Login processing...

Trial ends in Request Full Access Tell Your Colleague About Jove
Click here for the English version

Medicine

Jämföra bibliometriska analyser med hjälp av PubMed, Scopus och Web of Science-databaser

doi: 10.3791/58494 Published: October 24, 2019

Summary

Litteratur databaser används ofta för att bedöma publikationer i ett visst ämne, disciplin, land eller region i världen, en metod som kallas bibliometriska analyser. Det aktuella protokollet specificerar hur man använder PubMed, Scopus och Web of Science-databaser för att göra bibliometriska analyser.

Abstract

Litteratur databaser (t. ex.PubMed, Scopus och Web of Science) skiljer sig åt vad gäller täckning, fokus och det verktyg de tillhandahåller. PubMed fokuserar främst på biovetenskap och biomedicinska discipliner, medan Scopus och Web of Science är tvärvetenskapliga. Det protokoll som beskrivs i den aktuella studien användes för att söka efter publikationer från jordanska författare under åren 2013-2017. I det här protokollet beskrivs hur du använder varje databas för att utföra den här typen av sökning i detalj. En Scopus sökning resulterade i det högsta antalet dokument (11 444 dokument), följt av en Web of Science search (10 943 dokument). PubMed resulterade i ett mindre antal dokument på grund av dess snävare omfattning och täckning (4 363 dokument). Resultaten visar också en årlig trend i: (1) antalet publikationer, (2) de discipliner som har flest publikationer, (3) samarbets länderna, och (4) antalet Open Access-publikationer. Däremot har PubMed en sofistikerad sökords optimeringstjänst (dvs.medicinsk Ämnesrubrik eller mesh), medan både Scopus och Web of Science tillhandahåller Sök analysverktyg som kan producera representativa figurer. Slutligen, funktionerna i varje databas förklaras i detalj och flera index som kan extraheras med hjälp av sökresultaten tillhandahålls. Denna studie ger en bas för att använda litteratur databaser för bibliometriska analyser.

Introduction

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Klassiskt, forskare har använt litteratur databaser för att utföra litteraturstudie för sina studier1. En annan användning av dessa litteratur databaser uppstod i slutet av det 19: e århundradet, där forskarna analyserade kroppen av litteratur, en användning som långsamt har vuxit sedan2. Under de senaste decennierna, digitaliserande litteratur och bildandet av online litteratur databaser som en möjlighet för forskare att analysera kroppen av litteratur och forskningsresultat enkelt och effektivt. Ett exempel skulle vara att analysera forskningsresultat för ett dokument3, ett ämne4, en disciplin5, ett land6, eller ens en region i världen7. Denna typ av analys kallas Bibliometrisk analys. Heartsill Young definierade bibliometriska analys som användning av statistiska metoder för att analysera en kropp av litteratur för att avslöja historisk utveckling8. Bibliometri är med andra ord den kvantitativa studien av publicerade enheter utifrån citering och textanalys9.

Olika databaser används för att göra bibliometriska analyser och varje databas har olika egenskaper och kan tillhandahålla olika tjänster10. För närvarande är de mest använda litteratur databaserna Web of Science och Scopus för nästan alla discipliner, både tillgängliga på abonnemangsbasis11, och PubMed för biomedicinska och biovetenskap, en fritt tillgänglig databas10. Det finns också Google Scholar, som kan vara ett enkelt verktyg för att hantera, men det bör inte användas som en bibliometriska analysverktyg för närvarande på grund av vissa brister såsom dess oklara omfattning och täckning, dess brist på Citation analysverktyg, och dess införande av icke-peer granskat icke-vetenskapligt innehåll12,13. Dessutom saknar Google Scholar verktygen för att utföra avancerad sökning och sökordsoptimering14.

Flera tidigare studier har jämfört funktionerna i de tidigare nämnda litteratur databaserna i litteratur granskningssyfte3,5,10,12,13,15 ,16,17. Men i denna studie, de medel som PubMed, Scopus, och Web of Science-databaser används för att utföra en Bibliometrisk analys kommer att tillhandahållas, och för-och nackdelar för var och en av dem kommer att jämföras. Bibliometrisk analys kan användas för att analysera forskningsresultat i nästan alla discipliner, så målgruppen skulle vara någon forskare som avser att analysera publikationens trender. Ett exempel på att analysera en publicerings trend i Jordanien som ett land kommer att presenteras med hjälp av varje databas. Jordanien valdes för att göra en Bibliometrisk analys för ett land (i motsats till ett ämne) är inte särskilt enkelt. Dessutom är Jordanien, särskilt, dåligt studerat på ett bibliometriskt sätt eftersom det kan vara både ett författarnamn och ett landsnamn. Vi förklarar hur vi ska övervinna en sådan utmaning i sökandet.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Protocol

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

ANMÄRKNINGAR: följande är sökmetoder och en exempel sökning för varje metod tillhandahålls. Observera att den del som specifikt rör bibliometriska analyser också tillhandahålls.

