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Environment

EPA-Methode 1615 Messung der Enterovirus und Norovirus Vorkommen in Wasser von Kultur und RT-qPCR. I. Sammlung von Virenproben

Published: March 28, 2015 doi: 10.3791/52067

Introduction

Menschendarmviren replizieren im Magen-Darmtrakt und werden durch die fäkal-oral zu verbreiten. Diese Viren werden oft in Abwasser in hohen Konzentrationen 1-3 gefunden. Sie können in Abwässern 4,5 bestehen, und in Oberflächen 6,7, Boden 8-10 und behandelter Konsum 11 Gewässern. Wenn vorhanden, ist typischerweise die Konzentration der Viren im Umgebungswasser in den USA für die direkte Messung 12,13 zu gering. Dies erfordert, dass Viren aus großen Volumina von Wasser konzentriert werden. Während der Informationssammlungsregel (ICR) Überwachung durch die US-Umweltschutzbehörde (US-EPA) 14 durchgeführt, die Viruskonzentrationen positiver Proben im Quellwasser des großen Versorgungsunternehmen bundesweit von 0.009 lag um 19,7 wahrscheinlichste Zahl der infektiösen Einheiten (MPN) / L. Median und mittleren Konzentrationen von positiven Proben waren 0,03 und 0,17 MPN / L für Quellwasser aus frischem Wasser, 0,010,07 MPN / L für die von Seen und Stauseen, und 0,04-0,74 MPN / L für die Verwendung des Grundwassers 11 (Daten aus dem ICR Aux1 18 Monate Access-Datenbank vom 2000.04.25). Virus Konzentrationen von positiven Proben von einem US-EPA-Studie der nationalen Grundwasser reichten von 0,009 bis 2,12 infektiösen Einheiten / L mit einer medianen und mittleren Konzentrationen von 0,13 und 0,29 infektiösen Einheiten / L 8. Die Konzentration des Virus in positive Grundwasserproben war höher als die in fließende Ströme. Die meisten Einrichtungen mit Grundwasser in diesen Studien erhalten Wasser aus Grundwasserleitern in Karstgebieten entfernt. Diese, zusammen mit denen in Kalkstein und kristallinen befindet (gebrochene Fels) Einstellungen sind wahrscheinlich höhere Viruskonzentrationen als in anderen Einstellungen 8,15,16 haben. USEPA Virus Methoden festlegen Probevolumen von 200 l (ICR) und 300 L (Methode 1615) von Oberflächenwasser und 1.000 L (ICR) auf 1.500 L (Methode 1615) des Grundwassers 17,18. Aber auch bei der Verwendung vongroße Probenvolumina sind die meisten Oberflächen- und Grundwasserproben negativ Virus 8,11,19,20.

In Oberflächengewässern vorhandenen Viren ein potenzielles Gesundheitsrisiko für die Verbraucher von Trinkwasser. Die Wasseraufbereitungs Regel verlangt, dass alle Behandlungsanlagen mit Oberflächenwasser, um Viruskonzentrationen um mindestens 4-log zu reduzieren. Selbst mit einem 4-Log-Reduktion könnte infektiösen Viruskonzentrationen im Quellwasser so klein wie 0,0044 MPN / L auf eine Infektion pro Tag führen Nahme dieser durchschnittliche Exposition und Behandlungsbedingungen und die Dosis-Wirkungs-Parameter für Rotavirus 11,21. Das Risiko von Virus im unbehandelten Grundwasser Fall noch weiter aufgrund der fehlenden Behandlung und viralen Eintritt sein. Borchardt und Kollegen schätzen, dass bis zu 22% von akuter Gastroenteritis bei Erwachsenen und 63% bei Kindern unter fünf Jahren konnte aufgrund von Virus im Trinkwasser in den Gemeinden mit unbehandeltem Grundwasser 19 sein.

