Introduction
骨骼肌线粒体的主要生理作用是从氧化磷酸化1产生ATP。重要的是,骨骼肌线粒体的运动能力2发挥具体作用,延缓衰老3,退行性疾病4和II型糖尿病5。作为老龄化社会,和II型糖尿病是死亡在美国6的 7 个首要原因,是否需要评估线粒体功能的方法已经变得越来越在生物医学研究7,8-更普遍。具体地讲,氧的消耗的测量在线粒体功能的评估呈实用,因为它代表的线粒体和核基因组之间的协调功能,表达氧化磷酸9的功能组件。
几种技术存在,使氧消耗在完整细胞的测定和隔离ð线粒体7-10。另外,测定中已经开发了用于多种细胞类型和组织,并在各种物种,其允许线粒体途径和呼吸控制9,11,12的测定。然而,目前在文献中的空隙在问候所有这些测定中使用分离线粒体从小鼠骨骼肌中基于微孔板氧消耗的技术使用的汇编。重要的是,利用基于微孔板透气性试验越来越多线粒体生物学家中并允许使用量的分离线粒体9的最小的高通量测量。因此,基于微孔板呼吸计测定的集合被开发,允许精确定位,其中异常和/或改编可以在电子传递链(ETC)来发生的。此外,两个附加的微孔板基于呼吸计测定法开发,使协调的betwee评估n中的三羧酸(TCA)循环和ETC,和β-氧化和ETC.之间重要的是,所提出的方法提供了一个简洁明了的方法来衡量线粒体功能的常用动物模型的机械变化。
Protocol
注:此协议开始后的一个已分离出红骨骼肌线粒体。 100毫克红色骨骼肌13 -线粒体如先前从〜75描述分离。在5 - 10微克/微升线粒体蛋白会从这一数额的组织重新悬浮最后的线粒体沉淀于≤50微升隔离缓冲线粒体(IBM)2(见Frisard 等 13)来实现。
1.安装
- 制备工作储备溶液(表1)和线粒体测定溶液(MAS)混合( 表2)用于随后的测定。
注意:大多数的准备的测定的可预先完成,因为大多数股票溶液和MAS可以被存储。 - 在37℃实验中一个非 CO 2培养箱前水合在1ml溶液校准一个呼吸计测定盒过夜。
- 的实验中,吨的天阿克出冷冻股票(基材和线粒体调制器,MAS组合,MAS W / O BSA, 表1),解冻37℃水浴或孵化器。
- 准备所有底物溶液(表3)和注射剂(表4-5)和根据需要(pH7.4)中调节pH。后调节pH,储存在冰上。
- 程序的多井耗氧量测定器,以适当的组合,等待,测量参数,首先进入分析软件,其次是“标准”模式( 见表 6)和标签背景和组/条件井。
- 进入“客人”论坛,并点击“分析向导”。曾经在“试验向导”,单击“协议”,以更改组合,等待,测量参数。标签下方的“回到后台井。更正“选项卡,一定要突出”做背景校正“。
- 标签CONDitions首先点击“组和标签”选项卡上,其次是“组信息”选项卡。当这些参数被输入后,点击“结束”,其次是“保存模板”。
2.试验运行
- 加载注射液成分析来看墨盒,首先进入分析软件,然后输入“标准”模式开始校准。进入“访客”论坛。打开“XF”的驱动下,保存在步骤1.5的模板,“模板”选项卡下。一旦打开,请单击“开始”,开始校准。
注:该试剂盒盒式运行必须输入到机器的缺角的左下角。这大约需要30分钟。小心注入解决方案集成到正确的端口。 表 4-5注射顺序列出加载。 - 轻轻地,彻底混合和线粒体河口股票通过搅拌溶液与200μl的移液管尖,随后轻轻捣碎股票用200μl的移液管尖端有其孔口通过切割〜3毫米用剪刀尖端的端部变宽。
- 执行双金鸡宁酸(BCA)测定法来确定库存线粒体的蛋白质浓度。
- 使用来自步骤2.3获得的库存浓度,重悬10微克线粒体蛋白/ 200微升琥珀酸/鱼藤酮底物混合物(表3)。重悬14线粒体蛋白的微克/ 200微升剩余基板混合物的(必须为每个衬底混完成)(见表3)。置于冰上所有的线粒体蛋白/底物混合。