1. PubMed

  1. Välj Avancerad sökning från PubMeds hemsida (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed).
  2. Ange önskad sökterm i sökfältet. Välj söktermerna från den medicinska ämnesrubriken (MeSH) databas. Följande exempel specificerar hur man bedömer forskning i "cancer".
    1. Öppna MeSH-databasen: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh.
    2. Ange ordet "cancer" i sökfältet.
    3. Se till att resultaten visar ordet "neoplasmer" på toppen av sökningen, där den konstaterar att använda ordet "neoplasmer" är lämpligare, som "neoplasmer" är det ord som används för att indexera relevanta ämnen.
    4. Ytterligare kontrollera andra termer som anges under termen "neoplasmer" genom att klicka på den. Resultaten kommer att visa andra termer som används för att beskriva liknande ämnen (t. ex. tumör), och kommer också att lista andra underkategorier (underrubriker) under termen neoplasm.
    5. Använd listrutan i avsnittet Builder för att ange det fält i artikeln som PubMed ska söka efter termen i. Observera att följande sökfält är tillgängliga: alla fält, titlar, abstract, författare, tillhörighet, intressekonflikter, språk, journal, utgivare, publikationstyp, bidrags nummer, ISBN och MeSH-termer.
    6. Lägg till så många fält som behövs och välj relationen mellan dessa fält (och, eller, eller inte). Se tabell 1 för mer information.
  3. Klicka på Sök.
  4. Förfina sökresultaten ytterligare i resultaten med hjälp av olika filter som beskrivs i tabell 2. Observera att från och med nu kommer den slutgiltiga sökningen att sparas i historiken för den avancerade sökningen, som användes i det första steget. Detta innebär att sökningen kan pausas i det här steget och återupptas senare.
  5. Se till att varje ny sökning sparas i den avancerade sökhistorik skärmen där den kommer att tilldelas ett nummer (t. ex.#2). Använd detta nummer i sökfältet ovan för att subtrahera sökfrågor (t. ex. "#1 inte #2" för att subtrahera resultat i Sök #2 från resultat av sökning #1).
  6. Exportera resultaten för att ytterligare analysera dem.
    1. Använd FLink-verktyget (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/flink.cgi) för att exportera resultaten i ett CSV-format (kommaseparerade värden) och välj PubMed i listrutan Välj en databas att starta.
    2. Välj inmatning från Entrez-historiken från inmatningsskärmen och en avancerad PubMed-sökhistorik visas i listrutan.
    3. Välj den sökning som utfördes i föregående steg vid PubMed Advanced search och klicka på Skicka.
    4. Visa den resulterande rapporten eftersom den ger möjlighet att exportera sökresultaten i en CSV-formatfil.
  7. Utför följande steg för att analysera Jordaniens forskningsresultat under en 5-års period mellan 1/1/2013 och 31/12/2017 med PubMed.
    1. Öppna formuläret för avancerad sökning i formuläret för dokumentsökning på PubMeds webbplats (www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed).
    2. Använd Jordanien som sökterm och ange tillhörighet som sökfältet. Observera att PubMed tolkar tillhörighet som all information relaterad till författaren (dvs. författarens namn, adress, tillhörighet), så utesluta alla dokument som författats av en författare som heter "Jordanien" där anknytnings landet inte är Jordanien. Följ stegen nedan för att undvika att inkludera sådana irrelevanta resultat.
    3. Skriv Jordan i ett annat fält och välj fält typs författare.
    4. Välj operatorn inte som relationen mellan de två fälten och klicka på Sök.
    5. Ange publiceringsdatum från 1/1/2013 till 31/12/2017 i resultatfönstret och välj Journal artikel och granska från artikeltyper.
    6. Öppna FLink (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/flink/flink.cgi) och välj PubMed som databas.
    7. Välj inmatning från Entrez-historiken från inmatningsskärmen och välj Sök i listrutan.
    8. Klicka på Hämta CSV.
      Anm: figur 1 specificerar PubMed-sökrapporten med anteckning för varje avsnitt i rapporten.

