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Biology

Interactions protéine-protéine visualisés par fluorescence bimoléculaire complémentation en protoplastes de tabac et des feuilles

Published: March 9, 2014 doi: 10.3791/51327

Summary

La formation de complexes de protéines in vivo peut être visualisé par fluorescence bimoléculaire complémentation. partenaires d'interaction sont fusionnés à des parties complémentaires de marqueurs fluorescents et exprimés transitoirement dans des feuilles de tabac, ce qui entraîne un signal fluorescent reconstitué à proximité des deux protéines.

Abstract

De nombreuses protéines interagissent avec d'autres protéines de façon transitoire ou sont intégrés dans des complexes multi-protéiques de remplir leur fonction biologique. Complémentation de fluorescence bimoléculaire (BiFC) est une méthode in vivo de surveiller ces interactions dans les cellules végétales. Dans le protocole présenté les protéines candidates sont fusionnées à l'enquête moitiés complémentaires de protéines fluorescentes et les produits d'assemblage respectifs sont introduits dans des cellules végétales par transformation médiée par Agrobacterium. Par la suite, les protéines sont exprimées de manière transitoire dans les feuilles de tabac et les signaux fluorescents restaurées peuvent être détectés avec un microscope confocal à balayage laser dans les cellules intactes. Ceci permet non seulement la visualisation de l'interaction elle-même, mais aussi la localisation subcellulaire des complexes de protéines peut être déterminée. A cet effet, des gènes marqueurs contenant un marqueur fluorescent peuvent être co-exprimés avec les constructions BiFC, visualisant ainsi des structures cellulaires telles que la til reticulum endoplasmique, les mitochondries, l'appareil de Golgi ou la membrane plasmique. Le signal de fluorescence peut être contrôlée soit directement dans les cellules épidermiques des feuilles ou dans des protoplastes isolés, qui peuvent être facilement isolés à partir des feuilles de tabac transformées. BiFC est idéal pour étudier les interactions protéine-protéine dans leur milieu naturel au sein de la cellule vivante. Cependant, il doit être considéré que l'expression doit être entraînée par des promoteurs forts et que les partenaires d'interaction sont modifiées en raison de la fusion des balises relativement importantes de fluorescence, qui pourraient interférer avec le mécanisme d'interaction. Néanmoins, BiFC est une excellente approche complémentaire à d'autres méthodes couramment appliquées enquête interactions protéine-protéine, comme coimmunoprécipitation, essais in vitro déroulants ou des expériences de levure double hybride.

Introduction

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L'étude de la formation de complexes de protéines et de leur localisation dans les cellules végétales in vivo est essentielle pour étudier les réseaux cellulaires, de signalisation et les processus métaboliques. BiFC permet la visualisation des interactions protéine-protéine dans leur environnement naturel directement à l'intérieur de la cellule de plante vivante 1-5.

Dans le BiFC approcher la complémentation de deux fragments N-et C-terminaux d'une protéine non fluorescentes plomb fluorescent pour une protéine fluorescente reconstitué. Des fragments de nombreuses protéines fluorescentes différentes ont été utilisées pour détecter les interactions entre protéines, par exemple la protéine fluorescente verte (GFP) de la chromophore qui est chimiquement formée par trois résidus distincts 6. Les protéines fluorescentes peuvent être réduites de moitié dans une boucle ou ß-brin pour donner les deux fragments non fluorescentes qui peuvent être fusionnés aux deux protéines d'intérêt. Le dosage peut être utilisé pour détecter des interactions dans toute compartme subcellulairent dans un organisme ou des cellules en croissance en milieu aérobie qui peut être génétiquement modifiée pour exprimer les protéines de fusion. Si les deux protéines sont en proximité étroite à l'intérieur de la cellule, la fluorescence est reconstitué et peut être surveillée par microscopie sans addition de fluorophores exogènes ou des colorants 3.

