Summary
成長媒体の 2 種類の磁性のいくつかの株の成長のための手順を紹介します。磁性 gryphiswaldense MSR 1 株で栽培されて液体と O2濃度勾配半固体メディアM. 細菌系統 AMB 1 およびM. magnetotacticum系統 MS 1 を液体培地で育つ。
Abstract
走磁性細菌は、淡水と海洋の生息地におけるユビキタス グラム陰性、運動性、主に水生微生物です。彼らは biomineralize マグネトソーム磁気ナノ結晶マグネタイト (Fe3O4) または greigite (Fe3S4) の内脂質二重膜に囲まれたである彼らの能力によって特徴付けられる、細胞質。ほとんど知られている走磁性細菌の細胞質、細胞に永久磁気双極子モーメントを授与し、受動的外部磁気フィールドに合わせてそれらを引き起こしている中鎖マグネトソームをまとめます。走磁性細菌ではこれらの特定の機能のため商業・医療用大きな可能性があります。ただし、ほとんどの種は微好気、大腸菌など他の多くの細菌よりも日常的に成長するが難しくして特定の O2濃度要件をあります。走磁性バクテリア属磁性に属するすべての最も広く研究の系統の 3 つを成長のための詳しいプロトコルをご紹介します。これらのメソッド、彼らは正常に成長し、合成マグネトソームを確保するために、細菌に可能 O2濃度の正確な制御を可能にします。これらのプロシージャを使用して研究のための走磁性細菌の成長する微生物学の専門家である験者を必要はありません。この記事で紹介した一般的な方法も使えますを分離し、他の走磁性細菌文化成長媒体の化学組成を変更する必要がありそうだが。
Introduction
走磁性細菌 (MTB) は、グラム陰性菌原淡水と海洋の水生生息地1のユビキタスの広い範囲を表します。これらの細菌は、マグネタイト (Fe3O4) ・ greigite (Fe3S4)、鎖の細胞の中に組み立てられるほとんどの場合は、磁気の結晶を生産する能力を共有します。この特定の構造モチーフは、機能を持ち、各結晶2を取り囲む脂質膜に細菌の細胞質にいくつかの特定の蛋白質の存在によるものです。それぞれの個々 の水晶とその周囲の膜小胞、磁性細菌と呼ばれる約 30 から 50 までサイズで及ぶ磁性種3nm。マグネトソームのチェーンの配置、ためこれらの細菌は、外部磁場と受動的に整列させる永久磁気双極子モーメントを所有しています。したがって、これらの細菌は、積極的に演技以上におそらく自走マイクロ コンパスは効果的に最も有利な条件を見つけて、磁力線に沿って泳ぐ (e.g。、O2濃度) の成長のため。
MTB の興味深いプロパティ化学・磁性細菌結晶の結晶構造解析の両方を調節できることです。ほとんどの系統はいくつか磁鉄鉱の greigite、比較的高純度結晶を生成 biomineralize 鉱物4両。すべてのケースでは、細菌は単一磁結晶の形状とサイズを正確に制御することができます。これは MTB がこのバイオミネラリゼーション プロセスを実行する方法のよりよい理解を開発する研究の偉大な量を実施する理由について説明します。このプロセスを理解する多くの商業および医療アプリケーションの磁気ナノ結晶をオーダーメイドするため研究が可能です。
MTB の広範な研究に相当な障害物は、実験室でそれらの成長の難しさをされています。この作業で使用する系統を含む、ほとんどの種は、偏性微好気 O2ターミナル電子受容体として成長してきたときです。これは、これらの細菌が好気、無酸素条件 (酸素-無酸素インターフェイス、OAI) 間の移行帯で最もよく見られる理由について説明します。これは明らかに MTB が明らかにこれらの有機体のための成長媒体を工夫を考慮する必要がある正確なの O2濃度要件であることを示しています。また、MTB の優れた既存の多様性は、異なる系統が異なるタイプの化学勾配と最適な成長を達成するために栄養素を必要がありますを意味します。
この作品で最も広く研究の MTB の 3 つの成長のための方法を述べる: , 一般講演(AMB 1 株)、 m. magnetotacticum (MS-1)、 m. gryphiswaldense (MSR-1)。これらの種系統プロテオ バクテリア門でAlphaproteobacteriaクラスに属する形態でヘリカル、セルの各端の極鞭毛を持っています。液体の O2濃度勾配半固体媒体、以前に発行された中レシピ5,6に基づく MSR 1 株の成長のためのプロトコルを提供します。変更された磁気スピリルム成長媒体 (MGSM)7の AMB 1 および MS 1 系統を成長のための詳しいプロトコルを提案する.
