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Biology

Protocollo CUBIC Visualizza lo espressione della proteina a risoluzione singola cella di intere preparazioni della pelle Mount

Published: August 4, 2016 doi: 10.3791/54401
* These authors contributed equally

Summary

Questo rapporto descrive un protocollo CUBIC per chiarire tutto spessore del mouse biopsie cutanee, e visualizzare pattern di espressione delle proteine, le cellule proliferanti, e sebociti alla risoluzione di singola cellula in 3D. Questo metodo consente una valutazione accurata di anatomia e patologia della pelle, e di fenotipi epidermiche anomali nelle linee di topi geneticamente modificati.

Abstract

La pelle è essenziale per la nostra sopravvivenza. Lo strato epidermico esterno è costituito dell'epidermide interfollicolare, che è un epitelio squamoso stratificato che copre la maggior parte del nostro corpo, e appendici epidermiche, come i follicoli piliferi e delle ghiandole sudoripare. L'epidermide subisce rigenerazione per tutta la vita e in risposta al danno. Ciò è reso possibile dal K14-esprimendo popolazioni staminali / progenitrici di cellule basali epidermiche che sono strettamente regolati da molteplici meccanismi regolatori attivi all'interno dell'epidermide e tra epidermide e derma. Questo articolo descrive un metodo semplice per chiarire tutto spessore del mouse biopsie cutanee, e visualizzare modelli di espressione della proteina K14, Ki67 etichettato cellule proliferanti, Nile Red etichettato sebociti, e l'etichettatura nucleare DAPI ad una risoluzione di singola cellula in 3D. Questo metodo consente una valutazione accurata e la quantificazione di anatomia e patologia della pelle, e di fenotipi epidermiche anomali nelle linee di topi geneticamente modificati. Il protocollo è CUBIC °e miglior metodo disponibile ad oggi per indagare le interazioni molecolari e cellulari in piena biopsie cutanee spessore ad una risoluzione di singola cellula.

Introduction

La pelle è essenziale per la nostra sopravvivenza. Si compone di tre strati principali l'epidermide esterni, il derma e l'ipoderma. L'epidermide è un tessuto altamente rigenerativa. Si tratta di un epitelio stratificato squamoso, composta prevalentemente da cheratinociti. Cheratinociti sono nati nello strato basale, e si muovono verso l'alto attraverso gli strati soprabasali differenziando, e alla fine sono versate nello strato corneo esterno circa un mese dopo la loro nascita. L'epidermide sviluppa una serie di appendici compresi i follicoli piliferi e delle ghiandole sebacee. I follicoli piliferi rigenerano anche in modo ciclico per tutta la vita 1. La capacità rigenerativa dell'epidermide è consentito dalla presenza di cellule staminali e progenitrici che si trovano nello strato basale dell'epidermide interfollicolare e follicolo pilifero 2.

Molte vie di segnalazione sono stati implicati nello sviluppo epidermico e rigenerazione. Alcuni di questi si verificano all'internosolo l'epidermide, come il percorso Hedgehog. Altri eventi di segnalazione avvengono tra derma e dell'epidermide 3. Ad esempio, i segnali Wnt dal derma si pensa siano importanti per lo sviluppo del follicolo pilifero, e sono secreti dalla papilla dermica al momento della comparsa di anagen per attivare follicolo pilifero rigonfiamento la proliferazione delle cellule staminali / progenitrici e la crescita follicolo pilifero 4. E 'importante capire i meccanismi cellulari e molecolari che controllano lo sviluppo e la rigenerazione epidermica per capire meglio come essi possono essere disturbati in malattie della pelle rigenerativo come il cancro della pelle.

Questo articolo descrive un Lear C, U nobstructed B pioggia I cocktail Maging e analisi omputational (cubi) protocollo 5-7 C per chiarire interi preparati pelle di montaggio, e visualizzare modelli di espressione proteica in 3 dimensioni a risoluzione singola cellula al microscopio confocale. Il metodo CUBIC prevede l'immersione di pelletessuto in due cocktail chimici amminoalcol-based. Queste soluzioni regolare gli indici di rifrazione del campione di pelle, lasciando il tessuto trasparente e le proteine ​​intatte, permettendo immunolocalizzazione con risoluzione di singola cellula.

