı hava ile, elyafın her iki ucunu kurutun. Fiberin uzak ucundan bir epifluorescent mikroskobu ve görüntü üzerindeki lif monte edin. </li><li> Eu-TTA, C30 ve SAPE floresan emisyon yoğunluklarına karşılık mikrosferdir görüntü kazanır. Eu-TTA, C30 ve SAPE floresan görüntüleme için optik filtreler setup ve maruz bırakma süreleri, Tablo 2&#39;de gösterilmiştir. </li></ol><table border="1"><tbody><tr><td> Kanal </td><td> Eu-TTA </td><td> C30 </td><td> SAPE </td></tr><tr><td> Uyarıcı </td><td> 365/10x </td><td> 350/50x </td><td> 546/10x </td></tr><tr><td> Zayiflatıcı </td><td> 525DCLP </td><td> 400DCLP </td><td> 560LP </td></tr><tr><td> Emitör </td><td> 620/60m </td><td> 460/50m </td><td> 580/30m </td></tr><tr><td> Pozlama süresi </td><td> 1 sn</td><td> 0.3 sn </td><td> 1 sn </td></tr></tbody></table> Tablo 2. Mikrodizisinin üç floresan görüntü için parametreler.

<ol><li>Schena, M., Shalon, D., Davis, R. W., Brown, P. O. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Quantitative+monitoring+of+gene-expression+patterns+with+a+complementary-DNA+microarray%5BTitle%5D)+AND+%22Science%22%5BJournal%5D)">Quantitative monitoring of gene-expression patterns with a complementary-DNA microarray.</a> Science. 270, 467-470 (1995).</li>
<li>Schena, M. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSchena%2C+M+%22Protein+Microarray%22">Protein Microarray</a>. , Jones and Bartlett Publishers. (2004).</li>
<li>Tam, S. W., Wiese, R., Lee, S., Gilmore, J., Kumble, K. D. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simultaneous+analysis+of+eight+human+Th1%2FTh2+cytokines+using+microarrays%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Immunol.+Methods%22%5BJournal%5D)">Simultaneous analysis of eight human Th1/Th2 cytokines using microarrays.</a> J. Immunol. Methods. 261 (01), 157-165 (2002).</li>
<li>Wang, C. C., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Array-based+multiplexed+screening+and+quantitation+of+human+cytokines+and+chemokines%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Proteome+Res%22%5BJournal%5D)">Array-based multiplexed screening and quantitation of human cytokines and chemokines.</a> J. Proteome Res. 1, 337-343 (2002).</li>
<li>de Jager, W., Velthuis, te, Prakken, H., Kuis, B. J., W,, Rijkers, G. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Simultaneous+detection+of+15+human+cytokines+in+a+single+sample+of+stimulated+peripheral+blood+mononuclear+cells%5BTitle%5D)+AND+%22Clin.+Diagn.+Lab.+Immunol%22%5BJournal%5D)">Simultaneous detection of 15 human cytokines in a single sample of stimulated peripheral blood mononuclear cells.</a> Clin. Diagn. Lab. Immunol. 10, 133-139 (2003).</li>
<li>Lee, H. J., Nedelkov, D., Corn, R. M. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Surface+plasmon+resonance+imaging+measurements+of+antibody+arrays+for+the+multiplexed+detection+of+low+molecular+weight+protein+biomarkers%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Surface plasmon resonance imaging measurements of antibody arrays for the multiplexed detection of low molecular weight protein biomarkers.</a> Anal. Chem. 78, 6504-6510 (2006).</li>
<li>Vignali, D. A. A. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Multiplexed+particle-based+flow+cytometric+assays%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Immunol.+Methods%22%5BJournal%5D)">Multiplexed particle-based flow cytometric assays.</a> J. Immunol. Methods. 243 (00), 243-255 (2000).</li>