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Protocol
1. N2局設置
注: は、最小リークでガソリン タンクに接続することができます、1 mL プラスチック注射器のシリンダーがこのチューブにしっかりと収まるように、チューブの内径を選択します。給油完了 N2の図は、図 1で提供されます。
- N2駅 (約 50 cm の長さ) を設定する十分なスペースがベンチの近くに N2ガスのタンクを安全にインストールします。
- タンクに駅が建設される領域に到達する十分な長さにチューブの部分を接続します。必要に応じて、任意の漏れを避けるためにタンクの出力にテフロン テープを適用します。
- 同時に駅中のバブルの 5 本の対応を構築するための長さ約 5 cm のチューブの 4 つの部分をカットします。
- 3 3 ウェイ T 形プラスチック継手とラインのチューブの部分を組み立てます。余分な T 字継ぎ手を介して N2タンクの出力でのチューブの部分にこの線の一方の端を接続します。もう一方の端で 90 ° エルボを追加します。
- 構造を水平金属棒にアタッチする使用テープには、ベンチの上のおよそ 30 cm が配置されます。
- 手順 1.4 のインストール付属品の無料出力するため (長さ約 20 cm) にチューブの 5 個を接続します。
- 5 1.0 mL プラスチック注射器からピストンを外し、これらの注射器の大きい方の端をカット (すなわち。、反対側に針)、卒業の部分だけを維持します。余りに堅く、綿とこれらの注射器を入力します。
- チューブの 20 cm の縦に長い部分に注射器を挿入し、石鹸水を使用して N2を流れるときに漏れがないことを確認します。
- 5 25 G 針 (0.5 mm × 25 mm) のキャップを取り外し、これらの針を細いチューブの 10 cm の部分に挿入します。針がしっかりとチューブに収まることを確認します。
注意: この手順中に刺しの危険性があります。ゆっくりと慎重にそれを行います。 - N2駅の注射器に準備手順 1.9 で針を取り付けます。N2は、すべて 5 つのラインを流れることを確認し、スタンドでのステーションを維持します。
2. 成長培地の準備
注: それは 2.1.2、2.2.2 と 2.3.8 の手順で説明したように、調製した培地の量を調整することが可能です。水や化学薬品の量は、比例して調整するだけのニーズを使用しました。すべての培地成分の役割は、補足表 1で説明されます。
- MSR - 1 液体の成長媒体の作製
- ● クエン酸鉄の 0.245 g を 100 mL の脱イオン蒸留水に追加することによって 10 mM クエン酸第二鉄溶液を調製します。熱し、黄色のオレンジ色の明確な解が得られるまで溶解する攪拌します。オートクレーブの標準を使用して、ソリューション (121 ° C で少なくとも 15 分の露出) のサイクルし、暗闇の中で室温でこの原液を保存します。
注: は、沈殿物が明らかになるとき鉄のクエン酸液を捨てください。 - ビーカーに攪拌しながら順に以下の追加脱イオン蒸留水 1 L を含む: 1.0 mL の微量ミネラルを補うソリューション、KH2PO40.1 g、MgSO4.7 H2O の 0.15 g、HEPES、2.38 g ナノ3 0.34 g、0.1 グラム酵母抽出物、大豆豆ペプトン 3.0 g 4.35 mL 乳酸カリウム (60%/w 溶液) と 10 ミリメートル fe (iii) クエン酸原液 5 mL。
注: 小さい成長培地量が必要な場合それに比例して量を調整します。このプロトコルの手順 1 でビルドされるなど、同時にバブル 5 本ことができる N2駅の中の 300 mL を準備します。
警告: トレース鉱物と fe (iii) クエン酸在庫ソリューションを滅菌しておく必要があります。汚染を避けるためには、それら (火炎瓶ブンゼン バーナーを使用してのオープン トップ) を使用する場合、標準的な滅菌方法を使用し、調剤の滅菌ピペット チップを使用します。4 ° C で冷蔵庫にミネラル溶液を保存します。 - すべての化学薬品の添加後、1 M NaOH 水溶液で 7.0 に pH を調整します。125 mL の血清ボトルに作りたての媒体を調剤します。各ボトルの中の 60 mL を注ぐ。