Usando questo protocollo cubi, il basale e proliferanti popolazioni cheratinociti nell'epidermide interfollicolare e nel follicolo del capello sono stati ripreso in pieno biopsie cutanee spessore di tipo selvatico topo utilizzando anti-Keratin14 (K14) e anticorpi anti-Ki67. Le ghiandole sebacee in biopsie cutanee di tipo selvatico sono stati visualizzati con Nile Red colorazione. Infine, le popolazioni di cheratinociti basali di tipo selvatico e iperplastici biopsie cutanee YAP2-5SA-ΔC sono stati confrontati 8.

Questo protocollo permette CUBIC valutazione visiva di espressione della proteina in pieno biopsie cutanee spessore con risoluzione singola cella, ed è uno strumento importante per apprezzare l'anatomia epidermica e difetti morfologici nella pelle di organismi geneticamente modificatitopi, e di indagare i meccanismi cellulari e molecolari alla base dello sviluppo epidermico e la rigenerazione.

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Protocol

Etica Dichiarazione: Tutte le procedure che coinvolgono soggetti animali seguono le linee guida del Comitato Cura e etico degli animali (ACEC) all'UNSW l'Australia sotto approvato protocollo ACEC 13 / 64B.

1. Preparazione del Transparent mouse tessuto cutaneo

Nota: Tutti i topi utilizzati in questo studio erano su un C57BL / 6 background genetico

  1. Raccolta del tessuto cutaneo del mouse.
    1. Umanamente eutanasia i topi da dislocazione cervicale.
    2. Rimuovere con attenzione i peli dalla zona della pelle in questione con un trimmer facendo attenzione a non ferire la pelle.
    3. Lavare la pelle a decontaminare con il 70% di etanolo in tampone fosfato (PBS).
    4. Sollevare pelle del collo dorsale con una pinza e fare un'incisione con le forbici.
    5. Sezionare una grande area di pelle dorsale mouse (circa 1,5 x 4 cm).
    6. Appiattire pelle derma rivolto verso il basso su una carta da filtro, e annotare l'orientamento antero-posteriore del campione.
    7. Tricarta da filtro m attorno alla pelle sezionato, e mettere in un tubo da 15 ml piena di preparati al momento 4% paraformaldeide soluzione (PFA) in PBS.
    8. Fix per 1 ora a temperatura ambiente, o una notte in frigorifero a 4 ° C.
    9. Lavare 2 x 5 minuti in PBS in una provetta da 15 ml.
      Nota: Le seguenti (1.1.10 - 1.1.12) sono passaggi facoltativi per la conservazione a lungo termine dei tessuti.
    10. Disidratare pelle sezionato in PBS con l'aumentare della concentrazione di etanolo (25%, 50% 70%) in una provetta da 15 ml durante operazioni di lavaggio 1-hr a temperatura ambiente.
    11. Conservare disidratate in etanolo al 70% in PBS in una provetta da 15 ml a 4 ° C fino all'utilizzo.
    12. 4 ore prima di compensazione, reidratare tessuto cutaneo in PBS con una minore concentrazione di etanolo (70%, 50%, 25%, 0%) in una provetta da 15 ml durante operazioni di lavaggio 1-hr a temperatura ambiente.
  2. Cancellazione delle biopsie cutanee del mouse
    1. Preparare la soluzione CUBIC1 compensazione sciogliendo 3,85 g di urea e 3,85 g N, N, N ', N'-tetrakis (2-idrossipropil) etilendiammina in 5,38 ml di acqua distillata in un riscaldatore impostato a 60 - 70 ° C. Utilizzare un agitatore caldo.
    2. Aggiungere 2,31 g di polietilene glicole mono-p-isooctylphenyl etere / Triton X-100 alla soluzione una volta che è chiaro ed è raffreddata a temperatura ambiente.
    3. Tagliare il mouse pelle con una lama di rasoio affilata in biopsie di dimensioni di circa 0,2 x 0,5 cm, e immergere in 5 ml di soluzione CUBIC1 compensazione in una provetta da 15 ml. Per ottimizzare la visualizzazione dei follicoli piliferi, verificare che il lato più lungo della biopsia viene tagliato lungo la direzione antero-posteriore del campione.
    4. Collocare su una piattaforma rotante in un fornetto a 37 ° C.
    5. Cambiare la soluzione compensazione dopo 7 giorni. Preparare la soluzione CUBIC1 fresco prima dell'uso.
    6. Controllare la trasparenza del tessuto dopo 7 giorni. Se necessario, lasciare biopsie in soluzione compensazione CUBIC1 finché il tessuto è completamente trasparente.
    7. Una volta che la biopsia della pelle è trasparente,rimuovere la soluzione CUBIC1, e aggiungere 4 ml di 1 × PBS per lavare il tessuto 4 volte per 6 ore a 37 ° C.
    8. Lavare il tessuto cutaneo nel 20% w / v di saccarosio in PBS in una provetta da 15 ml per 4 ore a 37 ° C.
    9. Congelare il tessuto nel mezzo di montaggio composto ottimali di taglio temperatura (OCT) in un tubo da 15 ml durante la notte in un congelatore C -80 °.
      Nota: Questo passaggio aumenta la permeabilità della biopsia per la penetrazione degli anticorpi nei passaggi successivi.

