Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems

Karel &#352;imek; Dagmara Sirova

doi:10.3791/59903

Journal

/

Environment

/

Fluorescently mærkede bakterier som en Tracer til at afsløre nye veje af organisk kulstof flow i akvatiske økosystemer

Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems

JoVE Journal
Environment

A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.

JoVE Journal Environment

Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems

Fluorescently mærkede bakterier som en Tracer til at afsløre nye veje af organisk kulstof flow i akvatiske økosystemer

Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

7,002 Views

•

09:35 min

•

September 13, 2019

DOI:

10.3791/59903-v

DOI:

10.3791/59903-v

•

09:35 min

September 13, 2019

•

1 Views

Karel Šimek¹, Dagmara Sirova¹

¹Department of Aquatic Microbial Ecology, Institute of Hydrobiology,Biology Centre CAS

Transcript

Denne tilgang er betydelig, fordi det giver os mulighed for at visualisere og estimere kulstof- og energistrømme fra prokaryoter til højere trofiske niveauer i mikrobielle fødespind med en meget høj opløsning. Dette er den eneste teknik, der i øjeblikket er til rådighed til at bestemme, hvilke protistarter der indtager bakterier in situ, og samtidig kvantificere hastigheden af denne proces på et enkelt celleniveau. Da bakterier er de eneste signifikante mikrober, der ændrer opløst organisk kulstof til partikler af organisk kulstof, danner de involverede aktørers viden og de satser, hvormed dette sker, grundlaget for at forstå akvatiske økosystemer generelt. Vi anbefaler på det kraftigste, at forskerne bliver fortrolige med deres studiesystem, før de udfører græssende eksperimenter. Dette indebærer lys og epifluorescens af mikroskopi inspektion af prøverne, og viden om de vigtigste taxon nuværende og deres sæsonbestemte dynamik. Demonstration af proceduren vil blive Jitka Jezberov

Summary

Præsenteret her er en protokol for en enkelt celle, epifluorescens mikroskopi-baserede teknik til at kvantificere græsnings rater i akvatiske aggressiv eukaryoter med høj præcision og taksonomisk opløsning.