- バブル N2溶存 O2を削除する 30 分の中に、小さなチューブを使用して手順 1 で記載されている N2駅に接続されています。各ボトルは、ボトルを終了する過剰なガスを許可するように小さな開口部を残して上にブチル ゴム栓を置きます。
注意: N2をバブリングしながら泡を形作るかもしれない。泡の生産を避けるためにガスの流れを調整します。 - 圧着シール準備ストッパーとアルミ シール各ボトルです。アルミのシールによりボトルがプロトコルの残りの間に密封されたまま。
- N2駅から針と細いチューブを外し、清潔な針 (1 インチ、≤ 23 G) に置き換えます。ガスの穏やかな連続流れ終了 (約 50 mL/分) タンク N2タンクのバルブを調整します。
注意: 針 23 G より大きいストッパーの永久的な unsealable の穴になります。 - ゴム栓を介して、培地の瓶の中に N2タンクに接続されている針のいずれかを挿入します。すぐに同じボトルに別のきれいな針を挿入します。その他のボトルにこの手順を繰り返し、N2でボトル内の空気を交換する約 30 分の N2を流します。
- 対応する針を削除することによって、N2駅からボトル 1 本を外します。培地のボトル内の圧力が大気圧に減るまで、数秒間待つし、2 つ目の針を抜きます。すべての残りのボトルのためには、この手順を繰り返します。
注意: O2を防ぐため、2.1.4 のステップの後成長培地のボトルを再入力してから、立て続けに 2.1.8 2.1.4 - の手順に従います。すべてのボトルは、同時に N2駅に接続することはできない場合、は、ボトルの最初のセットの手順 2.1.4-2.1.8 続行し、残りのボトルにこれらの手順を繰り返します。 - オートクレーブ ボトル。一晩室温にクールにさせて、その後室温で保管します。
- ● クエン酸鉄の 0.245 g を 100 mL の脱イオン蒸留水に追加することによって 10 mM クエン酸第二鉄溶液を調製します。熱し、黄色のオレンジ色の明確な解が得られるまで溶解する攪拌します。オートクレーブの標準を使用して、ソリューション (121 ° C で少なくとも 15 分の露出) のサイクルし、暗闇の中で室温でこの原液を保存します。
- AMB 1、MS 1 液体の成長媒体の作製
- 10 mM 鉄キナ酸溶液を調製します。最初脱イオン蒸留水 100 mL にキナ酸 0.19 g を溶解した FeCl3.6H2O. 攪拌溶解、暗い赤、明確な解決策が得られるまでに 0.27 g を追加します。オートクレーブ (121 ° C で少なくとも 15 分の露出) の標準的なサイクルを使用して、ソリューション。
注: は、ストック溶液を滅菌として暗闇の中で部屋の温度を鉄系ソリューションを格納します。沈殿物が明らかになる場合は、ソリューションを破棄します。 - ビーカーに攪拌しながら順に以下の追加脱イオン蒸留水 1 L を含む: 10.0 mL のビタミン サプリメント溶液、トレース ミネラルのサプリメント溶液、KH2PO4、コハク酸ナトリウム二塩基の 0.848 g 0.68 g 5.0 mL六水和物、ナトリウム ・酒石酸二水和物、0.45 mL 0.1% の酢酸ナトリウム三水和物の 0.083 g の 0.575 g 0.17 g ナノ3、0.04 g のアスコルビン酸、10 ミリメートル fe (iii) キナ酸原液の 3.0 mL の水溶液レサズリン。
注: 小さい成長培地量が必要な場合それに比例して量を調整します。このプロトコルの手順 1 でビルドされるなど、同時にバブル 5 本ことができる N2駅の中の 300 mL を準備します。
注意: ビタミン、微量ミネラルとキナ酸鉄 (iii) 溶液は滅菌しておく必要があります。汚染を避けるためには、調剤するとき標準的な無菌手技と滅菌ピペット チップを使用します。4 ° C で冷蔵庫にミネラルとビタミンがソリューションを格納します。 - すべての化学薬品の付加の後で 6.75 1 M 水酸化ナトリウム溶液を使用するために pH を調整します。
- 手順 2.1.3-2.1.9 プロトコルの残りの部分を参照してください。
- 10 mM 鉄キナ酸溶液を調製します。最初脱イオン蒸留水 100 mL にキナ酸 0.19 g を溶解した FeCl3.6H2O. 攪拌溶解、暗い赤、明確な解決策が得られるまでに 0.27 g を追加します。オートクレーブ (121 ° C で少なくとも 15 分の露出) の標準的なサイクルを使用して、ソリューション。