Le tabac (Nicotiana benthamiana) s'est avéré être un organisme modèle commode pour visualiser l'interaction des protéines de plantes, étant donné que les protéines peuvent facilement être exprimées en utilisant une transformation médiée par Agrobacterium de feuilles de tabac avec les constructions générées. Agrobactéries utilisent un plasmide Ti dite (tumeur induisant) codant pour des enzymes qui interviennent dans la transduction du gène d'intérêt dans des cellules végétales. BiFC est bien applicable pour solubles ainsi que pour les protéines de la membrane au sein de tous les compartiments cellulaires et a été utilisé avec succès au cours des dernières années pour identifier des protéines qui interagissent in vivo, ainsi que pour analyser les sites d'interactiondans les protéines 7-9. Lors de l'expression des gènes introduits, l'interaction des protéines fluorescentes peuvent être visualisées directement en feuille, qui est approprié pour des structures cellulaires plus gros, tels que le reticulum endoplasmique (ER), la membrane plasmatique ou les chloroplastes. Toutefois, pour contrôler la localisation dans des structures plus fines, par exemple, l'enveloppe des chloroplastes, il est souhaitable de visualiser la fluorescence dans des protoplastes isolés à partir de feuilles de tabac transformées. Un ensemble de vecteurs BiFC contenant soit un C-terminal ou un marqueur fluorescent N-terminale doit être utilisée pour l'approche BiFC dans des plantes 10. Le protocole décrit de la suite a été utilisé pour étudier l'interaction de cytosolique protéine de choc thermique 90 (HSP90) avec la répétition de tetratricopeptide (TPR) de domaine contenant des protéines d'amarrage Toc64 et AtTPR7 résidant dans l'enveloppe extérieure du chloroplaste et le réticulum endoplasmique, respectivement 11-13. A cet effet, HSP90 a été fusionné à la Ctpartie de erminal SCFP (SCFP C). La balise était N-terminale fusionnée à la protéine chaperon pour assurer l'accessibilité du motif C-terminal MEEVD liaison de HSP90 pour serrer de type domaines TPR. En parallèle, la partie N-terminale de Vénus (Venus N) a été fusionné aux domaines cytosoliques du domaine TPR contenant des protéines d'amarrage Toc64 et AtTPR7, respectivement. Comme témoin négatif nous avons cloné la partie C-terminale soluble SCFP C uniquement qui réside dans le cytosol et est donc un contrôle approprié.

Les marqueurs fluorescents de protéines étudiées doivent faire face à la même compartiment cellulaire pour permettre proximité et ainsi la reconstitution du signal fluorescent. Pour déterminer la localisation du signal fluorescent reconstitué une protéine marqueur fusionnée à une étiquette fluorescente différente peut être co-transformée à démontrer la localisation subcellulaire de l'interaction. Une protéine servant de marqueur ER fusionnée à mCherrry a été transformé simultanément à l'cas de l'ER situé AtTPR7 14. L'auto-fluorescence de la chlorophylle a servi de marqueur chloroplaste en cas de Toc64. Par cela, non seulement l'interaction in vivo de Toc64 AtTPR7 et, respectivement, avec le chaperon HSP90 cytosolique peut être surveillée directement dans les feuilles de tabac, mais aussi la localisation subcellulaire de l'interaction peut être étudiée.

BiFC est bien adapté comme une approche complémentaire à d'autres méthodes qui étudient les interactions protéine-protéine. Par rapport aux co-immunoprécipitation ou in vitro des expériences d'excursion basse, par exemple, pas d'anticorps spécifiques doivent être disponibles pour des protéines d'intérêt, et les protéines n'ont pas à être exprimé par recombinaison in vitro, ce qui peut être difficile, en particulier pour les protéines de la membrane. De plus, aussi les interactions transitoires peuvent être surveillés à l'aide BiFC, étant donné que les protéines sont capturées par l'interaction des marqueurs fluorescents fusionnées 15.