<li>Rissin, D. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Single-molecule+enzyme-linked+immunosorbent+assay+detects+serum+proteins+at+subfemtomolar+concentrations%5BTitle%5D)+AND+%22Nat.+Biotechnol%22%5BJournal%5D)">Single-molecule enzyme-linked immunosorbent assay detects serum proteins at subfemtomolar concentrations.</a> Nat. Biotechnol. 28, 595-599 (2010).</li>
<li>Zhang, H., Nie, S., Etson, C. M., Wang, R. M., Walt, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Oil-sealed+femtoliter+fiber-optic+arrays+for+single+molecule+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Lab+Chip%22%5BJournal%5D)">Oil-sealed femtoliter fiber-optic arrays for single molecule analysis.</a> Lab Chip. 12, 2229-2239 (2012).</li>
<li>Blicharz, T. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Fiber-Optic+Microsphere-Based+Antibody+Array+for+the+Analysis+of+Inflammatory+Cytokines+in+Saliva%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Fiber-Optic Microsphere-Based Antibody Array for the Analysis of Inflammatory Cytokines in Saliva.</a> Anal. Chem. 81, 2106-2114 (2009).</li>
<li>Mukhopadhyay, R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Devices+to+drool+for%5BTitle%5D)+AND+%22Anal.+Chem%22%5BJournal%5D)">Devices to drool for.</a> Anal. Chem. 78, 4255-4259 (2006).</li>
<li>Wong, D. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Salivary+diagnostics+powered+by+nanotechnologies%2C+proteomics+and+genomics%5BTitle%5D)+AND+%22J.+Am.+Dent.+Assoc%22%5BJournal%5D)">Salivary diagnostics powered by nanotechnologies, proteomics and genomics.</a> J. Am. Dent. Assoc. 137, 313-321 (2006).</li>
<li>Segal, A., Wong, D. T. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Salivary+diagnostics%3A+enhancing+disease+detection+and+making+medicine+better%5BTitle%5D)+AND+%22Eur.+J.+Dent.+Educ%22%5BJournal%5D)">Salivary diagnostics: enhancing disease detection and making medicine better.</a> Eur. J. Dent. Educ. 12, 22-29 (2008).</li>
<li>St John, M. A. R., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Interleukin+6+and+interleukin+8+as+potential+biomarkers+for+oral+cavity+and+oropharyngeal+squamous+cell+carcinoma%5BTitle%5D)+AND+%22Arch.+Otolaryngol.+Head+Neck+Surg%22%5BJournal%5D)">Interleukin 6 and interleukin 8 as potential biomarkers for oral cavity and oropharyngeal squamous cell carcinoma.</a> Arch. Otolaryngol. Head Neck Surg. 130, 929-935 (2004).</li>
<li>Herr, A. E., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Microfluidic+immunoassays+as+rapid+saliva-based+clinical+diagnostics%5BTitle%5D)+AND+%22Proc.+Natl.+Acad.+Sci.+U.S.A%22%5BJournal%5D)">Microfluidic immunoassays as rapid saliva-based clinical diagnostics.</a> Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104, 5268-5273 (2007).</li>
<li>Pantano, P., Walt, D. R. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Ordered+nanowell+arrays%5BTitle%5D)+AND+%22Chem.+Mater%22%5BJournal%5D)">Ordered nanowell arrays.</a> Chem. Mater. 8, 2832-2835 (1996).</li>
<li>Schena, M. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aSchena%2C+M+%22Protein+Microarrays%22">Protein Microarrays</a>. , Jones and Bartlett Publishers. (2005).</li>
<li>Mouse IgG1 Isotype Control [Internet]. , Available from:
		
	 <a target="_blank" href="http://www.rndsystems.com/Products/MAB002">http://www.rndsystems.com/Products/MAB002</a> (2013).</li>
</ol>

Yazarlar, hiçbir rakip mali çıkarlarını olmadığını beyan ederim.

