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Encyclopedia of Experiments: Biology

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ゲノム修飾のスクリーニング

 
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ゲノム修飾のスクリーニング:ショウジョウバエにおけるCRISPR生成変異体の同定方法

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- 注入されたG0成人発達するとすべての個々のハエ適切なバランサって潜在的なF1 CRISPR編集ライン拡大ゲノム修飾継承追跡することができます

ゲノムDNA抽出するには、抽出バッファー含むピペットチップハエを押しつぶ組織分解されたら液体排出抽出バッファーサンプル中のタンパク質消化する酵素であるプロテナーゼK含まれによって不活性化される酵素。

DNAアクセスできるようになったので、PCRスクリーニング進みます例えば、新しい配列含む領域増幅するように設計されたプライマー使用します。改変の存在でのみ2番目プライマーが結合、PCR産物増幅されます

- 以前ガイドRNA発現プラスミド代替ドナー両方注射したnos-Cas9成人発達すると、G0個別飛んで標的となるアレレに適したラインからバランサフライ行います

F2幼虫が孵化したら十字架からF1の父親選び、各フライを50マイクロリットルスクッシュバッファ含むピペットチップ10〜15秒間しつぶしてゲノムDNA抽出し、残りのバッファチューブ分配してよく混ぜます

20〜30分間摂氏37インキュベーします。インキュベーションに続いてチューブ95°Cヒートブロック1〜2分間置いてプロテナーゼK.不活性化、10,000グラムで5分間回転した後さらにPCR分析のために摂氏4調製物保存します。

挿入または置換存在スクリーニングするためにプライマーフォワード1リバース1使用して3段階PCRベーススクリーン実行します。

- 確認されたエンドアウトHDRフライライン維持、F2世代からのバランスストック確立します。アウトは、他染色体上の意図しない突然変異取り除くために再び飛ぶバラン横切ります。

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