注意:每孔线粒体蛋白的每个测定的最佳量如前面所述9确定。经测定,丙酮酸/苹果酸盐,棕榈酰肉碱/苹果酸盐,谷氨酸/苹果酸盐的ð电子流测定利用3.5微克线粒体蛋白,而琥珀酸盐/鱼藤酮测定法利用2.5微克线粒体蛋白的每孔。因此,研究人员需要重悬足够线粒体蛋白为4个重复在此步骤,因为无论是2.5微克或每50μl3.5微克每孔加载(参见步骤2.6)。 - 轻轻地,但彻底搅拌溶液用200微升的吸头,接着轻轻捣碎的股票有200微升枪头,这带来了〜3毫米其末端的混合线粒体/底物溶液切断。
- 放置一个细胞培养板在冰上,一式三份,负载50μl/孔的各线粒体/基材的混合物。在基于微孔板透气性检测的开发者推荐留出至少两个空白(无线粒体)井,最好在细胞培养板两侧。
- 旋细胞培养板在2000克20分钟,在4℃。虽然板为s穿针,预热底物溶液在37℃水浴。
- 自旋完成后,小心地加载450微升在其相应孔中的顶端各底物溶液(即,加载丙酮酸/苹果酸盐衬底具有线粒体最初悬浮于该衬底溶液的孔中)。一定要在室温加载板。注意:空白孔应装有500微升底物。指定用于电子流动化验空白孔应加载与电子流基底(丙酮酸/苹果酸+ FCCP),而耦合测定空白孔中可以装入任何耦合测定衬底。
注意:如果在执行耦合和电流测定在同一板上,研究者必须重新分配背景孔于各自试验测定运行完成经由“仪器”标签使用“XF读者”平台之后。一旦中了“仪器”的设置,点击“管理”标签,其次是“背景校正”。点击“结束仪器设置模式”完成时。这是因为抗坏血酸/ TMPD的组合可以消耗的 O 2,因此单独的背景校正,需要对每个检测类型。 - 后450微升底物加入到每个孔中,查看线粒体在阱的层,以确保线粒体均匀地分散在单个单层(20X放大率〔见罗杰斯9, 图4])。没有出现有均匀分布的单层井可以除去事后 。
- 检查线粒体坚持后,将微孔板放入透气性测定仪,并开始通过点击“OK”运行试验。
注意:从步骤2.1标定必须完成之前运行将开始。一旦研究人员点击“确定”后,机器会弹出用于校准的工具盘。- <利>取出实用程序板和放置包含该托盘上的线粒体的细胞培养板。蓝色槽口上的细胞培养板应放置在托盘的左下角。点击“继续”开始试验运行。
- 一旦板被弹出,捞出弃去细胞培养板和墨盒,在屏幕上点击“继续”。该运行将被自动保存为“数据”文件中的.xls文件。
- 接下来的变化“中间点”到“点至点价格”下的“速率数据显示为:”选项。点击“确定”以应用这些更改。
注意:每个条件将具有平均值±显示每个速率和每个条件标准偏差。还有每个状态(状态2 [联轴器] / State3u [电子流]呼吸后面四次注射)采取率测量。使用的状态2速率的第二测量的平均值,确定国家的4o在最低点寡注射后,使用最大点为状态3和状态3U ADP和FCCP注射,分别后,并使用最小点为抗霉素阿诱导呼吸的耦合检测。使用最大点丙酮酸/苹果酸诱导状态3U呼吸,用最小点为鱼藤酮诱导的呼吸,使用最大点琥珀诱导状态3U呼吸,并使用最小点为抗霉素A诱导呼吸的电子流测定法。所有实验都进行3次并示出的数据是一代表跟踪的结果。
Representative Results
图1表示氧的消耗率(OCR)的丙酮酸/苹果酸盐,琥珀酸盐/鱼藤酮,棕榈酰肉碱/苹果酸盐,和谷氨酸/苹果酸测定法(偶联测定法)。这些测定法描记显示为耗氧率,或OCR,相对于时间,被背景correceted,并显示为点对点速率。每个小组代表氧消耗所描述的机遇与威廉姆斯14种不同的线粒体状态。第一面板代表基底耗氧量,或国家2.第二面板,注射的ADP后,表示最大连接呼吸,或国家3.第三面板,注射的寡霉素A(复合物V的抑制剂)后,表示呼吸因质子漏,或国家40。第四盘,注射FCCP后,表示极大的解偶联呼吸作用,或国家3U。最后,第五面板,注射抗霉素A的后,表示氧化呼吸的抑制。值得注意的是,人升线粒体状态有最小的标准偏差。这是由于在线粒体库存和线粒体/衬底混合物,和实现线粒体的粘附自旋(步骤2.6)后的单一单层的彻底混合。另一方面,装载不等线粒体在每个孔中,而不是实现线粒体的单个单层的微板的井引线显示在图2至增加标准偏差在每个状态。