Araştırmacılar, aşağıdaki adımlara fazla dikkat etmesi gerekir: daha iyi çözme doğruluğu, bu mikro-homojen tüm kuluçkalama içerisinde süspanse edildi doğrulamak ve mikro kodlama işlemi sırasında yıkama aşamaları için gereklidir. Buna ek olarak, kodlanmış mikrosferler, tüm deney boyunca ışıktan korunması gerekir. Uygun kodlama ve depolama prosedürleri takiben, biz genel olarak çözme doğruluk% 99 üstünde olduğunu öğrendim. Kodlanmış mikro-C donma önlemek ve ışıktan korumak 4 ° C&#39;de depolanmalı...

Mark Schena ve 1990&#39;ların ortalarında arkadaşları tarafından bildirilen ilk mikroarray beri, bu güçlü araç, biyolojik araştırmaların 1. birçok alanda kullanılmıştır. Aynı zamanda, kan gibi teşhis sıvıları, birden fazla proteinleri saptayabilen antikor mikrodizileri, klinik teşhis ve biyolojik tarama 2-10 önemli uygulamaları vardır. Tükürük, kan gibi aynı analitlere birçok içeren, tükürük toplama, güvenli ve noninvaziv çünkü kan bir tercih alternatif olarak kabul edilmiştir, ve minimal-eğitimli tıbbi personel 11-13 tarafından yapılabilir. Şu anda, tükürük numuneleri kullanılarak çoğaltılmış çok katlı protein analiz hedef analitin 14 en düşük konsantrasyonu ve farklı biyolojik 15 arasında geniş bir konsantrasyon aralığı dahil olmak üzere, pek çok önemli faktör tarafından sınırlıdır. . Burada, altı proteinlerinin analizi gösterilmektedir: insan vasküler endotelyal büyüme faktörü (VEGF), interferon gama-kaynaklı protein 10 (IP-10), interlökin-8 (IL-8), epidermal büyüme faktörü (EGF), matriks metalopeptidaz 9 (MMP-9), ve interlökin-1 beta (IL-1β) . Yöntemin performansı ilk olarak rekombinant proteinleri analit teşkil eden ve bloke edici tampon standart solüsyonları kullanılarak doğrulandı. Farklı kronik solunum yolu hastalıklarının hasta hem de sağlıklı kontrollerden toplanmış gerçek tükürük numuneleri, aynı zamanda tatmin edici bir performans ile test edilmiştir. Protokol diğer protein analit ve diğer mikroküre bazlı deneylere uygulanabilir olmalıdır. Bir ile karşılaştırıldığında, geniş bir dinamik aralık, en az spesifik olmayan etkileşimleri, daha az örnek tüketimi, ve düşük maliyet ile çeşitli proteinlerin düşük konsantrasyonlarda hızlı, doğru ve tekrarlanabilir bir eş zamanlı olarak analiz sağlar Bu platform, Analitik Kimya alan için önemli bir avantaj sunar benzer Enzyme-Linked Immunosorbent Assay (ELISA).

