Här presenteras ett protokoll för cellodling på kiselnitridmembran och djupfrysning före röntgenfluorescensavbildning med en synkrotron kryogen röntgennanosond. När endast nano-analys av rumstemperatur tillhandahålls kan de frysta proverna frystorkas ytterligare. Dessa är kritiska steg för att få information om den intracellulära elementära sammansättningen.