Journal
/
Genetics
/
Масса на основе спектрометрии протеомики анализа с использованием базы данных OpenProt откроет новые белки перевод с неканоническим открытом чтения фреймов
JoVE Journal
Genetics
This content is Free Access.
JoVE Journal Genetics
Mass Spectrometry-Based Proteomics Analyses Using the OpenProt Database to Unveil Novel Proteins Translated from Non-Canonical Open Reading Frames
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Масса на основе спектрометрии протеомики анализа с использованием базы данных OpenProt откроет новые белки перевод с неканоническим открытом чтения фреймов

DOI:
10.3791/59589-v

•

07:38 min

•

April 11, 2019

•

,
1Department of Biochemistry,Université de Sherbrooke, 2PROTEO,Quebec Network for Research on Protein Function, Structure, and Engineering

Chapters

  • 00:04Title
  • 00:52OpenProt Database Download
  • 01:53Database Handling
  • 02:41Mass Spectrometry File Preparation
  • 03:13Protein Quantification
  • 04:13Quality Control and OpenProt Database Mining
  • 05:25Results: Representative Interactor and Mass Spectrometry Identification of a Novel Protein
  • 06:40Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

OpenProt является свободно доступной базы данных, обеспечивающая полицистронная модель эукариотических геномах. Здесь мы представляем протокол для использования OpenProt баз данных, когда допрос наборов данных масс-спектрометрии. Использование OpenProt база данных для анализа proteomic экспериментов позволяет для обнаружения новых и ранее обнаружить белков.

Tags

Mass SpectrometryProteomicsOpenProt DatabaseNon-canonical Open Reading FramesNovel ProteinsProteomeProteomic AnalysesDatabase HandlingMS Convert ToolMzML File Format

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

подтипов<em> Campylobacter jejuni</em> Подвид.<em> doylei</em> Изолятов Использование PhyloProteomics Масс-спектрометрия на основе (MSPP)

Novel Выделение РНК-связывающих белков Стремительное Методология

Конъюгативных Спаривание Анализы для последовательности конкретного анализа переноса белков, участвующих в конъюгации бактерий

Из натурального продукта до его биосинтетического кластера генов: демонстрация Использование Polyketomycin из<em> Streptomyces diastatochromogenes</em> Tü6028

Определение оптимального расположения хромосомных ДНК элемента в Escherichia coli с помощью Роман Transposon опосредованный подход

Адаптация гибридизации захвата Chromatin связанных белков для протеомики в клетках млекопитающих

С помощью мыши яйцеклеток для оценки человеческого гена функции во время мейоза я

Быстрый и количественный метод для столб-поступательные изменения и вариант включено сопоставление пептидов в геномов

Изучение воздействия космических полетов по физиологии мыши, с помощью платформы GeneLab НАСА открытого доступа

Использование в пробирке и в клеток форму расследовать малые молекулы индуцированной пре мРНК структурные изменения

Read Article