Imágenes de inmunofluorescencia múltiple basadas en códigos de barras de ADN para analizar muestras de FFPE de melanoma murino reprogramado genéticamente

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6 de junio de 2025

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6 de junio de 2025

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Sachin S. Surwase^*¹^,²^,³ , Xin Ming M. Zhou^*³^,⁴ , Kathryn M. Luly¹^,²^,³ , Qingfeng Zhu⁵^,⁶^,⁷ , Niki Talebian⁶ , Robert A. Anders⁵^,⁶^,⁷^,⁸^,⁹ , Jordan J. Green¹^,²^,³^,⁵^,⁸^,⁹^,¹⁰^,¹¹^,¹² , Stephany Y. Tzeng¹^,²^,³ , Joel C. Sunshine¹^,³^,⁴^,⁵^,⁶^,⁸^,⁹

¹Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University, ²Translational Tissue Engineering Center, Johns Hopkins University, ³Johns Hopkins Translational ImmunoEngineering Center, Johns Hopkins University, ⁴Department of Dermatology, Johns Hopkins University, ⁵Department of Oncology, Johns Hopkins University, ⁶Department of Pathology, Johns Hopkins University, ⁷Convergence Institute, Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center Johns Hopkins University School of Medicine, ⁸Bloomberg Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy, Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center, Johns Hopkins University School of Medicine, ⁹Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center, Johns Hopkins University School of Medicine, ¹⁰Institute for Nanobiotechnology, Johns Hopkins University, ¹¹Departments of Neurosurgery and Ophthalmology, Johns Hopkins University School of Medicine, ¹²Departments of Materials Science & Engineering and Chemical & Biomolecular Engineering, Johns Hopkins University

^* These authors contributed equally

Este protocolo proporciona una guía paso a paso para diseñar un panel de anticuerpos de inmunofluorescencia multiplex para la obtención de imágenes basadas en códigos de barras de ADN de tejidos murinos de melanoma FFPE. También describimos una línea de análisis de imágenes que utiliza herramientas de código abierto para generar información proteómica espacial sobre el microambiente inmunológico del tumor de melanoma murino.

Explorar más videos

Imagen por código de barras de ADN

proteómica espacial

diseño de paneles de anticuerpos

microambiente tisular

flujo de análisis de imágenes

fenotipado celular

microambiente tumoral

Chapters in this video

0:00

Introduction

1:21

Formalin-Fixed Paraffin-Embedded (FFPE) Tissue Staining and Imaging for Multiplex Analysis

4:37

Digital Pathology Analysis and Proteomics Data Normalization

8:34

Results