2. Scopus

  1. Registrera dig för att få tillgång till de fullständiga sökfunktionerna i Scopus databas. Kontrollera om den lokala institutionen redan är registrerad och har tillgång till databasen eftersom akademiska institutioner vanligtvis är registrerade i Scopus.
  2. Gå till webbplatsen (www.scopus.com) och som standard öppnar Scopus fönstret dokument Sök formulär.
  3. Ange söktermen som önskas i sökfältet som finns.
  4. Ange de fält i artikeln som ska sökas efter. Observera att följande sökfält är tillgängliga: alla fält, titlar, abstract, nyckelord, författare, anknytningar, finansierings information, språk, referenser, konferens, ISSN, CODEN, DOI, ORCID och CAS-nummer.
  5. Lägg till andra fält för att söka efter och ange relationen mellan det nya fältet och det andra fältet som redan har angetts (och, eller, eller och inte). Se (tabell 1) för mer information.
  6. Använd alternativet begränsa för att begränsa sökningen baserat på de alternativ som tillhandahålls av Scopus, som beskrivs i tabell 2. efter att ha utfört sökningen, Spara sökningen och fortsätt senare om det behövs.
    1. I det här fallet anger du en avisering med alternativet Ange avisering, där ett e-postmeddelande skickas när en artikel som uppfyller sökvillkoren läggs till.
  7. Förfina sökresultaten ytterligare från resultaten direkt genom att välja bland de alternativ som tillhandahålls av Scopus (tabell 2), där Scopus visar antalet dokument som ingår för varje alternativ.
  8. Välj att antingen analysera resultaten direkt på Scopus webbplats (klicka på analysera sökresultat) eller exportera resultaten i antingen zip-eller CSV-format efter att du har slutfört sökkriterierna.
  9. Utför följande steg för att analysera Jordaniens forskningsresultat under en 5-års period mellan 1/1/2013 och 31/12/2017 med Scopus.
    1. Gå till webbplatsen (www.scopus.com) och som standard öppnar Scopus fönstret dokument Sök formulär.
    2. Skriv Jordanien som söktermen i formuläret dokumentsökning.
    3. Ange anknytnings land som Sök fält.
    4. Begränsa söktiden från 2013 till 2017. Observera att från 2013 medel från 1/1/2013, och till 2017 medel till 31/12/2017.
    5. Begränsa dokumenttypen till artikel eller granskning och klicka sedan på Sök.
      Anm: figur 2 specificerar Scopus sökrapport med anteckning för varje avsnitt i rapporten.

3. Web of Science

  1. Registrera dig för att få tillgång till de fullständiga sökfunktionerna i Web of Science-databasen. Kontrollera om den lokala institutionen redan är registrerad och har tillgång till databasen som akademiska institutioner vanligtvis är registrerade i Web of Science.
  2. Gå till hemsidan för Web of Science (www.webofknowledge.com). Webbplatsen öppnar den grundläggande sökningen och inkluderar Web of Science Core Collection som den valda databasen för sökning.
  3. Sök efter fälten som beskrivs i tabell 2.
  4. Lägg till ett annat fält (om det behövs) för att ansluta båda fälten genom att antingen och, eller eller inte. Se tabell 1.
  5. Definiera varaktigheten som söks ned till 1945. När du har slutfört sökningen sparas resultaten i historiken och kan returneras när som helst. Om det behövs anger du en avisering om ett nytt dokument läggs till i sökrapporten.
  6. Sortera resultaten enligt antingen data, angivna tider, användnings antal eller till andra kategorier från den nedrullningsbara listan.
  7. Förfina sökresultaten ytterligare från resultaten direkt genom att välja bland de alternativ som tillhandahålls av Web of Science (tabell 2), där Web of Science visar antalet dokument som ingår för varje alternativ.
  8. Visa resultaten och analysera dem via en trädkarta eller stapeldiagram. Observera att det finns en tabell som visar antalet i varje kategori.
  9. Ladda ner resultaten. Observera att till skillnad från Scopus och PubMed, Web of Science tillåter bara nedladdning av 5 000 poster i taget (t. ex. en 10 000 resultat sökning hämtas i två omgångar, den första omgången för de första 5 000 poster, och en andra batch för nästa 5 000 poster).
  10. Utför följande steg för att analysera Jordaniens forskningsresultat under en 5-års period mellan 1/1/2013 och 31/12/2017 med hjälp av Web of Science.
    1. Skriv Jordan i sökfältet och ange adress som sökfältet.
    2. Identifiera varaktigheten av sökningen mellan 2013 och 2017 och klicka på Sök.
    3. Begränsa sökningen med hjälp av artikel-och gransknings filter.
    4. Välj att analysera resultaten som sparas i sökhistoriken nu eller senare.
    5. Välj att analysera resultaten i form av tabeller eller visuella trädkarta och staplar.
      Anm.: figur 3 visar rapporten Web of Science search med anteckning för varje avsnitt i rapporten.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Representative Results