2. Immunofluorescenza

  1. Scongelare il tessuto da 1.2.9) a temperatura ambiente per 2-3 ore.
  2. tessuto di lavaggio nel tubo da 15 ml con 5 ml di PBS per 8 ore a temperatura ambiente per rimuovere ottobre Compound.
  3. biopsie trasferire in un tubo 2 ml, e incubare il tessuto in 1 ml di coniglio anti-Keratin14 o coniglio anticorpo anti-Ki67, sia diluito 1: 100 in PBST (PBS + 0,1% Triton-X100) per 3 giorni su un agitatore a 37 ° C forno.
  4. biopsie trasferimento in una provetta 15 ml, unnd lavare tessuti 4 volte per 6 ore in 5 ml di PBST su un agitatore in forno a 37 °.
  5. biopsie trasferimento in un tubo di 2 ml, aggiungere 1 ml anti-coniglio Alexa594 anticorpo secondario diluito 1: 100 in PBST e incubare 3 giorni su un agitatore in un forno a 37 ° C.
  6. biopsie trasferimento in un tubo da 15 ml, e lavare tessuti 4 volte per 6 ore in 5 ml di PBST su un agitatore in un forno a 37 ° C.
  7. biopsie trasferimento in un tubo di 2 ml, aggiungere 1 ml 4 ', 6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) soluzione nucleare di contrasto (1: 1.000) in PBST e incubare una notte su un agitatore in un forno a 37 ° C.
  8. Rimuovere la soluzione di contrasto DAPI, e aggiungere 1 ml di PBST al tubo 2 ml per lavare il tessuto 4 volte per 6 ore su un agitatore in un forno a 37 ° C.
    Nota: Passaggio facoltativo: Le biopsie possono essere conservate al buio in 1x PBS con sodio azide 0,02% per almeno 3 settimane.

3. Nile Red colorazione

  1. Sciogliere in polvere Nilo Red in dimetilsolfossido (DMSO) ad una concentrazione finale di 1 mg / ml
  2. Aggiungere 1 ml soluzione Nilo Red a 1 ml di PBS per una concentrazione finale di 1 mg / ml.
  3. Scongelare tessuto da 1.2.9) a temperatura ambiente per 2 - 3 ore, e lavare con 5 ml di PBS per 8 ore a temperatura ambiente.
  4. Trasferire biopsie ad un tubo 2 ml, e immergere il tessuto in 1 ml di soluzione colorante Nilo Red per 2,5 ore a temperatura ambiente.
  5. Lavare le biopsie della pelle nella provetta 2 ml con 1 ml PBST 4 volte per 30 minuti a temperatura ambiente.
  6. Rimuovere la soluzione PBST dal tubo 2 ml, aggiungere 1 ml di soluzione DAPI nucleare di contrasto (1: 1.000) in PBST e incubare una notte a temperatura ambiente.
  7. Rimuovere la soluzione di contrasto DAPI, e aggiungere 1 ml di PBST nel tubo 2 ml per lavare il tessuto cutaneo 4 volte per 6 ore a temperatura ambiente.
    Nota: Passaggio facoltativo: Le biopsie possono essere conservate al buio in 1x PBS con sodio azide 0,02% per almeno 3 settimane.

