대사율의 측정에

Biology

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Summary

대사 질환은 인간에서 가장 흔한 질병 중 하나들이다. 유 전적으로 다루기 쉬운 모델 생물 D. melanogaster의 대사를 조절하는 신규 한 유전자를 확인하는데 사용될 수있다. 이 논문은 자신의 CO 2 생산을 측정하여 파리의 신진 대사 속도를 연구 할 수있는 비교적 간단한 방법을 설명합니다.

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Yatsenko, A. S., Marrone, A. K., Kucherenko, M. M., Shcherbata, H. R. Measurement of Metabolic Rate in Drosophila using Respirometry. J. Vis. Exp. (88), e51681, doi:10.3791/51681 (2014).

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Abstract

대사 장애는 인간의 건강에 영향을 미치는 문제가 자주 발생합니다. 따라서 신진 대사를 조절하는 메커니즘을 이해하는 것은 매우 중요한 과학적 작업입니다. 인간의 많은 질병의 원인이 유전자는 초파리의 다른 질환의 개발에 관련된 신호 전달 경로를 연구 할 수있는 좋은 모델을 만들고, 비행 동성이있다. 또한, 초파리의 온순함은 신진 대사를 조절 할 수 있습니다 새로운 치료 표적을 식별에 도움이 유전 화면을 단순화합니다. 이러한 화면을 수행하기 위해 파리의 대사 상태의 변화를 확인하는 간단하고 빠른 방법이 필요하다. 일반적으로, 이산화탄소 생산 산화 기질 및 에너지 비용이 대사 상태에 대한 정보를 제공하는 좋은 지표이다. 이 프로토콜에서 우리는 파리에서 CO 2의 출력을 측정 할 수있는 간단한 방법을 소개합니다. 이 기술은 잠재적으로 신진 대사 속도에 영향을 미치는 유전 적 교란의 식별에 도움이 될 수 있습니다.

Introduction

생화학 Kreb의주기는 탄수화물, 지방, 그리고 CO 2 생성 단백질에서 파생 된 아세트산의 산화를 통해 ATP를 생성합니다. 초파리에서, O 2 입력은 직접 CO 2 출력과의 상관 관계 및 대사 1의 수준을 반영한다. 따라서, CO 2 출력의 측정은 성공적 노화와 신진 대사 2-5 관련 연구에 이용되고있다. 여기에 우리의 실험실은 전문 장비가 필요없이 최대 18 개의 시료에서 CO 2 생산을 측정 할 수 있도록, 이전에 설계 실험 설정을 수정했다. 기타 우리는 이전에 근육 영양 장애 관련 단백질, Dystroglycan (DG) 6-8 불충분 파리의 신진 대사 속도의 차이를 보여주기 위해이 방법을 사용했습니다.

O 산화 대사에 사용되는 2 호흡 폐기물로 배출되는 CO 2로 변환됩니다. construc손으로 만든 respirometers의 기는 O 2 소모의 속도의 측정을 위해 허용하는 기술되어있다. 파리 효율적으로 기체 상태에서 제거, CO 2 배출을 흡수하는 물질로 밀폐 용기에 배치됩니다. 가스 부피 (감소 압력)의 변화는 폐쇄 호흡계에 부착 유리 모세관 유체의 변위에 의해 측정된다.

다른 것보다이 기술의 주요 장점은 비용이다. 이전 연구는 가스 분석기 및 기술적으로 진보 된 respirometry 시스템 1.9을 사용하여 초파리에 의한 CO 2 생산을 측정했다. 더 복잡한 장비에도 불구하고, 여기에 기재된 방법의 감도는보고 된 값 (표 1)과 유사하다. 또한, 여러 가지 다른 그룹은 초파리 4-6에서 상대 신진 대사 속도를 결정하기 위해이 기술의 변화를 사용했습니다. 따라서, 이러한 분석은 reliab에를 생성하는데 사용될 수있다르, 모든 실험실에 설치 될 수 있으며, 교육 목적으로 사용할 수있는 특수 장비를 구입하지 않고 초파리의 신진 대사에 관련된 데이터를 재현.

