Introduction
MSは、ミエリンに向けられた自己免疫応答によって駆動されると考えられているCNSの慢性炎症および神経変性によって特徴付けられるヒト疾患です。時間の経過とともにミエリンおよび軸索の損失は、認知および運動機能1の緩やかな衰退につながります。 「実験的自己免疫性脳脊髄炎」は、CNSミエリンに向け自己免疫疾患の動物モデルのための包括的な用語です。ヒトMSと同様に、EAEは、典型的には、CNSの免疫細胞の浸潤を特徴とし、場合によっては、脱髄2れます。しかし、任意のEAEモデルは、部分的に人間のMSに似ている度合いは、使用される種または株に、基礎となる抗ミエリン自己免疫応答の複雑さによって異なります。
抗ミエリン自己免疫は実験的に、いくつかの方法で誘導することができるが、今日使用される最も一般的な方法は、免疫優性CD4を模倣するアミノ酸の短いペプチドでマウスを免疫化することです
EAEを誘導するために、より大きなタンパク質抗原を使用することの利点にもかかわらず、そのようなタンパク質のいくつかの市販の供給源が残ります。 MOG 35-55のような短いペプチドは、非常に迅速かつ比較的安価に合成することができるが、実際に、MOGタンパク質を商業オプション購入に限定されず、コスト実質的です。それにもかかわらず、MOGの細胞外ドメイン（MOG 1-125に ）自分自身を生成するために、研究グループのために利用可能ないくつかの発現ベクターがあります。 HoweveR、我々は文献で同定した発現系の全てを、以降、より効率的な発現系7で置換されている古い技術に基づいています。また、大部分はラットまたはヒトMOG 8に基づいています。マウスにおける自己免疫のいくつかの研究では、マウスMOG自己抗原に基づいて抗原が好ましいです。最後に、コマーシャルまたは発現ベクターのいずれかと、我々が同定したすべてのMOG系タンパク質は、MOG 1-125ベースに追加のアミノ酸を含む融合タンパク質です。これらは、同様に私たちは識別できなかった機能を備えているの多くを精製するためのタグと通常は他の配列が含まれます。
これらの制限に対処するために、我々は、MOGタンパク質5の既知の不溶性に対処するためにチオレドキシンを含むタグに融合したマウスMOGの細胞外ドメインに基づく新規な融合タンパク質を生成しました。タグ配列はまた、精製およびTEVプロテアーゼCLE用の6xHis配列を含みます必要に応じて、すべてのタグ配列を完全に除去することが可能avageサイト。これは、我々が純粋なMOG 1-125蛋白質を生成するの知っている唯一の方法です。タンパク質の大量生産を容易にするために、MOG 1-125配列を細菌発現のためにコドン最適化し、MOG タグ融合タンパク質は、PET-32発現系に挿入しました。ここでは、最も免疫学研究所で使用可能な非専門的な装置を使用して、詳細にMOG タグタンパク質を生成し精製するプロトコル、及び純粋MOG 1-125を記述する。
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Protocol
1.タンパク質誘導
注：以下の手順で、BL21 大腸菌細菌はMOG タグ融合タンパク質のための配列を含有するpET-32ベクターで形質転換された高密度まで増殖され、次いで、MOG タグタンパク質を発現するように誘導されている（参考文献5及び図1参照） 。日は概算と代替ストップポイントはプロトコールに記載されていていることに注意してください-全体的なタイムラインについては、 図2を参照してください。精製されたpET-32 MOG タグベクターDNAで開始した場合、化学的コンピテントBL21 大腸菌に変換する必要があります9十分に説明したように、アンピシリン選択を用いて、 大腸菌の細菌。成功した形質転換は、制限で消化し、続いて、標準的な市販のキットを使用して、選択された細菌からDNAを精製することにより確認することができるAGE1及びSAC1をアガロースゲル10上で424 bpのバンドを生成する酵素。
- 次の日の準備のために37℃のインキュベーターで滅菌LBブロス500 mlを含む2 1 L三角フラスコを置きます。
- ステップ1.2（最終濃度0.1mg / mlのアンピシリン）から500ミリリットルのLBを含むフラスコのそれぞれに100ミリグラム/ mlのアンピシリンを500μlを追加します。 LBブロスの2つのフラスコのそれぞれにステップ1.1から一晩培養物の1ミリリットルを転送します。 37℃でインキュベートし、200rpmで5時間または0.6の光学密度まで。
- フラスコの1から1 1ミリリットルのアリコートを取り、別の1.5ミリリットル遠心管にそれを転送します。 1分間16,000×gで細胞をペレット化し、上清を除去します。 T 0（プレ誘導）などのチューブにラベルを付け、その後に細菌ペレットを入れて-20将来のドデシル硫酸ナトリウムポリアクリルアミドゲル電気泳動（SDS-PAGのための℃の冷凍庫E）解析（セクション8および図3を参照）。
- 各培養フラスコに1 Mイソプロピルβ-D-1-チオガラクトピラノシド、イソプロピルβ-D-チオガラクトシド（IPTG）の0.5ミリリットルを追加します。一晩75 rpmで室温で、その後、37℃、4時間、200 rpmでフラスコをインキュベートします。
2.収穫MOG タグプロテイン
注：この段階では、細菌は、MOG タグタンパク質を大量に生産しているであろう。 MOG タグを収集するために、細菌は、まず、超音波処理、続いてトリトンX-100緩衝液中で溶解されます。 MOG タグは、その後、MOG タグタンパク質を含む粗タンパク質溶液を得、封入体から放出され、イミダゾールおよびグアニジンで変性されています。
- ステップ1.5から一晩培養の1から1 1ミリリットルのアリコートを取り、1.5 mlのマイクロ遠心チューブにそれを転送します。 1分間16,000×gで細胞をペレット化し、上清を除去します。浴槽にラベルを付けますE T O / N（誘導後）は、その後、-20将来のSDS PAGE分析のための℃の冷凍庫（ 図3）に細菌ペレットを入れます。
- 高速遠心分離と互換性の250ミリリットル瓶の中で均等に文化を配布し、この時点から氷上にこれらを保ちます。 4℃で15分間22,000×gで細菌細胞をペレット化。
- 上清を捨てます。 -20℃で細菌ペレットを保存するか、2.4に進みます。
- トリトンX-100の60μlの50 mg / mlで鶏卵リゾチームの120μLを加えることによって、溶解緩衝液（0.1mg / mlの鶏卵リゾチーム、0.1％のTriton-X（v / v）のリン酸緩衝生理食塩水（PBS））を準備しますPBSの60 mLまで原液。
- 再懸濁し、溶解緩衝液を30mlの総ステップ2.3からの細菌ペレットのすべてを組み合わせて。高速遠心分離が可能な丸底50mlチューブにこのボリュームを転送します。 30分間、30℃の水浴中で、このチューブを置きます。インキュベーション時間の間、チューブを振ります二回細胞を再懸濁します。
- インキュベーション後、氷の上にチューブを転送し、20 kHzの、振幅70％、3秒、3秒オフパルス、およびラウンドあたり5パルス上のパルスで溶液を超音波処理します。 6総ラウンドのためのソリューションを超音波処理し、溶液がラウンドで、間に氷上で冷却します。