4. Imaging

  1. Preparare la soluzione CUBIC2 compensazione, che contiene 50% (W / v) di saccarosio, 25% (w / v) di urea, 10% (w / v) 2,2 ', 2' '- nitrilotrietanolo, e 0,1% (v / v) Triton X-100.
  2. Incubare il tessuto cutaneo in 1 ml di soluzione CUBIC2 in una provetta 2 ml su un agitatore per 24 ore in un forno a 37 ° C. Questo passaggio uniformare l'indice di rifrazione del tessuto.
  3. Controllare la chiarezza del tessuto. Una volta che è chiaro, orientabilità dell'intera biopsia cutanea (0,2 x 0,5 cm) sul suo lato più lungo su un vetrino di vetro, in modo tale che la direzione della lunghezza dei follicoli piliferi è parallelo alla superficie coprioggetto (# 1 24 x 60 mm)
    Nota: Passaggio facoltativo: biopsie colorate con anticorpo possono essere memorizzati in soluzione CUBIC2 per circa 7 giorni. biopsie Nile Red-macchiati possono essere memorizzati in soluzione soltanto CUBIC2 per un massimo di 1 giorno, e dovrebbe essere ripreso al più presto possibile.
  4. Preparare camera di imaging (Figura 1)
    Nota: materiali di consumo necessari per la preparazione della camera di imaging sono: blu tack, plastilina o simili, e 2 coprioggetto (24 x 50 mm) (FIGURA 1A).
    1. Preparare due sottili strisce di virata blu (diametro di circa 1 mm x 2 cm), e due lamelle (Figura 1B).
    2. Mettere strisce dell'aderenza blu su un vetrino, lasciando abbastanza spazio per la pelle biopsia (Figura 1C). 4.4.3)
    3. Posizionare biopsia cutanea tra strisce sul vetrino in una goccia di soluzione CUBIC2 (Figura 1C).
    4. Coprire biopsia cutanea con il secondo vetrino (Figura 1D).
  5. Posizionare la camera di imaging con la biopsia cutanea montato sul palco di un microscopio confocale e spostare il tessuto nel percorso di luce.
  6. Eseguire la scansione del campione utilizzando una sorgente di luce alogena e mercurio o filtri epifluorescenza standard (ad es, DAPI / GFP / CY3 / CY5) per identificare le regioni fluorescente macchiati di interesse.
  7. Aree di immagine di interesse utilizzando un obiettivo 10X e 20X (NA 0,75) e le tecniche standard di imaging confocale a fluorescenza (ad es., Con DAcampioni PI macchiato illuminano con un laser 405 nm e raccolgono il segnale di fluorescenza tra 425-475 nm, e con Alexa Fluor 594 o campioni Nile Red-macchiati illuminano con un laser 561 nm e raccolgono il segnale di fluorescenza tra 570-620 nm).
  8. Generare immagini Z-pile di ogni regione di interesse utilizzando Z-stack software di acquisizione immagini al microscopio (ad es., Utilizzando elementi NIS software di imaging 4.13 come descritto di seguito).
    1. Assicurarsi potenza del laser ottimale e PMT HV / Offset impostazioni sono state selezionate per la raccolta del campione di fluorescenza.
    2. Aprire la barra degli strumenti "ND Acquisition" da "Controlli di acquisizione".
    3. Selezionare la scheda "Configurazione serie Z" (assicurare tutte le altre schede sono deselezionato).
    4. Durante la scansione in tempo reale, si concentrano per la parte superiore del campione e premere il pulsante "Top".
    5. Focus di fondo del campione e premere il tasto "basso".
    6. Ingresso dimensione richiesta passo (o premere il tasto ottimizzato dimensione del passo).
    7. Press la "Esegui ora".
    8. Salva risultanti Z-stack come individuo Tiff pile di immagini (1 fluorocromo per immagine Z-stack).
  9. Usa immagine Z-stack per ricostruire le regioni volume 3D di interesse utilizzando il software di analisi 3D (ad es., Utilizzando Imaris x64 7.2.3 come descritto di seguito).
    1. Avviare il software di analisi.
    2. Scegliere il pulsante "Surpass" nella barra degli strumenti per la generazione di volume 3D.
    3. Aprire prima Z-stack immagine a colori (ad es., DAPI).
    4. Utilizzare lo strumento 'aggiungi canale' per aggiungere canali di colori aggiuntivi, un canale per ogni fluorocromo. Così un campione contenente sia DAPI e Alexa Fluor 594 fluorocromi richiederà due canali.
    5. Utilizzare lo strumento "Proprietà Immagine" per impostare le dimensioni corrette pixel (voxel) (XYZ), determinato in 4,7 sopra.
    6. Utilizzare lo strumento "Regolazione Display" per modificare i colori di canale, se necessario (ad esempio, impostare il canale DAPI al blu, Alexa Fluor 594 canale rosso).
    7. per Posizione il volume 3D nella finestra dell'immagine, utilizzare il mouse del computer per fare clic e trascinare il volume, come richiesto.
    8. Utilizzare lo strumento "Snapshot" nella barra degli strumenti per generare i colpi di schermo dell'immagine 3D.
    9. Utilizzare lo strumento "Animazione" nella barra degli strumenti per generare i film di rotazione 3D campione.