USEPA Methode 1615 wurde entwickelt, um Enteroviren und Noroviren bei der ungeregelten Schadstoffüberwachungsverordnung drittÜberwachungsZyklus (UCMR3) 22 als National erkennen Follow-up zu den Ergebnissen der Borchardt und Kollegen 19,23. Das US-EPA-Methode wurde vor allem für die Messung Virus in Systemen mit unbehandeltem Grundwasser ausgelegt, wurde aber allgemein geschrieben, um andere Wassermatrixtypen umfassen. Das neue Verfahren ist ein Hybridkonservierungs viele Komponenten aus der bei der ICR 17 verwendet vorherigen Virus Verfahren ist der Zusatz von Molekular Verfahren nach dem Verfahren von Borchardt et al. 19,23 und zusätzliche Primersets für Norovirus 24 basiert. Das Ziel dieser Arbeit ist es, die Probenahmeverfahren und die notwendigen Schritte, um die Integrität der Probe während der Entnahme und Versand zu erhalten zu beschreiben. Eine Bewertung des Gesamtverfahrens wird in Cashdollar et al. 25 beschrieben. Dieses Protokoll umfasst einfache Feld collection von Oberflächen- und Grundwasser in dem eine Pumpe und Vorfilter sind nicht notwendig, und wo Anpassungen sind nicht für den pH-Wert oder die Anwesenheit von Desinfektionsmittel im Wasser erforderlich, um zu beproben. Je komplexer Sampling Anforderungen sind in Fout et al. 17,18 beschrieben.

Protocol

1. Vorabverfahren

  1. Montieren eines Standardfiltervorrichtung nach Figur 1, bestehend aus einem Saugmodul eine Kartusche Gehäusemodul und einem Abgabemodul nach Zusätzliche Materialien beschrieben ist.
  2. Kalibrieren Sie den Durchflussmesser / Zählwerk an den Flussraten für die Probenahme vor dem ersten Gebrauch verwendet. Überprüfen Sie die Kalibrierung nach dem ersten Einsatz und dann nach einem Monat der Nutzung. Ist der Durchfluss Kalibrierung entweder nach dem ersten Gebrauch oder nach dem ersten Monat der Nutzung geändert, bestimmen die Frequenz für Kalibrierungsprüfungen wie in Zusätzliche Materialien beschrieben.
    1. Schließen Sie ein Entlademodul mit einem Einlassmodul und schließen Sie das Einlassmodul an einen Wasserhahn. Stellen Sie den Durchflussmesser / Zähler, um den Durchsatz zu lesen. Drehen Sie den Wasserhahn vollständig und dann die Durchflussmenge auf 10 l / min mit dem Bronze-Durchgangsventil einzustellen. Sobald die Durchflussrate bei 10 l / min stabil, setzen Sie den Durchflussmesser / Zählwerk zu Gesamtvolumen lesen.
    2. Legen Sie die herausließ der Entladungsmodul in einen 4 L oder größer Messzylinder und gleichzeitig setzen Sie den Zähler auf Null zurück. Messen Sie den Zählerstand im 4-L-Zeichen und den Zeitaufwand für die 4 L Markierung auf dem Zylinder zu erreichen. Ändern Sie den Durchflussmesser / Zählwerk Einstellung zurück auf Durchfluss.
      HINWEIS: Wenn die Durchflussrate auf unter 9,95 L fallen gelassen oder nach Abschluss von Schritt 1.2.2 auf mehr als 10,05 L, warten Sie, bis die Durchflussrate stabil ist, und wiederholen Sie Schritt 1.2.2. Ein richtig kalibriert Messgerät den 4 L Markierung auf dem Messzylinder bei 24 ± 1 s mit einem Zählerstand von 4,0 ± 0,04 L. erreichen
    3. Wenn der Zählerstand weniger als 3,96 oder mehr als 4,04 L, berechnet einen Korrekturfaktor notwendig, um für die beobachtete Differenz einzustellen. Zum Beispiel, wenn der Durchflussmesser / Zähler liest 3,9 L in der 4 L Markierung auf dem Messzylinder, der Korrekturfaktor würde 1,026 (4 ÷ 3,9) sein. Wenn somit der gewünschte Volumen einer Feldprobe wurden 300 L nach der r das Volumen gesammelteneading am Durchflussmesser / Zählwerk soll 300 ÷ 1,026 = 292,4 L.
  3. Sterilisieren Sie die Standard-Filtergerät und bereiten Sie es für die Probenentnahme.
    1. Sterilisation der Einlass und Kartuschengehäusemodule mit 0,525% Natriumhypochlorit für mindestens 30 min vor jeder Verwendung durch entweder vollständig Eintauchen der Module in den Lösungen oder durch Zirkulieren des Natriumhypochlorit wenn die Module mit Hilfe einer Pumpe. Spülen der Module mit sterilem dH 2 O und dann in einer Lösung, die 50 ml 1 M Natriumthiosulfat pro Liter sterile analysenreinem Wasser für 5 min dechlorieren. Bedecken Sie die Filterentnahmevorrichtung Modul endet mit sterilen Aluminiumfolie.
    2. In einer elektroPatronenFilter mit dem Patronengehäuse Modul aseptisch.
      HINWEIS: Achten Sie darauf, dass die Filterpatrone richtig im Gehäuse sitzt. Richtig sitzt Filter wird nicht auslaufen und die Filter nicht innerhalb des Gehäuses zu bewegen, wenn sie geschüttelt. Die Dichtungen auf aproperly sitzen Filter wird sichtbar Vertiefungen zeigt, wo die Filter Kontakte ihnen. Die Dichtungen sollten immer Vertiefungen unmittelbar nach der Filter aus dem Gehäuse entfernt zu überprüfen.
    3. Nehmen Sie ein einzigartiges Probennummer auf einem Probendatenblatt (siehe Zusätzliche Materialien für ein Beispiel) und dann Bringen Sie das Filterproben-Entnahmevorrichtung und die Probendatenblatt an die Person, die werden das Feld Probensammel werden, zusammen mit allen zweckdienlichen Weisungen Probe Sammlung (zB Probenvolumen, Probenentnahmestelle, etc.).