- MSR 1 半固体成長培地の調製
- K2HPO4 3.362 g と KH2PO4 100 mL の脱イオン蒸留水で 4.178 g を溶解して 0.5 M のリン酸バッファー溶液 pH 7.0 を準備します。PH が 7.0 の場合をチェックし、KH2PO4または必要な場合は水酸化ナトリウムと pH を調整します。密封されたガラス瓶 (プラスチックの酸素交換を避けるためにすることが望ましい) でソリューションを保存します。
- 0.02 M 塩酸溶液 100 mL を準備します。このソリューションにした FeCl2.4H2O の 0.2 g を加え、10 mM 鉄塩化物溶液を得るために解散するかき混ぜます。密封されたガラス瓶の中の暗闇の中でソリューションを保存します。
- 0.8 M 重炭酸ナトリウム溶液を準備するには、100 mL の脱イオン蒸留水に NaHCO3 6.72 g 溶解します。密封ガラス瓶でソリューションを保存します。
- オートクレーブ ソリューション 2.2.1 - 2.2.3 標準サイクル (121 ° C で少なくとも 15 分の露出) を使用しての手順で準備します。暗闇の中で滅菌溶液を保存します。
- ビーカーに攪拌しながら順に以下の追加脱イオン蒸留水 1 L を含む: トレース ミネラルのサプリメント溶液、0.2 mL の 1% 水溶液レサズリン溶液、NH4Cl、MgSO4.7H2 0.1 g 0.3 g, 塩化ナトリウム 0.4 g 5 mLO、CaCl2.2H2O、1 g ナトリウム、コハク酸、酢酸ナトリウム、酵母の 0.2 グラムの 0.5 g の抽出の 0.05 g、寒天の 1.6 g。
- アルミ箔とオートクレーブ 2.3.5 準備したソリューション ビーカーをカバーします。
- オートクレーブ サイクルの最後の直前に準備新鮮な 4% L cysteine·HCl·L cysteine· の 0.8 g を溶解することにより H2O ソリューションHCl·H2O 脱イオン蒸留水 20 mL に。5 M NaOH 溶液で Ph7.0 にソリューションを中和します。
注意: システインの酸化を避けるためにシステイン溶液を調製して新鮮なことが重要です。4 ° C で冷蔵庫にミネラル溶液を保存します。 - オートクレーブ後、50-60 ° C まで中を冷ます、ブンゼン バーナーの炎の下でビーカーをもたらします。アルミ箔を削除し、すぐに軽く攪拌しながら順に次を追加: ビタミン溶液、滅菌リン酸バッファー原液、滅菌鉄塩化原液、重炭酸ナトリウム滅菌株式 1.8 mL 3 mL の 2.8 mL 0.5 mLソリューション、ろ過殺菌されたシステイン溶液 10 mL です。
注: 小さい成長培地量が必要な場合それに比例して量を調整します。通常媒体の 120 mL のバッチを準備すると便利です。
注意: すべてのソリューションに将来使用するため無菌のままする必要があります。手順 2.3.8 無菌手技と滅菌ピペットを使用して調剤するときのヒントします。 - すべての化学薬品の付加の後で 16 mL 滅菌スクリュー キャップ ハンゲイト チューブに温かい媒体を転送します。各チューブに媒体の 12 mL を転送し、チューブをシールします。
注意: 汚染を防止するには、ブンゼン バーナーの炎の下で 2.3.9 ステップを実行します。媒体は 40 ° c 以上、寒天が固化する前にそれを実行します。 - チューブを寒天が固化なり、OAI 明らかに無色のインターフェイス、媒体の表面下約 1 〜 3 cm にピンクとして具体化するまで数時間行わないでください。
メモ: 媒体はチューブで無色にはゆっくりと。この遷移に必要な時間の量は可変して O2媒体に溶解した当初の量によって異なります。
3。 MTB の接種
注: AMB-1 MS 1 および MSR 1 系統の文化商業的入手できます (テーブルの材料)。
注意: は、ブンゼン バーナーの炎の下で無菌の状態ですべての次の手順を実行します。
- 液体培地で MSR 1、AMB 1 MS 1 株の接種
- ブチル ゴム栓アルミシール圧着と空 125 mL 血清ボトルをシールします。ストッパーをボトルで 2 本の針を挿入し、それらの 1 つのステップ 1.7 のように注射器を接続します。O2 N の2駅の使用とチューブの同じタイプのシリンダーに注射器を接続します。