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Representative Results

Tutto spessore dorsali biopsie cutanee di topi di tipo selvatico adulti sono stati chiariti, macchiato con un anticorpo vincolante marcatore dei cheratinociti basali Keratin14 (K14), e nuclei sono stati di contrasto con soluzione colorante DAPI (Figura 2 e Movie 1).

Nuclei DAPI-positivi erano visibili in tutto il campione (Figura 2A, C), e K14 colorazione era visibile esclusivamente nello strato basale massiccio cellule dell'epidermide interfollicolare e illustrando le ghiandole sebacee (asterischi neri), le guaine radice esterne di follicoli piliferi, e nei germi capelli secondari (Figura 2b, C), come precedentemente pubblicati 9. Intensità di colorazione K14 è stata elevata nell'epidermide interfollicolare, il follicolo pilifero distale e germi capelli secondari (asterischi bianchi), ed è stato relativamente basso nella zona rigonfiamento del follicolo pilifero (Bu nella Figura 2C). Le papille dermiche erano anche visibl chiaramentee attraverso l'etichettatura DAPI (freccia in Figura 2C).

Per visualizzare le cellule proliferanti, pieno spessore biopsie cutanee dorsale in telogen di tipo selvatico topo adulto sono stati chiariti e colorati con un anticorpo anti-Ki67 e nuclei sono stati di contrasto con soluzione DAPI (figura 3, e Movie 2).

Cheratinociti proliferanti sono stati rilevati nell'epidermide interfollicolare basali (IFE in Figura 3C), e nell'istmo (Is in Figura 3C) dei follicoli piliferi, ma non nella regione di rigonfiamento (Bu in Figura 3C).

Per visualizzare ghiandole sebacee, pieno spessore biopsie cutanee dorsale in anagen di tipo selvatico topo adulto sono stati chiariti e colorate con Nile Red che etichetta il contenuto di grassi di sebociti, e nuclei sono stati di contrasto con soluzione colorante DAPI (figura 4 e Movie 3). sebaceou Nile Red-positivis ghiandole state osservate nella regione istmo di follicoli piliferi (SB in Figura 4C), mostrando che il protocollo CUBIC non influenza significativamente la morfologia di queste strutture contenenti grassi. Inaspettatamente, fusto del capello sono stati etichettati con Nile Red (HS nella Figura 4C).

Per visualizzare i cambiamenti morfologici nell'epidermide di YAP2-5SA-ΔC topi transgenici che esprimono una proteina iperattivo YAP mutante nei cheratinociti basali 8, completo spessore della pelle dorsale biopsie di tipo selvatico adulti e topi transgenici littermate YAP2-5SA-ΔC sono stati chiariti e colorati con il anticorpo anti-K14, e nuclei sono stati di contrasto con soluzione DAPI (Figura 5, e Movie 4 (tipo selvatico) e Movie 5 (YAP2-5SA-ΔC)).

Nella pelle transgenica YAP2-5SA-ΔC, l'iperplasia dell'epidermide interfollicolare (doppie frecce alto nella Figura 4F figura 5F), che rappresentano le popolazioni di cellule staminali allargate, come descritto in precedenza 8.