2. Vorbereitung der Probenentnahme an der Probenahmefläche

  1. Hände waschen nach der Ankunft in der Sammelstelle und don OP-Handschuhe, die Möglichkeit einer Kontamination der Probe minimieren. Proben zu sammeln, wenn Sie nicht erleben, Darm- oder Atemwegsbeschwerden. Wechseln Sie die Handschuhe häufig, vor allem nach dem Berühren Wasserhähne und andere Gegenstände, die Fortsetzung sein könnenaminierten.
  2. Nehmen Sie relevante Probe Tracking-Informationen auf einem Proben Datenblatt. Relevante Informationen sind vor Ort und Probenidentifikation, Namen Samplers und Ausrüstung Modelle und Seriennummern.
  3. Schalten Sie den Wasserhahn für 2-3 min bis alle Ablagerungen, die in der Zeile abgesetzt hat zu löschen. Falls erforderlich, verwenden Sie einen Gartenschlauch oder Schläuche zu einem Abfluss in diesem Schritt zu erreichen.
  4. Wenn die Probenentnahmevorrichtung Module angeschlossen sind, trennen Sie sie und schützen die offenen Enden des Kassettengehäuses Modul mit steriler Folie. Schließen Sie das Entlademodul mit dem Einlassmodul und schließen Sie beide an den Wasserhahn. Schließen Sie einen Gartenschlauch am Ende des Entladungsmodul und legen Sie das freie Ende in der 1 l Behälter aus Polypropylen.
  5. Drehen Sie den Wasserhahn auf und übergeben Sie bis zu 75 l des Wassers durch die Vorrichtung abgetastet werden.
    1. Messen und die Wasserqualitätsparameter während des Flush Frist am Wasser in den Behälter aus Polypropylen-Chlorrückstand fließendet, pH, Temperatur und Trübung.
    2. Nach dem Ausschalten des Wasser am Wasserhahn, trennen Sie das Entlademodul vom Saugmodul, und schließen Sie die Patronengehäusemodul mit dem Ausgang des Einlassmodul und der Entladungsmodul mit dem Ausgang des Patronengehäuses Modul dann. Setzen Sie den Zähler auf Null zu lesen.

