एक 1, 2-dithiolane संशोधित पेप्टाइड के संश्लेषण के लिए एक प्रोटोकॉल और supramolecular पेप्टाइड स्व-विधानसभा से उत्पन्न संरचनाओं के लक्षण वर्णन.
इस रिपोर्ट के संश्लेषण पर केंद्रित एक N-टर्मिनस 1, 2-dithiolane संशोधित स्व-कोडांतरण पेप्टाइड और जिसके परिणामस्वरूप स्वयं इकट्ठे supramolecular संरचनाओं के लक्षण वर्णन. सिंथेटिक मार्ग dithiolane अग्रदूत अणु, 3-(acetylthio)-2-(acetylthiomethyl) propanoic एसिड की पर राल युग्मन के साथ ठोस चरण पेप्टाइड संश्लेषण का लाभ लेता है, और माइक्रोवेव की सहायता से thioacetate के संरक्षण पेप्टाइड N-से पहले अंतिम दरार राल से टर्मिनस 1, 2-dithiolane संशोधित पेप्टाइड उपज । 1, 2-dithiolane पेप्टाइड के उच्च प्रदर्शन तरल क्रोमैटोग्राफी (HPLC) शुद्धि के बाद, अल्जाइमर रोग के साथ जुड़े Aβ पेप्टाइड के nucleating कोर से व्युत्पंन, पेप्टाइड को पार-β amyloid फाइबर में स्वयं इकट्ठा करने के लिए दिखाया गया है. चलत amyloid तंतुओं की विशेषता का रूपान्तर-रूपांतर इन्फ्रारेड स्पेक्ट्रोस्कोपी (एफटी-IR), परिपत्र dichroism स्पेक्ट्रोस्कोपी (सीडी) और ट्रांसमिशन इलेक्ट्रॉन माइक्रोस्कोपी (उनि) प्रस्तुत कर रहे हैं. एक 1, 2-dithiolane moiety के साथ एन टर्मिनल संशोधन के तरीके अच्छी तरह से विशेषता स्व-कोडांतरण पेप्टाइड्स अब मॉडल सिस्टम के बाद विधानसभा संशोधन रणनीतियों और गतिशील आबंध रसायन विज्ञान का पता लगाने के विकास के रूप में पता लगाया जा सकता है supramolecular पेप्टाइड nanofiber सतहों ।
मजबूत पेप्टाइड बांड बनाने में शामिल रसायन विज्ञान ठोस चरण पेप्टाइड संश्लेषण और अनुक्रम लंबाई और संरचना को नियंत्रित करने की क्षमता बनाने पेप्टाइड्स कि स्वयं supramolecular संरचनाओं में इकट्ठा एक भारी शोध क्षेत्र. पहलू है कि नियंत्रण और स्थिर पेप्टाइड स्व-इकट्ठे संरचनाओं, साइड चेन steric और इलेक्ट्रोस्टैटिक बातचीत, हाइड्रोजन बांड सहित, और hydrophobic प्रभाव1, डिजाइन नियमों का एक सेट के रूप में सेवा । के रूप में इन मौलिक डिजाइन नियमों में अनुसंधान के लिए जारी है प्रगति, तार्किक अगले पेप्टाइड स्व-विधानसभा में कदम पेप्टाइड की विविधता के विस्तार-संरचनाओं और कार्यों पर आधारित शामिल है । स्व-कोडांतरण पेप्टाइड्स एक बहुमुखी जैव सामग्री है कि कई बायोमेडिकल अनुप्रयोगों के लिए पेप्टाइड अनुक्रम या विधानसभा की स्थिति2,3,4, के लिए रणनीतियों के विकास ट्यूनिंग द्वारा इस्तेमाल किया गया है रहे हैं बाद विधानसभा संशोधनों के लिए पेप्टाइड nanofibers5,6,7,8,9 एक अपेक्षाकृत बेरोज़गार क्षेत्र रहता है ।
गतिशील डाइसल्फ़ाइड एक्सचेंज और supramolecular संरचनाओं की सतह पर thiol रसायन विज्ञान एक क्षेत्र है कि नए और कार्यात्मक जैव सामग्री उपज की क्षमता है । 1, 2 के शामिल-dithiolane moieties (आमतौर पर एक व्युत्पंन लाइपो एसिड (ला) या asparagusic एसिड (एए)) liposome सिस्टम में सूचित किया गया है10,11, ब्लॉक copolymers12,13, और के रूप में सतहों पर लंगर का आयोजन14,15। साथ ही, हम संश्लेषण और एक स्व-संयोजन पेप्टाइड के nucleating कोर से व्युत्पंन Aβ पेप्टाइड अल्जाइमर रोग है कि N-टर्मिनस में संशोधित किया गया है के साथ जुड़े के लक्षण वर्णन रिपोर्ट एक 1, 2-dithiolane कार्यात्मक समूह16के साथ, 17. शी. परिणामस्वरूप supramolecular फाइबर अब amyloid फाइबर18के supramolecular सतह पर डाइसल्फ़ाइड-विनिमय और thiol जेट का अध्ययन करने के लिए एक प्रयोगात्मक मंच के रूप में सेवा करते हैं ।
यह आलेख दोनों संश्लेषण और एक एन के शुद्धि-टर्मिनल 1, 2-dithiolane संशोधित आत्म कोडांतरण पेप्टाइड और परिणामी supramolecular संरचनाओं के लक्षण वर्णन के विवरण पर चर्चा की । 1, 2-dithiolane पेप्टाइड के संश्लेषण यहां की रिपोर्ट dithiolane अ?…
The authors have nothing to disclose.