- O2を通過、約 30 分のためのびんをさせて、O2でボトル内の空気をすべてを置き換えることを確認します。ボトルとし、オートクレーブのわずかな重圧を可能にする両方の針を削除します。使用する前に室温に冷却するボトルを許可します。
注: 時間を節約するには、媒体の準備・ オートクレーブ媒体または貯蔵液と一緒にボトル中 3.1.1 と 3.1.2 の手順に従います。 - それらの上に 70% エタノール溶液数滴を適用するブンゼン バーナーの炎の中を渡すことによって新鮮な中瓶・ O2ボトル ストッパーのトップスを滅菌します。
- 滅菌注射器と針を使って、O2ボトルから O2の 1 mL を抽出し、新鮮な培地ボトルにそれを転送します。針緊密に収まること注射器このステップの中に注射器で空気を避けるためにしていることを確認します。
- ガラス瓶で育った別の文化から接種材料を使用している場合は、それらの上に 70% エタノール溶液数滴を適用するブンゼン バーナーの炎の中を渡すことによって新鮮な中瓶の古い文化のボトル ストッパーを滅菌します。冷凍文化のチューブから菌を使用している場合ちょうどブンゼン バーナーの炎の下で密封された管とそれを室温まで温を知らせてください。
- ガラス瓶で育った別の文化から接種材料を使用している場合は、新鮮な媒体に古い文化の 1 mL を接種します。冷凍ストックから inoculate を使用している場合は、希釈、グリセロールまたはジメチル ジメチルスルホキシド (DMSO) 凍結の過程で使用する唯一の 0.1 mL を接種します。どちらの場合も、滅菌注射器、滅菌針を使用します。
- 32 ° C で文化を孵化させなさい、それを 4 〜 7 日後新鮮な培地に接種します。
- MSR 1 の O2グラデーション半固形培地での接種
- 新鮮な媒体のチューブが無色のインターフェイスにピンクが具体化、明確に定義された OAI を表示されることを確認します。
- 場合接種は別の O2濃度勾配半固体培養から来ている, 細菌によって形成されたバンドに配置滅菌ピペット チップ細菌の文化の 50 μ L 分注で収穫します。ゆっくりとインターフェイスの妨害を回避する新鮮な媒体 (ピンク/無色インターフェイス)、OAI でこれらの細菌を接種します。接種は、冷凍の文化から来ている場合、は、代わりに菌の 100 μ L と同じ方法で進みます。
- シール チューブと細菌は 25 ° C から 30 ° C 成長させバンド細菌の培地の表面に達する前に、同じ手順を使用して新鮮な媒体に転送します。
4. 細菌の観察
- それの上に 70% エタノール溶液を適用するブンゼン バーナーの炎を通過して文化の瓶の栓を消毒します。半固形培、ブンゼン バーナーの炎の下で管を開いてください。滅菌注射器、滅菌針を使用して、細菌を抽出します。
- 絞首刑の使用は、細菌が磁気と運動の両方であることを確認する方法8をドロップします。
注: 位相差顕微鏡は、偉大な結果を与えるが、必須ではありません。倍率 10 X 60 X に至るまでが適しています。 - 細胞の構造とで詳細8マグネトソームを観察するのに透過型電子顕微鏡 (TEM) を使用します。
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Representative Results
成長媒体の成功の準備は、次のとおり評価できます。プロセスの最後に、ソリューションをクリア (すなわち。 任意の沈殿物の無料) 取得する必要があります (これは液体メディアと O2グラデーション半固体媒体の両方に当てはまります)。接種は図 2 aで見ることができる前に、MSR 1 液体培地の予想される側面を表示する画像。成功した O2濃度勾配の半固体媒体に管 (図 3チューブ A) の上部にピンクの媒体の 1-3 cm の存在によって示されるいくつかの時間後、OAI の形成によって通知されます。メディアの残りの部分は、無色にする必要があります。接種が、レサズリンの完全酸化の署名する前にすべてのピンク色中、したがって O2濃度勾配の失敗の準備。