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Protocol

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Une. Transformation de BiFC Construit en Agrobacteria

  1. Le clonage de constructions BiFC
    1. Amplifier le gène d'intérêt à partir d'un modèle approprié, en utilisant des oligonucleotides contenant des sites attB encadrant. Effectuez une PCR en utilisant une polymérase de relecture. Adapter la longueur de l'étape de recuit de la combinaison d'amorces conçues et la durée de l'étape d'élongation en fonction de la taille des fragments. Vérifier le produit de PCR par électrophorèse sur gel d'agarose et le purifier en utilisant une PCR Clean-up Kit.
    2. Effectuer la réaction BP avec le fragment obtenu et le vecteur d'entrée en utilisant une recombinase BP. Mélanger de 15 à 150 ng du produit attB-PCR avec 150 ng du vecteur d'entrée, ajouter 2 ul de la recombinase BP et remplir avec du tampon TE jusqu'à un volume total de 8 ul. Incuber le mélange réactionnel pendant 1 heure à température ambiante et arrêter la réaction en ajoutant 2 ul de proteinase K pendant 10 min à 37 ° C.
    3. Transformer la totalité de la réaction dans E. compétente coli DH5a; Cellules et écran des colonies obtenues par PCR sur colonie pour l'insertion correcte du fragment d'ADN dans le vecteur. Le séquençage d'ADN des plasmides positifs est effectué pour vérifier l'absence de mutations.
    4. Utiliser l'entrée clone obtenu pour la recombinaison LR avec le vecteur de destination appropriée en utilisant une recombinase de LR. Mélanger 50-150 ng du vecteur d'entrée avec 150 ng du vecteur de destination, ajouter 1 pl LR recombinase et remplir avec du tampon TE à un volume total de 5 pi. Incuber le mélange réactionnel pendant 1 heure à température ambiante et arrêter la réaction en ajoutant 1 ul de proteinase K pendant 10 min à 37 ° C.
    5. Transformer la totalité de la réaction dans des cellules de E. coli DH5a compétentes et écran colonies obtenues par PCR sur colonie pour l'insertion correcte du fragment d'ADN dans le vecteur. séquençage de l'ADN n'est pas nécessaire à cette étape.
    6. Isoler l'ADN plasmidique avec un kit plasmide Mini pour assurer un haut degré de pureté.
  2. Préparation d'agrobactéries compétentes chimiquement (souche AGL1, la rifampicine et la résistance Carbénicilline)
    1. Streak sur agrobactéries d'une culture de valeurs et se développent pendant 24 heures à 28 ° C.
    2. Inoculer 5 ml de milieu LB avec une colonie unique et incuber pendant une nuit à 28 ° C.
    3. Inoculer 50 ml de milieu LB avec 2 ml de la culture d'une nuit et croître pendant environ 4 heures à 28 ° C jusqu'à une DO 600 de 1,0.
    4. Centrifuger les cellules à 3000 g pendant 15 min à 4 ° C et remettre en suspension le culot dans 1 ml stérilisées glacée CaCl2 (10 mM). Gardez les cellules sur la glace après cette étape.
    5. Préparer des aliquotes (100 pi) des cellules, geler immédiatement dans de l'azote liquide et conserver à -80 ° C.
  3. Transformation des agrobactéries chimiquement compétente
    1. Décongeler une aliquote de cellules AGL1 compétentes sur la glace. Ajouter 1-2 ug d'ADN de plasmide dans les cellules. Incuber pendant 5 min sur de la glace, 5 min dans de l'azote liquide et 5 min à 37 ° C. Ajouter 600 ul de milieu LB pour les cellules et les smerlu à 650 tours par minute pendant 4 heures à 28 ° C.
    2. Centrifuger les cellules pendant 1 min à 8000 xg et jeter le surnageant. Reprendre le culot dans 50 ul de milieu LB et restant plaque sur des plaques LB contenant les antibiotiques appropriés. Sceller les plaques et incuber pendant 2 jours à 28 ° C. colonies d'écran pour la présence du plasmide par PCR sur colonie.
    3. Inoculer une colonie positive dans 5 ml de milieu LB contenant les antibiotiques appropriés et incuber à 28 ° C pendant une nuit. Mélanger 500 ul de la culture d'une nuit avec 500 ul de glycerol à 50% stérile et congeler à -80 ° C.
    4. Inoculer les agrobactéries en milieu LB contenant les antibiotiques appropriés directement du stock de glycérol pour la transformation transitoire de feuilles de tabac.

