Summary

Um isoinokosterone baseado no Receptor Singular Gene interruptor para deliberada expressão do Transgene com robustez, reversibilidade e insignificante Leakiness

Published: May 07, 2018
doi:

Summary

Aqui, apresentamos um protocolo para a modulação da expressão do transgene usando pEUI(+) singular gene interruptor por tebufenozide tratamento.

Abstract

Controle preciso da expressão do transgene é desejável em estudos clínicos e biológicos. No entanto, porque o recurso binário de interruptores de gene empregado atualmente requer a transferência de duas unidades de expressão terapêutica simultaneamente em uma única célula, a aplicação prática do sistema de terapia genética é limitada. Para simplificar o sistema de expressão do transgene, geramos um interruptor de gene designado como pEUI(+), englobando um conjunto completo de módulos de expressão do transgene em um único vetor. Compreendendo o domínio GAL4 DNA-ligando e col modificado (GvEcR), um mínimo domínio de ativação VP16 fundido com um domínio de ligação a GAL4 DNA, bem como um receptor de isoinokosterone de Drosophila modificado (EcR), o interruptor do recém-desenvolvido gene singular é altamente responsivos à administração de um indutor químico de maneira tempo e dose-dependente. O vetor de pEUI(+) é uma ferramenta potencialmente poderosa para melhorar o controle da expressão do transgene em pesquisas biológicas e estudos pré-clínicos. Aqui, apresentamos um protocolo detalhado para a modulação de uma expressão do transgene transitória e estável usando vetor de pEUI(+) pelo tratamento de tebufenozide (Teb). Além disso, partilhamos diretrizes importantes para o uso de Teb como um indutor químico.

Introduction

Vários genes diferentes switches tem sido explorados por sua capacidade de regular precisamente a expressão do transgene em cultura de células e modelos animais, com diferentes graus de sucesso1,2,3. Sistemas de interruptor de gene potencial devem conhecer vários critérios rigorosos, incluindo: precisão direcional expressão do transgene, capacidade de resposta de dosagem e tempo-dependente para indutores, leakiness insignificante do promotor, reversibilidade do transgene ativação através da remoção de indutor e níveis de toxicidade do indutor toleráveis para linhas celulares e animais de laboratório a1,2,3. Indutores de várias pequenas moléculas têm sido explorados, incluindo tetraciclina4,5, rapamicina6,7,8, mifepristone9,10, e isoinokosterone11,12,13,14. Em geral, estes sistemas exigem pelo menos dois plasmídeos contendo duas ou três unidades discretas de expressão, um ou dois dos quais compõem um elemento regulatório (plasmídeo indutor) que vincula um indutor de pequenas moléculas para obter atividade transcricional; e outro plasmídeo (plasmídeo efetoras) contendo o transgene sob o controle de uma região de DNA reguladora que permite o acesso do elemento indutor-limite regulamentar. A principal desvantagem do sistema binário é que ele requer a introdução concomitante dos dois vetores (indutor e efetoras) na célula alvo. Em experimentos de expressão do transgene transitória, o transfection simultâneo de dois plasmídeos inevitavelmente produz uma população de células que isoladamente é transfectadas com o indutor ou o efetor, ou co transfectadas desigualmente. Além disso, o sistema binário requer pelo menos duas rodadas de seleção antibiótica para estabelecer linhas de célula estável, que é demorado e trabalhoso. Assim, combinar todos os componentes necessários para a expressão do transgene e regulamento em um único vetor seria o ideal para garantir a expressão concomitante de todos os elementos necessários em uma única célula e permitir a regulação da expressão do transgene através do tratamento com indutores de pequenas moléculas.

Para superar as deficiências do gene binário switches, recentemente desenvolvemos um interruptor de gene singular, usando uma Drosophila melanogaster gene Col-baseado sistema inducible15. Isoinokosterone Medeia a expressão genética quando se liga ao heterodímero Col/ultraspiracle (USP), que por sua vez induz a vinculação da colectânea de DNA dos elementos reguladores3,11. O receptor de vertebrados retinoide X (RXR), um ortholog de insecto USP, recrutas EcR para formar um ativador transcricional ativo16. Assim, a expressão orientada de um transgene em células de vertebrados ou tecido, o EcR e RXR devem ser co expressa simultaneamente antes de ser estimulado por isoinokosterone ou seus agonistas. Desde que o recurso heterodimérica dSwitch gene Col-baseado pode ser influenciado pela endógena RXR nível, Padidam et al. substituídos os domínios DNA EcR-vinculação e ativação com ligação de GAL4 DNA heteróloga, herpes simplex vírus proteína vmw65 domínios de ativação (VP16) fundiram-se ao domínio de ligação ligante EcR, que depois tornou-se insensível ao RXR endógena e formou um homodímero para ganhar a atividade transcricional17. O interruptor de gene Col-baseado foi melhorado através da construção de uma proteína quimérico composta por domínio de ativação VP16 mínimo combinado com GvEcR, que formou um homodímero e localizadas no citosol na ausência do agonista isoinokosterone, Teb16, 18. Por ligação a Teb, o GvEcR mudou sua localização subcellular do citosol para o núcleo de reconhecer um promotor híbrido composto de zebrafish E1b promotor mínimo combinado com um conjunto de dez repetidas sequências de ativação upstream (UASs) para iniciar o transcrição do gene alvo16.