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

Resultat från PubMed search

Sammanlagt 4 363 dokument hämtades baserat på den sökning som genomfördes i denna studie. Fri full text fanns tillgänglig för 1 767 dokument (40,5%). I 2013, totalt 532 dokument publicerades, 663 dokument i 2014, 811 dokument i 2015, 952 dokument i 2016, och 1 405 dokument i 2017.

Resultaten visar att 1 008 (23,8%) dokument diskuterade frågor som rör cancer, medan endast 53 (1,2%) dokument diskuterade AIDS-relaterade ämnen. Resultaten visar också att 150 (3,5%) dokumenten publicerades i tandläkar relaterade tidskrifter, medan 275 (6,5%) dokumenten publicerades i omvårdnads tidskrifter.

Resultat från Scopus search

Sammanlagt 11 444 dokument resulterade i den sökning som genomfördes i den aktuella studien, inklusive 10 974 (95,9%) artiklar och 470 (4,1%) Recensioner. Endast 652 (5,7%) av dokumenten var Open Access.

Diagram 4 visar den årliga trenden i jordanska publikationer under 5-års intervallet. Enligt samarbets landet i Scopus search (figur 5) är Amerikas förenta stater (USA) det vanligaste landet jordanska forskare samarbetar med (1 553 publikationer), följt av saudiarabien med 1 176 publikationer, och Storbritannien med 723 publikationer.

Figur 6 Detaljer de 10 vanligaste disciplinerna jordanier har publicerat i. Baserat på Scopus sökning, medicin är den vanligaste disciplinen Publicerad i (2 441 publikationer), följt av Engineering (1 837 publikationer), och samhällsvetenskap (1 468 publikationer). Jordan universitetet har bidragit till 3 346 (29,3%) publikationer av den sammanlagda femåriga publikationerna, följt av Jordanien universitetar av vetenskap och teknologi med 2 396 publikationer (21,0%) och Hashemiteuniversitetar vid 1 347 publikationer (11,8%).

Resultat från Web of Science search

Sammanlagt 10 943 dokument publicerades i Jordanien. 87 är mycket citerade papper och 14 anses vara heta papper. Resultaten visar att 2 879 dokument var öppen tillgång, 2 547 dokument var guld Open Access, 170 dokument var gröna publiceras, och 162 dokument var gröna accepterade (manuskript deponeras i förråd vid godkännande innan publicering).

Diagram 7 visar den årliga trenden i jordanska publikationer under 5-års intervallet. Figur 8 specificerar samarbets landet. Enligt Web of Science search är USA det vanligaste landet jordanier samarbetar med (929 publikationer), följt av Frankrike med 860 publikationer, och Österrike med 429 publikationer. Figur 9 specificerar de 10 vanligaste disciplinerna jordanier publicerade i. Enligt Web of Science search, är Engineering den vanligaste disciplinen Publicerad i (1 315 publikationer), följt av matematik (1 263 publikationer), och datavetenskap (828 publikationer).

Figure 1
Bild 1: rapporten för PubMed-sökningen med färg anteckning för varje avsnitt i rapporten. vänligen klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 2
Bild 2: rapporten för Scopus Sök med färg anteckning för varje avsnitt i rapporten. Klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 3
Figur 3: rapporten för webben av vetenskap Sök med färg anteckning för varje avsnitt i rapporten. vänligen klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 4
Figur 4: den årliga trenden i publikationer i Jordanien under 5-års perioden, som utvinns ur Scopus. vänligen klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 5
Figur 5: länderna jordanier tenderar att författare publikationer med, som utvinns ur Scopus. vänligen klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 6
Figur 6: disciplinerna jordanska publikationer är i allmänhet om, som utvinns ur Scopus. Klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 7
Figur 7: ett stapeldiagram som visar den årliga publicerings trenden under åren 2013-2017 i Jordanien, som utvinns ur Web of Science. vänligen klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 8
Figur 8: ett stapeldiagram som visar länderna jordanier ansar för att samarbeta med i åren 2013-2017, som utdraget från rengöringsduken av vetenskap. vänligen klicka här för att se en större version av denna siffra.

