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Using In Vitro and In-cell SHAPE to Investigate Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
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Utilizzando In Vitro e nelle celle di forma per indagare la piccola molecola ha indotto cambiamenti strutturali Pre-mRNA

DOI:
10.3791/59021-v

•

11:58 min

•

January 30, 2019

•

, ,
1Calibr,The Scripps Research Institute, 2Department of Integrative Structural and Computational Biology,The Scripps Research Institute

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:3132P-labeled Primer Labeling for In Vitro Selective 2‘-hydroxyl Acylation Analyzed by Primer Extension (SHAPE)
  • 03:44Small Molecule Binding and RNA 2‘-OH Modification
  • 06:29Marker Preparation and Primer Extension
  • 08:59PAGE Analysis
  • 10:15Results of In Vitro and In-cell SHAPE for Analyzing Small Molecule Induced Pre-mRNA Structural Changes
  • 11:02Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Protocolli dettagliati per entrambi in vitro e nelle celle selettivo 2'-idrossile acilazione analizzati dagli esperimenti di estensione (forma) di primer per determinare la struttura secondaria delle sequenze di pre-mRNA di interesse in presenza di una piccola molecola di RNA-targeting sono presentato in questo articolo.

Tags

In Vitro SHAPEIn-cell SHAPERNA Secondary StructureSmall MoleculePre-mRNAReverse TranscriptionRadioactive LabelingAcrylamide GelPassive Elution

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