Sabe-se hoje que os linfócitos T desempenham um papel crítico no desenvolvimento de várias doençascardiovasculares1,2,3,4,5. Por exemplo, estudos de nosso grupo mostraram que a hipertensão está associada a um acúmulo excessivo de células T nos vasos e rins durante o desenvolvimento da hipertensão experimental6. Uma vez nesses tecidos, as células T produzem várias citocinas que afetam a função vascular e renal, levando à vasoconstrição e retenção de sódio e água1,2. Para entender completamente como as células T causam doenças cardiovasculares e renais, é importante ser capaz de identificar e quantificar os subconjuntos específicos de células T presentes nesses tecidos. Os subconjuntos de células T são definidos por uma combinação de marcadores de superfície, as citocinas que secretam e os fatores de transcrição que expressam. A complexidade da população de células T torna a citometria de fluxo e a coloração intracelular uma técnica inestimável para dissecar os fenótipos dos linfócitos presentes nos tecidos. Aqui, fornecemos um protocolo detalhado para identificar os marcadores de superfície e intracelulares (citocinas e fatores de transcrição) em células T isoladas de rins murinos, aorta e linfonodos de drenagem aórtica em um modelo de hipertensão induzida por angiotensina II. As seguintes etapas são descritas em detalhes: isolamento dos tecidos, geração das suspensões unicelulares, estimulação ex vivo, fixação, permeabilização e coloração. Além disso, vários princípios fundamentais das análises de citometria de fluxo, incluindo a escolha dos controles adequados e estratégias de gating apropriadas, são discutidos.