Figure 9
Figur 9: en trädkarta som visar de 10 discipliner som mest jordanier publicerar in under åren 2013-2017, som utdraget från rengöringsduken av vetenskap. vänligen klicka här för att se en större version av denna siffra.

Operatörs funktion Pubmed Scopus Web of Science Exempel
Båda termerna måste visas Och Och Och
Minst ett av termerna måste visas Eller Eller Eller
Termen efter den får inte förekomma Inte OCH INTE Inte
Du vill hitta två ord inom ett "n" avstånd från varandra oavsett ordning X W/n NÄRA/n Jordan W/2 cancer → hitta ett resultat med orden "Jordan" och "cancer" inom 2 ord från varandra
Du vill hitta ett ord inom en "n" avstånd före det andra ordet (ordning respekteras) X Pre/n X Jordan pre/2 cancer → hitta ett resultat med orden "Jordan" är före "cancer" med 2 ord
Du vill hitta orden med den angivna stammen, oavsett den andra delen av ordet X eller? * Jordanien * eller Jordanien? → kommer också att returnera resultaten för "jordanier"
Du vill hitta ett ord med den angivna stammen och med ett maximum av bara en mer bokstav efter det X X $ eller? Jordanien $ eller Jordanien? → kommer att ge resultat för "Jordans" men inte för "jordanska"
Söker efter den exakta frasen inom citationstecken, kommer att respektera innebörden av alla aktörer som nämns i offerterna X "" "" "Cancer i Jordanien?" → kommer att söka efter "cancer i Jordanien" eller "cancer i Jordans"
Söker efter den exakta frasen inom citattecknen, utan att respektera innebörden av de operatorer som nämns i offerterna X {} X {Cancer i Jordanien?} → kommer att söka efter "cancer i Jordanien?" bara, det är det kommer att tolka frågetecknet som ett frågetecken

Tabell 1: operatorer för att utföra de angivna funktionerna för varje databas. Operatörerna i PubMed måste vara i versaler, till skillnad från de som gäller Scopus och Web of Science. X = inte närvarande.

Resultatåtgärder Pubmed Scopus Web of Science
Dokument varje år
Publikationer i särskild tidskrift
Publikationer per författare
Institutionell tillhörighet
Författar land
Antal Open Access-publikationer (Golden OA)
Antal Open Access-publikationer (grön OA) X X
Publikationer per dokumenttyp
Ämnesområde
Publikationer i särskilda förlag X X
Publikationer för specifika MeSH-termer X
Web of Science-kategorier X X
Finansieringsverket X X
Publikationer om specifika köns X X
Publikationer om specifik åldersgrupp X X
Publikationer av en unik PubMed ID X
Publikationer som förvaltas av en särskild redaktör X X
Högt citerade papper: papper i topp 1% i varje ämnesområde i termer av högsta citat under de senaste 10 åren. X X
Hot Papers på fältet: uppsatser som har varit mycket citerade i de senaste två månaderna jämfört med normen (genomsnittliga citeringar i peer Papers). X X

Tabell 2: resultatmått och sökfilter som är tillgängliga för varje litteraturdatabas. Forskare kan hänvisa till varje databas instruktioner för mer information om hur du använder varje filter.

Pubmed Scopus Web of Science
Täckta discipliner Biovetenskap och biomedicinska discipliner Alla discipliner Alla discipliner
Fokus Biovetenskap och biomedicinska discipliner Fysiska, hälsa, liv och samhällsvetenskap Vetenskap, teknik, samhällsvetenskap, humaniora och konst.
Omfattade perioden 1966 1970 1900 *
Gratis/betald Gratis Betalas Betalas
Ägande National Institute of Health Elsevier Clarivate
Professionell term indexering Ja Nej Nej
Associerad data sökning Nej Nej Ja
Gammal datatäckning Nej Nej Ja
Siffra produktion Nej Ja Ja
Öppen åtkomst bedömning Guld Open Access Guld Open Access Grön och guld Open Access
Användarvänligt gränssnitt + ++ +++
Operatörernas tillgänglighet + +++ ++
* Täckningen beror på institutionell teckning

Tabell 3: jämföra egenskaperna hos PubMed, Scopus och Web of Science. Informationen i denna tabell är baserad på denna studiedata och den information som lämnas av varje databas10,22,23,24.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Discussion

or Start trial to access full content. Learn more about your institution’s access to JoVE content here