<table><tbody><tr><td>Eu-TTA boya</td><td>Fisher Scientific</td><td>AC42319-0010</td><td></td></tr><tr><td>THF</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>34865-100ML</td><td></td></tr><tr><td>Amber cam şişe</td><td>Fisher Scientific</td><td>03-339-23B</td><td></td></tr><tr><td>Kumarin 30 boya</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>546127-100MG</td><td></td></tr><tr><td>Mikroküreler</td><td>Bangslabs</td><td>PC05N/6698</td><td></td></tr><tr><td>1.5 ml mikrosantrifüj tüpleri</td><td>Fisher Scientific</td><td>05-408-129</td><td></td></tr><tr><td>PBS 10x konsantre</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P5493-1L</td><td></td></tr><tr><td>Su</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>W4502-1L</td><td></td></tr><tr><td>Metanol</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>34860-100ML</td><td></td></tr><tr><td>Tw-20</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>P7949-100 ml</td><td></td></tr><tr><td>BupH MES tamponlu tuzlu</td><td>su Thermo Scientific</td><td>28390</td><td></td></tr><tr><td>SDS</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>05030-500ML-F</td><td></td></tr><tr><td>NaOH çözeltisi</td><td>Fisher Scientific</td><td>SS256-500</td><td></td></tr><tr><td>Güvenli kilitli mikrosantrifüj tüpü</td><td>VWR laboratuvar atölyesi</td><td>53511-997</td><td></td></tr><tr><td>EDC</td><td>Thermo Scientific</td><td>22980</td><td></td></tr><tr><td>Sulfo-NHS</td><td>Thermo Scientific</td><td>24510</td><td></td></tr><tr><td>İnsan VEGF yakalama antikoru</td><td>R& D Systems</td><td>MAB293</td><td></td></tr><tr><td>İnsan IP-10 yakalama antikoru</td><td>Ar-Ge D Systems</td><td>MAB266</td><td></td></tr><tr><td>İnsan IL-8 yakalama antikoru</td><td>R& D Systems</td><td>MAB208</td><td></td></tr><tr><td>İnsan EGF yakalama antikoru</td><td>Ar-Ge D Systems</td><td>MAB636</td><td></td></tr><tr><td>İnsan MMP-9 yakalama antikoru</td><td>R& D Sistemleri</td><td>MAB936</td><td></td></tr><tr><td>İnsan IL-1 ve beta; antikor</td><td>Ar-Ge yakala D Sistemleri</td><td>MAB601</td><td></td></tr><tr><td>Fare IgG1 izotip kontrol antikoru</td><td>R& D Systems</td><td>MAB002</td><td></td></tr><tr><td>StartingBlock (TBS) tamponu</td><td>Thermo Scientific</td><td>37542</td><td></td></tr><tr><td>HCl standart çözelti 1.0 N</td><td>Sigma-Aldrich</td><td>318949-500 ml</td><td></td></tr><tr><td>0.5 ml mikrosantrifüj tüpleri</td><td>Fisher Scientific</td><td>05-408-120</td><td></td></tr><tr><td>Protein içermeyen (PBS) tampon</td><td>Thermo Scientific</td><td>37572</td><td></td></tr><tr><td>Rekombinant insan VEGF 165</td><td>Ar-Ge D Systems</td><td>293-VE</td><td></td></tr><tr><td>Rekombinant insan IP-10</td><td>Ar-Ge D Systems</td><td>266-IP</td><td></td></tr><tr><td>Rekombinant insan IL-8</td><td>R& D Systems</td><td>208-IL</td><td></td></tr><tr><td>Rekombinant insan EGF</td><td>Ar-Ge D Systems</td><td>236-EG</td><td></td></tr><tr><td>Rekombinant insan MMP-9</td><td>Ar-Ge D Sistemleri</td><td>911-MP</td><td></td></tr><tr><td>Rekombinant insan IL-1 ve beta;</td><td>Ar-Ge D Systems</td><td>201-LB</td><td></td></tr><tr><td>StartingBlock T20 (PBS) tamponu</td> PBS'de <td>Thermo Scientific</td><td>37539</td><td></td></tr><tr><td>Bloker BSA</td><td>Thermo Scientific</td><td>37525</td><td></td></tr><tr><td>Biyotinillenmiş VEGF tespit antikoru</td><td>R& D Systems</td><td>BAF293</td><td></td></tr><tr><td>Biyotinillenmiş IP-10 tespit antikoru</td><td>R& D Systems</td><td>BAF266</td><td></td></tr><tr><td>Biyotinillenmiş IL-8 tespit antikoru</td><td>R& D Systems</td><td>BAF208</td><td></td></tr><tr><td>Biyotinillenmiş EGF tespit antikoru</td><td>R& D Systems</td><td>BAF236</td><td></td></tr><tr><td>Biyotinillenmiş MMP-9 tespit antikoru</td><td>R& D Sistemleri</td><td>BAF911</td><td></td></tr><tr><td>Biyotinillenmiş IL-1 ve beta; tespit antikoru</td><td>R& D Sistemleri</td><td>BAF201</td><td></td></tr><tr><td>Streptavidin, R-fikoeritrin</td><td>Invitrogen</td><td>S-21388</td><td></td></tr><tr><td>Etanol (200 kanıt)</td> <td>Sigma-Aldrich</td><td>E7023-500ML</td><td></td></tr></tbody></table>

polimer microspheres ve fiber-optik paketler kullanma İnsan tükürük protein analiz için çoklu floresan microarray

