Journal
/
Biochemistry
/
Anvendelsen av åpne søkebaserte tilnærminger for identifisering av Acinetobacter baumannii O-tilknyttede Glycopeptides
JoVE Journal
Biochemistry
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biochemistry
The Application of Open Searching-based Approaches for the Identification of Acinetobacter baumannii O-linked Glycopeptides

Anvendelsen av åpne søkebaserte tilnærminger for identifisering av Acinetobacter baumannii O-tilknyttede Glycopeptides

DOI:
10.3791/63242-v

•

08:37 min

•

November 02, 2021

•

, , ,
1Department of Microbiology and Immunology, Peter Doherty Institute for Infection and Immunity,The University of Melbourne

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:44Processing of Proteome Samples
  • 04:01Liquid Chromatography-Mass Spectrometry (LC-MS) of Proteome/Glycopeptide-Enriched Samples
  • 04:28Analysis of Proteome/Glycopeptide-Enriched Samples
  • 06:08Results: Open Searching and Glycan-Focused Glycopeptide Searches for Acinetobacter baumannii
  • 07:52Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Åpen søking gjør det mulig å identifisere glykopeptider dekorert med tidligere ukjente glykanske komposisjoner. I denne artikkelen presenteres en strømlinjeformet tilnærming for å gjennomføre åpne søk og påfølgende glykanfokusert glykopeptidsøk for bakterieprøver ved hjelp av Acinetobacter baumannii som modell.

Tags

Acinetobacter BaumanniiO-linked GlycopeptidesOpen SearchingGlycosylationProteomeSTB-RPSZIC-HILICChromatographyEnrichmentMass Spectrometry

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Identifisering av fettsyrer i<em> Bacillus cereus</em

Nuclear Magnetic Resonance spektroskopi for identifisering av flere Phosphorylations med egen Uordnede Proteiner

En Protein Forberedelse metode for High-throughput identifisering av proteiner samspill med et kjernefysisk kofaktor Bruke LC-MS / MS-analyse

Identifikasjon av havet Lamprey feromoner bruker Bioassay-guidede fraksjoneres

Måling av konsentrasjon i Unstirred grensen laget med åpne Patch-klemme Pipette: implikasjoner i kontroll av Ion kanaler av væske flyt

Ved hjelp av Open-Source MALDI TOF-MS IDBac rørledning for analyse av mikrobiell protein og spesialiserte metabolitten data

Karakterisering på Molecular Level bruker robust biokjemiske tilnærminger av en ny kinase protein

SUMO-bindende enheter (SUBEs) som verktøy for berikelse, isolasjon, identifisering og karakterisering av SUMO proteom i leverkreft

Foreta presise og nøyaktige FRET-målinger med ett molekyl ved hjelp av åpen kildekode-smfBox

Bruke tidsbestemt proteinindusert fluorescensforbedring for å identifisere stabile lokale konformasjoner En α-Synuclein Monomer om gangen

Read Article