Summary

השיטה MODS לאבחון שחפת שחפת עמידים multidrug

Published: August 11, 2008
doi:

Summary

תצפית מיקרוסקופית, רגישות לתרופות (MODS) assay היא בעלות נמוכה, low-tech כלי לגילוי בעל ביצועים גבוהים של שחפת (TB) ו multidrug עמיד שחפת (MDRTB). וידאו זה מתאר את שיטת התקשורת MODS נוזלי תרבות.

Abstract

חולים עם שחפת ריאתית פעילה (TB) 10-15 להדביק אנשים אחרים בשנה, מה שהופך לאבחון שחפת פעילה חיוני הן לרפא את המטופל ומניעת זיהומים חדשים. יתר על כן, את הופעתה של multidrug שחפת עמידים (MDRTB) כלומר זיהוי של עמידות לתרופה הכרחי לעצור התפשטות של זנים עמידים לתרופה. תצפית מיקרוסקופית, רגישות לתרופות (MODS) assay היא בעלות נמוכה, low-tech כלי לגילוי בעל ביצועים גבוהים של שחפת MDRTB. Assay MODS מבוססת על שלושה עקרונות: 1) Mycobacterium tuberculosis (MTB) גדל מהר יותר בתקשורת נוזל מאשר על התקשורת מוצק 2) צמיחה MTB מיקרוסקופי ניתן לאתר מוקדם יותר בכלי התקשורת נוזל מאשר לחכות להופעת מקרוסקופית של מושבות על התקשורת מוצק, כי הצמיחה האופיינית MTB, שמאפשר לו להבחין בין זיהום mycobacteria או פטרייתי או חיידקי טיפוסיות 3) התרופות isoniazid ו ריפמפיצין ניתן לשלב assay MODS כדי לאפשר זיהוי ישיר סימולטני של MDRTB, obviating את הצורך תת לבצע תרופה עקיף רגישות הבדיקה. אבחון הנוכחית מתחרים הם הקשו על ידי רגישות נמוכה למרוח עם כיח, עיכובים ארוכים עד לאבחון עם תרבות התקשורת מוצק, עלות גבוהה להחריד עם נוזל התקשורת השיטות הקיימות התרבות, צריך לעשות תת לבדיקת רגישות עקיף התרופה כדי לזהות MDRTB. לעומת זאת, שיטה שאינה קניינית MODS בעל רגישות גבוהה עבור שחפת MDRTB, היא שיטה התרבות מהירה יחסית, מספק בדיקות סימולטני הרגישות תרופה MDRTB, והוא נגיש מוגבל משאב הגדרות בבית רק תחת $ 3 עבור בדיקת שחפת MDRTB.

Protocol

הכינו פתרונות מניות פוספט חיץ מניות מערבבים 950ml של תמיסת נתרן dibasic (9.47g של dibasic סודיום פוספט מומס במים מזוקקים 1000ml) עם 950ml של תמיסת אשלגן זרחת?…

Discussion

Assay MODS מיועד משאב מוגבל הגדרות. בפעם הראשונה, MODS מביא את היכולת לאיתור מהיר תרבות נוזלי של שחפת multidrug שחפת עמידים משאב מוגבל רק על הגדרות תחת 3 דולר הבדיקה. MODS הוא שאינה קניינית, איטרטיבי מתודולוגיה, והקהילה MODS מעוניינת תמיד שיפורים מעבדות אחרות הצליחו לעשות.

<p style=";text-align:right;directio…

Acknowledgements

ברצוננו להודות שון Fitzwater וכרמן Giannina לונה קולומבו עבור קטע וידאו צמיחה שחפת זמן לשגות. אנו מודים מרטי רופר על המשוב יסודי מעולה שלה במהלך העריכה עריכה משותפת המדריך למשתמש, שממנו פרוטוקול הנוכחי נלקח בעיקר מילה במילה. הפקת וידאו זה מומן על ידי NIH / פוגארטי המרכז הבינלאומי http://www.fic.nih.gov/ דוד AJ מור תרם כמו עמית מחקר Wellcome Trust קליניים ברפואה Reader טרופי ועל מחלות זיהומיות באימפריאל קולג' בלונדון (Fellowship פרס מספר 078067/Z/05). מארק פ בריידי תרמו כמו עמית NIH / פוגארטי מרכז המחקר הבינלאומי.