2. Transformation transitoire de feuilles de tabac

  1. Agrobacteria croissance
    1. Préparer les solutions mères suivantes: Acétosyringone (150 mM, dissoudre dans 70% EtOH), magasin sous forme d'aliquotes à -20 ° C. MES / KOH (0,1 M) pH 5,7, conserver à 4 ° C (filtre stérile à travers un filtre de 0,2 um pour prévenir la croissance bactérienne pendant plus de stockage), MgCl 2 (1 M) stock, magasin à la température ambiante.
    2. Inoculer 10 ml de milieu LB contenant les antibiotiques appropriés avec 50 pl de la AGL1 stock de glycérol culture contenant le plasmide d'intérêt dans un tube de 50 ml stérile et incuber à 28 ° C pendant au moins 24 heures sous agitation à 190 tours par minute jusqu'à une DO 600 de 1,0 -2,0 est atteinte.
    3. bactéries à centrifuger à 3000 g pendant 15 min. Reprendre le culot dans fraîchement moyen d'infiltration [MgCl2 (10 mM), MES / KOH (10 mM) pH 5,7, Acétosyringone (150 M)] et ajuster la suspension à une DO 600 de 1,0.
    4. Incuber les cellules agrobactéries dans un agitateur de tête pendant 2 heures dans l'obscurité. Les cellules peuvent ensuite être utilisés pour l'infiltration.
  2. L'infiltration des feuilles de tabac
    1. Utilisez troissemaine vieux tabac (Nicotiana benthamiana) plantes. Choisissez plusieurs feuilles les plus âgées d'infiltration.
    2. Mélanger des volumes égaux des agrobactéries portant les constructions d'intérêt (3 ml chacun). Prendre une seringue de 5 ml sans aiguille pour l'infiltration. Infiltrer la suspension de cellules avec précaution dans les feuilles de tabac en appuyant sur la seringue sur la face inférieure des feuilles à plusieurs endroits.
    3. Arrosez les plantes et les laisser dans l'obscurité pendant deux jours.

3. Préparation de protoplastes

Préparation de protoplastes de feuilles de tabac a été adapté à partir de Koop et al. 16 et légèrement modifié.

