A subscription to JoVE is required to view this content. Sign in or start your free trial.
Chapters
- 00:04Title
- 00:44Germinating Potato in Sterilized Conditions
- 01:56Collecting Potato Root Exudates
- 03:23Treatment and Sampling of Bacteria
- 04:57RNA Isolation
- 07:12Results: RNA Quality Check and Ratio Intensity Plot for Visualizing Differential Gene Expression
- 08:30Conclusion
Het doel van het hier gepresenteerde protocol is het bestuderen van de reactie van de transcriptomic van endosphere-geïsoleerde Bacillus mycoides op aardappel wortel exsudaat. Deze methode vereenvoudigt de identificatie van belangrijke bacteriële genen die betrokken zijn in plant-microbe interacties en is in principe van toepassing op andere endofyten en planten, met kleine aanpassingen.