Materials

Material Name Type Company Catalogue Number Comment
Refrigerator/ freezer Equipment     to store pre-prepared broth and antibiotic stocks
Vortex Equipment     to aid sputum decontamination
Centrifuge Equipment     for sputum concentration; capable of reaching 3000 g; does not need to be refrigerated, but MUST be biosafe (buckets can be sealed)
Incubator (37 degree C) Equipment     for culture; need not be CO2 enriched
Inverted light microscope Microscope     to read MODS plates
Autoclave Equipment     to sterilize media, PBS and used plates
Balance Equipment     to weigh isoniazid, rifampicin and NALC
Middlebrook 7H9 broth (Difco) Reagent Fisher DF0713-17-9 500gr/bottle; culture media base
Casitone (pancreatic digest casein) Reagent Fisher DF0259‐17‐9 500gr/bottle; culture media base
Glycerol (glycerin) lyophilized Reagent Sigma G‐33‐500 500ml/bottle; culture media base
PANTA (Antibiotic mixture lyophilized BD) Reagent Fisher B4345114 6 bottles/pack; antibiotic media supplement
OADC (Middlebrook OADC enrichment BD) Reagent Fisher B11886 10 x 20ml/pack; nutritional media supplement
Dimethyl sulphoxide (Hibri-Max) Reagent Sigma D-2650 100ml/bottle; to prepare rifampicin stock
Antibiotic stocks: isoniazid Reagent Sigma I-3377 50gr/bottle; direct susceptibility testing
Antibiotic stocks: rifampicin Reagent Sigma 99 R-3501 1gr/bottle; direct susceptibility testing
Sodium hydroxide (pellets) Reagent Sigma 221465 500gr/bottle; sputum decontamination
Sodium citrate (trisodium salt dihydrate) Reagent Sigma S-4641 500gr/bottle; sputum decontamination
N-acetyl-L-cysteine Reagent Sigma A-7250 50gr/bottle; sputum decontamination
Potassium Phosphate Monobasic crystal. KH2PO4 Reagent Sigma P0662 500gr/bottle; sputum decontamination
Sodium Phosphate Dibasic, anhydrous. Na2HPO4 Reagent Sigma S0876 500gr/bottle; sputum decontamination
Sodium hypochlorite Reagent household bleach   to discard contaminated waste
15ml centrifuge tubes (polypropylene 15ml Falcon 35‐2096) Consumable Fisher 14‐959‐49B 500ea/case; for sputum decontamination and concentration
24 well plates (Plates Tissue 24 wells BD Falcon 35‐3047) Consumable Fisher 08-772-1 50 plates/case; for culture and reading
Sealable polythene bags 6 X 6 “ (ziplock) Consumable     for biosecurity to contain 24 well plate
Glass tubes with lid (16 x 100mm and 18 x 145mm) Consumable VWR 47729-583 500 tubes/case; to store aliquots of prepared broth
Screw cap microcentrifuge tubes (1.5ml) Consumable Fisher 05‐669‐22 1000ea/case; to store aliquots of antibiotic stocks
0.22μm filters (aqueous solvents) Syringe filter Millex blue Consumable Fisher SLGL 025 OS 50 units/case; to filter antibiotic stocks
0.22μm filters (organic solvents) Syringe filter Millex yellow Consumable Fisher SLGV 033 RS 50 units/case; to filter antibiotic stocks
Disposable Pasteur pipettes borosilicate glass 9″ Consumable Fisher 13‐678‐20C 720ea/case; to mix PANTA with media mix
Aerosol barrier tips 1000‐1300μl Consumable Fisher 02‐707‐51 1000ea/pk; to dispense media into plate
USA Scientific Tips One 1‐200μl yellow tips Consumable Fisher 1111‐0006 1000 tips/bag; to dilute antibiotic stocks