  1. préparation de tampon
    1. Préparer milieu F-PCN: Macro-sels [KNO 3 (1012 pg / ml), CaCl 2 • 2H 2 O (440 pg / ml), MgSO 4 7H 2 O • (370 pg / ml), KH 2 PO 4 ( 170 pg / ml), NH 4-succinate [(20 mM; préparer un 2 m stock solution (succinate (236 ug / ml) et NH 4 Cl (106 ug / ml), ajuster le pH à 5,8 pour dissoudre)], les micro-sels [EDTA-Fe (III) x sel de Na (40 ug / ml), KJ (0,75 ug / ml), H 3 BO 3 (3 pg / ml), MnSO 4 • H 2 O (10 pg / ml), ZnSO 4 • 7H 2 O (2 pg / ml), Na 2 MoO 4 • 7H 2 O (0,25 ug / ml), CuSO 4 • 5H 2 O (0,025 pg / ml), CoCl 2 • 6H 2 O (0,025 g / ml)], MES (390 ug / ml), du glucose (environ 80 pg / ml) osmolarité de 550 mOsm, pH 5,8 (KOH). Magasin à -20 ° C.
    2. Préparer le milieu F-PIN: tous les ingrédients du F-PCN, mais au lieu d'utiliser le glucose du saccharose (environ 110 pg / ml), l'osmolarité de 550 mOsm, pH 5,8 (KOH). Magasin à -20 ° C.
    3. Préparer milieu W5: NaCl 150 mM, 125 mM CaCl 2, 5 mM de KCl, 2 mM MES, osmolarité 550-580 mOsm, pH 5,7 (KOH). Conserver à 4 °; C (filtre stérile à travers un filtre de 0,2 um à prévenir la croissance bactérienne pendant plus de stockage).
    4. Préparer une solution fraîche d'enzymes pour l'isolement de protoplastes (0,1 g de cellulase, 0,03 g dans 10 ml macerozym F-PIN). Incuber la solution à 55 ° C pendant 10 minutes et laisser refroidir à température ambiante. Ajouter 100 ul de 10% de SAB à 10 ml de solution.
  2. Isolement de protoplastes
    1. Placez une feuille infiltré dans une boîte de Pétri et ajouter la solution d'enzyme fraîche. Utilisez une nouvelle lame de rasoir pour couper la feuille en environ 0,5 cm 2 morceaux. Transférer les feuilles-pièces avec la solution d'enzyme dans un flacon sous vide et l'infiltration sous vide s'infiltrer pendant environ 20 secondes jusqu'à ce que des bulles d'air se dégagent à partir des feuilles (aspirateur de libération très attentivement).
    2. Agiter le flacon pendant 90 min à 40 min dans l'obscurité.
    3. Relâchez protoplastes par agitation pendant 1 min à 90 min. Filtrer la solution à travers de la gaze (100 pM) dans un tube à centrifugation de 15 ml (à fond rond). Superposer la solution de protoplastes avec 2 ml de tampon F-PCN et centrifuger pendant 10 min à 70 xg (accélération et de décélération lente) à température ambiante.
    4. Protoplastes intacts s'accumulent à l'interface de la solution d'enzyme et de F-PCN. Prenez un large orifice 1 pointe ml de pipette pour transférer les protoplastes intacts dans un tube de centrifugeuse frais et remplir avec du tampon W5. Centrifuger pendant 2 min à 100 xg (accélération et décélération lente) pour sédimenter les protoplastes.
    5. Retirer le surnageant avec précaution à l'aide d'une pipette et remettre en suspension le culot dans environ 200 ul de tampon de W5, en fonction de la quantité de protoplastes.
    6. Toujours utiliser des embouts d'orifice large pour éviter la rupture de protoplastes intacts.

4. Balayage laser

  1. Préparation de l'échantillon
    1. Coller deux petites bandes de mastic autour d'une lame de microscope (2 cm d'intervalle). Placer 20 ul de la solution de protoplastes entre les bandes et placer soigneusement un couvercle en verresur le dessus. Les bandes d'étanchéité assurez-vous que les protoplastes ne sont pas écrasés par le couvercle en verre.
    2. Pour les échantillons de feuilles découpées au total un morceau de 1 cm de la feuille et le placer sur une lame de microscope avec le côté inférieur de la feuille tournée vers le haut. Ajouter environ 30 pi H 2 O, placer un couvercle en verre sur le dessus et le fixer solidement avec du ruban adhésif sur les deux côtés.
  2. Paramètres d'imagerie et microscope confocal
    1. L'imagerie est réalisée avec un microscope confocal à balayage laser microscope de Leica, Type: TCS SP5. Pour grossissement utiliser un objectif (HCX PL APO CS) d'une magnitude de 63X avec le glycérol comme moyen d'imagerie. Réglez l'ouverture numérique de 1.3. Utilisez le logiciel Leica Application Suite / avancée de fluorescence pour l'évaluation (voir données supplémentaires S1).
    2. Réglez le laser argon à 30% et la puissance du laser à 488 nm à une intensité de 18% pour surveiller le signal BiFC reconstitué à 515 nm et définir un débit d'émission de détecteur de PMT 495-550. Pour surveiller la chlorophylle autofluorescence mis une seconde bande passante d'émission de détecteur de PMT 650-705.
    3. Pour surveiller le signal mCherry utiliser le laser HeNe 561, régler l'intensité de laser de 561 à 18% et la largeur de bande d'émission d'un troisième détecteur de PMT 587-610.
    4. Assurez-vous que les photos de tous les canaux de détection PMT sont prises avec les mêmes réglages de gain (gain doit être compris entre 800-900 à exclure les signaux de fond).
    5. Prenez des photos dans un format largeur / hauteur de 1024 x 1024 pixels avec une vitesse de balayage de 100 Hz.
    6. Pour Z-empilements utilisent une distance maximale de 0,5 um entre chaque pile.