일반적으로, 생체의 신진 대사를 결정하는 허용 기법 CO 2 생산을 측정하는 소비 O 2 또는 둘 3,4,9. 하지만, 그것은 O 2의 1 당량은 CO 2의 1 당량을 생성하는 가정 할 수있다, CO 2의 정확한 비율은 발생 10을 활용 한 대사 기판에 따라 달라집니다. 따라서 정확하게 에너지 단위 대사량을 결정하기 위하여 그것 O이 소비 및 CO 2 생산 양을 측정 할 필요가있다. 이 때문에, 여기에 기재된 방법은 동물이 아닌 절대 값 사이의 CO 2 생산의 차이를 비교하는 특별히 중요한 것이다. 우리의 기술은 포의 기간에 걸쳐 여러 동물 CO 2 생산을 통합따라서 전자 (1 ~ 2 시간) 및 동물의 활동의 평균을 반환합니다. 실험 동물은 측정이 다른 활동의 수준과 반드시​​ 신진 대사를 반영 할 수있는 제어 동물보다 활성화되어 있다고 믿을만한 이유가있는 경우.

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Protocol

Respirometers 1. 준비

  1. 50 μL 모세관 마이크로 피펫의 삽입을 허용하는 면도날 1,000 μL 피펫 팁을 잘라 가능한 똑바로 피펫 팁을 얻을하려고합니다.
  2. 피펫으로 거품의 조각을 놓고 피펫 팁에 아래로 누르십시오.
  3. CO 2 흡수의 작은 금액을 추가하고 폼의 두 번째 부분으로 포함되어 있습니다.
  4. 마이크로 피펫은 피펫 팁에 삽입되는 장소에 접착제를 적용합니다.
  5. 접착제가 건조 할 수 있도록 밤새 호흡계를 남겨주세요.
    호흡계의 회로도는 그림 1A에 표시됩니다.

측정 상공 회의소 2. 준비

  1. 눈에 보이는 발색이 발생합니다 비율로 에오신와 물을 혼합하여 챔버의 솔루션을 준비합니다.
  2. 챔버에 에오신 / 물 솔루션을 붓는다.
  3. 센티미터 스케일과 챔버의 측면 중 하나를 레이블.

  1. 마커로 개별 respirometers 레이블을 지정합니다.
  2. 2 CO 각 호흡계 안에 원하는 유전자형의 3-5 파리를 배치하는 다른 방법을 사용하여 파리를 마취.
  3. 플라 퍼티를 사용하여 단단히 상단에 respirometers를 밀봉.
  4. 파리가 약 15 분 동안 마취에서 회복 할 수 있습니다.
  5. 대기 제어로 사용되는, 파리 않고 한 호흡계를 준비​​합니다.

4. 실험을 수행

  1. 챔버의 상부에서 상단과 하단에 열려 1.5 ㎖의 에펜 도르프 튜브 홀더를 부착하여 챔버 respirometers 매달아.
  2. 아래로 끝이 색 용액에 잠수함 수 있도록 챔버에 마이크로 피펫 팁과 respirometers를 삽입합니다.
  3. 온도 및 압력 fluct에서 강한 분리를 제공하기 위해 뚜껑 덮개와 챔버 사이 바셀린 추가상황들.
  4. 뚜껑을 닫고 시스템이 15 분 동안 평형 수 있습니다.
  5. 각 마이크로 피펫 내의 액체의 레벨이 표시되어 있는지 확인하고 챔버의 사진을 가지고 이렇게 스케일 (그림 1b에 도시 예 참조).
  6. 1 ~ 2 시간 후, 사진을 촬영.
  7. 실험이 완료되면, respirometers에서 파리를 제거하고 원하는 경우 무게 나 더 필요한 경우 유리 병에 다시 전송합니다.

