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Developmental Biology
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AMEBaS : Extraction automatique de la ligne médiane et soustraction de l’arrière-plan des time-lapses de fluorescence ratiométrique de cellules uniques polarisées

Article DOI: 10.3791/64857-v 06:03 min June 23rd, 2023
June 23rd, 2023

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Les méthodes actuelles d’analyse de la dynamique intracellulaire des cellules uniques polarisées sont souvent manuelles et manquent de standardisation. Ce manuscrit présente un nouveau pipeline d’analyse d’images pour automatiser l’extraction médiane de cellules polarisées uniques et quantifier le comportement spatio-temporel à partir de timelapses dans une interface en ligne conviviale.

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Biologie du développement Numéro 196 Soustraction de fond Time-lapses de fluorescence ratiométrique Cellules simples polarisées Polarité cellulaire Phénomène macroscopique Molécules concentrées dans l’espace Domaines spécialisés Niveau subcellulaire Structures morphologiques asymétriques Division cellulaire Croissance Migration Perturbation de la polarité cellulaire Troubles liés aux tissus Cancer Dysplasie gastrique Dynamique spatio-temporelle Rapporteurs fluorescents Étapes manuelles Traçage de la ligne médiane Chronophage Biais Ratiométrique Analyse Distribution inégale des molécules rapporteuses Techniques de soustraction d’arrière-plan Pipeline de calcul Automatiser et quantifier le comportement spatio-temporel Cellules uniques Croissance des cheveux du tube pollinique / racine Dynamique des ions cytosoliques
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