Multiplexed Fluorescent Microarray for Human Salivary Protein Analysis Using Polymer Microspheres and Fiber-optic Bundles

Burada, aynı zamanda, bir fiber-optik mikroküre bazlı antikor dizisi kullanarak tükürük proteinlerini altı ölçmek için bir protokolü tarif eder. Kullanılan immüno-dizi teknolojisi, floresan mikroskobu kullanımı ile mikroküre bazlı süspansiyon dizi üretim avantajlarını bir araya getirmektedir. Video protokolde tarif edildiği gibi, ticari olarak temin edilebilen 4,5 um, polimer mikrosferleri, fiziksel olarak mikro kürelerin içine sıkışıp iki floresan boyaların konsantrasyonu ile ayırt yedi farklı türde kodlanmış edilmiştir. Yüzey karboksil grupları içeren kodlanmış mikro EDC / NHS birleştirme kimyası ile monoklonal antikorlar ile modifiye edilmiştir. Protein mikrodizi monte etmek için, kodlanmış ve işlevselleştirilmiş mikrosferlerinin farklı karıştırılır ve rasgele kimyasal olarak bir fiber optik demetin yakın ucunda dağlanmıştır 4,5 um olan mikro oyuk, yatırılır. Fiber optik demeti, bir taşıyıcı madde ve hem de m görüntülenmesinde kullanılmıştıricrospheres. Monte edildikten sonra, mikrodizi klinik toplanan tükürük yüzer proteinleri yakalamak için kullanıldı. İzleme, bir streptavidin-konjuge floresan prob, R-fikoeritrin farklı analitler için biyotinile edilmiş antikorların algılama oluşan bir karışımı kullanarak, bir sandviç bağışıklık dayanıyordu. Mikrodizi mikroküre kayıt ve değerlendirme sinyali için biri için üç farklı kanal, iki floresan mikroskop ile görüntülendi. Floresan Mikrograflarda sonra çözülür ve MATLAB bir ev yapımı bir algoritma kullanılarak analiz edildi.

Fiber optik demeti küçük bir bölümünü gösteren üç kanallardan Floresan görüntüleri, Şekil 2A-C&#39;de gösterilmiştir. (Tartışma bölümünde daha ayrıntılı olarak tarif edildiği gibi) Bu görüntüler, MATLAB yazılmış bir algoritma kullanılarak analiz edilmiştir. Bu analiz, mikro kodunu çözmek için Eu-TTA kodlayan bir görüntü (Şekil 2A) için bilgiler ve C30 kodlama görüntüyü (Şekil 2B) hem çalışmaktadır, ve bir görüntü sinyalinin (Şekil 2C), farklı mikro-flor...

Bu multiplekslenmiş mikroküre bazlı antikor dizileri kullanılarak, tükürük proteinlerini profil için bir prosedür tarif eder. Monoklonal antikorlar, kovalent karbodiimid kimyası kullanılarak floresan boya ile kodlanmış 4,5 um polimer mikro bağlanmıştı. Modifiye mikroküreler floresan sandviç immunoassay&#39;ler kullanılarak tükürük protein seviyelerini ölçmek için fiber-optik mikro oyuk birikmiştir.

Polimer Microspheres ve Fiber-optik Paketler kullanma İnsan Tükürük Protein Analiz için çoklu Floresan Microarray

Herein, we describe a protocol for simultaneously measuring six proteins in saliva using a fiber-optic microsphere-based antibody array. The immuno-array ...