- 遠心分離機4℃で15分間、24,000×gでソリューションを提供します。上清を捨て、ステップ一度2.5から2.7を繰り返します。 -20℃でペレットを保存するか、2.8に進みます。
- 100mLのビーカーにNaClを0.8766 gのトリス-HCl 0.09456 g及びイミダゾール0.01021グラム添加することによって、バッファーA（500mMのNaCl、20mMのトリス-HCl、5mMのイミダゾール、pHは7.9）を準備します。体積28ミリリットルに達するまで、7.9まで、溶液のpHをH 2 Oを加えます。その後、100ミリリットルの解決策を転送するメスシリンダー、ボリュームが30ミリリットルになるまでH 2 Oを追加します。
- 緩衝液A 30mlにステップ2.7からペレットを再懸濁し、3時間、4℃でこの溶液をインキュベートします。この時間の間にグアニジン-HClの17.2グラムを量ります。
- ステップ2.6の場合と同じ設定を使用して、氷の上でソリューションを超音波処理します。次いで、溶液に塩酸グアニジンの17.2グラムを追加します。 MOG タグタンパク質を可溶化するために、氷上で1時間、これをインキュベートします。
- 遠心分離機4℃で30分間、24,000×gでソリューションを提供します。上清を収集し、タンパク質精製まで4℃で上清を保存します。
3.タンパク質精製
注：MOG タグタンパク質は、溶出（Hisタグを介して）に帯電したニッケル樹脂に吸収の4ラウンドを通して精製されるであろう次の手順で。
- 以下の緩衝液を作成します。
- 緩衝液B（500mMのNaCl、20mMのトリス-HCl、5mMイミダゾール、6 Mグアニジン-HCl、pHは7.9）を準備します。 500ミリリットルのビーカーに、NaClの5.844グラム、トリス塩酸の0.6304グラム、イミダゾールの0.0681グラム、および114.64グラムグアニジン-HClを追加します。そして、それが190ミリリットルになるまでH 2 Oを追加し、7.9にpHを調整します。ゾルを転送250ミリリットルのutionは、メスシリンダー、ボリュームが200ミリリットルになるまでH 2 Oを追加します。
- 溶出バッファー（500mMのNaCl、20mMのトリス-HCl、0.5 Mイミダゾール、6 Mグアニジン-HCl、pHは7.9）を準備します。 500 mLビーカーに、NaClの5.844グラム、トリス塩酸の0.6304グラム、イミダゾールの6.808グラム、および114.64グラムグアニジン-HClを追加します。それが190ミリリットルになるまでH 2 Oを追加し、7.9にpHを調整します。 250ミリリットルにソリューションを移しメスシリンダー、ボリュームが200ミリリットルになるまでH 2 Oを追加します。
- ストリップバッファー（500mMのNaCl、20mMのトリス-HCl、100mMのEDTA、pHは7.9）を準備します。 500 mLビーカーに、NaClの5.844グラム、トリス塩酸の0.6304グラム、40ミリリットルの500mM EDTAを追加します。それが190ミリリットルになるまでH 2 Oを追加し、7.9にpHを調整します。 250ミリリットルにソリューションを移しメスシリンダー、ボリュームが200ミリリットルになるまでH 2 Oを追加します。
- チャージバッファー（0.1 M硫酸ニッケル）を準備します。 500ミリリットルビーカーに5.257グラムの硫酸ニッケルを追加し、190ミリリットル（注意に達するまでH 2 Oを追加し、ニッケルを処理しませんヒュームフードの外側の硫酸ニッケル、硫酸は、H 2 O中に溶解されるまで）。硫酸ニッケルが溶解した後、250ミリリットルにソリューションを転送シリンダーを卒業し、体積が200ミリリットルになるまでH 2 Oを追加します。
- 4,500×gで（各チューブ5 ml）の上に遠心力に耐えることが可能な2コニカル50ml遠心管の間ニッケル樹脂10mlの分割。
- 充電およびニッケル樹脂を平衡化：
- 40ミリリットルのH 2 O樹脂を含む各チューブに添加することにより、樹脂を洗浄します。ロッカーの上に水平にチューブを置き、それらを4℃で5分間攪拌しましょう。一度、4℃で8分間、4500×gで、遠心管を終えました。
- ペレットを乱さないためにピペットで上清を捨てます。各チューブにチャージバッファの40ミリリットルを追加します。ロッカー上にチューブを移し、それらを4℃で15分間攪拌しましょう。一度、4℃で8分間、4500×gで、遠心管を終えました。
- オプション：ステップ2.11に回収可溶化タンパク質の150μLを取り、1.5 mlのマイクロ遠心チューブに移します。プレインキュベーションのようなチューブにラベルを付け、将来のSDS PAGE分析のために-20℃で、これを凍結する（ 図3、原油MOG タグ ）。
- MOG タグタンパク質を精製：
- 、ステップ3.3からのニッケル樹脂を含む第1のチューブ（ 図2、チューブ1）に（〜40ミリリットル、マイナスステップ3.4で削除少量のサンプルを）ステップ2.11から可溶化タンパク質のボリューム全体を移し混合し、ロッカー上に水平に置きます1時間4℃で。
- 4℃で8分間、4500×gでチューブを遠心。完成したら、第二に上清を移しますチューブ（ 図2、チューブ2）ニッケル樹脂の、前のステップで説明したようにインキュベートします。一方で、チューブ1と、以下の6のステップ3に進みます。
- 溶出緩衝液40mlにチューブ1中のニッケル樹脂を再懸濁し、4℃で5分間ロッカー上に水平にチューブを配置します。その後、4℃で8分間、4500×gでチューブを遠心します。
- 「精製されたMOG タグタンパク質」の標識250ミリリットル瓶に溶出したMOG タグタンパク質を含有する上清を移し、4℃で、このボトルを保持します。各溶出段階では、この瓶の中で得られた上清をプールします。
- ニッケル樹脂にストリップバッファの40ミリリットルを加え、4℃で5分間ロッカー上に水平に配置します。
- 4℃で8分間、4500×gでチューブを遠心。ステップ3.3に記載されているニッケル樹脂を充電、その後、上清を捨てます。
- いったん終了し、ステップ3.5に記載されているように、第二の管を進めます。 4ラウンドの合計希望、追加のタンパク質が吸収および溶出のさらなるラウンドで回収することができれば、帯電したニッケル樹脂および溶出へのステップ2.11から可溶化タンパク質の吸収のsが、けれども、タンパク質のほとんどを回復します。
- 吸収および溶出の4（またはそれ以上）のラウンドが完了したら、一晩4℃でプールされた精製タンパク質を格納します。それが再び必要になるまでニッケル樹脂は、4℃で20％のエタノール溶液40mlに格納することができます。
4.タンパク質濃度を測定
注：さらに進む前に、この値は、プロトコルの終了時に、タンパク質を濃縮するために、最終的な体積を決定するために使用される部3で生成された精製されたMOG タグタンパク質の量を定量化することが必要です。ここでは、標準的なブラッドフォードアッセイを説明します。精製されたMOG タグタンパク質の濃度を連続dilutの分光吸光度を比較することによって決定されます既知の濃度のウシ血清アルブミン（BSA）の標準曲線とED MOG タグタンパク質。