在图1中显示的高原的描记为每个线粒体状态和为每个衬底。两个测量周期后达到的高原表明良好线粒体质量和线粒体保持整个测定法期间粘附到孔中。此外,实现鳍最大速率可能更希望的,因为这使研究人员取平均的OCR这些线粒体状态,从而减少可能发生的偏差通过任意选择点。
每孔线粒体的量通过优化试验来确定。每孔线粒体的最佳量应导致国家100-200皮摩尔/分钟/孔和状态3个评分<之间2个评分1500皮摩尔/分钟/孔,因为这些值是多井氧的动态氧感应范围内消耗测量机。每孔中过多线粒体蛋白可能导致超出仪器(图3A)的动态范围同时进行文本识别。 图3示出了装载3.5每孔线粒体蛋白(蓝色曲线)的微克相比每孔加载线粒体蛋白的2.5微克(红跟踪)为琥珀酸/鱼藤酮测定法。载入每孔太多线粒体蛋白也可导致氧气的井的微室内用尽,从而防止OCR的精确测量对于每个连续测量9(图3B </ STRONG>)。点对点的OCR是OCR的变化的瞬时速率。如果持平,OCR稳定/稳定,但如果减少,则有可能是一种生物或技术问题。在急剧下降,OCR在国3和国3U呼吸( 图3A)是由排气测量( 图3B)年底前供氧线粒体引起的。
图4表示的OCR与时间的电子流测定。跟踪校正并显示所描述的图1所示。在该试验中的第一个面板上表示丙酮酸/苹果酸盐州3U呼吸经由复一,第二面板,注射鱼藤酮后,表示抑制复合物I介导的呼吸。第三小组,注射琥珀后,代表基板刺激国家3U与电子进入ETC的复合物II(复合物II介导的呼吸)。第四盘,安迪美注射后霉素A,代表了抑制复合物III,因此总的呼吸。最后,第五面板,注射抗坏血酸/ TMPD后,代表复合物IV介导的呼吸。类似于图 1中的描记,所有线粒体状态有最小的标准偏差,并且每个速率有或几乎已经达到平台期。
图1.耦合测定。(A)中的10mM丙酮酸/ 5mM的苹果酸盐,(B)中的10mM琥珀酸/ 2μM鱼藤酮,(C)的 40μM棕榈肉碱/ 1mM的苹果酸盐, 和 (D)的10mM谷氨酸盐/ 10mM的苹果酸盐耦合线粒体呼吸描记法如通过氧消耗多井测量来确定。值表示为平均值±标准差。每孔装线粒体蛋白是3.5微克的所有检测,除了琥珀/腐烯酮,其利用2.5微克线粒体蛋白的每孔。数据表示n = 3的配对生物学重复。 OCR =耗氧率; ADP =二磷酸腺苷;寡=寡A; FCCP =羰基氰- 4 - (三氟甲氧基)苯腙;抗A =抗霉素A; PYR =丙酮酸; SUCC =琥珀酸; ROT =鱼藤酮; PAL-C =棕榈肉碱; GLUT =谷氨酸。 请点击此处查看该图的放大版本。
图2.高度可变丙酮酸/苹果酸含量。引起的不完全混合线粒体从线粒体库存在衬底/ MAS混合,从而导致可变线粒体亲高度可变的10mM丙酮酸/ 5mM的苹果酸盐法蛋白质装载在每口井。每孔装线粒体蛋白是3.5微克。数据表示n = 3的配对生物学重复。 OCR =耗氧率; ADP =二磷酸腺苷;寡=寡A; FCCP =羰基氰- 4 - (三氟甲氧基)苯腙;抗A =抗霉素A; PYR =丙酮酸。 请点击此处查看该图的放大版本。
图3.重载线粒体蛋白为琥珀酸/鱼藤酮含量。 (A)引起的加载3.5每孔线粒体蛋白(蓝色跟踪)的微克的动态范围的多井氧消耗测量机之外氧消耗率相比每孔(红色曲线)线粒体蛋白的装载2.5微克。(乙)牛ygen张力接近零以下的ADP引起的加载每孔(蓝色曲线)过多的线粒体蛋白(3.5微克)FCCP注射相比,装载线粒体蛋白每孔的最佳量(2.5微克)(红色曲线)。数据代表N = 3成对生物元线粒体蛋白量的重复。 OCR =耗氧率; ADP =二磷酸腺苷;寡=寡A; FCCP =羰基氰- 4 - (三氟甲氧基)苯腙;抗A =抗霉素A; SUCC =琥珀酸; ROT =鱼藤酮; O 2 =氧;毫米汞柱=毫米汞柱。 请点击此处查看该图的放大版本。