I den här studien tillhandahölls de steg som PubMed, Scopus och Web of Science-databaser används för att utföra en Bibliometrisk analys. Det angavs att det vänligaste och enklaste verktyget för att använda för bibliometriska analystjänster är Web of Science; dess nackdel är dock att dess tjänster inte är tillgängliga gratis. PubMed ägnas åt biomedicinska vetenskaper och är knuten till flera andra nationella bibliotek av medicin (NLM) verktyg som kan bidra till att optimera analys av biomedicinska ämnen. Medicinsk ämnesrubrik (MeSH) är ett professionellt indexerings verktyg, där när du lägger till en ny artikel i PubMed databas, kommer artikeln att sökas av experter för de viktigaste ämnena den diskuterar, och en lista med MeSH kommer att tilldelas för varje artikel. Å andra sidan är dess huvudsakliga nackdel att det kräver goda kunskaper om hur man använder den. Söka på Web of Science Core Collection kommer att ge alla artiklar som publiceras i tidskrifter indexerade i Science Citation index expanderat (SCIE), samhällsvetenskapliga Citation index (SSCI), Arts and humaniora Citation index (AHCI), och den nyligen tillagda Framväxande källa Citation index (ESCI), där författarna kan välja databasen inom Web of Science att söka i18. Dessutom ingår även två andra databaser för böcker och konferenser19. Scopus är vanligtvis lätt att använda och har en databas som täcker fler journaler än de andra två tjänsterna20, men det är fortfarande en betaltjänst. Tabell 3 ytterligare detaljer och jämför egenskaperna hos PubMed, Scopus och Web of Science.

Som framgår av resultaten, var och en av Scopus och Web of Science Database search som olika discipliner som de vanligaste disciplinerna jordanier publicera i. Orsakerna bakom dessa avvikelser granskades genom att analysera forskningsområdets (disciplin) klassificering för varje databas. Det konstaterades att Scopus search gav 27 forskningsområden, där publikationer klassificeras i en eller flera av dem. Å andra sidan gav Web of Science search 140 forskningsområden. Web of Science-publikationer klassificeras dock endast i en av dem (ingen publikation klassificeras i mer än ett forskningsområde). Till exempel, det gemensamma forskningsområdet "medicin" i Scopus motsvarar 27 forskningsområden inom Web of Science, som är (siffror motsvarar bidraget från varje forskningsområde i den totala 10 936 publikationer som resulterade från Web of Science search):

Internmedicin (2,5%), neurologi (2,2%), onkologi (2,2%), kirurgi (1,4%), endokrinologi (1,1%), pediatrik (1,1%), psykiatri (1%), experimentell medicin (1%), kardiovaskulära systemet (0,9%), infektionssjukdomar (0,9%), radiologi (0,9%), ortopedi ( 0,7%), obstetrik och gynekologi (0,7%), immunologi (0,6%), rehabilitering (0,6%), hematologi (0,6%), urologi (0,5%), respiratorisk (0,4%), oftalmologi (0,3%), gastroenterologi (0,3%), komplementär medicin (0,3%), dermatologi (0,2%), morfologi ( 0,2%), reumatologi (0,2%), Anestesiologi (0,2%), akutmedicin (0,1%), allergi (0,1%).

Som förklarats tidigare i protokollet, forskare kan ladda ner sökresultat i en CSV-eller XLSX-format, där flera verktyg är tillgängliga för att ytterligare analysera och kartlägga resultaten. Dessa verktyg tillämpa begreppet vetenskap kartläggning eller bibliometriska kartläggning, som är en rumslig representation av hur discipliner, fält, dokument eller författare är relaterade24,25:

