Journal
/
Genetics
/
Nieuwe reeks ontdekking door subtractieve Genomics
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Novel Sequence Discovery by Subtractive Genomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Nieuwe reeks ontdekking door subtractieve Genomics

DOI:
10.3791/58877-v

•

09:40 min

•

January 25, 2019

•

, ,
1Biology Department,American University

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:08De novo Assemble Starting Sequence
  • 02:03BLAST the Assembly Against the Reference Sequence
  • 04:44Design Primers for the Sequence that Remains
  • 06:25qPCR Validation of the Remaining Sequence
  • 07:51Results: Example Data of qPCR Results Including Negative and Positive Outcomes
  • 08:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Het doel van dit protocol is met een combinatie van rekenkundige en onderzoek van de Bank te vinden van nieuwe sequenties die niet gemakkelijk kunnen worden gescheiden van een mede zuiverende sequentie, die slechts gedeeltelijk bekend kan zijn.

Tags

Novel Sequence DiscoverySubtractive GenomicsGenomic SequencesInexpensiveFlexibleBacterial Vaccine TargetsVirus IdentificationUnknown SeparationReference SequenceTrimmomaticPearReptileTrinityBlastTransdeckorTblastn

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

In vitro transcriptie Testen en hun toepassing in Drug Discovery

Novel-RNA-bindende eiwitten Isolatie door de snelle Methodologie

Conjugative Mating Testen voor sequentie-specifieke analyse van Transfer eiwitten die betrokken zijn in bacterieconjugatie

Bepaling van de optimale chromosomale locatie (s) voor een DNA Element in Escherichia coli met behulp van een nieuwe benadering van Transposon-gemedieerde

Hoog vet dieet voeding en High Throughput triglyceride test bij Drosophila Melanogaster

Volgorde-specifieke en selectieve erkenning van Double-stranded RNAs over Single-stranded RNAs van chemisch gewijzigd Peptide nucleïnezuren

Informatic analyse van sequencedata van Batch gist 2-Hybrid schermen

Het rangschikken van mRNA van geheel bloed gebruikend Nanogaatje het rangschikken

Navigeren MARRVEL, een web-based tool die Human Genomics en model organisme genetica informatie integreert

Sequentie ruimte verkennen om bindende sites te identificeren voor regulatoire RNA-bindende eiwitten

Read Article