2018年7月30日
本实验方案演示了如何利用绿色荧光蛋白(GFP)融合蛋白作为标记,并结合4',6-二脒基-2-苯基吲哚(DAPI)染色,在热应激条件下追踪蛋白质的核转位过程。DAPI染色步骤快速,且能有效保留GFP及蛋白质亚细胞定位信号。
该方法有助于解答秀丽隐杆线虫(C.elegans)研究领域中的关键问题,例如细胞生物学问题。该技术的主要优势在于能够快速高效地同时获得细胞核染色、绿色荧光蛋白(GFP)以及亚细胞定位变化的信号。首先,构建一个包含目的基因翻译融合结构的染色体外阵列。
或者,可从秀丽隐杆线虫遗传中心(Caenorhabditis Genetic Center)获取此类品系,该中心是提供 C. elegans 研究公共资源的机构;也可从先前已发表的研究实验室获得。将线虫暴露于γ射线以使染色体外阵列整合到基因组中后,筛选稳定表达的品系,使每条线虫均表达标记蛋白,例如 GFP 或 Roller 蛋白。
为消除辐射过程中产生的突变,需将品系至少回交两次。利用获得的转基因品系检测在胁迫条件下蛋白质表达模式的变化。接着,按照文本方案制备NGM线虫平板,划线接种OP50克隆,并在液体LB培养基中过夜培养细菌。
用液体OP50培养物接种NGM平板,并在37摄氏度培养箱中过夜培养,以形成供线虫食用的细菌菌苔。使用前将平板在室温下冷却至少30分钟。在进行热应激实验前,将转基因品系在20摄氏度条件下无饥饿培养至少两代。
挑选八到十条年轻的成年线虫(带有大量卵)转移到新的线虫培养板上。让它们产卵约三到五小时,然后将所有成虫从培养板上移除。为了同步线虫发育,让卵孵化并继续培养幼虫约48小时,直至发育至第四龄幼虫(L4期)。
可通过阴门(一种半月形结构)进行识别。将含有L4幼虫的培养皿置于35摄氏度下孵育2至5小时,对线虫进行热应激处理。在培养箱中放置一支温度计,以准确测量温度。
用移液器吸取10微升M9缓冲液,滴加到玻璃载玻片中央。然后挑取热激后的线虫,将其转移至缓冲液滴中。或者,也可使用M9缓冲液将线虫从培养皿上冲洗下来。
然后在室温下以1000 × g离心样品1分钟。弃去上清液,将线虫转移至玻片上。在体视显微镜下,用柔软的纸巾吸去多余的液体。
然后,在显微镜下向线虫加入 10 微升 95% 乙醇,并继续观察。乙醇干燥后立即重复添加乙醇,共重复两次。此步骤的关键在于乙醇必须在解剖显微镜下从动物样本上完全蒸发。
乙醇挥发后,立即进行下一步操作。向线虫中加入10 µL DAPI。立即加盖盖玻片,并用透明指甲油凝胶封片。
待指甲油固定约10分钟后,在荧光显微镜下观察动物。如需用丙酮固定样本,先用M9缓冲液冲洗热激后的平板,然后在室温下以1000 × g离心样品1分钟。弃去上清液,用1毫升蒸馏水洗涤沉淀。
去除上清液后,加入400微升30%丙酮,将样品孵育15分钟。然后在室温下以1000 × g离心1分钟。弃去上清液后,用500微升蒸馏水洗涤生物样本两次。
向沉淀中加入 200 微升 DAPI,或向试管中加入总体积的线虫体积四倍量的 DAPI,样品孵育 15 分钟。离心样品并弃去上清液。然后用 500 微升蒸馏水洗涤沉淀两次,再按照之前的方法进行封片和成像。
进行成像时,打开紫外光源和荧光显微镜,然后启动与显微镜连接的计算机。将玻片载入荧光显微镜。
使用10倍物镜定位线虫,然后将放大倍数调至400倍,并对样本进行聚焦。接着,打开显微镜配套的软件。
单击“采集”,然后单击“相机”,并选择连接到显微镜的相机。在相同的“采集”菜单下,单击“多维采集”。这将打开一个新的多维采集导航窗口。
单击多通道按钮,所有可用通道将显示出来。选择蓝色、绿色和 DIC 以观察样本。在多维采集导航窗口中,保持蓝色 DAPI、绿色 GFP 和灰色 DIC 通道开启,右键单击其他通道(如红色 Rhodamine 和白色 Brightfield)以关闭它们。
为测量每个通道的曝光时间,用鼠标左键单击蓝色的 DAPI 通道以选中该通道,然后单击“measure”以自动曝光时间采集实时图像。在实时图像窗口的左侧,可根据需要手动调整曝光时间,然后单击“OK”。以类似方式设置 GFP 和 DIC 通道的曝光时间。在多维采集导航窗口中,单击“Start”即可按照设定的曝光时间,依序自动采集三个不同通道下的三幅图像。
要保存文件,请在主菜单中点击“文件”,然后选择“另存为”。输入文件名和文件夹路径。请将文件以默认文件格式保存,以保留详细的成像信息,供日后参考。如需以其他格式导出文件,请在“文件”菜单下点击“导出”。
设置文件名和文件夹。勾选“创建项目文件夹”以更好地组织数据。从下拉菜单中选择所需的文件类型后,点击“开始”以导出。
秀丽隐杆线虫中有两种氯离子细胞内通道蛋白同源物,即 exl-1 和 exc-4。最近一项研究表明,exl-1 调控动物的应激管理。本文中,将一个翻译水平的 exl-1 GFP 构建体整合到动物基因组中,并建立了稳定表达绿色荧光 exl-1 的转基因品系。
在热应激条件下,exl-1 GFP 在肠区细胞核中积累,表现为强烈的 GFP 信号与细胞核重叠。为确认 exl-1 的亚细胞定位,对经乙醇和丙酮固定的动物均进行了 DAPI 染色。两种方法均清晰显示了动物体内的细胞核,且 GFP 信号与 DAPI 信号的重叠证实 exl-1 GFP 确实积累于肠区细胞核中。
一旦掌握,若操作得当,该技术可在一小时内完成。观看本视频后,您应能充分理解如何快速固定以保存线虫(C.elegans)在胁迫条件下GFP信号及蛋白质的核转位。
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本实验方案演示了如何利用GFP融合蛋白作为标记物并结合DAPI染色,检测热应激条件下蛋白质的核转位。该方法快速高效,可同时观察核染色和亚细胞定位的变化。
本方案能够快速、无需抗体地追踪蛋白质在应激条件下亚细胞定位的变化,有助于在发现阶段的工作流程中进行靶点的早期验证。通过将GFP标记与DAPI核染色相结合,可对转位事件(如热应激下的核内聚集)提供定量且直观的可视化确认,从而为治疗假设的机制性风险评估提供依据。该方法适用于常规荧光显微镜,便于在生物制药研发环境中用于高通量筛选的前期准备以及跨职能团队的协作使用。
该方法适用于从靶点假设验证到先导化合物筛选的发现连续过程,尤其适用于应激响应蛋白的研究。在化合物筛选项目之前,该方法通过验证靶点结合及亚细胞动态,支持早期的“继续/终止”决策。