Figura 1
Figura 1: Preparazione di sezione Imaging. A: materiali di consumo necessari per la preparazione della camera di imaging sono blu tack, pasta del gioco o simili, e 2 coprioggetto (24 x 50 mm). B: preparare due sottili strisce di virata blu (diametro di circa 2 mm x 2 cm), e due coprioggetto C:. Luogo strisce blu virare su un vetrino, consentendo spazio sufficiente per la biopsia cutanea. Posizionare la biopsia della pelle in una goccia di soluzione CUBIC2 tra le due strisce D:. Luogo secondo vetrino su strisce dell'aderenza blu per coprire la biopsia cutanea. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

figura 2
Figura 2: Etichetta ing K14 / DAPI di dorsale della pelle in telogen di topi adulti di tipo selvatico ricostruzione del volume 3D di una biopsia della pelle dorsale in telogen di un topo adulto di tipo selvatico marcato con un anticorpo K14 (rosso in B, C) ​​e DAPI di contrasto nucleare. (blu in a, C). K14 colorazione è forte nell'epidermide interfollicolare (IFE), l'istmo e le ghiandole sebacee (asterischi neri), e germi capelli secondari (asterisco bianco), e relativamente basso nel rigonfiamento zona (Bu). Scala bar 50 micron. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 3
Figura 3:. Ki67 Etichettatura di dorsale della pelle in telogen di adulti Wildtype topi ricostruzioni volume 3D di una biopsia della pelle dorsale di un topo adulto di tipo selvatico marcato con un anticorpo Ki67 (rosso in B, C) ​​e DAPI di contrasto nucleare (blu in A, C). Proliferanti Ki67-positivo cheratinociti sono evidenti nell'epidermide interfollicolare basali (IFE), e nella regione dell'istmo (Is), ma non nel rigonfiamento (Bu) del follicolo pilifero telogen. Scala bar 50 micron.rget = "_ blank"> Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 4
Figura 4: Nile Red colorazione di dorsale della pelle in Anagen di topi adulti di tipo selvatico ricostruzione del volume 3D di una biopsia della pelle dorsale in anagen di un topo adulto di tipo selvatico marcato con Nile Red (rosso in B, C) ​​e DAPI di contrasto nucleare (blu. A, C). Nile Red colorazione è visibile nelle sebociti (SB) e nel fusto del pelo (HS). Scala bar 50 micron. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

Figura 5

figura5: morfologica anomalie nel YAP2-5SA-ΔC epidermide ricostruzioni volume 3D di biopsie cutanee dorsale di tipo selvatico adulto (A - C) e topi transgenici littermate YAP2-5SA-ΔC (D - F) marcate con un anticorpo K14 (rosso. B, C, e, F), e DAPI di contrasto nucleare (blu in a, C, D, F). L'iperplasia epidermica dell'epidermide YAP2-5SA-ΔC è evidente nell'epidermide interfollicolare (doppie frecce migliori in F) e nei follicoli dei capelli, che visualizzano le masse di cellule staminali / progenitrici caratteristici prossimale (frecce doppie inferiori a F) 8. Scala bar 50 micron. Clicca qui per vedere una versione più grande di questa figura.

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Movie 5

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Discussion

I meccanismi regolatori che controllano lo sviluppo della pelle e l'omeostasi sono più comunemente studiate in 2D utilizzando il sezionamento del tessuto e la colorazione istologica o l'etichettatura con anticorpi, che consente solo un apprezzamento limitato di morfologia della pelle, le popolazioni di cellule o di espressione della proteina. Sono stati sviluppati numerosi metodi per migliorare la visualizzazione della organizzazione spaziale delle cellule e proteine ​​a risoluzione singola cellula in 3 dimensioni in epidermiche interi supporti 10-13. Alcuni di questi però coinvolgono la separazione dell'epidermide dal derma, che è tecnicamente impegnativo soprattutto utilizzando pelle pelosa, e spesso si traduce in danni ai tessuti e la rottura dei follicoli piliferi. Inoltre, la separazione di epidermide e derma danneggia studio delle interazioni cellulari e molecolari che si verificano tra di loro durante lo sviluppo embrionale e l'omeostasi dei tessuti.

L' 'approccio di montaggio flat' è un altro metodo in cui il mouse a tutto spessorela pelle è sezionato e immunostained, e poi ha chiarito utilizzando benzilico benzoato e alcol benzilico (BBBA) pur conservando i segnali di immunofluorescenza 14. Questo metodo non richiede la separazione tecnicamente impegnativo l'epidermide dal derma. Tuttavia, BBBA è altamente tossico, si denatura alcune proteine ​​fluorescenti, e contamina obiettivi del microscopio, non permettendo per l'imaging ad alta risoluzione dei campioni necessari per investigare le interazioni cellulari e molecolari nel tessuto.

