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Die transthorakale (TTE) und transösophageale (TEE) Echokardiographie stellen die grundlegenden bildgebenden Werkzeuge für die untersuchung des interatrialen Septums dar. Dreidimensionales (3D) TEE liefert inkrementelle Informationen bei der Beurteilung des interatrialen Septums. Weitere fortschrittliche Echokardiographie-Techniken unter Verwendung der Speckle-Tracking-Echokardiographie werden zur empfindlichen volumetrischen und funktionellen Beurteilung der Herzkammern eingesetzt.