3. Feldprobenentnahme

  1. Notieren Sie sich die ersten Zählerstand zusammen mit dem Datum und Uhrzeit und dann den Wasserhahn langsam öffnen.
    1. Sicherstellen, dass das Kassettengehäuse ist in einer aufrechten Position, und dass es vollständig mit Wasser füllt. Einige Gehäuse haben einen Lüftungstaster, der gedrückt werden kann, um Luft aus dem Gehäuse während der Befüllung zu vertreiben werden.
    2. Öffnen Sie den Wasserhahn vollständig. Die Durchflussmenge auf 10 l / min mit dem Bronze-Durchgangsventil und nehmen Sie dann die erste Durchflussrate.
  2. Fahren Sie 300 L von Oberflächenwasser oder 1.500 bis 1.800 L des Grundwassers durch die Vorrichtung mitdie Zählerstände (wie eingestellt, falls erforderlich). Wenn die Filter verstopft, bevor das erforderliche Volumen erreicht ist, und mehr als die Hälfte des Volumens gesammelt worden ist, mit einem zweiten Filtergehäusemodul, um die verbleibende Probe zu sammeln, wenn ein solcher vorhanden ist.
  3. Beachten Sie die Durchflussrate als das Probenvolumen nähert sich dem Ende der Abtastperiode und schalten Sie den Wasserfluss an der Probenhahn. Notieren Sie sich die endgültige Strömungsgeschwindigkeit, Datum, Uhrzeit, die letzte Zählerstand und die Gesamtprobenvolumen.
  4. Trennen Sie die Filterproben-Entnahmevorrichtung aus dem Wasserhahn. Trennen Sie das Patronengehäuse Modul von den anderen Modulen.
    1. Drehen Sie das Filtergehäuse (n) auf den Kopf und lassen Sie überschüssiges Wasser abfließen lassen, bis kein Wasser mehr aus den beiden Einlass- und Auslasskanäle zu entleeren.
    2. Drehen Sie das Gehäuse aufrecht und decken die Schnellverschlüsse an beiden Enden mit steriler Aluminiumfolie. Legen Sie das Gehäuse in eine oder mehrere Plastikbeutel.
    3. Lassen Sie das Wasser aus dem Einlass und discharge Module. Platzieren der Module, die in einem oder mehreren versiegelbaren Plastikbeuteln.

4. Lieferung von Feldproben

  1. Legen Sie die Filterentnahmevorrichtung Module in einem isolierten Lagerung und Transport kühler.
  2. Fügen gefrorenen Eispackungen oder doppelt verpackte Eiswürfel auf die Lagerung und Transport-Kühler, um sicherzustellen, dass die Probe zwischen 1-10 ° C bleibt während des Transports. Zwei große und 6-8 kleine Eisbeutel sollte ausreichend sein.
  3. Legen Sie eine Temperatur-Aufzeichnungsgerät in dem isolierten Lagerung und Transport der Brust an einem Ort ohne Kontakt zu Eisbeutel oder Eisbeutel.
    HINWEIS: Die Temperatur-Erfassungseinrichtung ist optional, wenn das Analyselabor wird mit Hilfe einer visuellen Infrarot-Thermometer, um die Temperatur des Kassettengehäuses unmittelbar nach der Ankunft und der Öffnung des Behälters zu messen.
  4. Füllen Sie jeden Hohlraum mit Verpackungsmaterial und legen Sie dann die Beispieldatenblatt in einem verschließbaren Plastikbeutel geschützt, auf T-op. Schließen Sie die isolierte Lagerung und Transport Brust und kleben Sie es auf ein Austreten von Wasser zu verhindern.
  5. Transporte des Probe zum Analyselabor. Dass die Probe gelangt zu dem Analyselabor nach Beginn der Feldprobensammlung nicht später als 24 Stunden (dh die Zeit, in Schritt 3.1 erfasst).