- 3リットルのビーカー8.2グラムの酢酸ナトリウム、23 mlのに氷酢酸を添加することにより10倍の酢酸緩衝液を作り、次いで、酢酸ナトリウムを溶解し、H 2 Oの1.9 Lを加えます。 2 Lに、このソリューションを移しメスシリンダー、ボリュームが2 Lに達するまで、次に室温で2 Lボトルに保管し、H 2 Oを追加します。 H 2 O 900μlに10倍の酢酸緩衝液100μlを添加することにより、1×酢酸緩衝液1mlを行います
- G9に井戸G2-8と60μlに1×酢酸緩衝液30μlを添加することにより、希釈液用の96ウェルプレートを設定します。 H2およびH3に1×酢酸緩衝液の48μLを加えます。
- 1×酢酸緩衝液の216μlを、よくG1で市販の2mg / mlのBSA標準の54μLを加え、よく混ぜ、次のように行GにおけるBSA標準の最初の連続希釈を設定します。 、よく混ぜ、よくG1からもG2に210μLを加えますそしてその後もG3によくG2の180μlを添加します。 、よくG4によくG3の150μLを加えよく混ぜ、よくG8まで後続の各ウェルに30μlの少ないを追加するこの傾向を続けています。 （同等の希釈因子のリストについては、 表1を参照）。
- 井戸A1、B1、およびC1によくG1の10μLを転送することにより、各希釈の三重のサンプルを設定し、ウェルA2、B2、およびC2によくG210μlの、というように。マルチチャンネルピペットを使用してください。
- MOG タグの希釈液を設定するには、ステップ3.6からよくH1に精製されたMOG タグタンパク質の60μlを添加します。 （これは1×H1で希釈、H2で1/5希釈、およびH3で1/25希釈を生産）完全に混合し、その後もH3によくH2の12μlを添加、よく混ぜ、ウェルH2にH1から12μlを添加します。
- ステップ4.4で説明したように、列D、E、およびFに、ウェルH1〜H3の10μLを転送することにより、MOG タグ希釈のための三重のサンプルを設定します。
- タンパク質アッセイ色素を2mlを混合H 2 Oの8ミリリットルと試薬の濃縮物利用可能な場合、マルチチャンネルピペットを使用して、列A、B、C、D、E、及びF内のすべてのプレロードのウェルにこの混合物の200μLを加えます。タンパク質濃度を読み取る前に針を使用してウェル内の気泡を開きます。
- 色素試薬を添加する10分以内に、行A、B、C、D、E、およびF内のすべてのウェルの595 nmの吸光度を測定
- 位置1-9が0.4、0.35、0.3、0.25、0.2、0.15、0.1、0.05、および0 mg / mlでBSAに対応し、標準曲線を設定する行A、B、およびCを使用してください。この曲線に基づいて、最高の標準曲線にフィットMOG タグの希釈を使用して、MOG タグタンパク質の濃度を算出。通常、ここに記載されているプロトコルを使用して細菌培養液1 LからMOG タグタンパク質の200〜250ミリグラムがあります。
注：MOG 1-125がプロトコルの最後に記載されているオプションのセクション7に、ここから進行させるために。それ以外の場合は、セクション5に進みます。
注：透析は徐々にタンパク質をリフォールディングすることを可能にする精製、変性MOG タグを含む溶液からのグアニジンを除去します。 MOG自体は非常に不溶性であり、そしてこれはチオレドキシンタグの存在によって改善される一方で、まだ溶液から出てくるしやすいようにケアは、このステップの間に採取されなければなりません。したがって、リフォールディングは徐々に比較的低いMOG タグ濃度で行われるべきです。
- 濃度部4で算出されたMOG タグの量に基づいて、0.5ミリグラム/ ml以下になるまで、透析を開始する前に、緩衝液B（ステップ3.1に記載されているとすることができる緩衝液B）を用いて精製したMOG タグタンパク質を希釈します。
- 蛇皮の透析チューブの約30センチカットし、3回にわたるヘビ皮の端を折り曲げると止血剤との折り畳まれた端部をクランプすることによってロック止血剤で一端を固定します。希で蛇を埋めますMOG タグタンパク質その後開放端部からそれらを強制することにより、蛇から気泡を除去（チューブあたりMOG タグタンパク質の60〜90ミリリットルの間）。最後に、第二のロック止血剤を使用して、チューブのもう一方の端をシールします。
- すべてのMOG タグタンパク質まで、透析チューブの追加セクションを埋めるための手順を繰り返し5.2は、蛇の透析チューブに転送されています。漏れがないことを確認してください。
- グアニジン-HClの382.12グラムを秤量し、2リットルのビーカーにステップ4.1で行われた10倍の酢酸緩衝液の100ミリリットルを追加することで、4 Mグアニジンと1xの酢酸を加えます。ビーカーにH 2 Oの0.5 Lを追加し、グアニジンHClを溶解させます。溶解後、1Lにソリューションを転送メスシリンダー、ボリュームが1 L.が必要とされる全ての2 snakeskinsためのこのレシピを繰り返し達するまでH 2 Oを追加します。
- 次のように透析を実行します。ステップ5.4から4 Mグアニジンと1xの酢酸緩衝液1Lで大きなバケツ（最小10 L）を記入してください。トンを置きますバケツにMOG タグを含む透析チューブの2セクションO、底に妨害されずに回転させる磁気攪拌棒の余地を残します。磁気撹拌プレート上で4℃の部屋にバケツを置き、（ すなわち 、高い流体を移動させるだけで十分ではありません）遅い回転速度にそれをオンに：
注：徐々にバッファにグアニジンの量を減らすために、次の手順を実行します。攪拌時間は最小値として与えられているが、一晩放置することができます。透析は、3日以上かかりますが、必要に応じてこれを拡張することができます。定期的にチューブが無傷であると端部がしっかりと閉じていることことを確認してください。- バケットが座って、4-5時間撹拌してみましょう。
- 各バケットに1×酢酸緩衝液（100ミリリットル10倍の酢酸バッファー及びH 2 Oの900ミリリットル）の1 Lを追加します。
- 繰り返しは、5.5.1と5.5.2バケット内のバッファの4 Lの合計3回の合計を繰り返します。
- （1バケットにバッファの半分を捨て、1×酢酸緩衝液1Lで補充00ミリリットル10倍の酢酸バッファー及びH 2 Oの900ミリリットル、無グアニジン）とチューブと撹拌棒を設定します。
- 繰り返しは一度5.5.1と5.5.2ステップ（ すなわちバケット内のバッファの4 Lの合計があるまで）。
- 最後に、新鮮な1×酢酸緩衝液の4 Lとバケツで全体4 Lのボリュームを交換し、4-5時間攪拌してみましょう。最良の結果を得るために、タンパク質濃度の日に、この手順を実行します。
- 慎重にリフォールディングMOG タグを持つ透析チューブを削除して、バケットバッファを破棄。
6.集中MOG タグプロテイン
注：最後のステップでは、リフォールディングMOG タグタンパク質を格納するための作業希釈液に濃縮します。 MOG タグは非常に不溶性であるように、それは5 mg / mlとを超えてはなりません。完全フロイントadjuvで1：この濃度は、一般的に、マウスにおいてEAEを誘導するために使用される0.4 mg / mlでMOG 35-55ペプチド、（混合1とほぼ等モルでありますアリ（CFA））。少量のタンパク質は、白色の沈殿物の形で溶液から来るの濃縮プロセスの間、それは珍しいことではありません。過度の降水量は、しかし、問題となっています。
