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Mappare le varianti della malattia di Alzheimer ai loro geni bersaglio utilizzando l'analisi computazionale della configurazione della cromatina
JoVE Journal
Genetics
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JoVE Journal Genetics
Mapping Alzheimer’s Disease Variants to Their Target Genes Using Computational Analysis of Chromatin Configuration
DOI:

04:41 min

January 09, 2020

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Chapters

  • 00:05Title
  • 01:00Generation of a Granges Object for Credible SNPs and Positional Mapping
  • 01:53Developmental Expression Trajectories
  • 02:18Cell-type Expression Profiles and Gene Annotation Enrichment Analysis
  • 02:46Results: Determination and Characterization of Putative Target Genes of AD GWS Loci
  • 03:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

Presentiamo un protocollo per identificare le implicazioni funzionali delle varianti non codificanti identificate dagli studi di associazione a livello di genoma (GWAS) utilizzando interazioni tridimensionali della cromatina.

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