Time-lapse mikroskopi av fluorescensmerkede autophagy markører tillater overvåking av den dynamiske autophagy respons med høy tidsmessig oppløsning. Ved hjelp av spesifikke autofagi og organellesystemer markører i en kombinasjon av tre forskjellige farger, kan vi følge bidraget av et protein til autophagosome formasjonen i en robust romlig og tidsmessig sammenheng.