- セクション4で算出された値に基づいて、5 mg / mlでのMOG タグの濃度を達成するために、最終的な所望の体積を計算します。
- アルミ箔とラインパン1において、ポリエチレングリコール（PEG）3350及びPEG 8,000とアルミ箔をカバー：1の比。 PEG 3350は、それが濃縮中にタンパク質凝集を防ぐかつ有効cyropreservative 11であることができ、この混合物に組み込まれます。
- ボリュームがステップで算出された推定最終容量（以下であるまで、これは室温で座って、定期的にボリュームを確認してみましょうアルミホイルの上に（内部MOG タグタンパク質との ）蛇チューブを入れて、PEG 8000でカバー6.1）、実際の音量は、次のステップで測定されます。パンはなくなった場合濃縮プロセス中に水で過飽和は、アルミ箔とPEG 3350およびPEG 8000で新鮮なパンを設定します。
- H 2 Oでsnakeskinsの外側を洗浄し、血清学的ピペットを使用して、別のガラスボトルにMOG タグタンパク質を転送します。タンパク質は、ボリュームが正しいことを確認するために転送されるボリュームを追跡します。
- 容積が推定最終容量よりも小さくされている場合、所望の体積に達するまで、1×酢酸塩緩衝液を加えます。ボリュームは、推定最終容量を超える場合、透析チューブに戻しMOG タグタンパク質を転送し、濃度を続ける（6.2から6.3ステップ）。
- 1.5 mlチューブ（チューブ当たり0.5ミリリットル）の間でMOG タグタンパク質を配布し、必要になるまで-80℃でチューブを保存します。 CFAで1：EAEを誘導するために、このボリューム1を混ぜます。
- ステップ1で採取した試料を用いて、MOG タグタンパク質の発現を確認するためにSDS PAGEゲルを実行します。4、2.1、3.4、およびステップ6.4から精製されたMOGタンパク質。
TEVプロテアーゼを使用したMOG タグから7の生成MOG 1-125（オプション）
注：このオプションのステップは、ステップ余分なタグ配列のないMOG 1-125が必要な場合は 、タグ配列は、TEVプロテアーゼを用いて除去することができる4（ 図4）の端から継続されます。限り我々が知っているように、純粋なMOG 1-125を生成することが可能な他の発現系はありません。しかし、チオレドキシンタグなしで、MOG 1-125は非常に不溶性であることに留意すべきであり、これは、精製および取り扱い中に問題を引き起こし、そしてこの理由のための実験的な理由のために絶対に必要な場合、タグを除去することができます。いくつかのステップは、純粋なMOG 1-125を生成するために必要とされます。 MOG タグが最初TEVプロテアーゼ切断緩衝液中に透析します。 TEVプロテアーゼによる消化に続いて、ボリュームが後の精製番目に支援するために低減されEPSは、次に緩衝液B中で透析し、次いでHisタグを含むタグ配列は、ニッケル樹脂を用いて除去されます。最後に、タンパク質を定量し、純粋MOG 1-125を最終濃度まで濃縮します。
- 1.861グラムのEDTA、44.4グラムのTris-HCl、および2リットルのビーカーに26.5グラムのトリスを追加することで、10倍TEV切断緩衝液（500mMのトリス-HCl、5mMのEDTA）の1 Lにします。容量990ミリリットルに達するまでEDTAを溶解するpHを8に調整し、次いでH 2 Oを加えます。 1 Lの解決策は、メスシリンダーを転送し、H 2 Oを使用して1 Lまでのボリュームをもたらします
- ステップ3.6〜0.5 mgの希薄MOG タグタンパク質は、/ mlの説明したように120ミリリットルは、蛇の透析チューブに希釈したMOG タグタンパク質のセクションで計算されたタンパク質の量に基づいて、4転送を緩衝液B（ステップ3.1で説明したのと同じバッファ）を使用して、手順5.3〜5.2インチボリュームはMOG タグタンパク質のすべてを切断するために必要なTEVプロテアーゼの量はsubstaになりますがスケールアップすることができますntial。
- ステップ7.1で行われた10倍のTEV切断緩衝液で10倍の酢酸緩衝液を交換する以外は、ステップ5.5に記載されている透析プロトコルに従ってください。
- 新しい250ミリリットルのガラス瓶に、TEV切断緩衝液中で、今、MOG タグを移し、透析からの増加量を監視します。ボトルに加えMOG タグタンパク質のあらゆる2.85ミリリットルあたりのβメルカプトエタノールの1μLを加えます。 MOG タグタンパク質のすべての50mgのために（5 mg / mlでの在庫のTEV溶液）TEVプロテアーゼの少なくとも1mgを追加します（TEVプロテアーゼが1時10分TEVまで追加することができます：MOGタンパク質比）、室温でインキュベートし、少なくとも72時間、光から保護。
注：TEVプロテアーゼインキュベーションの終わりに、白色沈殿物をガラス瓶の底に見られるべきです。 - タンパク質はガラス瓶に付着するタンパク質の沈殿物を防止するために、溶解するまで、透析管にタンパク質を転送する前に、この溶液に塩酸グアニジンを追加します。 150μlのを転送このソリューション1.5ミリリットルマイクロ遠心チューブへと「TEVとMOG」としてチューブにラベルを付けます。将来のSDS-PAGE分析のために-20℃で溶液を保管してください。
- ステップ5.3から5.2に記載されている透析チューブにステップ7.5からの流体のすべてを転送します。 H 2 O 2Lで大きなバケツを記入し、バケツに透析チューブを配置します。光は一晩攪拌しながら4℃でインキュベートします。このステップは、タンパク質濃度が急速に発生し、タンパク質精製を妨害する溶液からEDTAの削除を開始できるようにするためにグアニジンを希釈することが重要です。
- ステップ6.2〜6.3に記載された溶液の最終体積は〜40ミリリットルであるように（のみPEG 8000を使用することを除いて）透析チューブ中のタンパク質を濃縮します。 H 2 Oで透析チューブを洗浄し、まだチューブに接続されているすべての残留PEG 8000を削除します。体積の減少は、ニッケルの再を含む50 mlチューブに消化されたタンパク質のすべてに適合することができます罪、ステップ3.5で説明したように。
- 緩衝液Bに消化されたタンパク質を透析：
- バッファーB（29.22グラムのNaCl、3.152グラムのTris-HCl、0.3405グラムイミダゾール、グアニジン-HCl、pHが7.9の573.18グラム）の1 Lで大きなバケツを埋めます。
- （ステップ5.5でより詳細に説明するように）攪拌マグネットと一緒にバケツにステップ7.7から消化されたタンパク質を含むsnakeskinsを置きます。ゆっくりと攪拌に設定攪拌プレート上に4℃の低温室にバケツを置き、snakeskinsが5以上の時間透析することができます。
- バケツを空にし、バッファBの別の1 Lでそれを補充し、これが低速攪拌に設定攪拌プレート上に4℃の低温室で座ってsnakeskinsが5以上の時間透析することを可能にしましょう。