Para simplificar o gene Col-baseado anteriormente relatado muda16,18, nós combinamos os recursos binários do sistema em um único vetor equipado com todos os elementos necessários para estimular expressão do transgene e então designado o vetor recém-gerado, pEUI(+) (número de adesão GenBank: KP123436, figura 1A)15. O efetor respondendo para o driver de GvEcR (doravante driver) consiste em dez em tandem UAS repete ao lado de um promotor de E1b mínimo seguido de um local de clonagem múltipla (MCS) com EcoRI, PmlI, NheI, BmtI, AfeI e AflII sequências de reconhecimento (figura 1B). Além disso facilitar a seleção de transfectadas cells, uma puromicina orientada por promotor de SV40 N-acetil-gene transferase (PAC) foi colocada entre as regiões de driver e efetoras para manter a linha celular estável (Figura 1).

Descreveremos um protocolo detalhado para a modulação transitória e estável da expressão do transgene usando pEUI(+). Além disso, nós fornecemos instruções detalhadas para o uso bem sucedido de Teb como um agonista isoinokosterone.

Protocol

1. o Transgene Subcloning Escolha um local de reconhecimento de enzima de restrição apropriada (ou sites) em MCS de pEUI(+) e subclone o gene de interesse na direção desejada (Figura 1).Nota: O ankyrin epítopo-tag EGFP ou bandeira repete domínio 13A (ANKRD13A) transgene foi subcloned no sítio de EcoRI do vetor pEUI(+) usando T4 DNA polimerase em uma sequência e ligadura-independente de clonagem método19. Linearizar o …

Representative Results

O interruptor de gene singular GvEcR-baseado é retratado na figura 1A. O vetor pEUI(+) foi otimizado para a expressão do transgene regulamentado pelo tratamento com Teb. A região de efetor de pEUI(+) inclui um 10xUAS e um E1b promotor mínimo seguido por um MCS contendo sites de reconhecimento de enzima de restrição EcoRI, PmlI, NheI, BmtI, AfeI e AflII. Um sinal de poli SV40 foi adicionado para trás os MCS (figura 1B). Um …

Discussion

A principal desvantagem do uso de um interruptor de expressão do gene binário é a necessidade de entregar simultaneamente dois plasmídeos separados (motorista e efetoras) para a célula de destino. Isso pode levar a uma distribuição desigual de plasmídeos e resultam em uma resposta inconsistente do interruptor para o indutores1,2,3. Outra deficiência do sistema de dois vetores é que um mínimo de duas rodadas de seleç?…

Disclosures

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Os autores agradecer S-Y Choi (Universidade Nacional de Chonnam) comentários valiosos e leitura minuciosa de nosso manuscrito. Este trabalho foi financiado por um fundo de pesquisa da Universidade Nacional de Chungnam.

Materials

pEUI(+) TransLab The patent license was transferred to TransLab Inc. 
Gene-Fect Transfection Reagent TransLab TLC-001
HEK293 ATCC CRL-1573
Tebufenozide Fluka 31652
Cloning cylinder Sigma CLS31668
Puromycin Corning 58-58-2
Antibiotics Gibco 15240-062
Trypsin-EDTA Welgene LS015-01
DMEM Welgene LM001-05
Fetal Bovine Serum Welgene S001-01
Cell culture dish SPL life science 11090
mouse FLAG M2 Sigma F3165
anti-alpha tubulin antibody Calbiochem CP06
Cloning cylinder Sigma CLS31668
NucleoBond Xtra Midi Macherey-Nagel 740410.1
M-PER Mammalian Protein
Extraction Reagent
Thermo Fisher 78505
100X Protease inhibitor Cock. III T&I BPI-9200