液体媒体の成長に成功チェックできます約 48 時間 (または接種は冷凍の文化から来ている場合、数日後) 接種後光源または分光光度計を使用して濁度の文化を調べるだけで。成長は、濁質細菌が (図 2 b) を実際に成長したことを証明によって確認されます。媒体は 48 時間後明確に残る、細菌の成長していません。正常な成長、液体培、磁気撹拌プレートに培地のボトルを置いて、懐中電灯で照らすマグネトソームを合成する細菌の存在を 48 時間後チェックできます。低攪拌速度でメディアする必要があります「フラッシュ」、暗い、験者の位置に関して攪拌磁石の方向に応じて明るく交互に探しています。非磁性文化験者に向けて細胞からの散乱光の強度は一定になります。
半固体媒体の成功の成長は、ピンク/無色のインターフェイスでの細菌の微好気バンドの形成によって示されます。O2 O2グラデーションの変化と細菌によって消費のためバンドはゆっくり OAI (図 3チューブ B) に従うに移行されます。
ぶら下げドロップ法により細菌が磁気と運動の両方であることを確認するオブザーバー。数分後 MTB は、彼らが積極的に (図 4 a) 磁力線に沿って泳ぐことを証明するハンギング ドロップの端に集中すべきです。セルが磁気であるためには、ドロップの隣に座っている磁石の方向を反転します。細菌 (図 4 b) の反対側の端の方の水泳を開始する必要があります。最後に、tem、マグネトソームの図形を確認できます。Cuboctahedral 結晶約 30-45 nm の直径を9観察すべき。これらの結晶は通常、1 つの長いチェーンに配置または種の複数の短い鎖はここで学んだ (図 5)。
図 1: N2のイラスト給油します。(、) 模式図。(b) セットアップの画像。成功駅は、プロトコルの手順 1.9 で説明した細いチューブの端のままガスのバブリング段階媒体に没頭ように大きくて薄いチューブの適切な長さをあります。ガスの流れは、調整可能なすべての回で、すべての O2が削除されていることを確認して、媒体が流出しないこともあります。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
図 2: 液体の成長媒体の前に、と接種後のボトル。接種前に (、) 明確な MSR 1 媒体。成長の 3 日後に濁った MSR-1 (b) 媒体。この図の拡大版を表示するのにはここをクリックしてください。
図 3: O2のチューブ(チューブ A) 前にグラデーションの半固体媒体と (チューブ B) 接種後 10 日。チューブ B の細菌のバンドは、赤い矢印で示されます。
図 4: 20 X でハンギング ドロップの典型的な結果位相差顕微鏡を使用しての倍率。(、) MTB 磁石の南極に向かって泳ぐし、液体または空気インターフェイスでの蓄積します。(b) マグネットを反転した後 1 分、ほとんどの細胞は、ビューのフィールドを残しています。
図 5: AMB 1 セルの TEM 観察。磁性細菌のチェーンは、赤い矢印で示されます。2 本の鞭毛は、黒の矢印で示されます。
補足表 1.この表をダウンロードするにはここをクリックしてください。
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Discussion
MTB 特有の O2濃度要件はように実験室で成長する非自明です。液体培地用のプロトコルの重要なステップは、O2、接種直前の明確なボリュームを追加して最終濃度を制御するために媒体からのすべての O2の初期の除去です。MSR 1 がほぼ完全に好気性の条件の下で育つ、しかし、細胞の磁性を大幅に削減、それを示されています。同じ調査の結果を示した、AMB 1 系統と MS-1 成長しない完全好気性条件6歳未満。MSR 1 の半固体培養、すべて O2はまずシステイン溶液による減少し、O2濃度勾配の表示されます、OAI の形成に 。文化も育たない、磁気ではない場合、O2濃度は最初に確認をする必要があります。
半固体成長培地が不明な MTB を分離する、または成長と安定勾配の存在を確実に自分の位置に細菌をことができます両方の O2と酸化還元勾配に非常に敏感な種のための興味深い選択最適な生育条件を提供する場所です。液体培地は高いボリュームが必要な場合を使用する方が便利 (e.g、DNA の抽出のため)、さらなる分析がセル上で実施する必要がある場合、または (e.g。、磁性細菌の研究) 細胞から容易に分離でき、。成長媒体。半固形培地の寒天は、収穫技術携帯確かに干渉する可能性が。
