Journal
/
Biology
/
Doğal Dinamikler Görselleştiricisi, Gen Düzenleyici Ağ Çıkarım Ardışık Düzeninden Çıktıları Değerlendirmek ve Görselleştirmek için etkileşimli bir uygulama
JoVE Journal
Biology
A subscription to JoVE is required to view this content.  Sign in or start your free trial.
JoVE Journal Biology
Inherent Dynamics Visualizer, an Interactive Application for Evaluating and Visualizing Outputs from a Gene Regulatory Network Inference Pipeline
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Doğal Dinamikler Görselleştiricisi, Gen Düzenleyici Ağ Çıkarım Ardışık Düzeninden Çıktıları Değerlendirmek ve Görselleştirmek için etkileşimli bir uygulama

DOI:
10.3791/63084-v

•

10:44 min

•

December 07, 2021

•

, , , ,
1Department of Biology,Duke University, 2Department of Mathematical Sciences,Montana State University, 3Department of Mathematical Sciences,Florida Atlantic University

Chapters

  • 00:04Introduction
  • 00:46Node Finding
  • 03:40Edge Finding
  • 05:32Network Finding
  • 08:14Results: Investigating the Core Oscillator Gene Regulatory Network of the Yeast Cell-Cycle
  • 10:06Conclusion

Summary

Automatic Translation

Automatic Translation

Inherent Dynamics Visualizer, gelişmiş, kolaylaştırılmış işlevsel ağ modelleri üretimi için gen düzenleyici ağ çıkarım aracına bağlanan etkileşimli bir görselleştirme paketidir. Görselleştirici, çıkarım aracını parametrelendirmek için daha bilinçli kararlar vermek ve böylece ortaya çıkan modellere olan güveni artırmak için kullanılabilir.

Tags

Gene Regulatory NetworkInference PipelineInherent Dynamics VisualizerInteractive ApplicationVisualizationParameter ExplorationTime Series DataAnnotation FileOutput FileNumber Of ProcessesDLxJTKCutoffGene List

Article

Embed

ADD TO PLAYLIST

Usage Statistics

Related Videos

Düzenleyici T hücreleri: Nakli Reddetme ve Tip I Diyabet Tedavisinde Terapötik Potansiyeli

Gen İfadesi Çalışmaları basitleştirin Otomatik Hücre Sayıcı kullanma: Namalwa Hücreler IL-4 Bağımlı Gen İfadesi siRNA demonte

Uygulamalarda Kantitatif Karşılaştırılması Cis-Regulatory Element (CRE) Etkinlikler Drosophila melanogaster</em

Ribozom Ciltli Polipeptitler izole bir aracı olarak SECM Tutuklanma sırası kullanılarak

Genomik DNA 5-hydroxymethylcytosine seçici Yakalama

Bakteriyel Transkriptom Analizi Vaka çalışması için A Hızlı ve Güvenilir Boru Hattı: Serin bağımlı Gen Yönetmelik<em> Streptococcus pneumoniae</em

Floresan Mikroskopi ile Stromule Frekansı görselleştirme

Soya önceki ve geçici gen ifade analiz için uygulama yalıtım için basit bir yöntem

Transgenik Olmayan Omurgasızlarda Tek Nöron Çözünürlüğü ile Ağ Dinamiklerini Kaydetmek için Fotodiyot Tabanlı Optik Görüntüleme

RNA-seq Kullanarak Moleküler Evrimi ve Gen ekspresyonını Araştırmak için Biyoinformatik Boru Hattı

Read Article