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Developmental Biology
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Light-mediated Reversible Modulation of the Mitogen-activated Protein Kinase Pathway during Cell Differentiation and Xenopus Embryonic Development
Journal (Developmental Biology)
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Clonal Analysis of Embryonic Hematopoietic Stem Cell Precursors Using Single Cell Index Sorting Combined with Endothelial Cell Niche Co-culture
Journal (Developmental Biology)
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AMEBaS: estrazione automatica della linea mediana e sottrazione di fondo di time-lapse di fluorescenza raziometrica di singole cellule polarizzate

Article DOI: 10.3791/64857-v • 06:03 min • June 23rd, 2023
June 23rd, 2023 •
1, 1,2, 3, 4, 5, 6, 1, 1
1Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, 2Center for Mathematics, Computing and Cognition, Federal University of ABC, 3Department of Botany, Institute of Biosciences, University of São Paulo, 4Cell Biology and Molecular Genetics Department, University of Maryland, 5Department of Biosciences, University of Milan, 6Department of Physics, Politecnico di Milano

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Gli attuali metodi per analizzare la dinamica intracellulare delle singole cellule polarizzate sono spesso manuali e mancano di standardizzazione. Questo manoscritto introduce una nuova pipeline di analisi delle immagini per automatizzare l'estrazione della linea mediana di singole cellule polarizzate e quantificare il comportamento spazio-temporale dai time lapse in un'interfaccia online di facile utilizzo.

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Biologia dello sviluppo numero 196 sottrazione di sfondo time-lapse di fluorescenza raziometrica singole cellule polarizzate polarità cellulare fenomeno macroscopico molecole spazialmente concentrate domini specializzati livello subcellulare strutture morfologiche asimmetriche divisione cellulare crescita migrazione interruzione della polarità cellulare disturbi legati ai tessuti cancro displasia gastrica dinamica spazio-temporale reporter fluorescenti passaggi manuali tracciamento della linea mediana distorsione distorsione raziometrico Analisi Distribuzione irregolare delle molecole reporter Tecniche di sottrazione di sfondo Pipeline computazionale Automatizzare e quantificare il comportamento spazio-temporale Cellule singole Crescita dei peli del tubo pollinico/radice Dinamica degli ioni citosolici
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