- 切断されたタグ配列は、溶液中のMOG 1-125を残して 、ニッケル樹脂に拘束されることとなる重要な違いは、セクション3で説明するようにMOG 1-125タンパク質の精製を行います。この場合も、精製の4回になります同じボリュームで実行するが、この場合、目標は、純度を改善するためではなく、できるだけ多くのタンパク質を回収することです。 図4を参照してください。
- ステップ3.1に記載されているタンパク質精製バッファを作ります
- ステップ3.3で説明したようにニッケル樹脂の両方の管を充電してください。
- タグを含むニッケル樹脂からの溶出液は廃棄されることが不可欠除いて、ステップ3.5で詳述したプロトコルによってMOG 1-125を浄化しながら、（将来のSDS-PAGE分析では1.5 mlのマイクロ遠心チューブ内の溶出液の150μLを保ちます） MOG 1-125を含む溶液は、最終生成物として保持されています。
- 第4節で説明したようにMOG 1-125タンパク質の濃度を測定します。
- ステップ4.2および4.4に記載されているように、BSA標準曲線希釈液を設定します。
- ステップ4.5および4.6に記載されているようにMOG 1-125の希釈液を設定します。あるいは、広い範囲を生成するために貴重であり得ます希釈（例えば1倍、1/2、1/4、1/8、）の。それに応じて1×酢酸緩衝液およびMOG 1-125のボリュームを調整します。
- 4.9にステップ4.7で説明したようにブラッドフォードアッセイを実行し、生成されたMOG 1-125の量を計算します。予想収量は約4 mg以上のタンパク質です。
- セクション5で説明したように、透析を介したグアニジンの段階的除去によってMOG 1-125をリフォールディング。
- 最終濃度は、5mg / mLのMOG タグと等モルである2.24 mg / mlで、あるべきである項6に記載されているようMOG 1-125蛋白質を濃縮します。
8. SDS-PAGEゲルMOG タグの生産及び純度を確認します
注：ステップ1.4から採取した試料を、2.1、3.4、6.4がMOG タグ生産及び純度を確認するために、標準的なSDS-PAGEによって分析します。このステップは、MOG タグまたはMOG 1-125のいずれかの最終精製した後に行われるべきです。
- <李>はH 2 Oの2ミリリットルにトリス塩酸の1.576グラムを添加することにより、2倍のSDS-PAGEローディングバッファーを作成し、pHを6.8に設定します。トリス-塩酸溶液中に0.4グラムのSDSを加え、ボリューム7ミリリットルに達するまで、H 2 Oを加えます。
- ステップ8.1で行われた溶液に、本の1ミリリットルを追加し、H 2 Oの10ミリリットルにブロモフェノールブルーの0.2グラムを追加します。最後に、2×SDS-PAGEローディングバッファーを終了するグリセロールの2ミリリットルを追加します。このソリューションを保管する場合は、4℃で維持し、3ヶ月までのための光から保護します。
- 室温でのステップ3.4および6.4からステップ1.4および2.1からの細菌の凍結アリコートと同様に可溶化されたMOG タグタンパク質を解凍します。
- タンパク質脱塩カラムに各60μlのを追加することにより、ステップ3.4および6.4に回収溶液から塩を除去します。製造者の指示に従って、タンパク質を精製します。
- ステップ8.2で作られた溶液1mlにβメルカプトエタノールの20μLを追加します。 2 BACにこの40μlのを追加します。ステップ8.4から脱塩したタンパク質へのステップ8.3および60μlのからterialペレットおよび95℃で10分間これらをインキュベートします。
- トリスの5グラム、28.8グラムのグリシン、および1グラムのSDSを計量することにより1×SDSページランニングバッファーを作成します。 1リットルのビーカーにこれらを追加し、すべてを溶解するために500mLのH 2 Oを追加します。溶解したら容量が1リットルになるまで、1リットルの溶液をメスシリンダーに移し、H 2 Oで充填
- ランニングバッファーは、単にゲル中のウェルの上部上にあるようなゲル装置1X SDS-PAGEのランニングバッファーを追加し、ゲル装置12％ポリアクリルアミドゲルを設定します。ウェルに5回ずつバッファを実行して、50μlのピペットでゲルのウェルを洗浄します。
- 第一のウェルにロードしたタンパク質ラダーを10μl、ウェルを分離するためにステップ8.5から煮ソリューションの10μlを添加します。 60分間115 Vでゲルを実行します。
- 装置からゲルを外し、小さな容器に移します。コンタ塗りつぶし純粋なH 2 O 100mlでINERし、8分間ゆっくり回転プラットフォームにコンテナを転送します。 8分後、水をダンプし、H 2 Oで二回以上のゲルを洗います
- 容器からのH 2 Oをダンプし、容器に迅速な染色試薬の100ミリリットルを追加します。これは、一晩ゆっくりと回転台の上に座ってアルミホイルでカバーすることができます。
- 迅速な染色試薬をダンプし、容器にH 2 Oの約100ミリリットルを追加します。これは8分間の回転台の上に座ってできるようにします。 H 2 Oをダンプし、H 2 Oで2回洗浄を繰り返します。
- 画像クーマシーブルー汚れ用イメージャーを用いてゲル。付近のバンド31.86 kDaの（MOG タグタンパク質）および63.72 kDaの（MOG タグダイマー ）でかすかなバンドを探してください。
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Representative Results
精製が完了すると、サンプルがステップ1.4、2.1、3.4に回収し、ステップ6.4からの最終生成物は、タンパク質ゲル（ 図3A）上で実行する必要があります。 MOG タグは、最初のT O / Nのサンプルで31.86 kDaのバンドとして表示されますが、ないT 0、および最終的に純粋な生成物にのみバンドでなければならない必要があります。 MOG タグタンパク質が正しく折り畳まれているかどうかをテストするために、MOG タグタンパク質は、FACSによってMOGタンパク質特異的B細胞を標識するために使用することができます。 1で標識マウスリンパ球：Hisタグおよび蛍光標識された第三の抗IgG1抗体に対して向けられた二次抗体と共にMOG タグ 1000希釈、MOG特異的B細胞（ 図3B）を同定することができます。あるいは、MOG タグが直接バックグラウンド染色を減少させるためにフルオロフォアにコンジュゲートすることができるように（二次及び三次抗体に結合するB細胞から得られました）MOG特異的B細胞を同定するための参照5に記載。野生型マウスにおけるMOG結合性B細胞を同定しようとするとき、これらの細胞は通常、5は非常に稀であるので、これは、必要です。 IgH遺伝子MOGマウスは、適切なκ軽鎖と対になったときに、MOGに対する特異性を付与する重鎖ノックインを有します。 MOG タグの結合は、IgH遺伝子MOG B細胞間で増強されるように、これは、このプロトコルは、適切に折り畳まれた抗原を生成することを確認します。重要なことには、IgH遺伝子MOG B細胞は、MOG タグが TおよびB細胞自己免疫の両方を誘導することを確認し、MOG指向EAE 12のモデルにおいて、自己免疫病理に寄与する。
