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非正規の開いたリーディング ・ フレームから翻訳された蛋白質を発表する OpenProt データベースを利用した質量分析を用いたプロテオミクス解析
JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics
Mass Spectrometry-Based Proteomics Analyses Using the OpenProt Database to Unveil Novel Proteins Translated from Non-Canonical Open Reading Frames
DOI:

07:38 min

April 11, 2019

,

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:52OpenProt Database Download
  • 01:53Database Handling
  • 02:41Mass Spectrometry File Preparation
  • 03:13Protein Quantification
  • 04:13Quality Control and OpenProt Database Mining
  • 05:25Results: Representative Interactor and Mass Spectrometry Identification of a Novel Protein
  • 06:40Conclusion

Summary

Automatic Translation

OpenProt は、真核生物ゲノムのコードするモデルを適用自由にアクセス可能なデータベースです。ここで、質量データセットを問い合わせるときの OpenProt データベースを使用するためのプロトコルを紹介します。プロテオーム解析のためのデータベース OpenProt を使用して小説や以前検出できないタンパク質の探索できます。

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