图4.电子流检测。5毫米丙酮酸/ 1毫米的苹果酸+ 4μMFCCP,电子˚F低线粒体呼吸测定跟踪如通过氧消耗多井测量来确定。值表示为平均值±标准差。每孔装线粒体蛋白是3.5微克。数据表示n = 3的配对生物学重复。 OCR =耗氧率;抗A =抗霉素A; ASC =抗坏血酸; TMPD = N,N,N',N' -四甲基对苯二胺 。 请点击此处查看该图的放大版本。
试剂 | 股票集中度 | MW | 最终体积 | 大规模增加 | 评论/说明 |
(M)的 | (克/摩尔) | (毫升) | (g或毫升) | ||
EGTA,pH 7.2的 | 0.1 | 380.35 | 百毫升1M的Tris基地 | 3.801克 | 储存在4℃ |
HEPES | 1 | 238.3 | 250毫升DIH 2 O的 | 59.57克 | 储存在4℃ |
氯化镁 ,六 | 1 | 203.31 | 250毫升DIH 2 O的 | 50.82克 | 储存在4℃ |
丙酮酸pH值7.4 | 0.1 | 88.06(配为14.11溶液) | 40毫升DIH 2 O的 | 0.283 ml的丙酮酸 | 使1ml等份并储存在-20℃下,使新鲜每两周 |
琥珀酸PH值7.4 | 0.5 | 118.09 | 百毫升DIH 2 O的 | 9.4克苏ccinic酸 | 使1ml等份并储存在-20℃下 |
苹果酸,pH值7.4 | 0.5 | 134.09 | 百毫升95%乙醇的 | 6.7克苹果酸的 | 使200微升等分并储存在-20℃ |
TMPD | 0.01 | 164.25 | 10毫升 | 0.0164克 | 使300μl的等分试样并储存在-20℃;混合使用抗坏血酸,以保持TMPD的降低等摩尔量 |
棕榈左旋肉碱氯化物 | 0.01 | 436.07 | 1.14 ml的95%乙醇的 | 0.005克 | 使40微升等份并储存在-20℃ |
寡á | 0.006 | 791.06 | 0.987 ml的95%乙醇的 | 0.005克 | 使20微升等份并储存在-20℃ | FCCP | 0.01 | 254.17 | 3.9 ml的95%乙醇的 | 0.01克 | 使40微升等份并储存在-20℃ |
鱼藤酮 | 0.001 | 394.4 | 10毫升95%乙醇的 | 0.0039克 | 储存在-20℃ |
抗霉素A | 0.005 | 548.63 | 9.12毫升95%乙醇的 | 0.025克 | 储存在-20℃ |
K + ADP | 0.5 | 501.32 | 3.9毫升DIH 2 O的 | 1.0克 | 储存在-20℃ |
苹果酸,pH值7.4 | 0.5 | 134.09 | 40毫升 | 2.68克 | 使200微升等分并储存在-20℃ |
库存解决方案
试剂 | 股票集中度 | 大规模增加 | 最后摩尔浓度/百分比 |
(M)的 | (g或毫升) | ||
蔗糖 | - | 11.98克 | 70毫米 |
甘露醇 | - | 20.04克 | 220毫米 |
磷酸二氢钾 | - | 0.34克 | 5毫米 |
氯化镁 ,六 | 1 | 2.5毫升 | 5毫米 |
HEPES | 1 | 1.0毫升 | 2毫米 |
EGTA | 0.1 | 5.0毫升 | 1毫米 |
从本质上讲脂肪酸自由BSA | - | 1.0克 | 0.20% |
表2. MAS混合pH值7.4 500毫升 :分装25毫升并储存在-20ºC*注:排除BSA的用于检测注射MAS组合。
基材中 | 终浓度 | 库存量(微升) | MAS *量(毫升) |
丙酮酸/马拉特 | 10毫米/ 10毫米 | 丙酮酸:1000 | 9 |
苹果酸:100 | |||
Succicinate /鱼藤酮 | 的10mM / 2μM | 琥珀酸:200 | 10 |
鱼藤酮20 | |||
*丙酮酸/马拉特+ FCCP | 5毫米/ 1毫米/ 4μM | 丙酮酸:500 | 10 |