いくつかの文化で、細胞は時々 自発の突然変異の可能性が高いため、非運動になります。非運動性細胞は存続し、彼らは彼らの生存に必要な栄養素を見つけるために泳ぐ必要はありませんので、培地に成長します。標準的なレース トラック メソッド10は、レース トラック ダウンのみ運動性細胞が泳ぐことができるので、運動文化を回復する使用できます。磁気の表現の損失も文化 O2濃度が再び11自発の突然変異のための最適な場合でも実現可能です。最善の解決策は、新鮮な培地に野生型細菌の在庫を冷凍を接種して新しい文化を開始する場合です。また、レース トラック技術磁気文化の回復を許可できます。
他の有機体によって文化の汚染を避けるために不可欠である、したがって、プロトコルのほとんどは、無菌技術を使用して行う必要があります。ブンゼン バーナーの炎の下で通常操作無菌状態を保つことで満足のいく結果を与えます。しかし、文化は、汚染が発生しやすい環境で栽培されて場合、追加対策が必要、層流フードで培地を準備する際の作業など、細菌を接種します。汚染の危険性が高い半固形培地でチューブを細胞を除去するたびに開く必要がありますに注意してください。
これらのプロトコルは、実験、光学顕微鏡12,13, 電子顕微鏡イメージング14,15、に基づいて物理学などのさまざまな種類を実行する十分な細菌の成長を有効にします。X 線顕微分光分析16、ゲノムとタンパク質研究17,18。必要な場合は、遠心分離によって懸濁液中の細菌の高濃度を実現できます。また、マグネトソームを抽出し、細胞ペレットまたは遠心分離19によって得られる密な細胞懸濁液から用精製することができます。
成長メディア製剤は通常同じ統治の原則 (補足表 1成長媒体内の各コンポーネントの役割のリストの概要については、ここで説明を参照) に基づいています。炭素源を有機酸を介して、細菌が利用できなければなりません (e.g。、コハク酸、酢酸、酒石酸、乳酸) または重炭酸塩などの無機化合物。適切な炭素源の細菌の代謝によって決まります。DNA とタンパク質、リン (DNA、膜) に存在する窒素も必要です、ここで記載されているレシピで PO4ナノ3NH4Cl と KH2によって提供されます。(HEPES、リン酸バッファー) バッファー pH の変化に抵抗する必要があります。トレース ミネラルのサプリメントのソリューションには、酵素の補因子が含まれている、ビタミン使用できます細菌によって補酵素、または機能グループとして特定の酵素。酵母エキス、醤油豆のペプトンは、アミノ酸とタンパク質の生産に使用される塩のソースを提供します。MTB は酸化還元の敏感なので、1 つまたは複数の還元剤よくメディアに追加する必要が (e.g。、システイン、アスコルビン酸、乳酸)。鉄の主要な源 (e.g。、クエン酸第二鉄、鉄系、鉄塩化物) バイオミネラリゼーションのための媒体が必要。最後に、O2の少量は、ターミナル電子受容体として微好気バクテリアに必要です。硝酸態窒素や亜酸化窒素など他の化合物代わりに嫌気性の MTB 使用を義務づけます。
これらのプロトコルの主要な制限は、MTB の他の種ので動作するという保証はありません。AMB-1 系統すべて淡水 MTB は、MSR 1 MS 1、したがって、MMS 1 Magnetospira thiophila株、 Magnetospira株、QH 2 他の海洋の MTB など海洋 magnetospirilla を成長するこの資料に記載されているレシピを使用できませんこれは高い塩の集中を必要とします。ただし、さまざまなレシピにメディアを準備する、新種の分離、MTB の他の系統を成長し、液体および半固体メディアのこの記事で紹介した一般的な方法を使用できます。
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Disclosures
著者が明らかに何もありません。
Acknowledgments
電子顕微鏡施設 (マクマスター大学、訓練およびアクセス用 MTB 文化、アダム P. ヒッチコックとマクマスター大学で MTB 文化を設定中応援筱慧朱マルシア リードと彼の助けありがとうリチャード b. フランケル健康科学部)。この作品は、自然科学と工学研究会のカナダ (レベル) と米国立科学財団によって支えられました。
Materials
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
| AMB-1 | American Type Culture Collection (ATCC) | ATCC 700264 | |
