Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

Alireza Lorzadeh; Rodrigo Lopez Gutierrez; Linda Jackson; Michelle Moksa; Martin Hirst

doi:10.3791/56085

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Generación de inmunoprecipitación de la cromatina nativa secuenciación bibliotecas para el análisis de densidad de nucleosoma

Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

JoVE Revista
Genética

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JoVE Revista Genética

Generation of Native Chromatin Immunoprecipitation Sequencing Libraries for Nucleosome Density Analysis

Generación de inmunoprecipitación de la cromatina nativa secuenciación bibliotecas para el análisis de densidad de nucleosoma

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10:05 min

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December 12, 2017

DOI:

10.3791/56085-v

DOI:

10.3791/56085-v

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10:05 min

December 12, 2017

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Alireza Lorzadeh¹, Rodrigo Lopez Gutierrez¹, Linda Jackson¹, Michelle Moksa¹, Martin Hirst^1,2

¹Department of Microbiology and Immunology, Michael Smith Laboratories Centre for High-Throughput Biology,University of British Columbia, ²Canada’s Michael Smith Genome Science Center,BC Cancer Agency

Transcripción

Summary

Presentamos una inmunoprecipitación de cromatina nativa modificada secuencia (ChIP-seq) metodología para la generación de la secuencia de bases de datos adecuadas para un marco analítico de nucleosoma densidad ChIP-seq, integración de la accesibilidad de la nucleasa micrococcal (MNase) con medidas de modificación de las histonas.