Representative Results

Verstopfen des Filters ist ein wichtiger potentielles Problem, das mit der Methode 1615 angetroffen werden können Verstopfungen vermindert die Strömungsrate des Wassers durch den Filter. In einigen Fällen kann dies durch Öffnen des Kugelventils zu stärkeren Austausch ermöglichen überwunden werden. In anderen Fällen wird der Filter vollständig verstopft werden, bevor das erforderliche Volumen durchgeleitet wurde. Tabelle 1 zeigt den Anteil der Proben mit reduzierten Volumina als eine Funktion der Filtertyp, Wasser-Typ, und Trübung. Verstopfung aufgetreten sowohl Grund- und Oberflächenwasserproben mit der Aluminiumoxid-Nanofaser-basierten Filter besser als der quartären Amin-basierte Filter zur Grundwasserproben, während das Gegenteil der Fall für die Oberflächenwasserproben war. Insgesamt waren 6% der gesammelten Proben unter Verwendung des quartären Amin-basierte Filter Mangel an Volumen, während 10% der Proben mit den Aluminiumoxid-Nanofaser-basierten Filtern gesammelt nicht die erforderliche Mindest angegebene Volumen aufgrund einer Verstopfung zu erfüllen. In Gattungenl, Verstopfung erhöht mit Trübung, aber eine Reihe von verschiedenen Komponenten, die Trübung beitragen und einige von diesen nicht zu einer Verstopfung führen. So wurden beispielsweise 43% aller verstopfen Ereignisse während der ICR-Studie auftritt, zwei Flusssysteme beschränkt (Daten nicht gezeigt). Während des ICR war die Mindestzielvolumen für Oberflächenwasser 200 L. Das durchschnittliche Volumen während der Studie gesammelten betrug 217 ± 32 L mit einer mittleren Volumen von 208 L (Daten aus dem ICR Aux1 18 Monate Access-Datenbank vom 2000.04.25) . So kann das volle Volumen von vielen Wassern auch bei hohen Trübungen gesammelt werden.

Der ICR erforderlich Sampler einen Vorfilter zu verwenden, wenn Trübungen waren mehr als 75 NTU, aber auch mit einem Vorfilter, 34% der in den Gewässern mit Trübungen über 75 gesammelten Proben NTU verstopft. Methode 1615 empfiehlt die Verwendung von einem Vorfilter mit Wasser über 50 NTU; jedoch, da die Veröffentlichung Method 1615 verschiedene Vorfilter Optionen zusätzlich zu dem in der Methode aufgeführt wurdengetestet. Keine von diesen zu einer signifikanten Verbesserung der Probenvolumen (Daten nicht gezeigt).

Figur 1
Abbildung 1: Standard-Filtergerät. Die Standard-Filtergerät besteht aus Aufnahme, Filtergehäuse, und Druckmodule (siehe Zusätzliche Materialien für eine Beschreibung der einzelnen Module). Bitte klicken Sie hier, um eine größere Version dieses Bild anzuzeigen.

ext-align: center "> Oberflächenwasser mit 1MDS Filter c
Insgesamt Proben ein Anzahl der Mangel Proben b Prozent Mangel Proben Trübung (NTU)
Grundwasser mit NanoCeram Filter c
113 1 1 <20
Oberflächenwasser mit NanoCeram Filter c
83 12 14 <20 d
8 4 50 20 - <50
6 5 83 ≥ 50 d
Insgesamt NanoCeram c
210 22 10 ≥ 0
Grundwasser mit 1MDS Filter c
374 75 20 <20
2693 27 1 e <20 e
505 36 7 f 20 - <50 f
122 19 16 e 50 - <75 g
175 60 34 e, f ≥ 75 e, f, g
Insgesamt 1MDS c
3869 217 6 ≥ 0

