多个候选生物标志物的高吞吐量的验证可以通过顺序ELISA进行,以尽量减少冷冻/解冻循环和使用珍贵的血浆样品。在这里,我们演示了如何依次进行验证六种不同的血浆生物标志物的酶联免疫吸附<sup> 1-3</sup的移植物抗宿主病(GVHD)<sup></sup上相同的血浆样品。
偏发现蛋白质组学研究策略有可能确定大量的新型生物标志物的检测,在临床上可以提高诊断和预后,并可能有助于指导治疗干预。当大量的候选蛋白,它可能是难以验证的候选生物标志物的及时和有效的方式,从患者的血浆样本是事件驱动的,有限的,不可替代的量,如在发病的急性移植物抗宿主病(GVHD),异基因造血干细胞移植(HSCT)的一个潜在的危及生命的并发症。
在这里,我们描述的过程中,执行6验证的移植物抗宿主病(GVHD)的蛋白质的市售的ELISA试剂盒:IL-2Rα5星 ,TNFR1 6,肝细胞生长因子7,IL-8 8,elafin 2,和REG3α3(也称为PAP1)以顺序的方式,以尽量减少冻融循环,解冻的血浆和血浆的使用。对于此过程中,我们进行了酶联免疫吸附顺序确定样品稀释倍数作为建立在我们的实验室制造商ELISA试剂盒和协议细微的调整,以方便最优顺序ELISA性能。由此产生的血浆生物标志物的浓度可以被编译和重大的发现在患者队列分析。虽然这些生物标志物是目前仅用于研究目的,将其纳入临床护理,目前正在临床试验中。
此技术也可应用于在同一样品上执行多个感兴趣的蛋白/细胞因子ELISA试剂盒()提供的样品不需要与其它试剂混合。如果ELISA试剂盒不配备预涂覆板,96孔半孔板或384孔板可以使用,以进一步减少使用的样本/试剂。
3个器官系统功能障碍:急性移植物抗宿主病(GVHD),异基因造血干细胞移植(HSCT)的非复发死亡率(NRM)的首要原因,是衡量皮肤,肝脏和胃肠道(GI)道4。急性移植物抗宿主病通常发生移植后2至8个星期,但以后可能会出现,往往是临床上区分其他造血干细胞移植后的并发症,如预处理方案的毒性,感染或药物副作用。通过使用蛋白质组策略和高通量的验证,使用连续的ELISA,我们已经确定了6种蛋白质的浓度升高开始时,移植物抗宿主病的临床表现。 IL-2Rα,TNFR1,HGF和IL-8,组合成4的生物标志物面板时,可诊断移植物抗宿主病发病的临床症状,并能独立预测造血干细胞移植后生存期的移植物抗宿主病(GVHD)的严重性1。 Elafin,移植物抗宿主病的生物标志物的SK,可以区分移植物抗宿主病(GVHD)的皮疹和疹因其他原因(如药疹)和可以预测移植存活2。我们最近确定REG3α的作为生物标志物,移植物抗宿主病的下消化道,靶器官与NRM。的等离子REG3α浓度能够可靠地识别移植物抗宿主病造血干细胞移植后腹泻的原因和相关的诊断肠道活检组织学,移植物抗宿主病的严重程度。胃肠道移植物抗宿主病发病REG3α浓度也可以预测移植物抗宿主病治疗和NRM 3的响应。将这些经过验证的移植物抗宿主病(GVHD)的生物标志物进入临床护理临床试验,目前正在调查中。
这些实验是在接受造血干细胞移植治疗的患者,在2000年至2010年间的移植物抗宿主病(GVHD)发生的时间,是不可替代的,数量有限的小收集的血浆等份。由于这些样本的珍贵性,我们已经开发出一种MET排泥测量多个血浆蛋白浓度,在一个有效的,可重复的方式,以消除过量的冻结 – 解冻周期,解冻时间和血浆使用。此技术也可应用于在同一样品上执行多个感兴趣的蛋白/细胞因子ELISA试剂盒()提供的样品不需要与其它试剂混合。如果ELISA试剂盒不配备预涂覆板,96孔半孔板或384孔板可以使用,以进一步减少使用的样本/试剂。稿件侧重于技术方面的测量移植物抗宿主病(GVHD)的生物标志物。
顺序ELISA这里介绍的方法可以用于测量多个血浆蛋白,这可能是难以获取和/或不可替代的,如从人类受试者的样品与罕见疾病或血浆样品从小鼠9,10获得关于小体积的血浆。通常执行的顺序的ELISA在增加血浆稀释因子的顺序,用ELISA试剂盒需要血浆稀释的≥1:10通常不需要被回收的,虽然如果需要的话,可以做到。的能力来执行顺序的酶联免疫吸附由等离子体与其它试剂混合,或为不同的稀释液所需要的等离子体的ELISA试剂盒/协议的限制,这排除了重新使用一个样本ablility由于担心不兼容的缓冲/试剂会干扰与一个特定的测试的性能。通过精心规划,10个或更多的ELISA试剂盒可以执行相同的血浆样本。
