Simulação baseada em estrutura e amostragem de movimentos de proteína do fator de transcrição ao longo do DNA de pisando em escala atômica para difusão grosseira
O objetivo deste protocolo é revelar a dinâmica estrutural da difusão unidimensional de proteína ao longo do DNA, usando um fator de transcrição vegetal proteína de domínio WRKY como um sistema exemplar. Para isso, foram implementadas simulações de dinâmica molecular atomística e grosseira, juntamente com extensas amostras computacionais.