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कृमि-संरेखित और Worm_CP, कैनोरहैब्डिटिस एलिगेंस से प्राप्त फ्लोरेसेंस इमेज डेटा के स्ट्रेटनिंग और क्वांटिफिकेशन के लिए दो ओपन-सोर्स पाइपलाइन
JoVE Journal
Biology
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JoVE Journal Biology
Worm-align and Worm_CP, Two Open-Source Pipelines for Straightening and Quantification of Fluorescence Image Data Obtained from Caenorhabditis elegans
DOI:

11:16 min

May 28, 2020

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Chapters

  • 00:05Introduction
  • 00:57Mounting Fixed Worms for Imaging
  • 02:56Creating Montage Images of Aligned Single Worms Using the Worm-align FIJI Pipeline
  • 06:01Analyzing Single-worm Fluorescence Intensity Using the Output from Worm-align in an Automated CellProfiler Pipeline
  • 08:07Results: Fluorescence Quantification with the Worm_CP Pipeline
  • 09:50Conclusion

Summary

Automatic Translation

कृमि-संरेखित/Worm_CP एक सरल फिजी/सेलप्रोफिलर वर्कफ्लो है जिसका उपयोग कैनोरहैब्डिटिस एलिगेंस नमूनों को सीधा और संरेखित करने और पूर्व प्रशिक्षण चरणों की आवश्यकता के बिना पूरे कृमि छवि-आधारित परख को स्कोर करने के लिए किया जा सकता है। हमने जीवित जानवरों या लिपिड बूंदों में गर्म-सदमे प्रेरित अभिव्यक्ति के मात्राकरण के लिए कृमि-संरेखित/Worm_CP को निर्धारित नमूनों में लागू किया है ।

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