Bradfordアッセイ4.代表的な結果を表1に示すセクションで説明したよう項5に記載のタンパク質をリフォールディングするために透析を開始する前に、ブラッドフォードアッセイを用いてタンパク質濃度を測定する必要があります図5にまとめました。
純粋MOG 1-125の生成は、図6に示すように、最終的にMOG 1-125にMOG タグタンパク質とタグ配列の切断をもたらすMOG タグタンパク質にTEVプロテアーゼの添加により達成される。その後、ニッケル樹脂の精製はMOGを除去しますタグ 、タグ配列、及び図6に示すように、最終的に純粋なMOG 1-125が得られTEVプロテアーゼ不純物。
図1：MOG タグタンパク質 （ダンら 5から許可を得てここに重複。。）。。 MOG タグ融合タンパク質の線状構造、及びアミノ酸及びDNA配列。マウスMOGの細胞外ドメインのDNA配列（MOG1-125、青の下側の配列）にコドン最適化された発現のために細菌（黒）で。この配列は、チオレドキシンおよびMOGタンパク質13,14の既知の不溶性に対抗するS-タグを含むタグへのN末端融合、ならびに精製の15のための6X Hisタグを作成するために、ベクターに合成し、挿入しました。 TEVプロテアーゼ切断部位は、タグ配列からMOG 1-125を分離します 。切断部位TEV代替コンセンサスすべての非MOGのアミノ酸の除去で16の結果を用いて、グルタミン-164およびグリシン-165との間にTEV媒介切断。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図2：純粋なMOG タグタンパク質を生産するために必要な手順の概要に。MOG タグタンパク質を生成し、MOG タグタンパク質を発現する細菌を一晩培養した後、セクション1に記載されているようにIPTGを用いMOG タグを発現するように誘導され、高濃度に増殖させた細菌を溶解し、ペレット化の一連のタンパク質含有画分をステップその後、粗タンパク質画分から精製されるセクション2. MOG タグに記載されている部3の部分に記載されているMOG タグを含む封入体は、帯電したニッケル樹脂とMOG タグタンパク質の溶出への吸収の4サイクルを通じて抽出されますプールされた溶出液のその後MOG タグタンパク質の収量を決定するためのブラッドフォードアッセイのために採取され、セクション4及び5の最後に記載されて溶出液の残りは、数日間にわたって、酢酸緩衝液中に透析し、タンパク質を濃縮します5ミリグラムの最終濃度にPEG 3350およびPEG 8000を使用して/ mlのBで決定されたMOG タグの利回りに基づいてラドフォードアッセイ部6に記載されているプロセス全体を括弧内に示した各ステップの開始日と、10日間の最小値を取ることができます。しかし、別の停止と開始点は、プロトコルに記載されている、とのステップが必要であれば時間のより多くの量を分散させることができます。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図3：MOG タグタンパク質およびその活性の評価の精製 （A）図は、タンパク質精製手順の様々なポイントから収集し、SDS-PAGEゲルで泳動したタンパク質サンプルです。タンパク質発現のT 0 =前（ステップ1.4で収集した）タンパク質の誘導にBL21細菌、T O / N = BL21の細菌が誘導後（収集ステップ2.1）で、原油MOG タグ =可溶化MOG タグタンパク質ステップ3.4で収集したタンパク質精製（）、ピュアMOG タグ = MOG タグタンパク質ステップ6.4に集め精製（後）の前に。野生型C57BL / 6マウスまたはMOGタンパク質7,17のための特定の免疫グロブリン重鎖を発現するのIgH MOGマウスのいずれかからのリンパ節から（B）CD19 POS CD4 陰性にMOG タグタンパク質の結合は、ナイーブB細胞をフローサイトメトリーを用いて評価しました。 。 MOG タグ特異的B細胞を二次抗Hisタグ抗体および蛍光三次抗IgG1抗体、続いMOG タグとリンパ節細胞を染色することによって同定しました。 C57BL / 6またはIgH遺伝子MOGマウス由来の細胞の染色はのIgH MOG細胞のMOG タグ蛍光マイナス1（FMO）コントロール染色と一緒に示されている。 してくださいCこの図の拡大版をご覧になるにはこちらをなめます。
図4：MOG 1-125を生成する手順の概要 MOG タグ タンパク質 から 。プロトコールのステップ3.5で説明したようにMOG タグの溶出液を収集した後、MOG タグタンパク質は、TEVプロテアーゼ切断緩衝液中に透析します。透析が完了すると、TEVプロテアーゼは、MOG 1-125蛋白質にMOG タグの切断をもたらすMOG タグの溶液に添加します。切断溶液の量は、その後減少し、タンパク質精製の前に、バッファBに透析します。切断溶液から不純物が帯電したニッケル樹脂、最終的に純粋なMOGの溶液を得た不純物の溶出への吸収の4連続ラウンドを通じて抽出されます<サブ> 1-125。 MOG 1-125蛋白質濃度はBradfordアッセイによって決定されたタンパク質は、透析を数日間にわたって折り畳まれます。透析が完了すると、MOG 1-125蛋白質は2.24ミリグラムに濃縮される/ mlのPEG 3350およびPEGこのプロトコルは、セクション7で詳しく説明されている8000を使用して、 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図5：MOG タグの濃度を決定するためのブラッドフォードアッセイ標準曲線の例 表1から採取したタンパク質。BSAの標準測定値は595 nmでの光学密度に基づいて、MOG タグの濃度を算出するための回帰式を得るためにプロットしました。F = "https://www.jove.com/files/ftp_upload/54727/54727fig5large.jpg"ターゲット= "_空白">この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
図6：MOG タグタンパク 質およびMOG 1-125 のその後の精製 のTEV切断示さタンパク質サンプルはMOG 1-125のSDS-PAGEゲル実証精製上で実行されている純粋なMOG タグ = MOG タグタンパク質は切断前をTEVするには、（収集しますステップ7.5で収集したTEVプロテアーゼ（）とMOG タグのインキュベーションの72時間後に採取した）ステップ6.4で、MOG タグワット/ TEV =タンパク質画分、MOG 1-中にニッケル樹脂に結合したまま溶出=タンパク質画分（ステップ7.9で収集）125精製プロトコル、ピュアMOG 1-125 = MOG1-125タンパク質精製（ステップ7.12に回収）した後。 この図の拡大版をご覧になるにはこちらをクリックしてください。
| BSA（mg / mlで） | 0.4 | 0.35 | 0.3 | 0.25 | 0.2 | 0.15 | 0.1 | 0.05 | 0 |
| 1.079 | 0.998 | 0.948 | 0.853 | 0.769 | 0.699 | 0.583 | 0.493 | 0.373 | |