  • Verktyget Sci2 (https://sci2.cns.iu.edu/user/index.php): ett fritt tillgängligt verktyg för att utföra analyser av data som hämtats från Scopus, Web of Science eller till och med PubMed.
  • BibExcel (http://homepage.univie.ac.at/juan.gorraiz/bibexcel/): ett fritt tillgängligt verktyg som hanterar och bygger kartor för data som extraheras från olika bibliometriska program.
  • CiteSpace (http://cluster.cis.drexel.edu/~cchen/citespace/): ett fritt tillgängligt verktyg för visualisering och analysering av trender och mönster i vetenskaplig litteratur.
  • UCINET (https://sites.google.com/site/ucinetsoftware/home): ett s ubscription-baserat verktyg för analys av sociala nätverksdata och ritning visualiserade kartor.
  • Pajek (http://mrvar.fdv.uni-lj.si/pajek/): ett fritt tillgängligt verktyg för analys och visualisering av stora nätverk.
  • Leydesdorff s programvara (https://www.leydesdorff.net/software.htm): ett fritt tillgängligt verktyg för att analze utdata från bibliometriska databaser och att rita mappningar av resultaten.
  • Network Workbench Tool (http://nwb.cns.iu.edu): ett fritt tillgängligt verktyg som tillhandahåller specifika algoritmer för att hantera publikationsdata för att konstruera och analysera bibliometriska nätverk och kartor.
  • VintagePoint (https://www.thevantagepoint.com): ett prenumerationsbaserat verktyg för att analysera och kartlägga stora mängder strukturerad text för att upptäcka mönster och relationer
  • VOSviewer (http://www.vosviewer.com/download): ett fritt tillgängligt verktyg speciellt utformat för att konstruera och visualisera bibliometriska kartor, med särskild uppmärksamhet på den grafiska representationen av sådana kartor.

Dessutom kan forskarna använda data från de tre databaserna (PubMed, Scopus och Web of Science) och beräkna flera andra värdefulla index med hjälp av data från andra källor, inklusive Världsbanken och organisationen för ekonomiskt samarbete och Utveckling (OECD). Som årliga publikationer och författarens land av tillhörighet finns som utfall mätningar i de tre databaserna, kan följande index sålunda mätas:

  • Befolknings index
  • Antal publikationer per miljon invånare, där populationer kan erhållas från Världsbankens databas26.
  • Publikationer per bruttonationalprodukt (BNP)
  • Antal publikationer per miljard dollar BNP, där BNP kan erhållas från "World Development Indicators" från Världsbankens databas26.
  • Årlig vetenskaplig tillväxttakt (forsknings produktivitet)
  • (Publikationer år (n) – publikationer i år (n-1))/publikationer i år (n-1)
  • Publikationer per region

Eftersom världen är uppdelad i 9 regioner enligt FN: s statistikår bok av FN: s27, dessa divisioner bygger på geografiska, vetenskapliga och ekonomiska överväganden. Dessa regioner är: Västeuropa, Östeuropa, Amerikas förenta stater (USA), Kanada, Latinamerika och Västindien, Afrika, Japan, Asien (exklusive Japan) och Oceanien.

Forskare som siktar på att göra bibliometriska analyser med hjälp av ovannämnda databaser bör vara medvetna om sina begränsningar. tidskrifts täckningen av Scopus och Web of Science i nästan alla discipliner når inte hälften av tidskrifterna i Ulrich ' s periodiska ordbok28. Det innebär att även om Scopus och Web of Science indexerade tidskrifter bygger på kvalitet, täcker de inte alla tidskrifter i någon disciplin. Dessutom är icke-engelska språk journaler underrepresenterade, eftersom fokus för dessa databaser är engelskspråkiga tidskrifter28. En av de begränsningar man kan stöta på under analysen är otillgängligheten av fullständig information om en artikel (t. ex.saknade författarens land av tillhörighet), vilket kan leda till någon form av fel i resultaten. Detta kan undvikas genom att utföra en manuell sökning för författaren. Denna fråga diskuterades dock inte i den analys som genomfördes i denna studie, eftersom tidigare studier har uppskattat att den saknade informationen som orsakats av denna fråga är obetydlig (mindre än 5%)6.

Subscription Required. Please recommend JoVE to your librarian.

Disclosures

Alla författare avslöjar inga potentiella intressekonflikter.

Acknowledgments

Författarna skulle vilja tacka Deanship av vetenskaplig forskning för sin fond för att stödja videoproduktion för denna studie. Författarna skulle också vilja tacka Dr Aseel Zabin, Institutionen för engelska språket och litteraturen, University of Jordan för engelska språket översyn av denna studie.

Materials

Name Company Catalog Number Comments
clarivate N/A Web of Science provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.
Elsevier N/A Scopus provider, where the access was provided by the subscription made by the University of Jordan.

