En neuronal lysosomnærhed mærkning proteomics protokol er beskrevet her for at karakterisere det dynamiske lysosomale mikromiljø i humant inducerede pluripotente stamcelleafledte neuroner. Lysosomale membranproteiner og proteiner, der interagerer med lysosomer (stabilt eller forbigående), kan nøjagtigt kvantificeres i denne metode med fremragende intracellulær rumlig opløsning i levende humane neuroner.