Tabelle 1 Filterkapazität ein Muster sind aus den folgenden Studien, aus dem Volumen und Trübungsdaten stehen zur Verfügung:. 1) USEPA ICR-Studie (Daten aus dem ICR Aux1 18 Monate Access-Datenbank vom 02.045/2000), 2) USEPA Grundwasserstudie 8, 3) US-EPA und Lawrence Lowell, MA-Studie (unveröffentlichte Daten), 4) USEPA Mississippi Studie (unveröffentlichte Daten), 5) USEPA Trinkwasseraufbereitungsanlage Studie (unveröffentlichte Daten), 6) US-EPA-Methode 1615 Evaluationsstudie 25 und 7) die ersten drei Monate des UCMR3 Überwachung (unveröffentlichte Daten). b Proben, wo die Filter vor dem Mindestwassermenge für jede Studie angegeben verstopft gesammelt. Das war 200 L für Oberflächengewässer und 1.500 l bei Grundwasserkörpern, war aber 200 L für Quellwasser, das Grundwasser unter der USEPA ICR und 1893 L für die USEPA Grundwasser Studie waren. C Die Fähigkeit, den vollen festgelegten Mindestvolumen sammeln sich deutlich für Proben entnommen mit NanoCeram und 1MDS Filter (P = 0,002) und zwischen Oberflächengewässer und Grundwasser sowohl insgesamt (p <0,001) und für jeden Filtertyp (P <0,001) mit Hilfe des Mann-Whitney-Rangsummentest. d & #8211; g Gruppen mit der gleichen hochgestellten Wert unterscheiden sich signifikant (p <0,05) nach dem Kruskal-Wallis Eine Varianzanalyse an Rängen Test und Dunns paarweise multiple Vergleichsverfahren. Für alle statistischen Tests die abhängige Variable ist die durch das Filter als ein Bruchteil der festgelegten Mindestvolumen geleitet Volumen, jedoch mit einem maximalen Wert von 1,0.

Discussion

Verschiedene Filtertypen zur Konzentrierung von Viren aus Umwelt Wasser wurden über die Jahre 26 verwendet. Aktuelle Verfahren verwenden Ultrafilter 27, elektro Filter 13,28,29, Glaswolle-Filter 23 und elektro Filter 30. Elektro Filter wurden weit verbreitet für viele Jahre verwendet, aber eine Anforderung für die Zugabe von Salz und die Einstellung der Wasser pH im Bereich vor oder während des Abtastens der ihre Eignung 13. Die praktischste Filter Wahl für Feld Probenahme elektro Filter. Diese Filter ermöglichen die Probenahme von großen Wassermengen bei hohen Flussraten und ohne Konditionierung des Wassers. Glaswolle-Filter sind die am wenigsten teure Option, aber langsamere Fließgeschwindigkeiten als elektro Filter und sind nicht im Handel erhältlich. Ultrafilter die höchste Virusrückforderungen über einen großen Bereich der Wasserqualität, aber die Ausrüstung für sampli erforderlichng nicht ohne weiteres Feld beweglich und die erforderliche Zeit, um Proben zu sammeln, ist viel länger 27. Verfahren wurden vor kurzem entwickelt worden, dass die Verwendung vorkonditionierten elektro Filtern, um die Notwendigkeit einer Einstellung im Bereich zu vermeiden, aber diese können nicht für das Sammeln großer Probenvolumina 28,29 sein.

EPA-Methode 1615 nutzt elektroPatronenFiltern, die ihre positive Ladung entweder von Aluminiumoxid-Nanofasern oder quartäre Amine erhalten. Die Vorteile des ehemaligen über die letztere ist, dass es weniger teuer ist und effizient sammelt Virus von Wasser über einen größeren Bereich der natürlichen pH-Werten von 30,31; aber jede Patrone, sowie die Glaswollefilter von Borchardt und Kollegen verwendet zu ähnlichen Ausbeuten von Enteroviren und Noroviren aus dem Wasser 23,31,32 (Cashdollar, unveröffentlichte Daten). Patronenfilter werden in einer einfachen Abtastvorrichtung, die dazu bestimmt ist, die Entnahme von Proben zu vereinfachen platziertund verringern Kontamination während der Probennahme.

Standardmethoden sind von unschätzbarem Wert, wenn große Studien mit mehreren Analyselabors durchgeführt. EPA-Methode 1615 bietet Standard-Verfahren und Leitlinien, um die beiden wichtigsten Fragen, die Probennahme von Daten während dieser gesammelten beeinflussen können minimieren Studien-falsch-positive Ergebnisse stammen von Verunreinigungen während der Probenahme oder unzureichend desinfizierten Gerätekomponenten und die Verstopfung der Filterporen durch Komponenten wobei das Wasser entnommen.