ENT“>个人实验室可能需要调整血浆稀释,以便有根据预期的血药浓度的蛋白质样品从考试科目的兴趣可解释的结果。实验室设备的差异,可能会导致在需要优化的孵化和色度发展次,洗涤次数和/或洗浸泡时间,以优化任何给定的ELISA法。为了增加高通量能力和准确性,在成本效益的方式进行分析,使用机器人的液体处理平台,能够分析在384孔板上堆积单元和一个自动洗板推荐。该设备可以提高准确度和精密度由多个用户进行分析,并提供分析的一致性,以减少间和批内变异。
我们使用顺序ELISA的可复用平台的原因有两个:1)大部分的新型蛋白质的抗体对不能很容易地珠或其它材料上,以及共轭耗时和昂贵的; 2)单独的ELISA测定是更精确的比复用微阵列或珠粒,继发没有交叉反应性11。如果建立了一种可靠的方法来执行多路复用,珠为基础的微阵列,它可以是能够替换的顺序ELISA过程,但可能是有限的共轭的抗体的能力,珠和/或期望的蛋白质由数量进行了分析。
The authors have nothing to disclose.
国立卫生研究院资助RC1-HL-101102,P01-CA039542,T32-HL007622,哈特韦尔基金会,和多丽丝公爵慈善基金会的支持下。 Paczesny博士是研究员埃里克·哈特韦尔基金和艾米Strelzer的Manasevit研究计划。
Name of the reagent | Company | Catalogue number | Comments |
Human IL-2 R alpha Duoset | R&D Systems | DY223 | |
Human HGF Duoset | R&D Systems | DY294 | |
Human IL-8 OptEIA KIT II | Becton Dickinson | 550999 | |
Ab-Match ASSEMBLY Human PAP1 (REG3α) Kit | MBL International | 5323 | |
Ab-Match UNIVERSAL Kit | MBL International | 5310 | |
Human sTNFRI/TNFRSF1A Duoset | R&D Systems | DY225 | |
Human Trappin-2/Elafin Duoset | R&D Systems | DY1747 | |
96-well polystyrene conical bottom plates | Thermo Scientific | 249570 | Used for plasma source plates |
Costar half-well high-binding 96-well plates | Corning | 3690 | For IL-2Rα, HGF, TNFR1 and elafin ELISAs |
Nunc 384-well MaxiSorp plates | Nunc | 464718 | For REG3α Elisa |
HyClone Phosphate Buffered Saline, 1x | Thermo Scientific | SH30256.02 | |
Bovine Serum Albumin, Fraction V, Heat Shock Treated | Fisher Scientific | BP1600-100 | |
Blocker BLOTTO in TBS | Thermo Scientific | 37530 | Blocking agent for IL-2Rα HGF and TNFR1 ELISAs |
Dulbecco’s Phosphate-Buffered Saline | Gibco | 21600-069 | Wash buffer for IL-2Rα, HGF, Elafin and TNFR1 ELISAs |
TMB Peroxide Susbtrate | Kirkegaard and Perry Laboratories | 50-76-00 | |
Tween 20 | Acros Organics | 233362500 | Wash buffer for IL-2Rα, HGF, Elafin and TNFR1 ELISAs |
Sulfuric Acid | Sigma-Aldrich | 84720 | (Diluted to 2N) for stop solution |