Questo rapporto descrive un protocollo CUBIC 5-7 per chiarire pieno biopsie cutanee spessore del mouse da qualsiasi regione anatomica desiderata ed età che utilizzano reagenti relativamente sicuri ed economici. Questo tecnicamente semplice protocollo permette la visualizzazione di proteine ​​di espressione e di proliferazione modelli mediante immunofluorescenza in tutto spessore biopsie cutanee di contrasto con DAPI in tre dimensioni con una risoluzione di singola cellula, consentendo senza precedenti e di alta precisione qualvalutazione luni e la quantificazione di espressione della proteina, la proliferazione, la morfologia dei tessuti e delle dimensioni del follicolo pilifero. Questo metodo è adatto anche per la visualizzazione di sebociti utilizzando Nilo Red colorazione nonostante la rimozione dei lipidi del tessuto durante la procedura chiarimento. Un importante limitazione di questo metodo è la disponibilità di anticorpi leganti efficiente e permettendo la visualizzazione dei rispettivi proteine ​​bersaglio che utilizza questo processo di chiarificazione pelle. Inoltre, i file di immagini e film generati sono di grandi dimensioni, e buone risorse IT, come i computer con processori potenti e spazio di archiviazione dati sono essenziali ampio.

Un punto critico nella procedura è la preparazione delle biopsie cutanee. Per visualizzare intatta l'anatomia del follicolo pilifero, l'orientamento della biopsia cutanea dovrebbe essere presa in considerazione, e la lunghezza delle biopsie deve essere tagliato parallelamente alla direzione della lunghezza dei follicoli piliferi. Inoltre, piccolo e molto sottile scin biopsie sono difficili da montare correttamente per microscopia. biopsie più grande avrà bisogno di più tempo per cancellare, e possono incorrere in problemi di penetrazione degli anticorpi conseguente manufatti rilevazione dell'antigene. E 'quindi consigliabile tagliare, chiaro e macchia biopsie multiple per ogni esperimento.

E 'anche importante ermeticamente sigillare i tubi durante la preparazione delle soluzioni CUBICHE per evitare l'evaporazione del contenuto durante il processo di riscaldamento, che si traduce in cambiamenti nelle concentrazioni dei reagenti e può causare compensazione tessuto compromessa. Il prossimo passo importante è che il tessuto sarà chiarito a 37 ° C per accelerare il processo di compensazione. Dopo 7 giorni, la soluzione CUBIC1 dovrà essere preparato fresco per sostituire quello vecchio.

In futuro, saranno identificate più anticorpi che sono compatibili con la procedura di chiarimento pelle cubi, e le analisi possono essere estesi ad visualizzazione e quantificazione dei epidermica e melanociti marker delle cellule (staminali)S e del derma proteine. Questa tecnica svolgerà inoltre un ruolo fondamentale negli studi 3D di patologia della pelle e anatomia, e l'aiuto nella delucidazione dei meccanismi cellulari e molecolari alla base anomala e normale biologia epidermica in pelle di topi mutanti e modelli giornalista topo transgenico, tra cui segnalazione interazioni tra il derma e l'epidermide.

Il protocollo CUBIC 5-7 è probabile che sia applicabile per la pelle di altri modelli animali vertebrati, e per biopsie pelle umana. La microscopia foglio di luce permetterà la visualizzazione di epidermica anatomia, pattern di espressione delle proteine, e la progressione delle fasi del ciclo di capelli follicolo in campioni di pelle di grandi dimensioni.

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Disclosures

Gli autori non hanno nulla da rivelare.