FCCP:4 | |||
苹果酸:20 | |||
棕榈左旋肉碱/马拉特 | 40微米/ 1毫米 | Palmitoylcarnitine:40马拉特:20 | 10 |
谷氨酸/马拉特 | 的10mM / 10mM的 | 谷氨酸:400 | 10 |
苹果酸:200 |
表3底物解pH为7.4:使新鲜的实验当天。 *电子流检测解决方案。
注射中 | 集中 | 库存量(微升) | <TD> MAS的量(ml)注入墨盒数量 | 终浓度 | |
(注射板后) | |||||
ADP | 50毫米 | 300微升 | 3 | 50微升 | 5.0毫米 |
寡á | 20μM | 10微升 | 3 | 55微升 | 2.0μM |
FCCP | 40μM | 12微升 | 3 | 60微升 | 4.0μM |
抗霉素A | 40μM | 24微升 | 3 | 65微升 | 4.0μM |
Ť能够4.注射剂再加测定pH值7.4:让新鲜的实验当天。 *偶联测定法包括(但不限于)丙酮酸/苹果酸盐,琥珀酸盐/鱼藤酮,棕榈酰肉碱/苹果酸盐,和谷氨酸/苹果酸盐。
注射中 | 集中 | 库存量(g或UL) | MAS的量(ml) | 注入墨盒数量 | 终浓度(注射板后) |
鱼藤酮 | 20μM | 60微升 | 3 | 50微升 | 2.0μM |
琥珀酸 | 50毫米 | 300微升 | 3 | 55微升 | 5.0毫米 |
抗霉素A | 40μM | 24μ; l | 3 | 60微升 | 4.0μM |
TMPD / Ascorabte | 1毫米,100毫米 | TMPD:300微升 | 3 | 65微升 | 100μM的,10毫 |
抗坏血酸:0.059克 |
表5.注射剂的电子流测定 pH为7.4:使新鲜的实验当天
命令 | 时间(min) | #周期 |
校准 | ||
等一下 | 10分钟(以允许板从附着步骤暖) | |
拌 | 1分钟 | 2 |
我ASURE | 2分钟 | |
注入 | ||
拌 | 1分钟 | 2 |
测量 | 2分钟 | |
注入乙 | ||
拌 | 1分钟 | 2 |
测量 | 2分钟 | |
注入Ç | ||
拌 | 1分钟 | 2 |
测量 | 2分钟 | |
注入ð | ||
拌 | 1分钟 | 2 |
测量 | 2分钟 |
表6.仪运行协议。
Discussion
在这篇文章中介绍的方法提供一步一步的指示,使用线粒体75隔绝基于微孔板检测呼吸速率集合的性能 - 100毫克的小鼠骨骼肌。这些测定法可以以高精度来执行如由一式三份孔之间的紧密标准偏差。重要的是,这些透气性测定法允许精确定位,其中异常和/或改编可在通常使用的动物模型可发生在ETC,TCA循环,β氧化途径,衬底转运等。
它突出使用在本协议中使用的各种燃料和抑制剂的基本原理是很重要的。丙酮酸/苹果酸和谷氨酸/苹果酸盐呼吸计测定允许复合物I介导的呼吸的评估,以及它们各自的转运体的评估,以及在谷氨酸的情况下,该脱氨酶15。可替代地,组合琥珀酸/鱼藤酮使线粒体呼吸通量通过ETC的复合物II的评估,因为鱼藤酮抑制复杂我和琥珀酸通过黄素腺嘌呤二核苷酸的还原提供电子向复合物II(FADH 2)15。这些实验提供基板的具体信息以耦合效率和最大呼吸。电子流测定法是在底物和抑制剂的组合允许多种复合物的线粒体呼吸焊剂9在评估是唯一的。丙酮酸/苹果酸+ FCCP的初始衬底混允许最大呼吸络合我驱动的评价,而鱼藤酮的注射随后琥珀酸允许通过复合物II从动评估最大呼吸。注射抗霉素A的,复合物III抑制剂,接着注射抗坏血酸/ TMPD允许为呼吸自抗坏血酸由复合物IV驱动的评价/ TMPD是一个电子供体细胞色素C /复合物IV。虽然获得的耦合效率没有信息,该方法适合于那些妨碍独立运行的多个基板非常小的样本量。最后,使用棕榈酰肉碱/苹果酸盐的允许β氧化和由于来自的棕榈酸(β氧化)的氧化所产生的还原当量的ETC之间的协调的评估送入ETC通过电子转移黄素蛋白15。应当指出的是,耦合和电流测定法也可用于在串联以确定改变线粒体功能,由于一些干预(药物治疗,基因操作)。