결과 5. 분석

  1. 오픈 ImageJ에 소프트웨어 (11)를 사용하여 이미지를 획득.
  2. 각 그림의 배율을 사용하여 소프트웨어의 픽셀 스케일링을 설정합니다.
  3. 액체가 시작 (D1)에서 촬영 한 이미지의 판단 기준 지점에서 여행 그 거리 (Δd 및) 실험의 끝 (D2)를 측정한다. 개략적 인 예는 그림 1C에 표시됩니다.
  4. 식으로 제작 CO 2 (μL / 시간 / 플라이)의 양을 계산한다

그림 1

센티미터 마이크로 피펫 관의 R은 = 반지름
ΔD = 거리는 액체가 센티미터로 측정 시료의 마이크로 피펫에 이동했다
ΔC = 거리는 액체 (초파리없이) 음성 대조군 샘플의 마이크로 피펫에 이동했다
사용 파리의 N = 번호
h = 시간

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Representative Results

이 방법은 우리가 야생형 (오레곤 R)에서 CO 2 생산 남성은 18, 25 일에 파리, 29 ° C 및 DG에 돌연변이 파리를 측정 민감하다는 것을 보여주기 위해. 파리는 25 ° C에서 제기 한 후 측정에 앞서 5 일 동안 실험 온도로 이동했다. 이 ectothermic 종 예상 한 바와 같이, CO 2의 양은 온도 (그림 2)로 증가 생산. 우리는 과거에 설탕 무료 다이어트는 모두 야생 유형의 신진 대사 속도를 줄이고 DG 돌연변이 7 파리 것으로 나타났습니다. DG의 손실은 증가 신진 대사 수준 (그림 2)로 연결됩니다.

그림 1
파리에있는 CO 2 생산의 측정을 위해 그림 1. 설치. A. 회로도 t을 보여주는CO 2 측정시 챔버의 그는 개인 호흡계의 건설. B. 사진. 편지는 respirometers의 위치를​​ 표시합니다. 수직 숫자로 표기 규모를 나타냅니다. 실험 기간 동안 변경 사항을 표시 C. 회로도. 녹색 선이 기준 지점 (D1)을 나타냅니다, 블루 2 시간 (D2) 후 액체의 최종 위치를 나타냅니다. ΔD는 액체가 마이크로 피펫에 여행했다 거리이다.

그림 2
그림 2. 다른 온도 및 DG의 돌연변이 체에서 파리에있는 CO 2 생산. 주택 온도는 긍정적으로 초파리의 CO 2 생산과 상관 관계가 크게 DG 돌연변이에 증가한다. 오차 막대 *** P ≤ 0, 네 개의 개별 실험에서 SEM을 나타냅니다.01.

(μL / 비행 X 시간) 사용 장비 참고
2 ~ 3 CO 2 CO 2 가스 분석기 (반 Voorhies, Khazaeli 등. 2004)
4.68 ± 1.04 CO 2 CO 2 respirometry 시스템 (Khazaeli, 반 Voorhies 등. 2005)
2.9-6.2 O 2 이와 유사하게 설계 respirometers (헐버트, 클랜시 등. 2,004 알)
2.20 ± 0.15 O 2 설명 여기에 제 respirometers (Kucherenko, 등. 2,011 MARRONE)
* 테이블 값은 25 ° C에서 측정 파리의 수치를보고 연구에서이다

표 1. 비교초파리에 의한 CO 2 생산을 측정하는 데 사용되는 다른 기술.

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Discussion

이 프로토콜에서는, 우리는 파리에있는 CO 2 생산을 측정하기위한 저렴하고 신뢰할 수있는 방법에 대해 설명합니다. 우리는이 실험을 수행하는 빠르고, 쉽고, 다른 연구 1, 6, 9와 계약에 재생 가능한 데이터를 생성하는 것으로 나타났습니다. 여기에 설명 된 프로토콜은 쉽게 연구소의 예산 및 재료에 맞게 수정할 수 있습니다. 각 개별 호흡계의 구조는 한 챔버가 밀폐 남아 적응 될 수있다. 그러나, 더 이상 얇은 마이크로 피펫 짧은 사람을보다 정밀도를 제공합니다. 외부 챔버의 사용은 오랜 실험을 손상 유의 주위 온도 및 압력의 변화가 없기 때문에 선택적 일 수있다. 이는 대조군과 생물학적 시료 측정 사이 큰 변동의 분석에 의하여 결정될 수있다. 또한, 이산화탄소 흡수제로는, F에 독성이없는 한 모든 종류의 할 수있다거짓 (예를 들어, 수산화 칼륨). 이 기술이 제대로 작동하는지 확인하기 위해 부정적인 제어 할 가장 중요합니다. 호흡계 완전히 밀봉되지하기위한 가장 일반적인 문제이다. 이 경우, 다음 측정은 음성 대조군에 필적 할 것이다. 추가 문제로 인해 마취에서 회복 할 시간이 없었거나 사망 한 파리에 발생할 수 있습니다.