Bu prosedürün genel amacı, mikrosfer tabanlı floresan diziler kullanarak insan tükürük örneklerindeki birden fazla proteini analiz etmektir. İlk olarak, mikrosferleri iki farklı floresan boyanın farklı miktarlarıyla kodlayın. Farklı proteinler için yakalama antikorlarını kodlanmış mikrosferlere bağlayın.Ardından, test tükürük örneklerindeki birden fazla protein için birleştirilmiş mikro diziler üzerinde sandviç immünolojik analizlerini kullanarak, fiber optik demeti üzerinde çoklu protein mikro dizisini oluşturun. Nihayetinde, floresan mikroskobu ile yapılan analiz, tükürük örneklerindeki farklı proteinlerin sinyal yanıtlarını ölçebilir. Bu tekniğin ELISA gibi mevcut yöntemlere göre temel avantajı, karmaşık biyosıvılarda birden fazla proteinin eş zamanlı analizine olanak tanımasıdır.Bu yöntem insan tükürüğü analizine dair içgörü sağlayabilse de serum, idrar ve balgam gibi diğer biyolojik sıvılara da uygulanabilir. Opium TTA'yı kehribar renkli cam bir flakonda tartın ve tetrahidrofuran içerisinde 200 millimolar stok çözelti hazırlayın. Pipetleme yoluyla nazikçe karıştırın ve boyanın tamamen çözündüğünü görsel olarak doğrulayın.Benzer şekilde, pipetleme ile nazikçe karıştırılarak 12

multiplexed-fluorescent-microarray-for-human-salivary-protein

Research

JoVE Journal

Chemistry

Kimya

Oligonükleotid çiftli florasan boncuklar kullanarak bir örnek içinde mikroorganizmaların tespiti için çoklama yöntemi açıklar. Bir örnek içindeki tüm organizmalar Amplikon bir panel prob-çiftli boncuk melezleşmiştir. LUMINEX veya Bio-Plex enstrüman, boncuk, boncuk türü ve hibridizasyon sinyali için her bir sorgu için kullanılır.

Oligonükleotid çiftli Floresan Mikroküreler kullanarak Kompleksi Klinik ve Çevre Örneklerinde Bakterilerin Multiplex Algılama

Bir çip üzerinde fotopolimerizasyon tekniği kullanılarak bir polimer mikro oluşumu açıklaması. Atomik kuvvet mikroskobu, temas açısı ölçümleri, X-ışını fotoelektron spektroskopisi ve uçuş ikincil iyon kütle spektrometresi ve hücre bağlanma testinin zaman kullanarak yüksek aktarım yüzey karakterizasyonu da açıklanmıştır.

Biyomalzemelerin Yüksek Verimli Discovery için Polimer Mikroarray&#39;ler

Luminex Corporation Xmap mikroküre teknolojisini kullanarak, çeşitli laboratuvar hayvanı türlerinin serosurveillance için Multiplexed Florometrik immunoassay (MFIA) geliştirdik. MFIA antijeni, doku kontrolü veya immünglobulin kovalent renk kodlu polistiren mikroküreler bağlantılı bir süspansiyon mikroarray olduğunu. MFIA test yöntemi hem de çeşitli giderme konularını ele almaktadır.

Multiplexed Florometrik immunoassay Test Metodolojisi ve Sorun Giderme

Bu video, insan tükürüğündeki birden fazla çevresel patojen için antikorları aynı anda tespit etmek için boncuk tabanlı bir multipleks immünoassay tekniğini göstermektedir. Floresan boncuklar, insan tükürük örneğindeki antikorlar kullanılarak yakalanan farklı patojenlerden gelen antijenlere bağlandı. Antikorlar bir floresan raportör kullanılarak etiketlendikten sonra, boncuklar tükürükte farklı patojene özgü antikorların varlığını değerlendirmek için akış sitometrisi kullanılarak analiz edildi.