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Representative Results

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Dans cet exemple, nous avons utilisé la méthode BiFC pour surveiller l'interaction entre le chaperon moléculaire de HSP90 cytosolique des protéines membranaires amarrage AtTPR7 et Toc64. AtTPR7 fait partie du translocon Sec et interagit avec les chaperons cytosoliques, qui délivrent éventuellement préprotéines sécrétoires pour la translocation post-traductionnelle de la membrane du RE. De même, Toc64 à l'enveloppe extérieure chloroplaste agit dans l'importation post-traductionnelle en recevant HSP90 préprotéines des chloroplastes associés. Les deux protéines comprennent un domaine cytosolique exposé TPR, qui médie une interaction avec le MEEVD motif C-terminal de HSP90.

Les protéines ont été clonés à l'aide de recombinases spécifiques dans des vecteurs appropriés de destination de fusion du domaine TPR contenant des protéines d'amarrage de Vénus N, veillant à ce que le marqueur fluorescent est fixé au domaine cytosolique et ne gêne donc ciblage et d'insertion membranaire des protéines. Dans le cas de HSP90, SCFP C (Figures 1 et 2).

AtTPR7 HSP90 et ont été co-transformées avec un marqueur d'ER (mCherry) pour vérifier la localisation du complexe protéique. La fluorescence a été surveillée dans des feuilles intactes avec un microscope à balayage laser. Comme un seul SCFP contrôle C, qui est situé dans le cytosol (comme HSP90), a été exprimé avec AtTPR7 et le marqueur de RE. Plusieurs feuilles ont été contrôlés pour la fluorescence et photos ont été prises avec les réglages de microscope identiques. Dans notre expérience, un signal typique devrait être visible avec des réglages de gain de 800-900, tandis que le contrôle négatif ne devrait montrer très légère fluorescence de fond avec ces paramètres (figure 3). Un signal reconstitué pour Vénus N-AtTPR7 avec SCFP C-HSP90 à 515 nm a été suivie de chevauchement avec le marqueur de ER. Pas de signal pour Vénus N-ATPR7 et le témoin négatif SCFP C ont pu être observées.

Dans le cas de Toc64 et l'expression de HSP90, ainsi que Toc64 et SCFP C, les protoplastes ont été isolés à partir de feuilles de tabac infiltré, étant donné que dans les images microscopiques de l'ensemble de feuilles de la localisation exact est difficile à déterminer, même si la fluorescence est déjà visible (figures 4 et 5). Un signal à 515 nm a été restauré exprimer Toc64-Vénus N avec SCFP C-HSP90 à l'enveloppe du chloroplaste, qui pourrait être détecté comme structures en forme d'anneau entourant les chloroplastes. Comme ci-dessus le contrôle a été photographié avec réglages du microscope identiques et n'ont pas montré une fluorescence à 515 nm.

Figure 1
FigureUne. Clonage de procédure BiFC construit. Les gènes d'intérêt ont été amplifiées avec des oligonucleotides flanquées par des sites att B pour permettre la recombinaison BP dans un vecteur d'entrée avec les sites att P, remplaçant ainsi le gène ccdB dans le vecteur. Par la suite le vecteur d'entrée a été recombiné avec des vecteurs de destination appropriés en utilisant une recombinase de LR. Transformation de ces constructions dans des feuilles de tabac permet l'expression de protéines fusionnées à des protéines fluorescentes cassés et des tags pour la détection d'anticorps. Cliquez ici pour agrandir l'image.

Figure 2
Figure 2. Représentation schématique des protéines exprimées dans des expériences BiFC. Vénus N estcouplé aux parties cytosoliques de Toc64 ou AtTPR7 résidant dans le chloroplaste et ER, respectivement. HSP90 est la N-terminale fusionnée à CPFP C, ce qui permet l'interaction des domaines TPR et de Toc64 AtTPR7 avec la HSP90 extrémité C-terminale. SCFP C seule est exprimée dans le cytosol comme témoin. S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.

