Journal
/
Genetics
/
Romanserie upptäckten av subtraktiv genomik
JoVE Journal
Genetics
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Genetics
Novel Sequence Discovery by Subtractive Genomics
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Romanserie upptäckten av subtraktiv genomik

DOI:
10.3791/58877-v

•

09:40 min

•

January 25, 2019

•

, ,
1Biology Department,American University

Chapters

  • 00:04Title
  • 01:08De novo Assemble Starting Sequence
  • 02:03BLAST the Assembly Against the Reference Sequence
  • 04:44Design Primers for the Sequence that Remains
  • 06:25qPCR Validation of the Remaining Sequence
  • 07:51Results: Example Data of qPCR Results Including Negative and Positive Outcomes
  • 08:53Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Syftet med detta protokoll är att använda en kombination av computational och bänk forskning för att hitta nya sekvenser som inte kan lätt separeras från en co renande sekvens, som kan vara endast delvis kända.

Tags

Novel Sequence DiscoverySubtractive GenomicsGenomic SequencesInexpensiveFlexibleBacterial Vaccine TargetsVirus IdentificationUnknown SeparationReference SequenceTrimmomaticPearReptileTrinityBlastTransdeckorTblastn

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Transkription in vitro analyser och deras tillämpning i Drug Discovery

Nya RNA-bindande proteiner Isolering av den snabba Methodology

Konjugativ Parning Analyser för sekvensspecifik analys av Transfer proteiner involverade i konjugation

Bestämning av optimala kromosomala belägenheten för ett DNA-Element i Escherichia coli använder en ny metod för Transposon-medierad

High Fat Diet utfodring och hög genomströmning Triacylglyceride test på Drosophila Melanogaster

Sekvens-specifika och selektiv erkännande av dubbelsträngat RNA över enkelsträngat RNA av kemiskt modifierade peptid nukleinsyror

Datoriserad analys av sekvensdata från Batch jäst 2-Hybrid skärmar

Sekvensering av mRNA från helblod med Nanopore sekvensering

Navigera i MARRVEL, ett webbaserat verktyg som integrerar Human Genomics och Modellorganismens gen etik information

Utforska Sekvensutrymme för att identifiera bindnings platser för regulatoriska RNA-bindande proteiner

Read Article