JoVE
JoVE
Faculty Resource Center
Research
Behavior
Biochemistry
Biology
Bioengineering
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
Engineering
Environment
Genetics
Immunology and Infection
Medicine
Neuroscience
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
JoVE Chrome Extension
Education
Biology
Chemistry
Clinical
Engineering
Environmental Sciences
Pharmacology
Physics
Psychology
Statistics
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to your Course
Authors
Librarians
High Schools
About
Sign-In
Sign In
Contact Us
Research
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Education
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
High Schools
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Close
Research
Behavior
Biochemistry
Bioengineering
Biology
Cancer Research
Chemistry
Developmental Biology
Engineering
Environment
Genetics
Immunology and Infection
Medicine
Neuroscience
Products
JoVE Journal
JoVE Encyclopedia of Experiments
Education
Biology
Chemistry
Clinical
Engineering
Environmental Sciences
Pharmacology
Physics
Psychology
Statistics
Products
JoVE Core
JoVE Science Education
JoVE Lab Manual
JoVE Quiz
JoVE Business
Videos Mapped to Your Course
Teacher Resources
Get in Touch
Instant Trial
Log In
EN
EN - English
CN - 中文
DE - Deutsch
ES - Español
KR - 한국어
IT - Italiano
FR - Français
PT - Português
Journal
/
Genetics
/
減法混色のゲノム解析による新規シーケンスの発見
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.
Sign in or start your free trial.
JoVE Journal
Genetics
Novel Sequence Discovery by Subtractive Genomics
Please note that all translations are automatically generated.
Click here for the English version.
減法混色のゲノム解析による新規シーケンスの発見
DOI:
10.3791/58877-v
•
09:40 min
•
January 25, 2019
•
Kathryn C. Asalone
,
Megan M. Nelson
,
John R. Bracht
1
Biology Department
,
American University
Chapters
00:04
Title
01:08
De novo Assemble Starting Sequence
02:03
BLAST the Assembly Against the Reference Sequence
04:44
Design Primers for the Sequence that Remains
06:25
qPCR Validation of the Remaining Sequence
07:51
Results: Example Data of qPCR Results Including Negative and Positive Outcomes
08:53
Conclusion
Summary
Automatic Translation
English (Original)
العربية (Arabic)
中文 (Chinese)
Nederlands (Dutch)
français (French)
Deutsch (German)
עברית (Hebrew)
italiano (Italian)
日本語 (Japanese)
한국어 (Korean)
português (Portuguese)
русский (Russian)
español (Spanish)
Türkçe (Turkish)
Automatic Translation
このプロトコルの目的は、ベンチの研究と計算の組み合わせを使用して、可能性がありますのみ部分的に知られている共同浄化のシーケンスから容易に分離できない新規シーケンスを検索することです。
Tags
Novel Sequence Discovery
Subtractive Genomics
Genomic Sequences
Inexpensive
Flexible
Bacterial Vaccine Targets
Virus Identification
Unknown Separation
Reference Sequence
Trimmomatic
Pear
Reptile
Trinity
Blast
Transdeckor
Tblastn
Article
Embed
ADD TO PLAYLIST
Usage Statistics
Related Videos
in vitro
転写アッセイおよび創薬への応用
急速な手法による新規RNA結合タンパク質の単離
細菌接合に関与する転写タンパク質の配列特異的分析のための接合交配アッセイ
新規トランスポゾンを介したアプローチを使用して
エシェリヒア属大腸菌
DNA 要素の最適な染色体の場所の決定
高脂肪食給餌と
キイロショウジョウバエ
の高スループット Triacylglyceride 試金
一本鎖 Rna の二重鎖 Rna の特定のシーケンスで選択的な認識化学修飾ペプチド核酸
バッチ酵母 2 ハイブリッド スクリーンからシーケンス データの情報解析
ナノポアシーケンシングを用いた全血からの mRNA の配列決定
人間のゲノムとモデル生物遺伝学情報を統合するWebベースのツール、MARRVELのナビゲート
調節RNA結合タンパク質の結合部位を同定するための配列空間の探索
Read Article