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Developmental Biology
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AMEBaS: Extração Automática da Linha Média e Subtração de Fundo de Time-Lapses de Fluorescência Ratiométrica de Células Individuais Polarizadas

Article DOI: 10.3791/64857-v • 06:03 min • June 23rd, 2023
June 23rd, 2023 •
1, 1,2, 3, 4, 5, 6, 1, 1
1Institute of Mathematics and Statistics, University of São Paulo, 2Center for Mathematics, Computing and Cognition, Federal University of ABC, 3Department of Botany, Institute of Biosciences, University of São Paulo, 4Cell Biology and Molecular Genetics Department, University of Maryland, 5Department of Biosciences, University of Milan, 6Department of Physics, Politecnico di Milano

Chapters

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Os métodos atuais para analisar a dinâmica intracelular de células isoladas polarizadas são frequentemente manuais e carecem de padronização. Este manuscrito introduz um novo pipeline de análise de imagens para automatizar a extração da linha média de células polarizadas simples e quantificar o comportamento espaço-temporal de lapsos de tempo em uma interface on-line amigável.

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Biologia do Desenvolvimento Edição 196 Subtração de Fundo Time-Lapses de Fluorescência Ratiométrica Células Únicas Polarizadas Polaridade Celular Fenômeno Macroscópica Moléculas Espacialmente Concentradas Domínios Especializados Nível Subcelular Estruturas Morfológicas Assimétricas Divisão Celular Crescimento Migração Ruptura da Polaridade Celular Distúrbios Relacionados a Tecidos Câncer Displasia Gástrica Dinâmica Espaço-Temporal Repórteres Fluorescentes Passos Manuais Traçado de Linha Média Demorado Vieses Ratiométrico Análise Distribuição Desigual De Moléculas Reporter Técnicas de Subtração de Fundo Pipeline Computacional Automatizar e Quantificar o Comportamento Espaço-Temporal Células Únicas Crescimento de Pelos do Tubo Polínico/Raiz Dinâmica de Íons Citosólicos
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