References

  1. Arias, M. Clinical evaluation of the microscopic-observation drug-susceptibility assay for detection of tuberculosis. Clin Infect Dis. 44, 674-674 (2007).
  2. Caviedes, L. Rapid, efficient detection and drug susceptibility testing of Mycobacterium tuberculosis in sputum by microscopic observation of broth cultures. The Tuberculosis Working Group in Peru. J Clin Microbiol. 38, 1203-1203 (2000).
  3. Caviedes, L., Moore, D. A. Introducing MODS: a low-cost, low-tech tool for high-performance detection of tuberculosis and multidrug resistant tuberculosis. Indian J Med Microbiol. 25, 87-87 (2007).
  4. Caws, M. Evaluation of the MODS culture technique for the diagnosis of tuberculous meningitis. PLoS ONE. 2, e1173-e1173 (2007).
  5. Ejigu, G. S. Microscopic-observation drug susceptibility assay provides rapid and reliable identification of MDR-TB. Int J Tuberc Lung Dis. 12, 332-332 (2008).
  6. Kim, S. J. Risk of occupational tuberculosis in National Tuberculosis Programme laboratories in Korea. Int J Tuberc Lung Dis. 11, 138-138 (2007).
  7. Mello, F. C. Clinical evaluation of the microscopic observation drug susceptibility assay for detection of Mycobacterium tuberculosis resistance to isoniazid or rifampin. J Clin Microbiol. 45, 3387-3387 (2007).
  8. Moore, D. A. Future prospects for the MODS assay in multidrug-resistant tuberculosis diagnosis. Future Microbiol. 2, 97-97 (2007).
  9. Moore, D. A. Infrequent MODS TB culture cross-contamination in a high-burden resource-poor setting. Diagn Microbiol Infect Dis. 56, 35-35 (2006).
  10. Moore, D. A. Microscopic-observation drug-susceptibility assay for the diagnosis of TB. N Engl J Med. 355, 1539-1539 (2006).
  11. Moore, D. A. Microscopic observation drug susceptibility assay, a rapid, reliable diagnostic test for multidrug-resistant tuberculosis suitable for use in resource-poor settings. J Clin Microbiol. 42, 4432-4432 (2004).
  12. Moore, D. A., Roper, M. H. Diagnosis of smear-negative tuberculosis in people with HIV/AIDS. Lancet. 370, 1033-1033 (2007).
  13. Oberhelman, R. A. Improved recovery of Mycobacterium tuberculosis from children using the microscopic observation drug susceptibility method. Pediatrics. 118, e100-e100 (2006).
  14. Palomino, J. C., Martin, A., Portaels, F. MODS assay for the diagnosis of TB. N Engl J Med. 356, 188-189 (2007).
  15. Park, W. G., Bishai, W. R., Chaisson, R. E., Dorman, S. E. Performance of the microscopic observation drug susceptibility assay in drug susceptibility testing for Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol. 40, 4750-4750 (2002).
  16. Shiferaw, G. Evaluation of microscopic observation drug susceptibility assay for detection of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis. J Clin Microbiol. 45, 1093-1093 (2007).
  17. Tovar, M. Improved diagnosis of pleural tuberculosis using the microscopic- observation drug-susceptibility technique. Clin Infect Dis. 46, 909-909 (2008).
  18. Vargas, D. Diagnosis of sputum-scarce HIV-associated pulmonary tuberculosis in Lima, Peru. Lancet. 365, 150-150 (2005).

Play Video

Cite This Article
Brady, M. F., Coronel, J., Gilman, R. H., Moore, D. A. The MODS method for diagnosis of tuberculosis and multidrug resistant tuberculosis. J. Vis. Exp. (18), e845, doi:10.3791/845 (2008).

View Video