Acknowledgments

Ringraziamo australiano Bio-Resources (Garvan Institute, Australia), il Centro di Risorse Biologiche (UNSW Australia) e la cura degli animali e del Comitato Etico per il supporto con la sperimentazione animale. Questo lavoro è stato sostenuto dal National Health and Medical Research Council of Australia (sovvenzione di progetto APP1062720). Dr. Cesar P. Canales è destinatari di una borsa di studio CONICYT-Becas Cile (# 72.101.076). Mr. Bassem Akladios è un destinatario del Premio Internazionale dell'Università Postgraduate da UNSW Australia.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
Paraformaldehyde Sigma-Aldrich  P6418
Ethanol 96% (undenaturated) Chem-supply UN1170
Nile Red Sigma-Aldrich  72485-100MG
4’,6-diamidino-2-phenylindole (DAPI) Roche 10236276001
N,N,N’,N’-tetrakis (2-hydroxypropyl) ethylenediamine Merck Millipore 821940
Polyethylene glycol mono-p-isooctylphenyl ether Merck Millipore 648462
Triton X-100 Merck Millipore 648462
Sucrose Sigma-Aldrich  S0389
Optimal Cutting Temperature (OCT) Compound Tissue-Tek 4583
anti-Keratin14 antibody Covance PRB-155P
anti-Ki67 antibody  Abcam ab16667
Donkey anti-rabbit Alexa 594 Life Technologies A21207
Dimethylsulfoxide Sigma-Aldrich  D2650
Urea Merck Millipore 66612
2,2′,2′’-nitrilotriethanol Merck Millipore 137002
Confocal Microscope Nikon Instruments Inc Nikon A1 - Confocal Microscope
cruZer6 Face Trimmer Braun Braun cruZer6 Face
Sodium azide Sigma-Aldrich  438456

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References

  1. Fuchs, E. Scratching the surface of skin development. Nature. 445 (7130), 834-842 (2007).
  2. Watt, F. M., Lo Celso, C., Silva-Vargas, V. Epidermal stem cells: an update. Curr Opin Genet Dev. 16 (5), 518-524 (2006).
  3. Hardy, M. H. The secret life of the hair follicle. Trends Genet. 8 (2), 55-61 (1992).
  4. Lim, X., Nusse, R. Wnt signaling in skin development, homeostasis, and disease. Cold Spring Harb Perspect Biol. 5 (2), (2013).
  5. Susaki, E. A., et al. Whole-brain imaging with single-cell resolution using chemical cocktails and computational analysis. Cell. 157 (3), 726-739 (2014).
  6. Susaki, E. A., Tainaka, K., Perrin, D., Yukinaga, H., Kuno, A., Ueda, H. R. Advanced CUBIC protocols for whole-brain and whole-body clearing and imaging. Nat Protoc. 10 (11), 1709-1727 (2015).
  7. Tainaka, K., et al. Whole-body imaging with single-cell resolution by tissue decolorization. Cell. 159 (4), 911-924 (2014).
  8. Beverdam, A., Claxton, C., Zhang, X., James, G., Harvey, K. F., Key, B. Yap controls stem/progenitor cell proliferation in the mouse postnatal epidermis. J Invest Dermatol. 133 (6), 1497-1505 (2013).
  9. Fuchs, E., Green, H. Changes in keratin gene expression during terminal differentiation of the keratinocyte. Cell. 19 (4), 1033-1042 (1980).
  10. Braun, K. M., Niemann, C., Jensen, U. B., Sundberg, J. P., Silva-Vargas, V., Watt, F. M. Manipulation of stem cell proliferation and lineage commitment: visualisation of label-retaining cells in wholemounts of mouse epidermis. Development. 130 (21), 5241-5255 (2003).
  11. Hamilton, E., Potten, C. S. Influence of hair plucking on the turnover time of the epidermal basal layer. Cell Tissue Kinet. 5 (6), 505-517 (1972).
  12. Morris, R. J., Fischer, S. M., Slaga, T. J. Evidence that a slowly cycling subpopulation of adult murine epidermal cells retains carcinogen. Cancer Res. 46 (6), 3061-3066 (1986).
  13. Schweizer, J., Marks, F. A developmental study of the distribution and frequency of Langerhans cells in relation to formation of patterning in mouse tail epidermis. J Invest Dermatol. 69 (2), 198-204 (1977).
  14. Chang, H., Wang, Y., Wu, H., Nathans, J. Flat mount imaging of mouse skin and its application to the analysis of hair follicle patterning and sensory axon morphology. J Vis Exp. (88), e51749 (2014).

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Biologia Cellulare Numero 114 la pelle l'epidermide cubico 3D imaging confocale mouse
Protocollo CUBIC Visualizza lo espressione della proteina a risoluzione singola cella di intere preparazioni della pelle Mount
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Liang, H., Akladios, B., Canales, C. More

Liang, H., Akladios, B., Canales, C. P., Francis, R., Hardeman, E. H., Beverdam, A. CUBIC Protocol Visualizes Protein Expression at Single Cell Resolution in Whole Mount Skin Preparations. J. Vis. Exp. (114), e54401, doi:10.3791/54401 (2016).

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