高精度实现对这些测定主要是由于线粒体的充分混合,无论是前蛋白测定,或与基板的解决方案。沿着这些线路,一旦线粒体是resuspendend在衬底搜索解决方案纳秒,关键是混合此溶液彻底之前按照步骤2.2中所述带的加宽孔枪头加载细胞培养板。失败来混合线粒体充分将导致在测定内大的变化。此外,使用一个窄孔移液管尖端将产生的剪切力,同时混合的线粒体并增加损伤线粒体膜和细胞色素C的释放的粘附步骤(2.7)也是在这个协议中的一个关键步骤的潜力。失败旋转加载的细胞培养板长足够快/将导致线粒体的不完全粘附到孔,因此导致油井和测量之间增加变性。
所描述的方案进行了优化,包括:装载线粒体蛋白质的最佳量每孔,使用正确的浓度/制备方法,使股市和基体的解决方案,改变了试验运行,确保线粒体状态解放军teaus,和线粒体库存和线粒体/衬底混的合适的混合。在此之前,优化的努力,作者在试验运行中遇到的陷阱。下面讨论的故障排除方法/是优化这个协议有帮助修改。对于最佳的装载,装载太少线粒体不会引起一个强有力的反应,同时加载了太多的线粒体会耗尽微容器内的氧气,导致不准确的测量。 Rogers等9条规定确定每口井的线粒体最佳负载量为基于微孔板透气性检测的例子。更多的时候,太多的线粒体是每个加载以及由国家证明2率超过100-200皮摩尔/分钟/孔,状态3速率> 1500皮摩尔/分钟/孔。如果发生过载,进行一个实验,用不同浓度的线粒体蛋白(例如,在1 - 10微克),以动态R内部引起光学字符识别安格耗氧量测量机。准备和使用基材和个股的正确浓度是非常重要的。始终使用的基板/注射的酸形式和调整用氢氧化钾或盐酸的pH值;钠缓冲液/解决方案不推荐。此外,重悬基质/股在DMSO或100%的乙醇,将导致测量失败或错误。一定要使用95%的乙醇注意的地方。是很常见的棕榈酰肉碱以沉淀出95%的乙醇的解冻冷冻的储存后,从而导致大的可变性。一定要热身棕榈酰肉碱的股票和漩涡以及之前使用。此外,高度可变的丙酮酸/苹果酸盐化验结果,可能是由于丙酮酸股票之中> 2周大。一定要重拍丙酮酸冷冻等份,每2周。该法的运行被修改为2分钟测量,以确保线粒体状态高原。如果观察ADP耗尽的需要,研究人员可该“协议”选项卡下延长测量时间下的“试验向导”的论坛。最后,当线粒体库存和线粒体加底物溶液不充分均质化在装载前发生大的变化。如果井间变异是试验运行后高,一定要在底物液充分搅拌下一个实验前。切勿涡线粒体/基板解决方案,而搅拌,捣烂,与加宽孔的枪头轻轻地磨碎。
有此技术是值得注意的一些限制。首先,孔中的用于这些分析的细胞培养板的数目是相对低的(即,24个孔和指定为空白孔至少2)。如果期望在一个板上执行所有5这些测定的,研究人员仅能够检查从一只小鼠的响应的时间。但是,应该指出的是,96孔仪器可用于解释第1条- [R吞吐量。其次,有先天的优势和劣势评估线粒体功能障碍的分离线粒体相比,在完整细胞1。一些弱点包括具有较少生理学相关性相比完整细胞和从隔离过程诱导工件。最后,该方法的成功是取决于线粒体隔离工艺的质量。
虽然这些测定法已被已显影在不同的系统或在其他动物模型中已被证实,在此提出的方法是首先在一个多井氧消耗测量机使用小鼠合成所有上述测定法的最佳利用骨骼肌。重要的是,所有5这些测定可以与线粒体从〜75中分离的量来进行 - 100毫克的小鼠骨骼肌,从而提供了以最小的材料的高通量。具有十分重要的意义,多井的能力耗氧量的技术来执行检测与数量时线粒体的最小的,结合经优化的分离方法,使研究人员进行大量的其他实验用的骨骼肌组织其余(例如,蛋白质印迹,RT-PCR法,酶测定法,等),这是通常与该动物模型的斗争。