| 1.071 | 1.014 | 0.95 | 0.854 | 0.777 | 0.681 | 0.579 | 0.484 | 0.375 | |
| 1.069 | 1.017 | 0.944 | 0.848 | 0.781 | 0.592 | 0.494 | 0.374 | ||
| MOG タグ希釈 | 1 | 1/5 | 1月25日 | ||||||
| 1.327 | 1.013 | 0.493 | |||||||
| 1.332 | 1.063 | 0.491 | |||||||
| 1.367 | 1.088 | 0.488 |
表1：MOG タグ タンパク 質 の濃度を決定するためのブラッドフォードアッセイの代表値 BSA DILU。既知の濃度でションは、MOG タグタンパク質精製後の希釈液は、最終MOG タグタンパク質濃度を決定するために使用されている図5に示される標準曲線を決定するために使用されます。行は、595nmで測定した光学密度が含まれており、各行がそれぞれ示された濃度での3反復の合計の1の複製を表します。
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Discussion
ここでは、MOG タグタンパク質および方法MOG タグタンパク質から純粋MOG 1-125を生成するための製造のためのプロトコルを記載しています。このプロトコルは、両方の標準的なHisタグベースのタンパク質精製方法、ならびに古いMOGベースのタンパク質15の世代のために以前に記載されたプロトコルに基づいています。それはここで説明されていないが、MOG タグタンパク質の主な用途は、タンパク質抗原での免疫を介してEAEを誘導することです。 EAEは、MOG タグタンパク質と互換性のあるマウスに誘導される様子を説明するプロトコルは、参考文献3に記載されています。我々は以前MOG タグ由来MOG タグまたはMOG 1-125での免疫がないだけで、標準のMOG 35-55ペプチドと比較して大きく、脊髄の炎症および脱髄とCNS自己免疫疾患だけでなく、その病原性のIgH MOG B細胞股関節を誘導することを実証していますT MOGタンパク質を認識すると、MOG タグまたはMOG 1-125に応答して胚中心応答を生成するように活性化されるが、35-55 5 MOGしません。したがって、MOG タグを用いた免疫は、確かに適切な抗MOG B細胞応答を誘導ありません。
MOG タグタンパク質は、（Hisタグを介して）の荷電ニッケル樹脂への吸着および溶出により精製されます。そのため、前のステップで生成されたタンパク質の大量の、吸収および溶出の複数のラウンドは、タンパク質の大部分を収集するために必要とされます。我々は、少なくとも4回、50 mlチューブ用樹脂の適切な量を使用する場合、タンパク質の大部分を分離する必要があることを発見しました。所望の場合、プロトコルは、吸収のラウンドの数を減らすために、より以上の管、さらにニッケル樹脂を用いることがスケールアップすることができます。あるいは、ニッケルカラムでの高速液体クロマトグラフィー（HPLC）を効果的にHisタグ-タンパク質18 <精製することができます/ SUP>と確かに我々は、HPLCを効率的にMOG タグタンパク質（未発表の観察）を精製することができることを見出しました。 HPLCは、多くの標準的な免疫学の研究室にアクセスできないように、ここに記載されているプロトコルは、一般的な実験装置を使用して実行されるように設計されています。 hisタグの精製に加えて、MOG タグタンパク質は、14を好みに応じてS-タグ精製プロトコルと互換性のあるS-タグを含んでいます。
MOG（主に、ヒトまたはラット）に基づいて、組換えタンパク質を8以前に記載されています。これらは、以降、 大腸菌におけるタンパク質の大量を生産することができる強力な転写プロモーターによって駆動されるシステムに置き換えられている旧式の発現系に基づいていました。私たちのMOG タグ発現系は、MOGタンパク質19の内製のために利用可能なシステムよりもかなり効率的であるPET-32A（+）ベクター、で効率的なT7プロモーターを使用しています。しかし、よhouldは、ここで説明MOG タグタンパク質をマウスMOGに基づいていることに留意す。ヒトMOGタンパク質による免疫化は、マウスMOG 8を用いて誘導する疾患とは異なる特徴を有するマウスにおいてEAEを誘導することが示されています。さらに、ラットMOGは、いくつかの例20のマウスにおけるマウスMOGよりも免疫原性であり得ます。したがって、いくつかの実験的な目的のためにマウスベースMOG タグは理想的ではないかもしれません。私たちはより良いいくつかの目的に合うことができ、ここで説明する精製プロトコルは、これらのすべてのために働くよりもMOG タグタンパク質のいくつかの異なるバージョンを生成するプロセスです。一方で、ニッケル樹脂に吸収するために6×Hisタグを組み込むように、ここで説明した精製プロトコルがあれば、他のMOG発現系、または他のタンパク質のために働く可能性があります。しかし、チオレドキシンタグなしで、高濃度でMOGタンパク質の溶解性に問題がある可能性があり、そしてもちろんそれは、GEにはできませんこのようnerate純粋MOG 1-125は、MOG タグシステムに固有のものです。
透析を経て前タンパク質のリフォールディングにMOG タグタンパク質濃度を測定することは、この精製プロトコールの成功に不可欠です。濃度が高すぎると、タンパク質が凝集し、その代わりに、個々のタンパク質への折り畳みの溶液から落下することができます。この白色沈殿物を透析チューブの底部に形成するように、透析手順の間に見ることができます。これが発生している場合、6 Mグアニジン再びMOG タグタンパク質を溶解し、タンパク質濃度を測定します。何の析出物が0.5 mg / mlとで形成してはならないとして0.5 mgのタンパク質を希釈/再び透析を開始mLです。 MOG 1-125については、沈殿は、タンパク質が非常に不溶性であるように形成することが期待できます。我々は、これはタンパク質が十分に透析前に希釈されたことを提供MOG 1-125の折り畳みに影響を与えないであろうことを見出しました。
NT ">効果的に純粋なMOG 1-125にMOG タグタンパク質を切断するTEVプロテアーゼのためには、TEVプロテアーゼの十分な量を使用することが重要である。TEVプロテアーゼの古いバージョンでは、21しかし、より現代的なバージョンが苦しむ自己切断を介して不活性化されます不溶性は、参照22で説明したように、市販のTEVプロテアーゼはコストがかかる可能性があるので、我々は生産と精製TEVプロテアーゼをお勧めします。TEVプロテアーゼの不活性化の前にMOG タグタンパク質の十分な切断を達成するために十分なTEVプロテアーゼを添加することが重要である、従って22を発行します。使用している場合実験用純マウスMOG 1-125蛋白質は、蛋白質が高度に不溶性であり、溶液から沈殿し、したがって使用前に広範囲に混合しなければならないことに留意することが重要です。要約すると、ここでは、MOG タグタンパク質を大量に生産し、精製するためのシンプルなプロトコルを記述しています。 Furtherm鉱石、我々のMOG タグタンパク質にTEVプロテアーゼ切断部位の付加は、必要に応じて純粋MOG 1-125を生成するための機会を提供します。 MOG タグタンパク質は、抗ミエリン自己免疫B細胞およびMOG タグ誘発EAEは、B細胞媒介病態5を内蔵することにより認識され結合されます。したがって、MOG タグタンパク質は、EAEを誘導するタンパク質抗原の広範な使用を制限する主要な障害を克服します。