| MS-1 | ATCC | ATCC 31632 | |
| MSR-1 | Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen (DSMZ) | DSM 6361 | |
| Ferric citrate | Sigma-Aldrich | F3388-250G | |
| Trace mineral supplement | ATCC | MD-TMS | |
| KH2PO4 | EMD | PX1565-1 | |
| MgSO4.7 H2O | EMD | MX0070-1 | |
| HEPES | BioShop Canada Inc | HEP001.250 | |
| NaNO3 | Sigma-Aldrich | S5506-250G | |
| Yeast extract | Fischer scientific | DF210929 | |
| Peptone | Fischer scientific | DF0436-17-5 | |
| Potassium L-lactate solution (60%) | Sigma-Aldrich | 60389-250ML-F | |
| D-(-)-Quinic acid | Sigma-Aldrich | 138622 | |
| FeCl3.6H2O | Fischer scientific | I88-100 | |
| Vitamin supplement | ATCC | MD-VS | |
| Sodium succinate hexahydrate | Fischer scientific | S413-500 | |
| Sodium L-tartrate dibasic dihydrate | Sigma-Aldrich | 228729-100G | |
| Sodium acetate trihydrate | EMD | SX0255-1 | |
| Resazurin | Difco | 0704-13 | |
| Ascorbic acid | Sigma-Aldrich | A4544-25G | |
| K2HPO4 | Caledon | 6620-1-65 | |
| FeCl2 .4H2O | Sigma-Aldrich | 44939-250G | |
| Sodium bicarbonate | EMD | SX0320-1 | |
| NaCl | Caledon | 7560-1 | |
| NH4Cl | EMD | 1011450500 | |
| CaCl2.2 H2O | EMD | 1023820500 | |
| Agar A | Bio Basic Canada Inc | FB0010 | |
| L-cysteine.HCl.H2O | Sigma-Aldrich | C7880-100G | |
| 1.0 mL syringes | Fischer scientific | B309659 | |
| 25G x 1 needles | BD | 305125 | |
| 125 mL serum bottles | Wheaton | 223748 | |
| 20 mm aluminum seals | Wheaton | 224223-01 | |
| 20mm E-Z Crimper | Wheaton | W225303 | |
| Butyl-rubber stoppers | Bellco Glass, Inc. | 2048-11800 | |
| Hungate tubes | Chemglass (VWR) | CLS-4208-01 | |
| Septum stopper, 13mm, Hungate | Bellco Glass, Inc. | 2047-11600 | |
| Glass culture Tubes | Corning (VWR) | 9826-16X | |
| Hydrochloric acid 36.5-38%, BioReagent | Sigma-Aldrich | H1758-100ML | 11.6 - 12 N |
References
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