总之,本文介绍的方法提供一步一步的指示,适用于使用量的小鼠骨骼肌最小的基于微孔板检测呼吸速率集合的性能。重要的是,所提出的方法需要大量的组织和线粒体最小。一旦掌握,本文中描述的技术将允许研究人员确定在一个常用的动物模型对线粒体耗氧量的化合物或基因产物的潜在机制。
Disclosures
乔治·W·罗杰斯是海马生物科学的员工是生产的这些分析是开发的工具。
Materials
Name | Company | Catalog Number | Comments |
Sucrose | Sigma Aldrich | S7903 | Store at RT |
D-Mannitol | Sigma Aldrich | 63559 | Store at RT |
Potassium phosphate monobasic, minimum 99.0% | Sigma Aldrich | P5379 | Store at RT |
Magnesium chloride hexahydrate, ACS reagent, 99.0-102.0% | Sigma Aldrich | M9272 | Store at RT |
HEPES minimum 99.5% titration | Sigma Aldrich | H3375 | Store at RT |
EGTA | Sigma Aldrich | E4378 | Store at RT |
Essentially Fatty | Sigma Aldrich | A6003 | Store at 4 °C |
Acid Free- BSA | |||
Pyruvic Acid, 98% | Sigma Aldrich | 107360 | Store at 4 °C |
Succinic Acid | Sigma Aldrich | S9512 | Store at RT |
L(-) Malic Acid, BioXtra, ≥95% | Sigma Aldrich | M6413 | Store at RT |
L-Glutamic acid | Sigma Aldrich | G1251 | Store at RT |
N,N,N′,N′-Tetramethyl-p-phenylenediamine | Sigma Aldrich | T7394 | Store at RT |
99%, powder [TMPD] | |||
Palmitoyl L-carnitine chloride | Sigma Aldrich | P1645 | Store at -20 °C |
Oligomycin A, ≥ 95% (HPLC) | Sigma Aldrich | 75351 | Store at -20 °C |
Carbonyl cyanide 4-(trifluoromethoxy) | Sigma Aldrich | C2920 | Store at 2 - 8 °C |
phenylhydrazone | |||
≥98% (TLC), powder [FCCP] | |||
Antimycin A from streptomyces sp. | Sigma Aldrich | A8674 | Store at -20 °C |
Adenosine 5′-diphosphate monopotassium salt dehydrate [ADP] | Sigma Aldrich | A5285 | Store at -20 °C |
Rotenone | Sigma Aldrich | R8875 | Store at RT |
Pierce™ BCA Protein Assay Kit | Thermo Scientific | 23225 | N/A |
References
- Brand, M., Nicholls, D.
