Journal
/
Biology
/
Visualizer דינמיקה אינהרנטית, יישום אינטראקטיבי להערכה והדמיה של יציאות מצינור הסקת רשת רגולטורית גנטית
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Visualizer דינמיקה אינהרנטית, יישום אינטראקטיבי להערכה והדמיה של יציאות מצינור הסקת רשת רגולטורית גנטית

DOI:
10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

, , , ,
1Department of Biology,Duke University, 2Department of Mathematical Sciences,Montana State University, 3Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:46Node Finding
  • 03:40Edge Finding
  • 05:32Network Finding
  • 08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
  • 10:06Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Visualizer Dynamics Inherent היא חבילת ויזואליזציה אינטראקטיבית המתחברת לכלי הסקת רשת רגולטורית גנטית ליצירה משופרת ויעילה של מודלי רשת פונקציונליים. visualizer יכול לשמש כדי לקבל החלטות מושכלות יותר עבור parameterizing כלי ההסקה, ובכך להגביר את האמון במודלים המתקבלים.

Tags

Gene Regulatory NetworkInference PipelineInherent Dynamics VisualizerInteractive ApplicationVisualizationParameter ExplorationTime Series DataAnnotation FileOutput FileNumber Of ProcessesDLxJTKCutoffGene List

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

רגולציה T תאים: הפוטנציאל הטיפולי לטיפול דחייה וסוג אני סוכרת

שימוש מונה תא אוטומטי כדי לפשט את הביטוי מחקרים ג'ין: siRNA מציאה הביטוי IL 4-Gene תלויים תאים Namalwa

השוואה כמותית של Cis-רגולטוריות (Cre) אלמנט פעילות טראנסגנטי תסיסנית melanogaster</em

באמצעות רצף מעצר SecM ככלי לבודד פוליפפטידים כרוכים הריבוזום

לכידה סלקטיבית של 5-hydroxymethylcytosine מהדנ"א הגנומי

צינור מהיר ואמין למחקר בקטריאלי transcriptome ניתוח מקרה: ויסות גני Serine תלויה ב<em> Streptococcus pneumoniae</em

חזותי תדר Stromule עם מיקרוסקופ פלואורסצנטי

שיטה פשוטה עבור בידוד של סויה Protoplasts, ליישום ניתוחים ביטוי גנים ארעית

הדמיה אופטית מבוססת פוטודיודה להקלטת דינמיקה ברשת עם רזולוציית נוירון יחיד בבלתי חוליות לא מהונדסים

צינור ביואינפורמטיקה לחקירת אבולוציה מולקולרית וביטוי גנים באמצעות RNA-seq

Read Article