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Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| BL21 E. coli- pet32-MOGtag | Kerfoot lab | These bacteria are required to make the MOGtag protein. Glycerol stocks of these bacteria are available upon request. | |
| LB broth miller | Bioshop | LBL407.1 | |
| Ampicillin | bio basic | AB0028 | Reconsititute the powder into 50% ethanol/ 50% H2O at 100 mg/ml. Store at -20 °C. |
| IPTG | Bioshop | IPT002.5 | Reconsititute the powder into H2O at 1M and store at -20 °C. |
| Chicken-egg lysozyme | Bioshop | LYS702.10 | Reconstitute in H2O at 50 mg/ml and store at -80 °C. |
| Triton-X100 | Sigma | T-8532 | |
| Phosphate buffered saline | life technologies | 20012-027 | Commercial phosphate buffered saline is not required, any standard lab made phosphate buffered saline is sufficient. |
| Sodium chloride | Bioshop | SOD004.1 | |
| Tris-HCl | Bioshop | TRS002.1 | |
| Imidazole | Bioshop | IMD508.100 | |
| Guanidine-HCl | Sigma | G3272 | The quality must be greater than 98% purity. |
| 0.5 M EDTA | bioshop | EDT111.500 | |
| Nickel (II) sulfate | Bioshop | NIC700.500 | |
| His bind resin | EMD Millipore | 69670-3 | Store in 20% ethanol 80% H2O at 4 °C |
| Anhydrous ethanol | Commercial Alcohols | P016EAAN | Dilute with water as needed. |
| Glacial acetic acid | Bioshop | ACE222.1 | |
| Sodium acetate trihydrate | Bioshop | SAA305.500 | |
| bovine serum albumin standard | bio-rad | 500-0206 | |
| Bio-rad protein assay dye reagent concentrate | bio-rad | 500-0006 | |
| Ethylenediamine tetraacetic acid, disodium salt dihydrate | Fisher scientific | BP120-500 | |
| Tris-base | Bioshop | TRS001.1 | |
| 7000 MW Snakeskin dialysis tubing | Thermoscientific | 68700 | |
| 2-mercaptoethanol | Sigma | M3148-25ml | This reagent should not be handled outside of a fume hood. |
| AcTEV protease | lifetechnologies | 12575-015 | Producing your own TEV protease can be accomplished using (https://www.addgene.org/8827/) and purified as in reference 17 |
| Polyethyleneglycol 3350 | Bioshop | PEG335.1 | |
| polyethyleneglycol 8000 | Bioshop | PEG800.1 | |
| Nunc MaxiSorp flat-bottom 96 well plate | ebioscience | 44-2404-21 | |
| Sonicator | Fisher scientific | FB-120-110 | |
| Eon microplate spectrometer | Biotek | 11-120-611 | This equipment uses the Gen5 data analysis software. |
| Gen5 data analysis software | BioTek | ||
| sodium dodecyl sulphate | Bioshop | SDS001 | |
| bromophenol blue | Bioshop | BRO777 | |
| Glycerol | Bioshop | GLY001 | |
| Protein desalting columns | Thermoscientific | 89849 | |
| Glycine | Bioshop | GLN001 | |
| precast 12% polyacrylamide gel | bio-rad | 456-1045 | |
| Rapid stain reagent | EMD Millipore | 553215 | |
| Gel dock EZ imager | bio-rad | 1708270 | |
| White Light Sample Tray | bio-rad | 1708272 | Used along with gel dock EZ imager for coomassie blue stains |
| Protein ladder | bio-rad | 1610375 |
References
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