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DOI: 10.3791/57950-v
Louise Benning1, Samuel Robinson1,2, Marie Follo3, Lukas Andreas Heger1, Daniela Stallmann1, Daniel Duerschmied1, Christoph Bode1, Ingo Ahrens1,4, Marcus Hortmann1
1Department of Cardiology and Angiology I, Heart Center Freiburg University, Faculty of Medicine,University of Freiburg, 2Department of Medicine,Monash University, 3Department of Medicine I, Lighthouse Core Facility, Medical Center,University of Freiburg, 4Department of Cardiology, Augustinerinnen Hospital, Academic Teaching Hospital,University of Cologne
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
循环 microRNAs 表明, 作为心血管疾病和急性心肌梗死的标志物的承诺。在本研究中, 我们描述了一个 miRNA 提取, 反向转录和数字 PCR 的协议, 以绝对量化的 miRNAs 在心血管疾病患者的血清。
这种方法可能有助于回答诊断领域的关键问题,例如 micro RNA 是否是心血管疾病的有效生物标志物。与实时定量 PCR 相比,数字 PCR 在定量循环中的 microRNA 方面表现出卓越的技术品质。由于样品被分成大约 20, 000 个液滴,因此不需要重复测量,也不需要标准曲线进行定量。
虽然这种方法可能提供对心血管患者 microRNA 定量的见解,但它也可以应用于其他患者和疾病,因为其他 microRNA 已显示出作为癌症进展生物标志物的前景,它也可以应用于肿瘤患者。一般来说,刚接触这种方法的人会很挣扎,因为产生的飞沫很脆弱,需要小心处理。从血清样品中分离 RNA 后,继续进行逆转录以获得更稳定的互补 DNA 用于 dPCR。
首先,在冰上解冻逆转录试剂盒。然后将酶和引物向下旋转。接下来,按照文本方案中的说明准备预混液。
在 96 孔板的每个孔中混合 10 μL 预混液和 5 μL 提取的 RNA。然后将板在 2, 000xg 和 4 摄氏度下离心 2 分钟。按照文本协议中的详细说明进行逆转录。
首先,在冰上解冻市售的 dPCR 混合物、cDNA 和 PCR 引物,并在使用前立即离心。然后按照文本方案中的说明准备预混液。将 1.33 微升体积的逆转录产物添加到 18.67 微升体积的预混液中,并短暂离心。
使用移液管,将 20 微升样品转移到 8 孔盒的中等行的每个孔中。然后将 70 微升液滴生成油移入盒的油井中。接下来,在暗盒顶部放置垫圈并将其放入液滴发生器中。
关闭液滴发生器并等待三个指示灯呈绿色常亮。使用移液管,小心地将 40 μL 液滴状样品转移到 96 孔板的单独孔中。然后用 180 摄氏度的 dPCR 箔密封板 4 秒钟。
将密封的 PCR 板放入循环仪中,并按照文本实验步骤中概述的循环说明进行作。从热循环仪中取出板并将其转移到板架的底座上。然后将板支架的顶部放在 PCR 板上。
最后,启动市售 dPCR 软件。在该方案中,数字 PCR 用于定量心血管疾病患者血清中的 microRNA。从经皮介入前、经皮干预后 8 小时和之后 16 小时的 16 例患者身上采集样本。
与稳定冠状动脉疾病患者相比,ST 段抬高型心肌梗死患者的 miR-499 水平显著增加。一旦掌握,如果作正确,该技术可以在大约一个小时内完成,以形成 96 个样品的液滴。在尝试此过程时,请务必记住小心处理飞沫。
观看此视频后,您应该对如何通过正确的液滴形成、循环、读取和分析来正确进行数字 PCR。
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