So wie Enteroviren können aufgrund mangelnder Hygiene verbreiten Person-to-Person werden, können Viren in Proben aus schlecht gewaschene Hände oder Hände mit kontaminierten Handschuhen 33 eingeführt werden. Es ist wichtig, Sampler verstehen die potenziellen Wege der Kontamination und benutzen aseptische Technik bei der Probenahme. Sampler sollten verstehen, dass Handschuhe sind in erster Linie verwendet, um den p-Sampler aus dem Gefahrenbereich zu schützen und nichtchützen das Gerät vor Verschmutzung. Die Hände sollten gewaschen werden vor Beginn der Probenahme und Sorgfalt ist bei der An- und Ausziehen von Handschuhen ergriffen werden, um die Hand zu verhindern, um eine Kontamination Handschuh werden. Sampler mit Gastroenteritis oder Atembeschwerden dürfen nicht Proben zu sammeln, wie sie sein könnten vergießen Enteroviren oder Noroviren in hohen Konzentrationen.

Zweitens, muss darauf geachtet werden, um Kontamination des Virus aus vorherigen Abtastereignissen verhindern. Um diese potentielle Quelle von Verunreinigungen zu verringern, wurde die Probenentnahmevorrichtung in Verfahren 1615 von dem des ICR, indem sie nicht einen Druckregler und Druckmesser zwischen dem Einlass und dem Kassettengehäuse Modul modifiziert. Diese Komponenten wurden entfernt, weil die bei der Probenahme Ereignisse beobachtet Drücke waren immer unter der maximalen Gehäuse Bewertung (zB 125 psi für 5-Zoll Kassettengehäuse) und weil sie schwer zu desinfizieren. Das letztere Problem wurde durch die Verwendung von Geräten Blindkontrollen in st gezeigtudies im Anschluss an die ICR 6,20. Das Ausmaß, in dem sie die betroffenen ICR-Daten ist unbekannt, aber wahrscheinlich war klein; gab es nur zwei falsch positive negative Performance Evaluation Proben während der Studie (Daten nicht gezeigt). Um die Möglichkeit einer Verschleppung weiter zu verringern, es wird auch empfohlen, dass die Einlassrohrmodul nach jedem Abtastereignis ersetzt. Es ist besonders wichtig, um eine ausreichende Desinfektion zu gewährleisten, wenn die Vorrichtung für eine Qualitäts- oder Leistungssteuerung, die mit dem Virus geimpft wurde. Vor der Durchführung der Desinfektion, sollte die Konzentration des freien Chlors für Verluste während der Lagerung zu messen. Zusätzlich zu den Änderungen in der Konfiguration der oben beschriebenen Vorrichtung ist es wichtig, dass regelmäßige Ausrüstung Rohlinge ausgeführt, um zu zeigen, dass eine Desinfektion wirksam werden. Methode 1615 schreibt vor, dass Geräte-Rohlinge mit Apparaten, die nach der für die Virus ausgesät Kontrollen verwendet desinfiziert worden sind ausgeführt werden, wodurch die Vereinfachungdas Verfahren durch den Wegfall der Notwendigkeit, einen Virus-seeded-Lösung durch die Vorrichtung vor der Desinfektion übergeben. Die Konzentration des Desinfektionsmittels für Method 1615 bis 0,525% Hypochlorit erhöht, da diese Konzentration auch erforderlich, um alle lebensfähigen Viren auf der Ausrüstung zu inaktivieren und Nukleinsäuren abbauen. Daher müssen die Geräte Blanks sowohl mit Zellkultur und qPCR-Assays untersucht werden.

