Стимулированное рамановское рассеяние (SRS) и когерентная микроскопия против стоксовского рамановского рассеяния (CARS) являются наиболее широко используемыми технологиями когерентного рамановского рассеяния. Гиперспектральная визуализация SRS и CARS предлагает рамановскую спектральную информацию на каждом пикселе, что позволяет лучше разделять различные химические составы. Хотя оба метода требуют двух лазеров возбуждения, их схемы обнаружения сигналов и спектральные свойства совершенно различны. Целью этого протокола является выполнение гиперспектральной визуализации SRS и CARS на одной платформе и сравнение двух методов микроскопии для визуализации различных биологических образцов. Метод спектральной фокусировки используется для получения спектральной информации с помощью фемтосекундных лазеров. При использовании стандартных химических образцов сравниваются чувствительность, пространственное разрешение и спектральное разрешение SRS и CARS в одинаковых условиях возбуждения (т.е. мощность на образце, время выдержки пикселя, объективная линза, энергия импульса). Контрасты изображений CARS и SRS для биологических образцов сопоставляются и сравниваются. Прямое сравнение характеристик CARS и SRS позволит оптимально выбрать модальность для химической визуализации.