Protein-Protein Etkileşimlerinin Floresan Anizotropi Tabanlı Tespiti

0 görüntüleme3:41 dk • July 8th, 2025

Loading...
$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Floresan anizotropi bazlı protein-protein etkileşimi tespiti için, uygun bir anizotropi tamponunda C-terminal tetrasistein motifleri ile etiketlenmiş rekombinant hedef proteinlerle başlayın.

Florofor içeren bir boya ekleyin - tetrasistein motifi yoluyla hedef proteinlere bağlanın. Anizotropi tamponu ile diyalize edin, bağlanmamış boyayı çıkarın. Karışımı kuvars küvetlere aktarın. Başarılı bir şekilde etiketlenmiş hedef proteinlerin yüzdesini belirleyerek absorbansı ölçün.

Bir floresan küvetinde, florofor etiketli hedef proteinleri etiketlenmemiş proteinlerle karıştırın. Bir spektroflorometre kullanarak, floresan anizotropisini ölçün.

Hedef proteinler tamponda serbestçe asılı kaldıkça, onlara bağlı floroforlar, Brown hareketi nedeniyle eksenleri etrafında rastgele döner. Uygun bir dalga boyunda dikey polarize ışıkla uyarıldığında, floroforlar dikey ve yatay düzlemlerde polarize ışık yayar. Dikey ve yatay polarize emisyonların floresan yoğunluklarının oranı - anizotropi - ölçülür.

Etiketlenmemiş proteinler florofor etiketli hedeflere bağlandığında, protein kompleksinin moleküler boyutu artar ve dönme hareketini azaltır. Sonuç olarak, yayılan ışık daha polarize hale gelir ve dikey düzlemde yatay düzlemden daha yüksek emisyon ile anizotropiyi arttırır.

Etiketlenmemiş proteinin artan konsantrasyonlarını ekleyin ve anizotropi ölçümünü tekrarlayın.

Artan etiketlenmemiş protein ilavesi ile anizotropide doğrusal olmayan bir artış, florofor etiketli hedef proteinler üzerindeki çoklu özdeş olmayan bağlanma bölgelerinde etiketlenmemiş protein bağlanmasını gösterir.

3 nanomol SBDS-FlAsH proteinini 3 nanomol Lumio Green boya ile 5 mikrolitre hacminde anizotropi tamponunda karıştırın. Reaksiyonun 4 santigrat derecede 8 saat devam etmesine izin verin. 8 saat sonra, serbest boyayı çıkarmak için numuneyi gece boyunca anizotropi tamponuna karşı diyalize edin. Bir kuvars küvet kullanarak bir spektrofotometrede 280 nanometre ve 508 nanometrede absorbansı ölçün. Ardından, metin protokolünde açıklandığı gibi etiketli proteinin yüzdesini ölçmek için Lambert-Beer yasasını kullanın.

Anizotropi değerini ölçmeden önce, protein-ligandın her titrasyon adımı, tüm numunenin çözeltiye dağıtıldığından ve homojen hale geldiğinden emin olarak dikkatli bir şekilde yapılmalıdır.

Bir floresan küvette, 200 mikrolitre 30 nanomolar SBDS-FlAsH'yi anizotropi tamponuna yerleştirin ve 2 mikrolitre 30 mikromolar EFL1'i titre edin. İyice karıştırın ve anizotropi ve floresan değerini ölçmeden önce reaksiyonun 3 dakika beklemesine izin verin. Toplam 40 mikrolitre EFL1 hacmi eklenene kadar bu işlemi tekrarlayın. Son adım olarak, verileri metin protokolünde açıklandığı gibi varsayılan bir bağlama modeline sığdırın.

12:30

Tek molekülün yapısal bilgiler Hızlı Nano konumlandırma Sisteminin Kullanılması Deneyler FRET

İlgili videolar

0 Görüntüler

09:30

Otomatik Flüoresans Ömrü Görüntüleme Mikroskopi kullanmak Open Source Yüksek İçerik Analizi

İlgili videolar

0 Görüntüler

08:22

Kalibrasyon-Alerjik Vitro miktar Protein Homo-Oligomerizasyonda ticari araçları ve ücretsiz, açık kaynak parlaklık analiz yazılımı kullanarak

İlgili videolar

0 Görüntüler

11:15

Görüntüleme Protein-protein etkileşimleri In vivo

İlgili videolar

0 Görüntüler

04:48

Protein Homo-Oligomerizasyonunu İncelemek için Floresan Dalgalanma Spektroskopisi

İlgili videolar

0 Görüntüler

05:00

Transkripsiyon Faktörü-DNA Bağlanma Afinitesini Belirlemek için Floresan Anizotropisi

İlgili videolar

0 Görüntüler

13:26

Diferansiyel Taramalı florimetri Kullanarak Protein-ligand Etkileşimleri belirlenmesi

İlgili videolar

0 Görüntüler

10:44

Protein-protein etkileşimleri çalışmak için aracı olarak floresan Anizotropi

İlgili videolar

0 Görüntüler

11:22

Üç renkli tek molekül FRET Protein etkileşimleri korelasyon çalışma için kullanma

İlgili videolar

0 Görüntüler

09:18

Heterodimerization in Situ yakınlık ligasyonu tahlil kullanarak Protein izoformlarının tespiti

İlgili videolar

0 Görüntüler

Son güncelleme: 15 Ağustos 2026