Vi presenterer en sirkulær RT-PCR-basert strategi ved å kombinere sirkulær RT-PCR, kvantitativ RT-PCR, RNA 5 ' polyphosphatase og Northern blot. Denne protokollen inkluderer en normalisering skritt for å minimere påvirkning av ustabile 5 ' trifosfat, og det er egnet for diskriminerende og kartlegging den primære og bearbeidede transkripsjoner stabilt akkumulert i mais mitokondrie.