Beide Arten von elektro Filter unterlagen Verstopfung während des Studiums in Tabelle 1 angegeben. Eine unbekannte Anzahl von Proben mit reduzierten Volumina können durch Stichprobenfehler wie einem falschen Verständnis der Zähler oder einer vorsätzlichen frühen Stopp der Probenahme in einen anderen zu erfüllen gewesen, Frist, vor allem für Gewässer mit Trübungswerte von weniger als 20 NTU. Der Grad der Verstopfung ist sowohl von den Parametern Filtertyp und Wasserqualität. Vorfilter bieten ein gewisses Maß an Verbesserung, aber wenn verwendet wird, sollte verarbeitet und analysiert werdengetrennt von der elektroFilter. Die aktuelle Empfehlung für die UCMR3 ist, dass die Probe ohne Vorfiltern mit zwei Aluminiumoxid-Nanofaser basierenden Filter, wenn zumindest die Hälfte des Volumens unter Verwendung des ersten Filters gesammelt werden gesammelt werden.

Acknowledgments

Die Autoren danken zahlreichen WPA Personal deren Beiträge die Überwachung während des ICR und durchgeführt UCMR3 möglich, die folgenden führenden Forschern anderer EPA Studien berichtet: Daniel Dahling, Alfred Dufour, Andrej Egorov, Susan Glassmeyer, Asja Korajkic, Richard Lieberman, Robert Safferman, und Tim Wade; und Shannon Griffin und Michael Ware für dieses Manuskript kritisch zu prüfen. Die Autoren danken den Indian Hill Water Works für die Nutzung einer ihrer Pumpenhäuser zu Probennahme zu zeigen. Obwohl diese Arbeit wurde vom US-EPA überprüft und zur Veröffentlichung freigegeben, kann es nicht unbedingt offizielle Agentur Politik. Die Erwähnung von Handelsnamen oder Handelsprodukten stellt keine Billigung oder Empfehlung für den Einsatz.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
1-L polypropylene bottle Nalgene 2104-0032
Aluminum foil squares Cole-Parmer 06275-40
Autoclave Steris Amsco Lab Series
Bubble wrap U.S. Plastics 50776
Closable bag Uline S-12283
Closable bag Fisher Scientific S31798C
Commercial ice packs Cole-Parmer 06345-20
Cool safe box Diversified Biotech CSF-BOX
Gauze sponge Fisher Scientific 22-415-469
Graduated cylinder Cole-Parmer 06135-90 4-L or larger
Hype Wipe Fisher Scientific 14-412-56
iButtons temperature data logger Maxim DS1921G
Insulated storage and transport chest Fisher Scientific 11-676-12
Packing tape U.S. Plastics 50083
Portable chlorine colorimeter II test kit Hach 5870062
Portable pH and temperature probe Omega PHH-830
Portable turbidity meter Omega TRB-2020-E
PTFE thread tape Cole-Parmer 08270-34 Use on all threaded connections
Pump, Centrifugal Magnetic Drive Cole-Parmer 72010-20
Reduction nipple Cole-Parmer 06349-87
Sodium hypochlorite (NaClO) Use locally available household bleach
Sodium thiosulfate (Na2S2O3) Sigma Aldrich 217247
Surgical gloves Fisher Scientific 19-058-800
Waterproof marker Fisher Scientific 22-290546
Media Composition
0.525% sodium hypochlorite (NaClO) Prepare a 0.525% NaClO solution by diluting household bleach 1:10 in dH2O.  Store 0.525% NaClO solutions for up to 1 week at room temperature.  
 
 
 
 
Name Company Catalog Number Comments
1 M sodium thiosulfate (Na2S2O3) pentahydrate Prepare a 1 M solution by dissolving 248.2 g of Na2S2O3 in 1 L of dH2O.  Store sodium thiosulfate for up to 6 months at room temperature.

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

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Umweltwissenschaften Heft 97 Enterovirus Umweltmikrobiologie Wasser Virus Auftreten elektroPatronenFilter Probensammlung
EPA-Methode 1615 Messung der Enterovirus und Norovirus Vorkommen in Wasser von Kultur und RT-qPCR. I. Sammlung von Virenproben
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Fout, G. S., Cashdollar, J. L.,More

Fout, G. S., Cashdollar, J. L., Varughese, E. A., Parshionikar, S. U., Grimm, A. C. EPA Method 1615. Measurement of Enterovirus and Norovirus Occurrence in Water by Culture and RT-qPCR. I. Collection of Virus Samples. J. Vis. Exp. (97), e52067, doi:10.3791/52067 (2015).

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