References

  1. Rossi, F. M., Blau, H. M. Recent advances in inducible gene expression systems. Curr. Opin. Biotechnol. 9 (5), 451-456 (1998).
  2. Clackson, T. Regulated gene expression systems. Gene Ther. 7 (2), 120-125 (2000).
  3. Suzuki, Y., Suzuki, Y., Xu, K. Gene regulatable lentiviral system. Viral Gene Therapy. , 285-309 (2011).
  4. Gossen, M., Bujard, H. Tight control of gene expression in mammalian cells by tetracycline-responsive promoters. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (12), 5547-5551 (1992).
  5. Baron, U., Bujard, H. Tet repressor-based system for regulated gene expression in eukaryotic cells: principles and advances. Methods Enzymol. 327, 401-421 (2000).
  6. Hentges, K. E., et al. FRAP/mTOR is required for proliferation and patterning during embryonic development in the mouse. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (24), 13796-13801 (2001).
  7. Banaszynski, L. A., Liu, C. W., Wandless, T. J. Characterization of the FKBP.rapamycin.FRB ternary complex. J Am Chem Soc. 127 (13), 4715-4721 (2005).
  8. Seto, B. Rapamycin and mTOR: a serendipitous discovery and implications for breast cancer. Clin Transl Med. 1 (1), 29 (2012).
  9. Ulmann, A., Peyron, R., Silvestre, L. Clinical uses of mifepristone (MFP). Ann N Y Acad Sci. 761, 248-260 (1995).
  10. Sitruk-Ware, R., Spitz, I. M. Pharmacological properties of mifepristone: toxicology and safety in animal and human studies. Contraception. 68 (6), 409-420 (2003).
  11. Yao, T. P., et al. Functional ecdysone receptor is the product of EcR and ultraspiracle genes. Nature. 366 (6454), 476-479 (1993).
  12. Riddiford, L. M., Cherbas, P., Truman, J. W. Ecdysone receptors and their biological actions. Vitam Horm. 60 (2000), 1-73 (2000).
  13. Saez, E., Nelson, M. C., Eshelman, B., Banayo, E., Koder, A., Cho, G. J. Identification of ligands and coligands for the ecdysone-regulated gene switch. Proc Natl Acad Sci USA. 97 (26), 14512-14517 (2000).
  14. Karzenowski, D., Potter, D. W., Padidam, M. Inducible control of transgene expression with ecdysone receptor: gene switches with high sensitivity robust expression, and reduced size. Biotechniques. 39 (2), 191-200 (2005).
  15. Lee, S., et al. Ecdysone receptor-based singular gene switches for regulated transgene expression in cells and adult rodent tissues. Mol. Ther. Nucleic Acids. 5 (9), e367 (2016).
  16. Esengil, H., Chang, V., Mich, J. K., Chen, J. K. Small-molecule regulation of zebrafish gene expression. Nat Chem Biol. 3 (3), 154-155 (2007).
  17. Padidam, M., Gore, M., Lu, D. L., Smirnova, O. Chemical-inducible, ecdysone receptor-based gene expression system for plants. Transgenic Res. 12 (1), 101-109 (2003).
  18. Knopf, F., Schnabel, K., Haase, C., Pfeifer, K., Anastassiadis, K., Weidinger, G. Dually inducible TetOn systems for tissue-specific conditional gene expression in zebrafish. Proc Natl Acad Sci USA. 107 (46), 19933-19938 (2010).
  19. Jeong, J. Y., et al. One-step sequence- and ligation-independent cloning as a rapid and versatile cloning method for functional genomics studies. Appl Environ Microbiol. 78 (15), 5440-5443 (2012).
  20. Zhu, B., Cai, G., Hall, E. O., Freeman, G. J. In-fusion assembly: seamless engineering of multidomain fusion proteins, modular vectors, and mutations. Biotechniques. 43 (3), 354-359 (2007).
  21. No, D., Yao, T. P., Evans, R. M. Ecdysone-inducible gene expression in mammalian cells and transgenic mice. Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (8), 3346-3351 (1996).
  22. Sawada, Y., et al. Synthesis and insecticidal activity of benzoheterocyclic analogues of N’-benzoyl-N-(tert-butyl)benzohydrazide: Part 1. Design of benzoheterocyclic analogues. Pest Manag Sci. 59 (1), 25-35 (2003).
  23. Lafont, R., Girault, J. P., Kerb, U. Excretion and metabolism of injected ecdysone in the white mouse. Biochem Pharmacol. 37 (6), 1174-1177 (1988).
  24. Carlson, G. R., et al. The chemical and biological properties of methoxyfenozide, a new insecticidal ecdysteroid agonist. Pest Manag Sci. 57 (2), 115-119 (2001).
  25. McConnell, M. J., Imperiale, M. J. Biology of adenovirus and its use as a vector for gene therapy. Hum Gene Ther. 15 (11), 1022-1033 (2004).
  26. Gorell, E., Nguyen, N., Lane, A., Siprashvili, Z. Gene therapy for skin diseases. Cold Spring Harb Perspect Med. 4 (4), a015149 (2014).
  27. Kotterman, M. A., Chalberg, T. W., Schaffer, D. V. Viral Vectors for Gene Therapy: Translational and Clinical Outlook. Annu Rev Biomed Eng. 17, 63-89 (2015).
  28. Matsumoto, T., Yamaguchi, M., Kuzume, M., Matsumiya, A., Kumada, K. Insulin gene transfer with adenovirus vector via the spleen safely and effectively improves posthepatectomized conditions in diabetic rats. J Surg Res. 110 (1), 228-234 (2003).
  29. Han, J., McLane, B., Kim, E. H., Yoon, J. W., Jun, H. S. Remission of diabetes by insulin gene therapy using a hepatocyte-specific and glucose-responsive synthetic promoter. Mol Ther. 19 (3), 470-478 (2011).

Play Video

Cite This Article
Lee, S., Won, M., Hwang, R. H., Hur, G. M., Ro, H. An Ecdysone Receptor-based Singular Gene Switch for Deliberate Expression of Transgene with Robustness, Reversibility, and Negligible Leakiness. J. Vis. Exp. (135), e57494, doi:10.3791/57494 (2018).

View Video