Figure 3
Figure 3. BiFC avec AtTPR7 et HSP90 visualisée dans les cellules épidermiques des feuilles de tabac. Vénus N-AtTPR7 et SCFP C-HSP90 ont été co-transformée avec le marqueur ER mCherry (panneau du milieu) et exprimée de façon transitoire dans des feuilles de tabac. Comme un contrôle Vénus N-AtTPR7 a été co-transformée avec le SCFP S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.

Figure 4
Figure 4. BiFC avec Toc64 et HSP90 visualisée dans les cellules épidermiques des feuilles de tabac. Toc64-Vénus N et SCFP C-HSP90 ont été exprimés transitoirement dans des feuilles de tabac. Comme un contrôle Toc64-Vénus N a été co-transformée avec SCFP C seul (panneaux inférieurs). Reconstitué fluorescence a été contrôlée à 515 nm (panneau de gauche). Superposition de la signaturenal à 515 nm et l'auto-fluorescence de la chlorophylle est représenté (panneau de droite). Chlorophylle autofluorescence est suivie à 480 nm. Barres d'échelle: 10. pm S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.

Figure 5
Figure 5. BiFC avec Toc64 et HSP90 visualisée dans des protoplastes de tabac. Toc64-Vénus N et SCFP C-HSP90 ont exprimé de façon transitoire dans des feuilles de tabac. Comme un contrôle Toc64-Vénus N a été co-transformée avec SCFP C seul (panneaux inférieurs). Fluorescence reconstitué a été contrôlé à 515 nm (panneau de gauche) dans les protoplastes isolés. Superposition du signal à 515 nm et l'auto-fluorescence de la chlorophylle est signalée (panneau de droite). Chlorophylle autofluorescence est suivie à 480 nm. Barres d'échelle: 10. pm S'il vous plaît cliquer ici pour voir une version plus grande de cette figure.

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Discussion

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Lors de la planification d'une expérience BiFC plusieurs points doivent être considérés. Bien qu'aucune information structurale sur les protéines d'intérêt est requise, la topologie doit être connu lorsque l'on travaille avec des protéines de la membrane couvrant. Les protéines fluorescentes doivent se trouver dans le même compartiment sous-cellulaire ou orientés dans le même côté d'une membrane pour permettre l'interaction. Naturellement, lorsque l'on analyse les protéines qui nécessitent une séquence de ciblage N-terminal, seulement une étiquette C-terminale peut être envisagée. Comme il est possible que l'étiquette interfère avec le ciblage ou la membrane insertion correcte de la protéine d'intérêt, il est recommandé de tester préalablement la localisation subcellulaire, par exemple, en exprimant une protéine GFP-étiqueté. En outre, un contrôle négatif doit toujours être inclus. Dans cet exemple, nous avons généré une construction que l'expression SCFP C dans le cytosol. Cependant, toute protéine qui n'est pas prévu pour interagir peut être utilisé comme témoin négatif. Pour vérifier le bon expression of les constructions, surtout si aucune fluorescence est visible, extraits de protéines de feuilles ou de protoplastes infiltrés peuvent être soumis à une SDS-PAGE et l'expression des protéines peuvent être vérifiées avec des anticorps dirigés contre les étiquettes respectives.

Les signaux fluorescents peuvent être contrôlés soit dans les feuilles intactes ou protoplastes isolés. Bien que la détection dans des feuilles entières est plus rapide, les signaux de structures plus fines sont mieux visualisés dans des protoplastes. En outre, la plupart des cellules épidermiques sont surveillés quand on regarde l'ensemble de la feuille, qui ne contiennent pas de chloroplastes. Par conséquent, lors de l'analyse des protéines du chloroplaste, l'isolement de protoplastes est conseillé.