DOWNLOAD MATERIALS LIST

References

  1. McGowan, J. PRESS peer review of electronic search strategies: 2015 guideline statement. Journal of Clinical Epidemiology. 75, 40-46 (2016).
  2. Hood, W., Wilson, C. The literature of bibliometrics, scientometrics, and informetrics. Scientometrics. 52, (2), 291-314 (2001).
  3. Bar-Ilan, J. Citations to the Introduction to infometrics indexed by WOS, Scopus and Google Scholar. Scientometrics. 82, (3), 495-506 (2010).
  4. Boudry, C., Baudouin, C., Mouriaux, F. International publication trends in dry eye disease research: A bibliometric analysis. The Ocular Surface. 16, (1), 173-179 (2018).
  5. Kulkarni, A. V. Comparisons of citations in Web of Science, Scopus, and Google Scholar for articles published in general medical journals. Journal of the American Medical Association. 302, (10), 1092-1096 (2009).
  6. AlRyalat, S. A., Malkawi, L. International Collaboration and Openness in Jordanian Research Output: A 10-year Publications Feedback. Publishing Research Quarterly. 34, (2), 265-274 (2018).
  7. Falagas, M. E., Karavasiou, A. I., Bliziotis, I. A. Estimates of global research productivity in virology. Journal of Medical Virology. 76, (2), 223-229 (2005).
  8. Young, H. The ALA glossary of library and information science. Ediciones Díaz de Santos. (1983).
  9. Broadus, R. Toward a definition of bibliometrics. Scientometrics. 12, (5-6), 373-379 (1987).
  10. Falagas, M. E. Comparison of PubMed, Scopus, web of science, and Google scholar: strengths and weaknesses. The FASEB Journal. 22, (2), 338-342 (2008).
  11. Guz, A. N., Rushchitsky, J. J. Scopus: A system for the evaluation of scientific journals. International Applied Mechanics. 45, (4), 351 (2009).
  12. Jacso, P. As we may search-comparison of major features of the Web of Science, Scopus, and Google Scholar citation-based and citation-enhanced databases. CurrentScience. 89, (9), 1537-1547 (2005).
  13. Li, J. Citation analysis: Comparison of Web of Science, Scopus, Scifinder, And Google Scholar. Journal of Electronic Resources in Medical Libraries. 7, (3), 196-217 (2010).
  14. Levine-Clark, M., Kraus, J. Finding chemistry information using Google Scholar: a comparison with Chemical Abstracts Service. Science & Technology Libraries. 27, (4), 3-17 (2007).
  15. Gavel, Y., Iselid, L. Web of Science and Scopus: a journal title overlap study. Online Information Review. 32, (1), 8-21 (2008).
  16. Harzing, A. W., Alakangas, S. Google Scholar, Scopus and the Web of Science: a longitudinal and cross-disciplinary comparison. Scientometrics. 106, (2), 787-804 (2016).
  17. Aghaei Chadegani, A., et al. A comparison between two main academic literature collections: Web of Science and Scopus databases. (2013).
  18. Testa, J. The Thomson Reuters journal selection process. Transnational Corporations Review. 1, (4), 59-66 (2009).
  19. Web of Science Core Collection: Web of Science: Summary of Coverage. http://clarivate.libguides.com/woscc/coverage (2018).
  20. Burnham, J. F. Scopus database: a review. 3, (1), Biomedical Digital Libraries. 1 (2006).
  21. Pubmed. www.ncbi.nlm.nih.gov/ (2018).
  22. Scopus. www.scopus.com (2018).
  23. Web of Science. www.webofknowledge.com (2018).
  24. Small, H. Visualizing science by citation mapping. Journal of the American society for Information Science and Technology. 50, (9), 799-813 (1999).
  25. Cobo, M. J. Science mapping software tools: Review, analysis, and cooperative study among tools. Journal of the American Society for Information Science and Technology. 62, (7), 1382-1402 (2011).
  26. World bank. http://www.worldbank.org (2018).
  27. Statistical Yearbook – 60th issue. https://unstats.un.org/unsd/publications/statistical-yearbook/ (2018).
  28. Mongeon, P., Paul-Hus, A. The journal coverage of Web of Science and Scopus: a comparative analysis. Scientometrics. 106, (1), 213-228 (2016).
Jämföra bibliometriska analyser med hjälp av PubMed, Scopus och Web of Science-databaser
Play Video
PDF DOI DOWNLOAD MATERIALS LIST

Cite this Article

AlRyalat, S. A. S., Malkawi, L. W., Momani, S. M. Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases. J. Vis. Exp. (152), e58494, doi:10.3791/58494 (2019).More

AlRyalat, S. A. S., Malkawi, L. W., Momani, S. M. Comparing Bibliometric Analysis Using PubMed, Scopus, and Web of Science Databases. J. Vis. Exp. (152), e58494, doi:10.3791/58494 (2019).

Less
Copy Citation Download Citation Reprints and Permissions
View Video

Get cutting-edge science videos from JoVE sent straight to your inbox every month.

Waiting X
simple hit counter