이 프로토콜에서 가장 중요한 단계는 호흡계의 건설입니다. 위에서 언급 한 바와 같이, 호흡계는 밀폐해야합니다. 큰 피펫 챔버에 마이크로 피펫의 첨부 파일이 올바른 접착제로 수행해야합니다. 더 고무 같은 접착제는 가장 근무하고있다. 그것은 완료 후 접착 구조의 타협을 관찰하는 현미경으로 respirometers을 검사하는 것이 좋습니다. 또한, 파리 안에 배치 된 후 호흡계의 밀봉은 매우 중요합니다. 퍼티 (H)의 사용최고의 작품을 발견하고 자주 실패했던만큼. 파라핀은 매우 가난하게 작동하는 것으로 확인되었습니다 피해야한다. 가스 부피를 측정하기 위해 사용되는 액체는 또한 매우 중요하며 마노미터이어야한다. 물은 따라서 최선의 선택이다. 그것은 호흡계 쓸모 만드는 모세 혈관에 경화 할 수 있기 때문에 잉크의 사용은 권장하지 않습니다. 우리가 자신의 CO 2 생산이 매우 다양 할 수 있습니다 것으로 나타났습니다으로도 여성을 재현 사용하지하는 것이 중요합니다. 또한 파리의 나이가 중요하다, 따라서 비교 파리는 같은 연령이어야합니다. 우리의 테스트에서 우리는 5 일 이전 남성을 사용했다. 파리의 유전 적 배경도 중요합니다. 돌연변이에 비해 제어 파리는 동일한 유전 배경이어야한다. 데이터는 또한 파리의 크기에 큰 차이가있는 경우 분석을 수행 한 후 파리의 질량을 측정하여 (μL / 시간 / ㎎)을들 수있다. 우리 손에, 한 야생형 비행 N = 1 (0.80 ± 0.11 mg의 무게80). 또한, 실험의 타이밍 동안, 보통 대사량의 값이 얻어지는 것을 지적한다. 우리는 또한 개별 플라이를 측정하는 것이 가능하다는 것을 발견했지만, 우리는 3-5 파리를 사용하여 높은 정밀도를 달성했다. 파리에 대한 호흡계에서 사용할 수있는 공간들이 혼잡 생각하지 않는 것이 충분하지만, 동시에 그들은 집중적으로 걸을 공간이없는 : 따라서 결함 geotaxis는 CO 2 생산의 수준에 영향을주지해야한다.

파리는 긴 발달 생물학, 세포 생물학 및 신경 생물학에 관련된 인간의 질병을 연구하는 중요한 모델 생물의 하나로서 설립되었습니다. 최근의 많은 연구는 파리가 쉽게 (12, 13에서 검토)뿐만 아니라 에너지 항상성을 연구하는 데 사용할 수있는 것으로 나타났습니다. 여기에 제시된 방법으로 간단 아마도 저 제어에 관련된 새로운 분자 구성 요소를 식별하는 유전 스크린에서 사용될 수있다이전보다 정확하고 고가의 장비를 구매하는 tabolic 상태. 지금까지 이러한 스크린의 대부분은 고급 연구가 보증하는 것을 나타내는 유일한 세포 배양에서 수행되었다.

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Disclosures

우리는 공개 아무것도 없어.

Acknowledgments

우리는 우리의 연구 자금에 대한 최대 플랑크 사회에게 감사의 말씀을 전합니다.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
BlauBrand IntraMark 50 µl micropipettes VWR 612-1413
Soda Lime Wako CDN6847
Eosine  Sigma 031M4359 Any dye that can create visible colorization of liquid can be used
Thin Layer Chromatorgaphy (TLC) Developing Chamber VWR 21432-761 Any transparent glass chamber that can be closed with the lid
Anesthetizer, Lull-A-Fly Kit Flinn FB1438
Power Gel Glue Pritt
1 ml pipett tips Any
Foam Any
Plaesticine Putty Any
Scalpel Any
Tweezers Any

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References

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