L'avantage majeur de cette technique est la possibilité de surveiller les interactions protéine-protéine dans des cellules végétales vivantes. Il n'est pas nécessaire de briser les cellules et à solubiliser les complexes protéiques de la membrane, comme c'est le cas par exemple dans des expériences de co-immunoprécipitation. En outre, l'application est simplepuisque les seuls documents requis sont les vecteurs, agrobactéries et un microscope à fluorescence norme (bien que des images de qualité sont obtenus avec un microscope confocal à balayage laser microscope). Contrairement aux dosages in vitro pull-down avec des protéines recombinantes, qui ne permettent la détection d'une interaction si les deux protéines interagissent directement, BiFC peut également détecter les complexes de protéines qui nécessitent, d'autres protéines endogènes présents dans la cellule. Toutefois, cela signifie également que BiFC ne fournit aucune preuve d'une interaction protéine-protéine directe, qui doit toujours être vérifiée par d'autres techniques. En outre, en raison de la surexpression par les promoteurs fortes interactions non spécifiques peuvent se produire, qui doivent être exclu par des contrôles négatifs appropriés. A cette fin, une protéine non prévu pour interagir avec la protéine d'intérêt, mais demeurant dans le même compartiment, ou des constructions manquant des domaines d'interaction protéine-protéine doivent être utilisés. En outre, une série de dilution du CD de proieNA sans interaction avec un ADNc ainsi que l'observation de la fluorescence d'une manière dépendant du temps après la transformation peut permettre de valider les résultats. Pour assurer la discrimination des vrais signaux fluorescents et les artefacts des signaux BiFC doivent être quantifiés et mis en relation avec une autre protéine fluorescente exprimée, par exemple une protéine marqueur 7,8. Un autre inconvénient de la méthode est BiFC, que les interactions des protéines peuvent également être empêchés stériquement par les marqueurs fluorescents relativement grandes.

Application de la transformation médiée par Agrobacterium dans d'autres plantes (par exemple Arabidopsis) est limitée, cependant, il est possible de transformer l'ADN plasmidique soit directement dans des protoplastes d'Arabidopsis isolé ou pour transformer des cellules en utilisant un canon à particules. Cependant, l'ADN plasmidique doit être isolé en utilisant un kit de MAXI, car elle doit être très concentrée et aussi pure que possible pour la transformation de protoplastes. Un autre problème que nous Observed due à une expression élevée des protéines cibles était agrégation non spécifique dans le cytosol, en particulier lorsque l'on travaille avec des protéines de la membrane mitochondriale. Ce problème peut être surmonté par transformation biolistique de cellules d'oignon.

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Disclosures

Les auteurs n'ont rien à révéler.

Acknowledgments

Nous tenons à remercier Jürgen Soll pour des discussions utiles et Chris Carrie pour la lecture critique du manuscrit. Ce projet a été financé par la DFG et le Fonds der chemischen Industrie (nombre de subventions SFB 1035, projet A04 SS et faire 187/22 de RS).

Materials

Name Company Catalog Number Comments
3',5'-Dimethoxy-4'-hydroxyacetophenone Sigma-Aldrich D134406 Acetosyringone
Cellulase, Onozuka-R10 Serva 16419 from Trichoderma viridae
Macerozyme R-10  Serva 28302 from Rhizopus sp.
GATEWAY, BP Clonase II, Enzyme Kit Invitrogen 11789-(020)
GATEWAY, LR Clonase II, Enzyme Kit Invitrogen 11791-(020)
QIAprep Spin Miniprep Kit Qiagen 27106
NucleoSpin Gel and PCR Clean-up Kit Macherey-Nagel 740609-250
pDEST-GWVYNE Invitrogen Gateway-cloning
pDEST-VYNE(R)GW Invitrogen Gateway-cloning
pDEST-SCYCE(R)GW Invitrogen Gateway-cloning

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References

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Interactions protéine-protéine visualisés par fluorescence bimoléculaire complémentation en protoplastes de tabac et des feuilles
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Schweiger, R., Schwenkert, S. Protein-protein Interactions Visualized by Bimolecular Fluorescence Complementation in Tobacco Protoplasts and Leaves. J. Vis. Exp. (85), e51327, doi:10.3791/51327 (2014).More

Schweiger, R., Schwenkert, S. Protein-protein Interactions Visualized by Bimolecular Fluorescence Complementation in Tobacco Protoplasts and Leaves. J. Vis. Exp. (85), e51327, doi:10.3791/51327 (2014).

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