लेखक उसे तकनीकी प्रशिक्षण के लिए Dr. B. एलेन Scanley शुक्रिया अदा करना चाहूंगा और कनेक्टिकट राज्य के कॉलेजों और विश्वविद्यालय (CSCU) नैनो के लिए केंद्र और डॉ इशिता Mukerji Wesleyan विश्वविद्यालय में उसकी सीडी का उपयोग करने के लिए में उनि का उपयोग करने में मदद spectrophotometer । काम की रिपोर्ट Fairfield विश्वविद्यालय में विज्ञान संस्थान द्वारा समर्थित भाग में था, नासा कनेक्टिकट स्पेस ग्रांट कंसोर्टियम, और राष्ट्रीय विज्ञान फाउंडेशन द्वारा अनुदान नंबर चे-१६२४७७४ के तहत ।
Rink amide MBHA resin, high load | Gyros Protein Technologies | RAM-5-HL | Avoid contact with skin and eyes; do not inhale |
N,N-Dimethylformamide | Fisher Scientific | D119-4 | Flammable liquid and vapor; irritating to eyes and skin; Use personal protective equipment; keep away from open flame |
Fmoc-L-Val-OH | Gyros Protein Technologies | FLA-25-V | Wear personal protective equipment; do not inhale |
Fmoc-L-Leu-OH | Gyros Protein Technologies | FLA-25-L | Wear personal protective equipment; do not inhale |
Fmoc-L-Lys(Boc)-OH | Gyros Protein Technologies | FLA-25-KBC | Wear personal protective equipment; do not inhale |
Fmoc-L-Phe-OH | Gyros Protein Technologies | FLA-25-F | Wear personal protective equipment; do not inhale |
Fmoc-L-Ala-OH | Gyros Protein Technologies | FLA-25-A | Wear personal protective equipment; do not inhale |
Fmoc-L-Gln(Trt)-OH | Gyros Protein Technologies | FLA-25-QT | Wear personal protective equipment; do not inhale |
N,N,N′,N′-Tetramethyl-O-(1H-benzotriazol-1-yl)uronium hexafluorophosphate | Gyros Protein Technologies | 26432 | Causes skin, eye and respiratory irritation; do not inhale; use under hood or in well ventilated area |
0.4 M N-methylmorpholine in DMF | Gyros Protein Technologies | PS3-MM-L | highly flammable; wear personal protective equipment; keep away from heat and keep container tightly closed; do not inhale or swallow; wash skin thoroughly after handling |
20% piperidine in DMF | Gyros Protein Technologies | PS3-PPR-L | Causes severe eye and skin burns; Flammable Liquid and vapor; Do not inhale |
dichloromethane | Fisher Scientific | D37-4 | May cause cancer; Do not inhale; Wear personal protective equipment; use under hood only; if contacted rise with water for at least 15 minutes and obtain medical attention |
acetonitrile | Fisher Scientific | A998-4 | Flammable; irritating to eyes; Use personal protective equipment; Use only under a fume hood; keep away from open flame or hot surface; if contacted rinse wiith water for at least 15 minutes and obtain medical attention |
trifluoroacetic acid | Fisher Scientific | A116-50 | Causes severe burns; do not inhale; harmful to aquatic life; use personal protective equipment; use only under fume hood; if contacted rinse with water for at least 15 minutes and obain immediate medical attention |
4% uranyl acetate | Electron Microscopy Sciences | 22400-4 | Do not inhale; harmful to aquatic life |
4-(2-Hydroxyethyl)piperazine-1-ethanesulfonic acid | Acros Organics | AC172571000 | Do not inhale; use outdoors or in well-ventilated area |
nitrogen Gas | TechAir | Contents under pressure, may explode if heated | |
3-bromo-2-(bromomethyl)propionic acid | Alfa Aesar | AAA1963014 | Do not inhale; causes irritation to skin and eyes; corrosive |
sodium hydroxide | Fisher Scientific | S318-100 | Use personal protective equipment; use only under fume hood; if contact rinse area for at least 15 minutes and obtain medical attention |
potassium thioacetate | Acros Organics | AC221300250 | Causes skin and eye irritation; do not inhale; use personal protective equipment |
