Helsen til vill fisk kan brukes som en indikator på akvatisk økosystem helse. Obduksjon-baserte fisk helse vurderinger gi dokumentasjon av synlig lesjoner eller unormalt, brukes til å beregne tilstand indekser samt muligheten til å samle vev for mikroskopiske evaluering, genuttrykk og andre mer detaljert analyser.