Tükürükteki patojene özgü antikorları tanımlamak için boncuk bazlı bir multipleks immünolojik test

Bu protokol hücre sinyal çalışmalar ve biyolojik belirteç tespiti potansiyel uygulamalar ile büyük ölçekli imalat, mültipleksli iki boyutlu DNA veya antikor dizisi, özetlemektedir.

Yüksek yoğunluklu Barkod Antikor Mikroarray Akışı-desen Rehberli Fabrikasyon

Damlacık mikroakışkanlarında çok renkli floresan algılama, tipik olarak hacimli ve karmaşık epifloresan mikroskobu tabanlı algılama sistemlerini içerir. Burada, tek bir fotodetektör tarafından toplanan çok renkli verileri geçici olarak kodlamak için bir dizi optik fiber kullanan kompakt ve modüler çok renkli bir algılama şemasını açıklıyoruz.

Damlacık Mikroakiskan için renkli Floresan Algılama Optik Elyaf kullanma

Mevcut kıt kaynak ortamında, araştırmacıların çalışmaları daha ucuz, daha hızlı ve daha hassas bir şekilde yürütmelerine olanak tanıyan yeni teknolojiler ortaya çıkıyor. Burada, insanların aynı anda birden fazla çevresel patojene maruz kalmasını ölçmek için boncuk bazlı bir tükürük antikoru multipleks immünolojik testin geliştirilmesini açıklıyoruz.

Bir Tükürük Antikor Multiplex Immuoassay Gelişmekte Çevre Patojenler İnsan Pozlama&#39;yı Tedbir

Biz sadece iki slayt şaklatarak çoğaltılmış sandviç çapraz-reactivity ücretsiz uzun gerçekleştirmek için bir ek çip teknolojisi göstermek. Bir ek aparatı reaktifler Mikroarray Mikroarray güvenilir bir şekilde aktarmak için kullanılır. Ek çip olmadan Çapraz bulaşma farklı reaktifler colocalization gerektiren herhangi bir biyokimyasal reaksiyonlar için kullanılabilir.

Çip için çapraz-reactivity ücretsiz ve gözcü-Alerjik çoğaltılmış sandviç uzun snap

Burada, içinde yüksek üretilen iş ekran ekstraselüler protein microarrays kimliği roman reseptör-ligand etkileşimleri için bir iletişim kuralına mevcut. Ayrıca protein-microbead kompleksleri kullanarak geçici protein-protein etkileşimlerinin algılama geliştirmek için bir yöntem açıklar.

Hücre dışı Protein Mikroarray teknoloji yüksek işlem hacmi düşük benzeşme reseptör-Ligand etkileşimleri algılanması için

Biz dondurulmuş dokularda multispektral görüntüleme gerçekleştirmek için hızlı bir boyama yöntemi açıklar.

Dondurulmuş Doku Kesitlerinin Multispektral Floresan Görüntülemesi için Hızlı Bir Yöntem

Bu rapor, otomatik bir slayt boyayıcı üzerinde multipleks immünofloresan (mIF) testleri için otomatik bir protokolü açıklar. Translasyonel araştırmalarda çok sayıda doku slaytında özel mIF tahlilleri için ideal olan standart yüksek verimli doku otomatik boyalayıcıları ve tam slayt floresan görüntüleyiciler üzerinde uzamsal proteomiklerin yüksek tekrarlanabilirliğini gösterir.

Translasyonel Araştırmalar için Yüksek Verimli Otomatik Multipleks İmmünofloresan Testleri

Öğrenin, insan tükürüğündeki çoklu proteinleri aynı anda analiz etmek için floresan mikroküre tabanlı mikrodizi yöntemini. Fiber optik paketler ve antikorlar kullanarak hassas biyobelirteç tespiti sağlar.

Polimer Microspheres ve Fiber-optik Paketler kullanma İnsan Tükürük Protein Analiz için çoklu Floresan Microarray

Daha fazla video keşfet