sulfuric acid | Fisher Scientific | SA213 | Causes burns; keep away from water; keep away from combustible material; do not inhale; use personal protective equipment; if contact rinse area for at least 15 minutes and obtain medical attention |
chloroform-d | Acros Organics | AC320690075 | Possible cancer hazard; irritating to skin and eyes; do not inhale; Use personal protective equipment; use only under fume hood; If contact rinse area for at least 15 minutes and obtain medical attention |
chloroform | Fisher Scientific | C298-4 | Possible cancer hazard; irritating to skin and eyes; do not inhale; Use personal protective equipment; use only under fume hood; If contact rinse area for at least 15 minutes and obtain medical attention |
N,N-diisopropylethylamine | Acros Organics | AC367841000 | Highly flammable; harmful to aquatic life; wear personal protective equipment; do not swallow |
ammonium hydroxide | Fisher Scientific | A669S-500 | Corrosive; do not inhale |
methanol | Fisher Scientific | A452-4 | Flammable liquid and vapor; use personal protective equipment; do not inhale; If contact rinse area for at least 15 minutes and obtain medical attention |
triisopropylsilane | Sigma Aldrich | 233781 | Flammable; use personal proctective safety equipment; keep container tightly closed |
diethyl ether | Fisher Scientific | E138-1 | Extremely flammable; Irritating to skin and eyes; Use personal protective equipment |
2,5-dihydroxybenzoic acid | Sigma Aldrich | 39319-10x10MG-F | do not inhale; irritating to skin and eyes |
alpha-cyano-4-hydroxycinnamic acid | Alfa Aesar | AAJ67635EXK | |
c18 zip-tip | Millipore | ZTC18S096 | |
tris(2-carboxyethyl) phospine hydrochloride | Thermo Scientific | PI20490 | |
silica gel 60 F254 coated aluminum-backed TLC sheets | EMD Millipore | 1.05549.0001 | |
Thin walled Precision NMR tubes | Bel-Art | 663000585 | 5mm O.D. |
All-plastic Norm-Ject syringes | Air Tite | AL10 | |
single-use needle | BD PrecisionGlide | BD 305185 | used needles get disposed on in sharps waste container |
disposable fritted syringe | Torviq | SF1000LL | 10mL fritted syringes were used in the report, but larger syringes are avaibale if needed for larger scale synthesis. |
carbon grid | Ted Pella, Inc. | CF200-CU | Make sure to prepare samples and staining on the carbon grid side, not the shiny copper side of grid |
self-closing tweezers | Electron Microscopy Sciences | 78318-3X | very sharp tips, length: 120 mm |
0.1 mm short path length cell | Starna Cells, Inc. | 20/C-Q-0.1 | Fragile |
10mL Vessel Caps | CEM | 909210 | |
10mL Pressure Vessels | CEM | 908035 | |
Aeris Semi-Prep HPLC column | Phenomenex | 00F-4632-N0 | 150 x 10mm |
cell holder | Starna Cells, Inc. | CH-2049 | Needed when using short pathlength cells |
PS3 peptide synthesizer | Gyros Protein Technologies | ||
DiscoverSP Microwave Reactor | CEM | ||
centrifuge | HERMLE | Z 206 A | used a fixed 6×50 mL rotor |
HPLC | Shimadzu | UV Detector | |
nuclear magnetic resonance spectrometer | Avance, Bruker | 300 MHz | |
MALDI-TOF mass spectrometer | Axima Confidence, Shimadzu | ||
lyophilizer | Millrock Technology | BT85A | |
Fourier-Transform Infrared Spectrometer | Alpha Tensor, Bruker | ||
Transmission Electron Microscope | Tecnai Spirit, FEI | Used with Gatan Orius Fiberoptic CCD digital camera. Accessed at CSCU Center for Nanotechnology | |
Circular Dichroism Spectropolarimeter | J-810, JASCO | Used with a six-cell Peltier temperature controller. Accessed at Wesleyan University. |