Assessing mitochondrial dysfunction in cells. Biochem J. 435, 297-312 (2011). - Wang, H., Hiatt, W. R., Barstow, T. J., Brass, E. P. Relationships between muscle mitochondrial DNA content, mitochondrial enzyme activity and oxidative capacity in man: alterations with disease. European Journal of Applied Physiology and Occupational Physiology. 80, 22-27 (1999).
- Lauri, A., Pompilio, G., Capogrossi, M. C. The mitochondrial genome in aging and senescence. Ageing Research Reviews. 18C, 1-15 (2014).
- Nunnari, J., Suomalainen, A.
Mitochondria: in sickness and in health. Cell. 148, 1145-1159 (2012). - Dube, J. J., et al. Effects of acute lipid overload on skeletal muscle insulin resistance, metabolic flexibility, and mitochondrial performance. Endocrinology and Metabolism. 307, E1117-E1124 (2014).
- Disease Control and Prevention Services. National diabetes statistics report: estimates of diabetes and its burden in the United States. , US Department of Health and Human Services. Atlanta, GA. (2014).
- Guarino, R. D., et al. Method for determining oxygen consumption rates of static cultures from microplate measurements of pericellular dissolved oxygen concentration. Biotechnology and Bioengineering. 86, 775-787 (2004).
- Will, Y., Hynes, J., Ogurtsov, V. I., Papkovsky, D. B. Analysis of mitochondrial function using phosphorescent oxygen-sensitive probes. Nature Protocols. 1, 2563-2572 (2007).
- Rogers, G. W., et al. High throughput microplate respiratory measurements using minimal quantities of isolated mitochondria. PloS One. 6, e21746 (2011).
- Wu, M., et al. Multiparameter metabolic analysis reveals a close link between attenuated mitochondrial bioenergetic function and enhanced glycolysis dependency in human tumor cells. American Journal of Physiology-Cell Physiology. 292, C125-C136 (2007).
- Fernandez-Vizarra, E., Lopez-Perez, M. J., Enriquez, J. A. Isolation of biogenetically competent mitochondria from mammalian tissues and cultured cells. Methods (San Diego, Calif.). 26, 292-297 (2002).
- Frezza, C., Cipolat, S., Scorrano, L. Organelle isolation: functional mitochondria from mouse liver, muscle and cultured fibroblasts. Nature Protocols. 2, 287-295 (2007).
- Frisard, M. I., et al. Low levels of lipopolysaccharide modulate mitochondrial oxygen consumption in skeletal muscle. Metabolism. 64, 416-427 (2015).
- Chance, B., Williams, G. R. The respiratory chain and oxidative phosphorylation. Advances in Enzymology and Related Subjects of Biochemistry. 17, 65-134 (1956).
- Mitochondrial pathways and respiratory control. Gnaiger, E. , OROBOROS MiPNet Publications. Innsbruck. (2007).